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单细胞RNA-seq数据整合:SeuratIntegrationandHarmony1.研究背景在单细胞RNA测序(scRNA-seq)研究中,批次效应(batcheffect)是不可忽视的问题。不同样本来源(如多个实验室、不同测序平台、不同患者)可能会导致非生物学因素的影响,从而影响数据分析的准确性。之前单独写过Harmony去除批次,为了更好地整合多个样本,这次使用以下两种方法进行批次校正:S
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Master:管控集群的管理面节点,提供Kubernetes核心服务和应用程序工作负载的业务流程,对集群进行调度管理。MasterNode由APIServer、Scheduler、ClusterStateStore和Controller-ManagerServer所组成。Node:业务运行的工作节点,用于运行应用程序的容器工作负载。WorkerNode包含kubelet、kubeproxy和Con
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npmvue.jselectron
1.npm(NodePackageManager)读音:“N-P-M”或者直接读作“npm”。npm是Node.js的官方包管理器,用于安装、发布和管理JavaScript软件包。它允许开发者轻松地共享代码,并且可以通过命令行工具来管理依赖关系。通过npminit命令可以交互式地初始化一个项目,而npminstall则可以安装指定的软件包到当前项目中。2.cnpm(ChinaNodePackage
- R中单细胞RNA-seq分析教程 (6)
后端
引言本系列开启R中单细胞RNA-seq数据分析教程,持续更新,欢迎关注,转发!简介现在,很少有人只进行一次单细胞RNA测序实验并仅产生一份数据。原因很直接:目前的单细胞RNA测序技术每次只能捕捉到有限样本的分子状态。为了在多个实验和不同条件下对众多样本进行测量,通常需要对来自不同实验的单细胞RNA测序数据进行联合分析。虽然有些实验策略,比如细胞哈希!,以及一些计算方法,比如demuxlet和scS
- docker启动容器,语句名词解释
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docker容器运维
#启动容器代码dockerrun-it-d--namedev_aios-vD:\project\aialign:/www/-vD:\project\data\dev\aios:/myfile/data/dev/aios-w/www/stand-alone-aios/aios-p9002:9000--ulimitcore=0aialign/python-base:1.0bash名词解释dockerr
- async-http-client使用示例
光芒再现0394
http网络协议网络
文章目录概要整体架构流程技术名词解释技术细节小结概要async-http-client是一个用于Java平台的高性能、非阻塞HTTP客户端库,它允许开发者以异步的方式发送HTTP请求并处理响应,从而提高应用程序的性能和响应性。主要特点异步处理:基于Netty框架实现,支持异步发送HTTP请求和处理响应,避免了传统同步请求中的阻塞。支持多种请求方法:支持GET、POST、PUT、DELETE等常见的
- python消费kafka数据nginx日志实时_基于nginx+flume+kafka+mongodb实现埋点数据采集
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名词解释埋点其实就是用于记录用户在页面的一些操作行为。例如,用户访问页面(PV,PageViews)、访问页面用户数量(UV,UserViews)、页面停留、按钮点击、文件下载等,这些都属于用户的操作行为。开发背景我司之前在处理埋点数据采集时,模式很简单,当用户操作页面控件时,前端监听到操作事件,并根据上下文环境,将事件相关的数据通过接口调用发送至埋点数据采集服务(简称ets服务),ets服务对数
- 大话商品模型
云夢南行
java
商品模型术语名词解释达尔文体系是天猫发起的一套全新的商品管理体系,它不同于淘宝原来的分类法(基于类目属性体系)的管理思路,而是以最细粒度的产品节点(CSPU)为核心,使用系统和运营机制的方式维护一套丰富、准确的产品库,通过产品实现聚合、管控商品,以确保商品信息的确定性。SPUStandardProductUnit,标准化产品单元,是对某一类标准产品的共同特征属性的描述,是商品信息共有属性的一种抽取
- 调控元件,顺式作用元件和反式作用因子
梦云澜
基因调控网络推断人工智能深度学习论文阅读
调控元件(RegulatoryElements,REs)定义:调控元件是基因组中能够调控基因表达的DNA序列。它们通过与转录因子和其他调控蛋白相互作用,影响基因的转录活性。特点:位置:调控元件可以位于基因的上游(如启动子)、下游或内部。功能:调控元件通过与转录因子结合,调控基因的转录起始或转录效率。常见类型:启动子(Promoters):位于基因转录起始点上游,是RNA聚合酶结合的位点。增强子(E
- Python3 【数学运算】项目实战:5个实战项目案例
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Python精讲精练-从入门到实战python经验分享案例学习编程技巧项目实战
Python3【数学运算】项目实战:5个实战项目案例本文展示5个实用性强且代码简洁的Python数学运算迷你项目,涵盖金融、教育、工程等场景,每个项目均提供完整代码、注释和测试案例:项目1:房贷计算器(金融数学)目标:计算每月还款额和总利息importmathdefmortgage_calculator(principal,annual_rate,years):monthly_rate=annua
- 小麦雌蕊相关基因和网络的共表达网络分析
请你喝好果汁641
文献学习学习
https://peerj.com/articles/13902/#摘要作物雄性不育具有重要的理论研究和育种应用价值。HTS-1的雄蕊转化为雌蕊或雌蕊状结构,是春季三雌蕊(CSTP)小麦中重要的雄性不育材料。然而,HTS-1中雌蕊发育的分子机制仍然是一个谜。11个小麦组织的RNA-seq数据来自美国国家生物技术信息中心(NCBI),包括CSTP的雄蕊和HTS-1的雌蕊和雌蕊。鲑鱼程序用于量化11种
- deseq2进行差异分析时的分组问题
请你喝好果汁641
RNA-seq学习
这段代码是使用DESeq2包进行RNA-Seq数据差异表达分析的示例。它展示了如何在不同实验设计下进行差异表达分析,包括两组比较、两条件两基因型的交互作用,以及两条件三基因型的分析。示例1:两组比较#创建一个示例数据集,包含4个样本dds=1.10中,所选的阈值是过滤器的最低分位数,其中拒绝数接近拟合曲线在过滤器分位数上的峰值。“接近”定义为在1个残差标准差内。对于未通过过滤阈值的基因,调整后的p
- CFM与RPM-名词解释
道阻且长行则将至!
名词解释CFM与RPM-名词解释
1.CFM(气体流量单位):立方英尺每分钟1CFM=28.316846592L/MIN=0.028316847m3/min2.RPM(转速单位):表示设备每分钟的旋转次数
- 《C程序设计》第三章练习答案
西蒙尼的马竞
c语言算法开发语言
习题1.假如我国国民生产总值的年增长率为9%,计算10年后我国国民生产总值与现在相比增长多少百分比,计算公式为p=(1+r)^nr为年增长率,n为年数,p为与现在相比的倍数。#include#includeintmain(){doubler=0.09;intn=10;doublep;p=pow((1+r),n);printf("After10years,increasepercentageis:%
- 【学习pyqt5记录:界面来回切换】
Leuanghing
学习python笔记经验分享开发语言qt
文章目录一、概要二、整体架构流程三、技术名词解释四、技术细节五、小结六、代码一、概要学习操作界面来回切换有以下作用:1.提高工作效率:通过界面切换,我们可以在不同的应用程序或选项卡之间快速切换,无需频繁使用鼠标,从而节省时间,提高工作效率。2.减少操作难度:对于不熟悉某些应用程序或操作系统的人来说,使用界面切换可以减少在繁琐的菜单中寻找所需选项的时间,从而降低操作难度。3.提高使用舒适度:通过界面
- SpringBoot使用RabbitMQ实现延迟队列
Funky_oaNiu
Java后端java-rabbitmqspringbootrabbitmq
SpringBoot使用RabbitMQ实现延迟队列需求和目标名词解释实现方式引入依赖添加配置文件配置类死信队列消费者即时队列消费者延迟消息发送结果注意需求和目标商城系统,用户下单后若15分钟内仍未完成支付,则自动取消订单,若已支付,不做其他特殊操作系统还需要支持即时消息的功能,即发即收。名词解释①即时队列:即发即收②延迟队列:发了消息,没有接收方,只有消息过期后才被处理③死信队列:延迟队列上的消
- tomcat基础与部署发布
暗黑小菠萝
Tomcat java web
从51cto搬家了,以后会更新在这里方便自己查看。
做项目一直用tomcat,都是配置到eclipse中使用,这几天有时间整理一下使用心得,有一些自己配置遇到的细节问题。
Tomcat:一个Servlets和JSP页面的容器,以提供网站服务。
一、Tomcat安装
安装方式:①运行.exe安装包
&n
- 网站架构发展的过程
ayaoxinchao
数据库应用服务器网站架构
1.初始阶段网站架构:应用程序、数据库、文件等资源在同一个服务器上
2.应用服务和数据服务分离:应用服务器、数据库服务器、文件服务器
3.使用缓存改善网站性能:为应用服务器提供本地缓存,但受限于应用服务器的内存容量,可以使用专门的缓存服务器,提供分布式缓存服务器架构
4.使用应用服务器集群改善网站的并发处理能力:使用负载均衡调度服务器,将来自客户端浏览器的访问请求分发到应用服务器集群中的任何
- [信息与安全]数据库的备份问题
comsci
数据库
如果你们建设的信息系统是采用中心-分支的模式,那么这里有一个问题
如果你的数据来自中心数据库,那么中心数据库如果出现故障,你的分支机构的数据如何保证安全呢?
是否应该在这种信息系统结构的基础上进行改造,容许分支机构的信息系统也备份一个中心数据库的文件呢?
&n
- 使用maven tomcat plugin插件debug关联源代码
商人shang
mavendebug查看源码tomcat-plugin
*首先需要配置好'''maven-tomcat7-plugin''',参见[[Maven开发Web项目]]的'''Tomcat'''部分。
*配置好后,在[[Eclipse]]中打开'''Debug Configurations'''界面,在'''Maven Build'''项下新建当前工程的调试。在'''Main'''选项卡中点击'''Browse Workspace...'''选择需要开发的
- 大访问量高并发
oloz
大访问量高并发
大访问量高并发的网站主要压力还是在于数据库的操作上,尽量避免频繁的请求数据库。下面简
要列出几点解决方案:
01、优化你的代码和查询语句,合理使用索引
02、使用缓存技术例如memcache、ecache将不经常变化的数据放入缓存之中
03、采用服务器集群、负载均衡分担大访问量高并发压力
04、数据读写分离
05、合理选用框架,合理架构(推荐分布式架构)。
- cache 服务器
小猪猪08
cache
Cache 即高速缓存.那么cache是怎么样提高系统性能与运行速度呢?是不是在任何情况下用cache都能提高性能?是不是cache用的越多就越好呢?我在近期开发的项目中有所体会,写下来当作总结也希望能跟大家一起探讨探讨,有错误的地方希望大家批评指正。
1.Cache 是怎么样工作的?
Cache 是分配在服务器上
- mysql存储过程
香水浓
mysql
Description:插入大量测试数据
use xmpl;
drop procedure if exists mockup_test_data_sp;
create procedure mockup_test_data_sp(
in number_of_records int
)
begin
declare cnt int;
declare name varch
- CSS的class、id、css文件名的常用命名规则
agevs
JavaScriptUI框架Ajaxcss
CSS的class、id、css文件名的常用命名规则
(一)常用的CSS命名规则
头:header
内容:content/container
尾:footer
导航:nav
侧栏:sidebar
栏目:column
页面外围控制整体布局宽度:wrapper
左右中:left right
- 全局数据源
AILIKES
javatomcatmysqljdbcJNDI
实验目的:为了研究两个项目同时访问一个全局数据源的时候是创建了一个数据源对象,还是创建了两个数据源对象。
1:将diuid和mysql驱动包(druid-1.0.2.jar和mysql-connector-java-5.1.15.jar)copy至%TOMCAT_HOME%/lib下;2:配置数据源,将JNDI在%TOMCAT_HOME%/conf/context.xml中配置好,格式如下:&l
- MYSQL的随机查询的实现方法
baalwolf
mysql
MYSQL的随机抽取实现方法。举个例子,要从tablename表中随机提取一条记录,大家一般的写法就是:SELECT * FROM tablename ORDER BY RAND() LIMIT 1。但是,后来我查了一下MYSQL的官方手册,里面针对RAND()的提示大概意思就是,在ORDER BY从句里面不能使用RAND()函数,因为这样会导致数据列被多次扫描。但是在MYSQL 3.23版本中,
- JAVA的getBytes()方法
bijian1013
javaeclipseunixOS
在Java中,String的getBytes()方法是得到一个操作系统默认的编码格式的字节数组。这个表示在不同OS下,返回的东西不一样!
String.getBytes(String decode)方法会根据指定的decode编码返回某字符串在该编码下的byte数组表示,如:
byte[] b_gbk = "
- AngularJS中操作Cookies
bijian1013
JavaScriptAngularJSCookies
如果你的应用足够大、足够复杂,那么你很快就会遇到这样一咱种情况:你需要在客户端存储一些状态信息,这些状态信息是跨session(会话)的。你可能还记得利用document.cookie接口直接操作纯文本cookie的痛苦经历。
幸运的是,这种方式已经一去不复返了,在所有现代浏览器中几乎
- [Maven学习笔记五]Maven聚合和继承特性
bit1129
maven
Maven聚合
在实际的项目中,一个项目通常会划分为多个模块,为了说明问题,以用户登陆这个小web应用为例。通常一个web应用分为三个模块:
1. 模型和数据持久化层user-core,
2. 业务逻辑层user-service以
3. web展现层user-web,
user-service依赖于user-core
user-web依赖于user-core和use
- 【JVM七】JVM知识点总结
bit1129
jvm
1. JVM运行模式
1.1 JVM运行时分为-server和-client两种模式,在32位机器上只有client模式的JVM。通常,64位的JVM默认都是使用server模式,因为server模式的JVM虽然启动慢点,但是,在运行过程,JVM会尽可能的进行优化
1.2 JVM分为三种字节码解释执行方式:mixed mode, interpret mode以及compiler
- linux下查看nginx、apache、mysql、php的编译参数
ronin47
在linux平台下的应用,最流行的莫过于nginx、apache、mysql、php几个。而这几个常用的应用,在手工编译完以后,在其他一些情况下(如:新增模块),往往想要查看当初都使用了那些参数进行的编译。这时候就可以利用以下方法查看。
1、nginx
[root@361way ~]# /App/nginx/sbin/nginx -V
nginx: nginx version: nginx/
- unity中运用Resources.Load的方法?
brotherlamp
unity视频unity资料unity自学unityunity教程
问:unity中运用Resources.Load的方法?
答:Resources.Load是unity本地动态加载资本所用的方法,也即是你想动态加载的时分才用到它,比方枪弹,特效,某些实时替换的图像什么的,主张此文件夹不要放太多东西,在打包的时分,它会独自把里边的一切东西都会集打包到一同,不论里边有没有你用的东西,所以大多数资本应该是自个建文件放置
1、unity实时替换的物体即是依据环境条件
- 线段树-入门
bylijinnan
java算法线段树
/**
* 线段树入门
* 问题:已知线段[2,5] [4,6] [0,7];求点2,4,7分别出现了多少次
* 以下代码建立的线段树用链表来保存,且树的叶子结点类似[i,i]
*
* 参考链接:http://hi.baidu.com/semluhiigubbqvq/item/be736a33a8864789f4e4ad18
* @author lijinna
- 全选与反选
chicony
全选
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">
<html>
<head>
<title>全选与反选</title>
- vim一些简单记录
chenchao051
vim
mac在/usr/share/vim/vimrc linux在/etc/vimrc
1、问:后退键不能删除数据,不能往后退怎么办?
答:在vimrc中加入set backspace=2
2、问:如何控制tab键的缩进?
答:在vimrc中加入set tabstop=4 (任何
- Sublime Text 快捷键
daizj
快捷键sublime
[size=large][/size]Sublime Text快捷键:Ctrl+Shift+P:打开命令面板Ctrl+P:搜索项目中的文件Ctrl+G:跳转到第几行Ctrl+W:关闭当前打开文件Ctrl+Shift+W:关闭所有打开文件Ctrl+Shift+V:粘贴并格式化Ctrl+D:选择单词,重复可增加选择下一个相同的单词Ctrl+L:选择行,重复可依次增加选择下一行Ctrl+Shift+L:
- php 引用(&)详解
dcj3sjt126com
PHP
在PHP 中引用的意思是:不同的名字访问同一个变量内容. 与C语言中的指针是有差别的.C语言中的指针里面存储的是变量的内容在内存中存放的地址 变量的引用 PHP 的引用允许你用两个变量来指向同一个内容 复制代码代码如下:
<?
$a="ABC";
$b =&$a;
echo
- SVN中trunk,branches,tags用法详解
dcj3sjt126com
SVN
Subversion有一个很标准的目录结构,是这样的。比如项目是proj,svn地址为svn://proj/,那么标准的svn布局是svn://proj/|+-trunk+-branches+-tags这是一个标准的布局,trunk为主开发目录,branches为分支开发目录,tags为tag存档目录(不允许修改)。但是具体这几个目录应该如何使用,svn并没有明确的规范,更多的还是用户自己的习惯。
- 对软件设计的思考
e200702084
设计模式数据结构算法ssh活动
软件设计的宏观与微观
软件开发是一种高智商的开发活动。一个优秀的软件设计人员不仅要从宏观上把握软件之间的开发,也要从微观上把握软件之间的开发。宏观上,可以应用面向对象设计,采用流行的SSH架构,采用web层,业务逻辑层,持久层分层架构。采用设计模式提供系统的健壮性和可维护性。微观上,对于一个类,甚至方法的调用,从计算机的角度模拟程序的运行情况。了解内存分配,参数传
- 同步、异步、阻塞、非阻塞
geeksun
非阻塞
同步、异步、阻塞、非阻塞这几个概念有时有点混淆,在此文试图解释一下。
同步:发出方法调用后,当没有返回结果,当前线程会一直在等待(阻塞)状态。
场景:打电话,营业厅窗口办业务、B/S架构的http请求-响应模式。
异步:方法调用后不立即返回结果,调用结果通过状态、通知或回调通知方法调用者或接收者。异步方法调用后,当前线程不会阻塞,会继续执行其他任务。
实现:
- Reverse SSH Tunnel 反向打洞實錄
hongtoushizi
ssh
實際的操作步驟:
# 首先,在客戶那理的機器下指令連回我們自己的 Server,並設定自己 Server 上的 12345 port 會對應到幾器上的 SSH port
ssh -NfR 12345:localhost:22
[email protected]
# 然後在 myhost 的機器上連自己的 12345 port,就可以連回在客戶那的機器
ssh localhost -p 1
- Hibernate中的缓存
Josh_Persistence
一级缓存Hiberante缓存查询缓存二级缓存
Hibernate中的缓存
一、Hiberante中常见的三大缓存:一级缓存,二级缓存和查询缓存。
Hibernate中提供了两级Cache,第一级别的缓存是Session级别的缓存,它是属于事务范围的缓存。这一级别的缓存是由hibernate管理的,一般情况下无需进行干预;第二级别的缓存是SessionFactory级别的缓存,它是属于进程范围或群集范围的缓存。这一级别的缓存
- 对象关系行为模式之延迟加载
home198979
PHP架构延迟加载
形象化设计模式实战 HELLO!架构
一、概念
Lazy Load:一个对象,它虽然不包含所需要的所有数据,但是知道怎么获取这些数据。
延迟加载貌似很简单,就是在数据需要时再从数据库获取,减少数据库的消耗。但这其中还是有不少技巧的。
二、实现延迟加载
实现Lazy Load主要有四种方法:延迟初始化、虚
- xml 验证
pengfeicao521
xmlxml解析
有些字符,xml不能识别,用jdom或者dom4j解析的时候就报错
public static void testPattern() {
// 含有非法字符的串
String str = "Jamey친ÑԂ
- div设置半透明效果
spjich
css半透明
为div设置如下样式:
div{filter:alpha(Opacity=80);-moz-opacity:0.5;opacity: 0.5;}
说明:
1、filter:对win IE设置半透明滤镜效果,filter:alpha(Opacity=80)代表该对象80%半透明,火狐浏览器不认2、-moz-opaci
- 你真的了解单例模式么?
w574240966
java单例设计模式jvm
单例模式,很多初学者认为单例模式很简单,并且认为自己已经掌握了这种设计模式。但事实上,你真的了解单例模式了么。
一,单例模式的5中写法。(回字的四种写法,哈哈。)
1,懒汉式
(1)线程不安全的懒汉式
public cla