《学习小组Day3笔记--曾俊辉》

Linux环境下安装软件

conda是Linux的应用商店,因此要安装软件，需下载一个miniconda

miniconda下载流程：

检查是否有bzip2压缩软件，无则输入yum install -y bzip2安装

进入biosoft目录:cd biosoft

搜索miniconda下载网址，复制下载链接到目录下

然后 bash Miniconda3-latest-Linux-x86.sh，一直ENTER到YES

激活conda:source ~/.bashrc

添加镜像来加快下载速度：conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes

查看软件列表
搜索软件并安装：conda install 软件名称，后Y同意

同时安装多个软件

查看conda有哪些环境：conda info --envs

建立环境：conda create -n 软件名称 python=3 软件名称 trimmomatic -y

激活新的conda环境：source activate rna-seq

截图