biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置

就目前来看，这一周主要以补交上次作业为主，所以上一周的总结增加了很多新内容。但是关于本体论和富集分析，大家还是有点小困难。当然我自己交东西也慢了很多，因为时间也总是不太够，完全靠周末挤出来。

第三周笔记汇总如下

• Biostar学习笔记（3）Gene set analysis related topics.
• 本体论
• biostarhandboo(四)|本体论和功能分析
• 基因本体论

第四周作业发布

我们处在大数据时代，尤其是测序技术诞生之后，测序仪生产的数据更是不可思议地多。那么问题来了，我们每个人都在说数据，但是数据（data)是什么呢？还有一个问题数据格式(data format)又是什么？数据那么多，你需要的数据存放在哪里，你需要到哪里才能找到这些数据呢？这些都是你这一周需要思考的问题。

第四周的任务是阅读第六章和第七章的内容。这部分内容比较简单，都是属于了解即可的内容。此外，这一周涉及到命令行操作的代码也有很多，可能需要一段时间去练习。

• 了解GenBank格式
• 了解FASTA/FASTQ格式，尤其是FASTA的命名方式
• 整理目前你已知的数据库
• 学会使用命令行访问NCBI
• 学会从数据库下载数据到本地，以SRA为例。