- 用DESeq2包来对RNA-seq数据进行差异分析
Seurat_Satija
差异分析的套路都是差不多的,大部分设计思想都是继承limma这个包,DESeq2也不例外。DESeq2是DESeq包的更新版本,看样子应该不会有DESeq3了,哈哈,它的设计思想就是针对count类型的数据。可以是任意features的count数据,比如对各个基因的count,或者外显子,或者CHIP-seq的一些feature,都可以用来做差异分析。使用这个包也是需要三个数据:表达矩阵分组矩阵
- 使用ESP-IDF出现A fatal error occurred: This chip is ESP32-S3 not ESP32. Wrong --chip argument?的解决方案
HawkJgogogo
ubuntulinux单片机嵌入式硬件
使用ESP-IDF出现Afatalerroroccurred:ThischipisESP32-S3notESP32.Wrong--chipargument?的问题是因为没有把芯片设为目标。在将环境设置为esp-idf,就是需要export.sh一下,这个不做解释。之后我们在terminal中逐个输入以下代码idf.pyset-target#我的是esp32s3,这里填写你的芯片#idf.pyful
- JAVA 手机部件功耗计算
西柚第一深情jq
javajava智能手机开发语言
手机由芯片、分离元件等部件组成,编程计算手机所含部件的总功耗。要求如下:1.创建一个ComputePower接口,接口中有方法:doublecomputePower();2.创建两个类Chip、Discrete,这些类都实现了ComputePower接口,能够提供功耗。其中,Chip的功耗为16.6w、Discrete的功耗为40.0w。3.创建一个Phone类,私有成员变量parts是一个Com
- ZCC575Digital On‐chip Temperature Sensor with I2C Interface
ZCWC123
社交电子
FeaturesTemperatureaccuracy‐±1℃from-20℃~80℃‐±2℃from-40℃~125℃Lowpowerconsumption‐4.5uAshutdowncurrentatVDD=5.0V‐125uAcontinuousconversioncurrent2.2~8.0Vultra-wideoperationsupplyvoltageHighPSRintemp
- keil MDK报错显示error: #20: identifier “inline“ is undefined
Lulifer。
单片机stm32嵌入式硬件keilMDKinline
用keilMDK编译STM32代码,报错为:..\LCD\atk_md0430.c(72):error:#20:identifier"inline"isundefinedstaticinlineuint16_tatk_md0430_get_chip_id(void)之所以产生这样的原因,是因为MDK的inline函数和stm32的不一样,在MDK中,应该是__inline,修改后编译正确:
- 2021-10-31
人文一班刘彤
Part11,从本单元中我学到的最重要的理念(精读和视听说分别总结)视听说:①语言是一门工具,听读英语都有技巧。②多听多练才能熟练。精读:熟悉生词与语块可以帮助理解文章。2.我在本片文章/音频/视频中学到的怦然心动的单词(精读和视听说分别总结)视听说:①extremely②retell③chip精读:①priority②crucial③intangible3,在本篇文章/音频/视频中我最喜欢的一句
- Quantitative Analysis: PIM Chip Demands for LLAMA-7B inference
简vae
软硬件结合neardataprocessingPIMforAIllamatransformer
1Architecture如果将LLAMA-7B模型参数量化为4bit,则存储模型参数需要3.3GB。那么,至少PIMchip的存储至少要4GB。AiM单个bank为32MB,单个die512MB,至少需要8个die的芯片。8个die集成在一个芯片上。提供8×16bank级别的访存带宽。整个推理过程完全下放至PIM。CPU把prompt传给ControllerController控制推理过程,将推
- 转录调控研究数据库推荐 | 你要找的ChIP-seq数据都在这里啦!
尐尐呅
染色质免疫沉淀、DNase-I超敏反应和转座酶可及性分析结合高通量测序,使染色质动力学、转录因子结合和基因调控的全基因组研究成为可能。来自同济大学的研究人员开发了人类和小鼠ChIP-seq和染色质可及性数据库:CistromeDB(CistromeDataBrowser),为转录和表观遗传调控研究提供最全面数据资源。其相关研究成果已发表在《Nucleicacidsresearch》。Cistrom
- 生信地基系列--常规分析流程
可能性之兽
还在到底搜索一些R的分析流程吗?biocondutor已经给你准备好了29篇Bioconductor-BiocViewsimage.png注释流程生物导体可以导入多种与序列相关的文件类型,包括Fasta、fastq、BAM、VCF、gff、bed和wig文件等。包支持常见的和高级的序列操作操作,例如修剪、转换和对齐。领域特异性分析包括质量评估、ChIP-seq、差异表达、RNA-seq和其他方法。
- K210如何下载程序
我先去打把游戏先
K210单片机嵌入式硬件c语言stm32学习
一、打开资料包里提供的K-Flash程序烧录软件二、选择串口三、选择波特率四、选择In-Chip,烧录到Flash芯片里面,重新上电还会运行程序五、如果选择In-Memory,这次可以运行,但下次重新上电就不会保持这次的程序了。六、选择固件烧录的路径七、这个勾是烧录完成后会弹出一个终端,可以用来显示打印的数据八、点击FLASH便可开始烧录固件,这里我下的是资料包提供的入手试玩程序九、烧录成功
- numa网卡绑定
大隐隐于野
#网络专栏numa
#概念参考:https://www.jianshu.com/p/0f3b39a125eb(opensnewwindow)chip:芯片,一个cpu芯片上可以包含多个cpucore,比如四核,表示一个chip里4个core。socket:芯片插槽,颗,跟上面的chip一样。两颗四核,就表示总共8个corecore:包含在一个cpu芯片里的多个核心LCPU:逻辑cpu,一个core里可以做多个逻辑cp
- 看了老大比较基因组学视频后扩展的小内容
小梦游仙境
老大视频比较基因组在IGV看了http://www.bio-info-trainee.com/2218.htmlwes:探针捕获rna-seq:不会出现外显子两边下降chip-seq:不会出现整齐,得到的文件是peaksbedfilesRNA-seq这十年https://mp.weixin.qq.com/s/a3y46NNNO-wardO3XWwh0w经过不断的技术开发和改进,以Roche公司的4
- 2022-08-14
佳奥
上一次写随笔还是两周前八月第一周在玩异度之刃3.....第二周把EGO数据库挖掘的内容结束了,另外学了chip-seq全流程,这一次感觉比rna-seq那一趟顺利多了,当然,数据量也是大多了,分析结束后还要把WSL占用的空间重新释放出来,属实头大。chip-seq实战九、十已经完成,每天更新一篇。假期还剩两周左右,接下来学什么呢?我想完善一下,会使用Linux,会使用R语言,学了转录组分析的流程和
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单片机结构与原理(MCS-51为例)基础知识概述什么是单片机单片机(Single-Chip-Microcomputer)又称为单片微计算机结构特点:将微型计算机的基本功能部件全部集成在一个半导体芯片上单片机的特点集成度高,体积小,抗干扰能力强,可靠性高开发性能好,开发周期短,控制功能强低功耗,低电压,具有掉电保护功能通用性和灵活性好具有良好的性能价格比单片机的应用领域工业自动化控制智能仪器仪表通信
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UnveilingtheIPQ4019:RevolutionizingLong-RangeWirelessConnectivityIntroduction:TheIPQ4019System-on-Chip(SoC)emergesasagame-changerforPoint-to-Point(PTP)andPoint-to-Multipoint(PTMP)applications,presenti
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芯片设计入门DRAM内存交叉burst模式rowbuffer
目录1、DRAM单元阵列1.1、DRAM基本单元1.2、cell阵列1.3、cell阵列的读取1.4、DRAM刷新2、DRAM芯片的读写2.1、必须的周围逻辑2.2、完整的读过程(重点)2.3、完整的写过程2.4、时间消耗和行缓存3、DRAM系统层次3.1、bank划分3.2、存储芯片/chip3.3、rank和DIMM4、burst猝发模式5、bank并行和内存交错6、小结如果你是一个EECS专
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AlterationsofspecificchromatinconformationaffectATRA-inducedleukemiacelldifferentiation期刊:CellDeath&Disease影响因子:6.044主要技术:Hi-C、ATAC-seq、ChIP-seq、RNA-seq发表时间:2018年研究背景染色体形成多层次构象在基因表达调控中起着至关重要的作用。高通量染色体
- ChIP-seq数据质控
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日常瞎掰 ChIP-seq可以用来研究某种转录因子或者组蛋白(后面统称为蛋白因子吧)在基因组上的结合位置,从而来确定蛋白因子可能调控的靶基因,继而推测出在生物过程中的相关调控功能。既然是用来研究某种特定的蛋白因子,所以ChIP-seq在建库时就会用到相对应的抗体来结合蛋白因子,从而特异性地富集蛋白因子结合的DNA片段。因此,ChIP-seq实验成功与否的关键在于抗体结合的特异性,如果特异性不好,
- 2019-03-16
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EP3C40F780I7N介绍:EP3C40F780I7N属于芯片,芯片(chip)就是半导体元件产品的统称。是集成电路(IC,integratedcircuit)的载体,由晶圆分割而成。就是集成电路,泛指所有的电子元器件,是在硅板上集合多种电子元器件实现某种特定功能的电路模块。它是电子设备中最重要的部分,承担着运算和存储的功能。集成电路的应用范围覆盖了军工、民用的几乎所有的电子设备。除了最通用的
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CUTANACUTRUNAssays表观遗传学
蛋白质和核酸是构成生命体最为重要的两类生物大分子,二者间的相互作用一直是分子生物学研究的中心问题之一。研究细胞内蛋白质-DNA相互作用的常用方法是染色质免疫沉淀(ChromatinImmunoprecipitation,ChIP),同时ChIP还常被用于确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点(即组蛋白修饰酶的靶标)。但是由于ChIP存在高细胞需求量、技术难度大、成本高、深度测序、数据质量差以及变量
- TiED:人类组织特异性增强子数据库
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欢迎关注”生信修炼手册”!TiED是一个人类增强子数据库,对10种不同组织中的增强子表进行定量和分析,鉴定了增强子的组织特异性,网址如下http://lcbb.swjtu.edu.cn/TiED/首先综合H3K27ac,H3K4me1,H3K4me3和DHS的结果来识别增强子区域,从Roadmap和ENCODE下载chip_seq数据进行分析,将在DHS,H3K27ac,H3K4me1peak2k
- IPQ9574: High-performance WiFi7 wireless network chip leading the future
Wallytech
网络5G嵌入式硬件物联网大数据
Withthecontinuousadvancementoftechnology,wirelessnetworkshavebecomeanindispensablepartofourlives.IPQ9574,asawirelessnetworkchipbasedonWiFi7technology,leadsthefutureofwirelessconnectionswithitsexcellen
- 易基因:ChIP-seq等揭示WWOX基因通过上调Myc促进骨肉瘤发生发展的表观调控机制|Cell Death Dis
易基因科技
高分文献文献科普项目文章生物学生物信息学经验分享数据挖掘
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。骨肉瘤(Osteosarcoma,OS)是一种高侵袭性骨肿瘤,主要影响儿童和青少年。这种恶性肿瘤与不良临床结果相关,尤其是肺转移。由于其罕见性和生物学异质性,对其分子基础研究有限,阻碍了有效疗法的发展。WW结构域氧化还原酶(WWdomain-containingoxidoreductase,WWOX)是一种在人骨肉瘤中经常发生变化的基因
- linux系统服务器下jsp传参数乱码
3213213333332132
javajsplinuxwindowsxml
在一次解决乱码问题中, 发现jsp在windows下用js原生的方法进行编码没有问题,但是到了linux下就有问题, escape,encodeURI,encodeURIComponent等都解决不了问题
但是我想了下既然原生的方法不行,我用el标签的方式对中文参数进行加密解密总该可以吧。于是用了java的java.net.URLDecoder,结果还是乱码,最后在绝望之际,用了下面的方法解决了
- Spring 注解区别以及应用
BlueSkator
spring
1. @Autowired
@Autowired是根据类型进行自动装配的。如果当Spring上下文中存在不止一个UserDao类型的bean,或者不存在UserDao类型的bean,会抛出 BeanCreationException异常,这时可以通过在该属性上再加一个@Qualifier注解来声明唯一的id解决问题。
2. @Qualifier
当spring中存在至少一个匹
- printf和sprintf的应用
dcj3sjt126com
PHPsprintfprintf
<?php
printf('b: %b <br>c: %c <br>d: %d <bf>f: %f', 80,80, 80, 80);
echo '<br />';
printf('%0.2f <br>%+d <br>%0.2f <br>', 8, 8, 1235.456);
printf('th
- config.getInitParameter
171815164
parameter
web.xml
<servlet>
<servlet-name>servlet1</servlet-name>
<jsp-file>/index.jsp</jsp-file>
<init-param>
<param-name>str</param-name>
- Ant标签详解--基础操作
g21121
ant
Ant的一些核心概念:
build.xml:构建文件是以XML 文件来描述的,默认构建文件名为build.xml。 project:每个构建文
- [简单]代码片段_数据合并
53873039oycg
代码
合并规则:删除家长phone为空的记录,若一个家长对应多个孩子,保留一条家长记录,家长id修改为phone,对应关系也要修改。
代码如下:
- java 通信技术
云端月影
Java 远程通信技术
在分布式服务框架中,一个最基础的问题就是远程服务是怎么通讯的,在Java领域中有很多可实现远程通讯的技术,例如:RMI、MINA、ESB、Burlap、Hessian、SOAP、EJB和JMS等,这些名词之间到底是些什么关系呢,它们背后到底是基于什么原理实现的呢,了解这些是实现分布式服务框架的基础知识,而如果在性能上有高的要求的话,那深入了解这些技术背后的机制就是必须的了,在这篇blog中我们将来
- string与StringBuilder 性能差距到底有多大
aijuans
之前也看过一些对string与StringBuilder的性能分析,总感觉这个应该对整体性能不会产生多大的影响,所以就一直没有关注这块!
由于学程序初期最先接触的string拼接,所以就一直没改变过自己的习惯!
- 今天碰到 java.util.ConcurrentModificationException 异常
antonyup_2006
java多线程工作IBM
今天改bug,其中有个实现是要对map进行循环,然后有删除操作,代码如下:
Iterator<ListItem> iter = ItemMap.keySet.iterator();
while(iter.hasNext()){
ListItem it = iter.next();
//...一些逻辑操作
ItemMap.remove(it);
}
结果运行报Con
- PL/SQL的类型和JDBC操作数据库
百合不是茶
PL/SQL表标量类型游标PL/SQL记录
PL/SQL的标量类型:
字符,数字,时间,布尔,%type五中类型的
--标量:数据库中预定义类型的变量
--定义一个变长字符串
v_ename varchar2(10);
--定义一个小数,范围 -9999.99~9999.99
v_sal number(6,2);
--定义一个小数并给一个初始值为5.4 :=是pl/sql的赋值号
- Mockito:一个强大的用于 Java 开发的模拟测试框架实例
bijian1013
mockito单元测试
Mockito框架:
Mockito是一个基于MIT协议的开源java测试框架。 Mockito区别于其他模拟框架的地方主要是允许开发者在没有建立“预期”时验证被测系统的行为。对于mock对象的一个评价是测试系统的测
- 精通Oracle10编程SQL(10)处理例外
bijian1013
oracle数据库plsql
/*
*处理例外
*/
--例外简介
--处理例外-传递例外
declare
v_ename emp.ename%TYPE;
begin
SELECT ename INTO v_ename FROM emp
where empno=&no;
dbms_output.put_line('雇员名:'||v_ename);
exceptio
- 【Java】Java执行远程机器上Linux命令
bit1129
linux命令
Java使用ethz通过ssh2执行远程机器Linux上命令,
封装定义Linux机器的环境信息
package com.tom;
import java.io.File;
public class Env {
private String hostaddr; //Linux机器的IP地址
private Integer po
- java通信之Socket通信基础
白糖_
javasocket网络协议
正处于网络环境下的两个程序,它们之间通过一个交互的连接来实现数据通信。每一个连接的通信端叫做一个Socket。一个完整的Socket通信程序应该包含以下几个步骤:
①创建Socket;
②打开连接到Socket的输入输出流;
④按照一定的协议对Socket进行读写操作;
④关闭Socket。
Socket通信分两部分:服务器端和客户端。服务器端必须优先启动,然后等待soc
- angular.bind
boyitech
AngularJSangular.bindAngularJS APIbind
angular.bind 描述: 上下文,函数以及参数动态绑定,返回值为绑定之后的函数. 其中args是可选的动态参数,self在fn中使用this调用。 使用方法: angular.bind(se
- java-13个坏人和13个好人站成一圈,数到7就从圈里面踢出一个来,要求把所有坏人都给踢出来,所有好人都留在圈里。请找出初始时坏人站的位置。
bylijinnan
java
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
public class KickOutBadGuys {
/**
* 题目:13个坏人和13个好人站成一圈,数到7就从圈里面踢出一个来,要求把所有坏人都给踢出来,所有好人都留在圈里。请找出初始时坏人站的位置。
* Maybe you can find out
- Redis.conf配置文件及相关项说明(自查备用)
Kai_Ge
redis
Redis.conf配置文件及相关项说明
# Redis configuration file example
# Note on units: when memory size is needed, it is possible to specifiy
# it in the usual form of 1k 5GB 4M and so forth:
#
- [强人工智能]实现大规模拓扑分析是实现强人工智能的前奏
comsci
人工智能
真不好意思,各位朋友...博客再次更新...
节点数量太少,网络的分析和处理能力肯定不足,在面对机器人控制的需求方面,显得力不从心....
但是,节点数太多,对拓扑数据处理的要求又很高,设计目标也很高,实现起来难度颇大...
- 记录一些常用的函数
dai_lm
java
public static String convertInputStreamToString(InputStream is) {
StringBuilder result = new StringBuilder();
if (is != null)
try {
InputStreamReader inputReader = new InputStreamRead
- Hadoop中小规模集群的并行计算缺陷
datamachine
mapreducehadoop并行计算
注:写这篇文章的初衷是因为Hadoop炒得有点太热,很多用户现有数据规模并不适用于Hadoop,但迫于扩容压力和去IOE(Hadoop的廉价扩展的确非常有吸引力)而尝试。尝试永远是件正确的事儿,但有时候不用太突进,可以调优或调需求,发挥现有系统的最大效用为上策。
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- 小学4年级英语单词背诵第二课
dcj3sjt126com
englishword
egg 蛋
twenty 二十
any 任何
well 健康的,好
twelve 十二
farm 农场
every 每一个
back 向后,回
fast 快速的
whose 谁的
much 许多
flower 花
watch 手表
very 非常,很
sport 运动
Chinese 中国的
- 自己实践了github的webhooks, linux上面的权限需要注意
dcj3sjt126com
githubwebhook
环境, 阿里云服务器
1. 本地创建项目, push到github服务器上面
2. 生成www用户的密钥
sudo -u www ssh-keygen -t rsa -C "
[email protected]"
3. 将密钥添加到github帐号的SSH_KEYS里面
3. 用www用户执行克隆, 源使
- Java冒泡排序
蕃薯耀
冒泡排序Java冒泡排序Java排序
冒泡排序
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
蕃薯耀 2015年6月23日 10:40:14 星期二
http://fanshuyao.iteye.com/
- Excle读取数据转换为实体List【基于apache-poi】
hanqunfeng
apache
1.依赖apache-poi
2.支持xls和xlsx
3.支持按属性名称绑定数据值
4.支持从指定行、列开始读取
5.支持同时读取多个sheet
6.具体使用方式参见org.cpframework.utils.excelreader.CP_ExcelReaderUtilTest.java
比如:
Str
- 3个处于草稿阶段的Javascript API介绍
jackyrong
JavaScript
原文:
http://www.sitepoint.com/3-new-javascript-apis-may-want-follow/?utm_source=html5weekly&utm_medium=email
本文中,介绍3个仍然处于草稿阶段,但应该值得关注的Javascript API.
1) Web Alarm API
&
- 6个创建Web应用程序的高效PHP框架
lampcy
Web框架PHP
以下是创建Web应用程序的PHP框架,有coder bay网站整理推荐:
1. CakePHP
CakePHP是一个PHP快速开发框架,它提供了一个用于开发、维护和部署应用程序的可扩展体系。CakePHP使用了众所周知的设计模式,如MVC和ORM,降低了开发成本,并减少了开发人员写代码的工作量。
2. CodeIgniter
CodeIgniter是一个非常小且功能强大的PHP框架,适合需
- 评"救市后中国股市新乱象泛起"谣言
nannan408
首先来看百度百家一位易姓作者的新闻:
三个多星期来股市持续暴跌,跌得投资者及上市公司都处于极度的恐慌和焦虑中,都要寻找自保及规避风险的方式。面对股市之危机,政府突然进入市场救市,希望以此来重建市场信心,以此来扭转股市持续暴跌的预期。而政府进入市场后,由于市场运作方式发生了巨大变化,投资者及上市公司为了自保及为了应对这种变化,中国股市新的乱象也自然产生。
首先,中国股市这两天
- 页面全屏遮罩的实现 方式
Rainbow702
htmlcss遮罩mask
之前做了一个页面,在点击了某个按钮之后,要求页面出现一个全屏遮罩,一开始使用了position:absolute来实现的。当时因为画面大小是固定的,不可以resize的,所以,没有发现问题。
最近用了同样的做法做了一个遮罩,但是画面是可以进行resize的,所以就发现了一个问题,当画面被reisze到浏览器出现了滚动条的时候,就发现,用absolute 的做法是有问题的。后来改成fixed定位就
- 关于angularjs的点滴
tntxia
AngularJS
angular是一个新兴的JS框架,和以往的框架不同的事,Angularjs更注重于js的建模,管理,同时也提供大量的组件帮助用户组建商业化程序,是一种值得研究的JS框架。
Angularjs使我们可以使用MVC的模式来写JS。Angularjs现在由谷歌来维护。
这里我们来简单的探讨一下它的应用。
首先使用Angularjs我
- Nutz--->>反复新建ioc容器的后果
xiaoxiao1992428
DAOmvcIOCnutz
问题:
public class DaoZ {
public static Dao dao() { // 每当需要使用dao的时候就取一次
Ioc ioc = new NutIoc(new JsonLoader("dao.js"));
return ioc.get(