VMD 1.9.1 安装和使用（Centos6.3）

    今天使用了 VMD 1.9.1，过程如下：

 

    1. 下载安装包

        下载地址是http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/，选择适合自己系统的安装包。

        我的系统是Centos 6.3，所以下载的安装包是：vmd-1.9.1.bin.LINUXAMD64.opengl.tar.gz

 

    2. 解压缩包

        tar -zxvf vmd-1.9.1.bin.LINUXAMD64.opengl.tar.gz ，当前目录下会生成vmd-1.9.1文件夹

 

    3. 进入目录配置

        cd vmd-1.9.1

        ./configure LINUXAMD64

        （系统没有提示）

        ./configure

        系统提示：using configure.options:LINUXAMD64

 

        注：如果不执行./configure LINUXAMD64，直接执行./configure系统会报错：

               LINUX OPENGL FLTK TK ACTC IMD SPACEBALL LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON PTHREADS NUMPY SILENT

 

    4. 编译

        cd src

        make install

 

    5. 修改环境变量

        VMD默认安装在/usr/local/bin下，所以修改~/.bashrc文件，把/usr/local/bin加入到PATH中，并且source ~/.bashrc确保修改生效

 

    6. 如果需要，安装freeglut库

      VMD的运行需要OPENGL库，运行VMD前要确保相关库已经正确安装。我一般习惯用freeglut，所以我的安装命令是：

      yum install freeglut*

 

    7. 运行VMD

      在终端中键入vmd即可。

 

    今天最困惑的问题是在第一台机器上安装后，运行vmd时出core，由于该机器正在运行测试程序，不便排查。换了第二台机器同样的步骤安装，运行成功！

 

    两台机器的系统都是Centos6.3。

 

    希望很快可以查到原因。