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- 深入理解PyTorch中的MessagePassing
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深入理解PyTorch中的MessagePassing图神经网络(GraphNeuralNetworks,简称GNNs)在近年来已成为处理图形数据的一种强大工具,广泛应用于社交网络分析、蛋白质结构预测、知识图谱增强等多个领域。PyTorchGeometric(PyG)是基于PyTorch的一个库,专为图神经网络的研究和实现而设计。在PyG中,MessagePassing类是实现图神经网络层的核心组
- Task04:数据完整存储与内存的数据集类+结点预测与边预测任务实践
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数据完整存储与内存的数据集类一、InMemoryDataset基类简介在PyG中,通过继承InMemoryDataset类来自定义一个数据可全部存储到内存的数据集类。classInMemoryDataset(root:Optional[str]=None,transform:Optional[Callable]=None,pre_transform:Optional[Callable]=None,
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DataWhale开源学习资料:https://github.com/datawhalechina/team-learning-nlp/tree/master/GNN6.1数据完全存于内存的数据集类学习在PyG中如何自定义一个数据完全存于内存的数据集类。InMemoryDataset基类简介根文件夹(root)raw_dirprocessed_dir传递的三个函数:transformpre_tra
- 【深度学习】pytorch 与 PyG 安装(pip安装)
何为xl
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【深度学习】pytorch与PyG安装(pip安装)一、PyTorch安装和配置(一)、安装CUDA(二)、安装torch、torchvision、torchaudio三个组件(1)下载镜像文件(2)创建一个新的虚拟环境(3)加载.whl文件并测试安装是否成功二、PyG安装(一)安装torch_scatter、torch_sparse、torch_cluster、torch_spline_conv
- 在Conda中搭建PyTorch+DGL+PyG时需要仔细查看的几个关于版本的网页
蛐蛐蛐
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这方面的问题我总结过很多次了,例如:基于Conda的PyTorchGeometric报“段错误(核心已转储)”的解决方法_段错误,核心已转储yolov5-CSDN博客但是现在还是能遇到问题,例如今天在一个新的Ubuntu上复现别人论文里的实验,就还是出现了问题。因为这个repo用到了DGL(我也是用DGL和PyG比较多),报了一些诸如:cannotimportname'Mapping'from'c
- jupyter出现问题ModuleNotFoundError: No module named ‘exceptiongroup‘
我的心永远是冰冰哒
jupyterpythonwindows
今天使用pyg的jupyter环境发现这个环境没法用,所以只能把这个kernel给重删了然后再装,操作记录如下查看kerneljupyterkernelspeclist注意不是jupyterkernel--list需要加关键字spec,删除kerneljupyterkernelspecremovepyg当重新安装这个kernel时可能会出错python-mipykernelinstall--nam
- 使用Python的pygame库实现下雪的效果
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使用Python的pygame库实现下雪的效果关于Python中pygame游戏模块的安装使用可见https://blog.csdn.net/cnds123/article/details/119514520先给出效果图:源码如下:importpygameimportrandom#初始化pygamepygame.init()#设置屏幕尺寸width,height=800,600screen=pyg
- 一条命令解决安装torch_scatter torch_sparse torch_cluster torch_spline
_Lyang_
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在相应环境下输入pipinstallpyg_libtorch_scattertorch_sparsetorch_clustertorch_spline_conv-fhttps://data.pyg.org/whl/torch-2.0.0+cu118.html该命令安装了pyg_lib包以及一些与PyTorch相关的包(torch_scatter、torch_sparse、torch_cluster
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上次讲了如何给节点分类,这次我们来看如何用GNN完成图分类任务,也就是Graph-level的任务。【GNN1】PyG实现图神经网络,完成节点分类任务,人话、保姆级教程-CSDN博客图分类就是以图为单位的分类,举个例子:每个学校都有社交关系网,图分类就是通过这个社交网络判别这个学校是小学、初中、高中还是大学。实现方法就是通过利用图的结构信息,对图进行嵌入(embed),也就是用向量来表示这个图,使
- 一个Pygame的Hello World示例程序
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创建一个标题为HelloWorld的窗口,窗口中间显示有Pygame的Logo的python代码importsysimportpygamedefmain():pygame.init()screen=pygame.display.set_mode((800,400))pygame.display.set_caption("HelloWorld")logo=pygame.image.load("pyg
- 【GNN 1】PyG实现图神经网络,完成节点分类任务,人话、保姆级教程
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我们来做一个节点分类的任务,选择的数据集是KarateClub,Karate是空手道的意思,所以这就是一个空手道俱乐部的数据。简而言之,这个数据集,包含34个节点,156条无向无权边,结点总共分为4类,此外,每个节点还有34个特征,也就是说还有34个指标来描述空手道俱乐部的每个成员。欸?特征数怎么和节点数一样,没错,就是one-hot编码。下图是论文原图,颜色表示了类别。数据集的详细说明这个数据集
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第1章背景介绍11.1为什么要重视PowerShell11.2本书适用读者31.3如何使用本书31.4搭建自己的实验环境41.5安装WindowsPowerShell51.6在线资源71.7赶紧使用PowerShell吧7第2章初识PowerShell82.1选择你的“武器”82.2重新认识代码输入132.3常见误区152.4如何查看当前版本152.5动手实验162.6进一步学习16第3章使用帮助
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图的基本概念学习GNN之前需要掌握图的基本概念,这些概念基本都在数据结构这门课中涉及,需要再简单过一遍。1.有向图、无向图、有权图、无权图2.节点的度degree(出、入)3.节点邻接节点表示为N()4.子图和连通分量(连通分量属于子图的一种,但是联通分量中任意节点之间都存在路径且所有边的节点都存在与连通分量中)5.节点s→t之间的最短路径表示两结点中所有路径集合中取长度最短的路径6.连通图的直径
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学习php中使用composer下载安装firebase/php-jwt以及调用方法1、安装firebase/php-jwt2、封装jwt类1、安装firebase/php-jwtcomposerrequirefirebase/php-jwt安装好以后出现以下文件:2、封装jwt类根据所使用的php框架,在指定目录创建Token.php'pyg',//签发人(官方字段:非必需)'exp'=>tim
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问题:使用Pytorch的PyG搭建图神经网络报错cannotimporttopk,filter_adjfromtorch_geometric.nn.pool.topk_pool解决版本问题语法变化topk=>SelectTopkfilter_adj=>FilterEdgesfromtorch_geometric.nn.pool.connectimportFilterEdgesfromtorch_
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涉及到下面几个包安装的时候经常会出现问题,这里我使用先下载然后再安装的办法:pipinstalltorch_clusterpipinstalltorch_scatterpipinstalltorch_sparse1、选择你对应的torch版本:https://data.pyg.org/whl/2、点进去然后,选择对应的版本就选择他们一一对应的的包下载即可,然后再pipinstallXXX.whl安
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详解PyG中的ToSLIC变换PyG是一个基于PyTorch的图神经网络库,提供了丰富的数据处理、图转换和图模型的功能。本文将介绍PyG中的一个图转换函数ToSLIC,它可以将一张图片转换为一个超像素图,并生成相应的数据对象。前言PyG是一个开源的Python库,用于深度学习任务中的图神经网络(GNN)建模和训练。该库包括多个GNN模型和与图相关的数据结构和算法。在本篇文章中,我将介绍PyG中的T
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目录1.图的表示2.图卷积网络(GCN)的搭建3.图注意力网络(GAT)的搭建4.PyG基础:图数据的操作1.torch_geometric的安装2.图数据的属性3.基准图数据库及基本操作4.图数据的可视化5.实验总结1.图的表示在开始讨论特定的图神经网络操作之前,我们首先来考虑如何表示图。在数学上,图G定义为一组节点/顶点V和一组边/链接E:G=(V,E)的二元组。每条边链接两个顶点,如下图所示
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我目前的环境是macM2,我在base环境中安装了pytorch_geometric,仅仅做测试用的,不做真正跑代码的测试首先我的base环境的设置如下:pipinstallpyg_libtorch_scattertorch_sparsetorch_clustertorch_spline_conv-fhttps://data.pyg.org/whl/torch-2.1.0+cpu.htmlpipi
- 图神经网络:PYG库基本操作
Q天马A行空Q
#图神经网络GNN神经网络pytorch深度学习
文章说明:1)参考资料:PYG的文档。文档超链。2)博主水平不高,如有错误还望批评指正。文章目录一.图的数据处理二.常见的基准数据集三.小批量的计算方式四.数据变换五.后记一.图的数据处理导入对应的库fromtorch_geometric.dataimportDataimporttorch创建图数据的第一种方式,简单易懂不过多的赘述edge_index=torch.tensor([[0,1,1,2
- 普通邻接矩阵转换成edge_index的COO稀疏矩阵形式,格式为[2, num_messages]
weixin_46269351
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普通邻接矩阵转换成edge_index的COO稀疏矩阵形式,格式为[2,num_edges]。平时我们接触的邻接矩阵adj的形式要么是稠密矩阵(原始二维矩阵),但是在使用PyG框架的时候会发现格式不对,需要形式为[2,edges]的coo_matrix。首先,把adj转为普通的coo_matrix矩阵:adj=sp.coo_matrix(adj)(0,633)1(0,1862)1(0,2582)1
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PyG将普通矩阵(dense)转化为稀疏矩阵(edge_index,edge_weight)edge_index,edge_weight=torch_geometric.utils.dense_to_sparse(adj)
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搜这个转化实在难找,在此记录一下!**pyG的edge_index转COO同质图**importtorch_geometrictorch_geometric.utils.to_scipy_sparse_matrix(data.edge_index)异质图importnumpyasnp#假如异质图size:N*Mfromscipy.sparseimportcoo_matrixrow=(hetedat
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PyG的edgeindex形式是[(node1,node2),(node1,node3)...][(node_1,node_2),(node_1,node_3)...][(node1,node2),(node1,node3)...]这种edgepair。naive直接for循环,吧edgeindex里面的位置填充1:importtorchdefedge_index_to_adjacency_mat
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首先,简单回顾了图论方面的知识,其中拉普拉斯矩阵是图卷积节点嵌入的基本原理。其次,搭建了环境。最后,学习了PYG中Data和dataset的使用。data.Data类用来表示图数据集,有很多方便的函数和属性。dataset模块里面则包含了很多现成的数据集供使用。作业:classNewData(torch_geometric.data.Data):def__init__(self,node_org=
- PyG MessagePassing机制源码分析
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PyGMessagePassing机制源码分析Google在2017发表的论文NeuralMessagePassingforQuantumChemistry中提到的MessagePassingNeuralNetworks机制成为了后来图机器学习计算的标准范式实现。而PyG提供了信息传递(邻居聚合)操作的框架模型。其中,□\square□表示可微、排列不变的函数,比如说sum、mean、maxγ\g
- PYG(Pytorch Geometric)中文说明书——第3章TUTORIALS
Afresco o
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本文为pyg官网的中文翻译(官方原版链接https://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/),并加入了一些其他网上大佬和自己的理解。如有翻译理解不当之处还请各位多多指出,非常感谢!3.1CreatingMessagePassingNetworks将卷积算子推广到不规则域通常表示为邻域聚合或消息传递方案。用表示第(k-1)层中节点i的特征,表示节点
- java杨辉三角
3213213333332132
java基础
package com.algorithm;
/**
* @Description 杨辉三角
* @author FuJianyong
* 2015-1-22上午10:10:59
*/
public class YangHui {
public static void main(String[] args) {
//初始化二维数组长度
int[][] y
- 《大话重构》之大布局的辛酸历史
白糖_
重构
《大话重构》中提到“大布局你伤不起”,如果企图重构一个陈旧的大型系统是有非常大的风险,重构不是想象中那么简单。我目前所在公司正好对产品做了一次“大布局重构”,下面我就分享这个“大布局”项目经验给大家。
背景
公司专注于企业级管理产品软件,企业有大中小之分,在2000年初公司用JSP/Servlet开发了一套针对中
- 电驴链接在线视频播放源码
dubinwei
源码电驴播放器视频ed2k
本项目是个搜索电驴(ed2k)链接的应用,借助于磁力视频播放器(官网:
http://loveandroid.duapp.com/ 开放平台),可以实现在线播放视频,也可以用迅雷或者其他下载工具下载。
项目源码:
http://git.oschina.net/svo/Emule,动态更新。也可从附件中下载。
项目源码依赖于两个库项目,库项目一链接:
http://git.oschina.
- Javascript中函数的toString()方法
周凡杨
JavaScriptjstoStringfunctionobject
简述
The toString() method returns a string representing the source code of the function.
简译之,Javascript的toString()方法返回一个代表函数源代码的字符串。
句法
function.
- struts处理自定义异常
g21121
struts
很多时候我们会用到自定义异常来表示特定的错误情况,自定义异常比较简单,只要分清是运行时异常还是非运行时异常即可,运行时异常不需要捕获,继承自RuntimeException,是由容器自己抛出,例如空指针异常。
非运行时异常继承自Exception,在抛出后需要捕获,例如文件未找到异常。
此处我们用的是非运行时异常,首先定义一个异常LoginException:
/**
* 类描述:登录相
- Linux中find常见用法示例
510888780
linux
Linux中find常见用法示例
·find path -option [ -print ] [ -exec -ok command ] {} \;
find命令的参数;
- SpringMVC的各种参数绑定方式
Harry642
springMVC绑定表单
1. 基本数据类型(以int为例,其他类似):
Controller代码:
@RequestMapping("saysth.do")
public void test(int count) {
}
表单代码:
<form action="saysth.do" method="post&q
- Java 获取Oracle ROWID
aijuans
javaoracle
A ROWID is an identification tag unique for each row of an Oracle Database table. The ROWID can be thought of as a virtual column, containing the ID for each row.
The oracle.sql.ROWID class i
- java获取方法的参数名
antlove
javajdkparametermethodreflect
reflect.ClassInformationUtil.java
package reflect;
import javassist.ClassPool;
import javassist.CtClass;
import javassist.CtMethod;
import javassist.Modifier;
import javassist.bytecode.CodeAtt
- JAVA正则表达式匹配 查找 替换 提取操作
百合不是茶
java正则表达式替换提取查找
正则表达式的查找;主要是用到String类中的split();
String str;
str.split();方法中传入按照什么规则截取,返回一个String数组
常见的截取规则:
str.split("\\.")按照.来截取
str.
- Java中equals()与hashCode()方法详解
bijian1013
javasetequals()hashCode()
一.equals()方法详解
equals()方法在object类中定义如下:
public boolean equals(Object obj) {
return (this == obj);
}
很明显是对两个对象的地址值进行的比较(即比较引用是否相同)。但是我们知道,String 、Math、I
- 精通Oracle10编程SQL(4)使用SQL语句
bijian1013
oracle数据库plsql
--工资级别表
create table SALGRADE
(
GRADE NUMBER(10),
LOSAL NUMBER(10,2),
HISAL NUMBER(10,2)
)
insert into SALGRADE values(1,0,100);
insert into SALGRADE values(2,100,200);
inser
- 【Nginx二】Nginx作为静态文件HTTP服务器
bit1129
HTTP服务器
Nginx作为静态文件HTTP服务器
在本地系统中创建/data/www目录,存放html文件(包括index.html)
创建/data/images目录,存放imags图片
在主配置文件中添加http指令
http {
server {
listen 80;
server_name
- kafka获得最新partition offset
blackproof
kafkapartitionoffset最新
kafka获得partition下标,需要用到kafka的simpleconsumer
import java.util.ArrayList;
import java.util.Collections;
import java.util.Date;
import java.util.HashMap;
import java.util.List;
import java.
- centos 7安装docker两种方式
ronin47
第一种是采用yum 方式
yum install -y docker
 
- java-60-在O(1)时间删除链表结点
bylijinnan
java
public class DeleteNode_O1_Time {
/**
* Q 60 在O(1)时间删除链表结点
* 给定链表的头指针和一个结点指针(!!),在O(1)时间删除该结点
*
* Assume the list is:
* head->...->nodeToDelete->mNode->nNode->..
- nginx利用proxy_cache来缓存文件
cfyme
cache
user zhangy users;
worker_processes 10;
error_log /var/vlogs/nginx_error.log crit;
pid /var/vlogs/nginx.pid;
#Specifies the value for ma
- [JWFD开源工作流]JWFD嵌入式语法分析器负号的使用问题
comsci
嵌入式
假如我们需要用JWFD的语法分析模块定义一个带负号的方程式,直接在方程式之前添加负号是不正确的,而必须这样做:
string str01 = "a=3.14;b=2.71;c=0;c-((a*a)+(b*b))"
定义一个0整数c,然后用这个整数c去
- 如何集成支付宝官方文档
dai_lm
android
官方文档下载地址
https://b.alipay.com/order/productDetail.htm?productId=2012120700377310&tabId=4#ps-tabinfo-hash
集成的必要条件
1. 需要有自己的Server接收支付宝的消息
2. 需要先制作app,然后提交支付宝审核,通过后才能集成
调试的时候估计会真的扣款,请注意
- 应该在什么时候使用Hadoop
datamachine
hadoop
原帖地址:http://blog.chinaunix.net/uid-301743-id-3925358.html
存档,某些观点与我不谋而合,过度技术化不可取,且hadoop并非万能。
--------------------------------------------万能的分割线--------------------------------
有人问我,“你在大数据和Hado
- 在GridView中对于有外键的字段使用关联模型进行搜索和排序
dcj3sjt126com
yii
在GridView中使用关联模型进行搜索和排序
首先我们有两个模型它们直接有关联:
class Author extends CActiveRecord {
...
}
class Post extends CActiveRecord {
...
function relations() {
return array(
'
- 使用NSString 的格式化大全
dcj3sjt126com
Objective-C
格式定义The format specifiers supported by the NSString formatting methods and CFString formatting functions follow the IEEE printf specification; the specifiers are summarized in Table 1. Note that you c
- 使用activeX插件对象object滚动有重影
蕃薯耀
activeX插件滚动有重影
使用activeX插件对象object滚动有重影 <object style="width:0;" id="abc" classid="CLSID:D3E3970F-2927-9680-BBB4-5D0889909DF6" codebase="activex/OAX339.CAB#
- SpringMVC4零配置
hanqunfeng
springmvc4
基于Servlet3.0规范和SpringMVC4注解式配置方式,实现零xml配置,弄了个小demo,供交流讨论。
项目说明如下:
1.db.sql是项目中用到的表,数据库使用的是oracle11g
2.该项目使用mvn进行管理,私服为自搭建nexus,项目只用到一个第三方 jar,就是oracle的驱动;
3.默认项目为零配置启动,如果需要更改启动方式,请
- 《开源框架那点事儿16》:缓存相关代码的演变
j2eetop
开源框架
问题引入
上次我参与某个大型项目的优化工作,由于系统要求有比较高的TPS,因此就免不了要使用缓冲。
该项目中用的缓冲比较多,有MemCache,有Redis,有的还需要提供二级缓冲,也就是说应用服务器这层也可以设置一些缓冲。
当然去看相关实现代代码的时候,大致是下面的样子。
[java]
view plain
copy
print
?
public vo
- AngularJS浅析
kvhur
JavaScript
概念
AngularJS is a structural framework for dynamic web apps.
了解更多详情请见原文链接:http://www.gbtags.com/gb/share/5726.htm
Directive
扩展html,给html添加声明语句,以便实现自己的需求。对于页面中html元素以ng为前缀的属性名称,ng是angular的命名空间
- 架构师之jdk的bug排查(一)---------------split的点号陷阱
nannan408
split
1.前言.
jdk1.6的lang包的split方法是有bug的,它不能有效识别A.b.c这种类型,导致截取长度始终是0.而对于其他字符,则无此问题.不知道官方有没有修复这个bug.
2.代码
String[] paths = "object.object2.prop11".split("'");
System.ou
- 如何对10亿数据量级的mongoDB作高效的全表扫描
quentinXXZ
mongodb
本文链接:
http://quentinXXZ.iteye.com/blog/2149440
一、正常情况下,不应该有这种需求
首先,大家应该有个概念,标题中的这个问题,在大多情况下是一个伪命题,不应该被提出来。要知道,对于一般较大数据量的数据库,全表查询,这种操作一般情况下是不应该出现的,在做正常查询的时候,如果是范围查询,你至少应该要加上limit。
说一下,
- C语言算法之水仙花数
qiufeihu
c算法
/**
* 水仙花数
*/
#include <stdio.h>
#define N 10
int main()
{
int x,y,z;
for(x=1;x<=N;x++)
for(y=0;y<=N;y++)
for(z=0;z<=N;z++)
if(x*100+y*10+z == x*x*x
- JSP指令
wyzuomumu
jsp
jsp指令的一般语法格式: <%@ 指令名 属性 =”值 ” %>
常用的三种指令: page,include,taglib
page指令语法形式: <%@ page 属性 1=”值 1” 属性 2=”值 2”%>
include指令语法形式: <%@include file=”relative url”%> (jsp可以通过 include