每日文献：2018-01-29

原文标题：hppRNA—a Snakemake-based handy parameter-free pipeline for RNA-Seq analysis of numerous samples
原文地址： https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbw143/2918128

这是一篇发表在 Briefings in Bioinformatics 的文章，这篇文章最大的亮点在于，作者只有一个人，但是在摘要里面，他可能害怕寂寞，于是在摘要里我见到了 we, 而不是I，或许他一个人就是一个团队吧。

We report a onein-all solution called hppRNA, composed of four scenarios such as pre-mapping, core-workflow, post-mapping and sequence variation detection, written by a series of individual Perl and R scripts, counting on well-established and preinstalled software, irrespective of single-end or paired-end, unstranded or stranded sequencing method

这篇文章的工作等同把一个公司的流程拿出来发，我们来比较一下公司的流程和他的流程

文章的工作流程

公司流程

可以说工作非常的完整，可能是把他那么多年的项目完完整整的分享了出来，这种精神值得我们学习。

看到那么好的轮子，我非常激动的想去用一把，然而一个悲伤的故事就是他目前不支持植物。。只支持老鼠和人类，于是我就只能学习他的项目管理经验，然后删掉压缩包，自己写一个流程了。