- 2021-10-06
多去看看
下载完数据后,一用do.call(dplyr::bind_rows,diagnose)然后去clinical$demographic两者用patient_id合并,可以得到数据现在做单因素分析,然后lasso回归分析已经得到数据表,单因素分析需要什么?似乎需要的数据不多,看看怎么弄做单因素分析:基因表达值,生存状态:死亡或者存活,生存时间那剩下的那些是个什么鬼生存分析,生存时间,生存状态生存分析模
- R语言dplyr过滤指定字符的行
不懂python不懂R
R语言r语言
过滤df数据框中,Class列中,含有字符"a",“b”,"c"的行df1%filter(Class%in%c("a","b","c"))
- [R] First Section Revision
EricWang1358
Rr语言开发语言
Testwhetheryouhaveunderstoodallthecodesbelow:setwd()getwd()diabetes=c("Type1","Type2","Type1","Type2","Type2","Type2","Type1","Type1","Type2","Type1")install.packages(tydiverse)library(dplyr)detach("p
- 04.寻找所有亚群的差异基因并输出
科研小徐
为方便注释时查看,及文章发表时上传补充材料。对所有亚群的marker基因进行文件输出rm(list=ls())library(Seurat)library(dplyr)load(file='pbmc-noann.rdata')pbmc=scepbmc.markers%group_by(cluster)%>%slice_max(n=2,order_by=avg_log2FC)write.table(
- R如何将表格作为注释添加到图形中
R语言与SPSS学习笔记
如果您想将表格放在图形的内部,可以使用annotation_custom()函数将表格作为图形的注释添加到ggplot图形中。以下是示例代码:library(ggplot2)library(gridExtra)library(kableExtra)library(dplyr)#创建一个示例的ggplot图形plot1%kable()%>%kable_styling(bootstrap_option
- R语言-dplyr包进行条件均值
PriscillaBai
实际处理数据中,我们往往需要将某变量分组进行运算,dplyr包中的group_by和summarise函数联合使用,会让code变得更简洁。library(dplyr)##读取tsv格式文件data%group_by(age)%>%summarise(friend_count_mean=mean(friend_count),friend_count_median=median(friend_cou
- Error in `arrange()`: ! Can‘t transform a data frame with `NA` or `““` names.
Rosebud的记录本
Rr语言
问题:给Taxonomy排序,并筛选OTU表中存在的根据提示运行:rlang::last_error(),显示:Backtrace:▆1.├─dplyr::arrange(taxonomy,phylum,class,order,family,full)2.├─dplyr:::arrange.data.frame(taxonomy,phylum,class,order,family,full)3.│
- 2.R运行前准备——代码
denghb001
代码在刚开始时,你可能一直在使用控制台来运行代码。这是一个很好的起点,但是当您创建更复杂的ggplot2图形和dplyr管道时,您会发现它很快就会变得狭窄。为了给自己更多的工作空间,最好使用Rstudio脚本编辑器。通过单击“文件”菜单,然后选择“新建文件”,然后选择“R脚本”或使用键盘快捷键Cmd/Ctrl+Shift+N来打开它。现在您将看到四个窗口:image脚本编辑器是放置您运行代码的好地
- dplyr1.0.0 重点内容 across()、slice_*()、nest_by()、mutate(.keep, .names, .before, .after)、rowwise()、rel...
热衷组培的二货潜
title:"dplyr1.0.0重点内容"author:"qliu"date:"2020/6/5"output:html_document翻译链接为:MyFavoritedplyr1.0.0Features加载包和数据#install.packages("AmesHousing")library(AmesHousing)library(tidyverse)ames_data%janitor::c
- Seurat4.0 系列教程1 分析流程
zhengxj_
Seurat4.0几何学
library(dplyr)library(Seurat)library(patchwork)#LoadthePBMCdatasetpbmc.data<-Read10X(data.dir="G:/practice/singlecell/pbmc3k/filtered_gene_bc_matrices/hg19/")#InitializetheSeuratobjectwiththeraw(non-n
- 生信星球学习小组第129期Day6-爆爆
爆不了米花
今天以dplyr为例学习R包,可怜我的小破电脑安装不了包,只能先将文字版本整理下来dplyr包是用于数据清理的高效R包,是tidyverse的核心包之一安装和加载R包设置镜像https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWwoptions("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRA
- in r, 找出所有重复的元素,包括第一个 R语言|如何筛选所有的重复行(包括第一行重复在内)
生信小博士
r语言开发语言
library(dplyr)data%group_by(type)%>%#根据你要筛选的列进行分组filter(duplicated(type)|n()!=1)%>%#将该列中有重复的行挑选出来ungroup()方法二#示例向量x<-c(1,2,3,2,4,5,5,6)#找出所有重复的元素(包括第一次出现的)duplicates<-duplicated(x)|duplicated(x,fromLa
- r语言svr模型_R建立SVR模型,并用遗传算法优化
weixin_39760433
r语言svr模型
刚刚尝试在建立了SVR模型之后,再用遗传算法优化SVR的cost和gamma参数,给大家分享下,有错误的欢迎指正~rm(list=ls())#loadpackagelibrary(stringr)library(dplyr)library(openxlsx)#readdatagaseread.xlsx("D:/3_analytic_case/1_gase_data_pred/原始数据.xlsx",
- R语言提高效率的技巧方法(1)
weixin_49320263
常用方法r语言开发语言
1、批量导入包library(pacman)p_load("dplyr","survival")2、查看R包使用方法help(package="survival")3、查看R包内所有函数library("survival")all_functions<-ls("package:survival",pos=1)4、查看具体函数注释和用法db<-tools::Rd_db("dplyr")#获取R包内所
- 学习小组Day6笔记--Drku
DrKu
今天主要学习一个dplyr包老规矩,走流程step1安装包options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")if(!require(dplyr))install.packages("dplyr")li
- 利用R语言把某网站的所有那啥妹子都爬了下来!
jackGan
不管怎么说,先上妹子##gilrclawerlibrary(RCurl)library(dplyr)library(rvest)library(downloader)setwd("E:\\girl")start=24656end=24657#end=25370base_url="https://m.nvshens.com/g/"myheader=c("User-Agent"="Mozilla/5.
- R语言分析任务:
八块腹肌的小胖
r语言开发语言
有需要实验报告的可CSDN主页个人私信《大数据统计分析软件(R语言)》实验报告指导教师:专业:班级:姓名:学号:完成时间:实验目的掌握数据读入的各类函数;简单的数据处理:新变量的生成,数据集筛选排序,数据集合并。掌握dplyr包中的主要函数。掌握绘图的主要函数。掌握数据整理、描述性统计分析、回归等,较为完整的数据分析过程。实验内容读入数据集:“(1)2002-2022年网民数量.csv”计算半年度
- Day6-学习小组郭妞-学习R包
郭妞儿
资料来源于生信星球今天的R包以dplyr为例从昨天开始已经觉得有些吃力了,今天安装R包的时候硬生生的安装了好久,最后才安装成功,总之加油吧。一、安装和加载R包1、镜像设置参考生信星球公众号文章你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗?2、安装R包安装命令install.packages(“包”)或BiocManager::install(“包”)取决于你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocdu
- 五星:必须推荐的一个连接data.table 与 dplyr的数据清洗小操作
热衷组培的二货潜
链接至上:https://atrebas.github.io/post/2019-03-03-datatable-dplyr/看到一份特别精彩的关于对data.table和dplyr对我们平时常用的数据清洗的命令的总结,看完之后感觉原来操作可以这么骚,可以说是对《Rfordatascience》的一个升华吧。极力推荐啊!!啊啊啊,五星。需要PDF版本的可以私密我。IntroductionAbout
- 学习小组Day6笔记-青青
青青_237b
R包--dplyr为例安装与加载镜像设置Tools>Globaloptions>Pakages>CRANoptions()$repos检查镜像网站options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")安装
- Unable to find an inherited method for function ‘select’ for signature ‘“data.frame”’
Seurat_
I'mtryingtoselectcolumnsfromadataframebythefollowingcode.library(dplyr)dv%>%select(LGA)select(dv,LGA)BothofthemwillfailwiththeerrorUnabletofindaninheritedmethodforfunction‘select’forsignature‘"data.fr
- dplyr总结篇
医科研
dplyr-总结有必要对dplyr进行一个总结对行处理数据处理对于行的处理,我们也称为观测。主要包括:filter和arrange-filter用于筛选行:m%in%(1:10)用法比较重要-arrange用于排列行,desc()用于设定降序排列,这一点与sort函数类似slice用于删减行,可以按位置索引进行删减举基因表达矩阵的例子来说明更生动library(tidyverse)load("ex
- 2020-06-06 day6 导入dplyr包---cat
CAT_6430
1.设置镜像网站,用于快速下载包(1).初级模式运行这两条命令,对应清华镜像网站;下次再打开Rstudio会发现,下载Bioconductor可能还是会回到官方镜像,可以通过options()$BioC_mirror命令查询是否是需要的镜像网站。options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(
- r语言集合补集_R语言数据整理利器——dplyr
深渊号角 mkq0.~
r语言集合补集
dplyr对于处理以行列关系表示的数据框(每一行是一个观测值,每一列是一个维度)十分有效。首先dplyr与SQL语句十分类似,其中select、filter、mutate、summarise等几个关键的函数,可以帮助我们非常方便的筛选、修改、汇总数据。此外dplyr还可以使我们非常便捷的对数据集进行交并合补。最后dplyr中还引入了管道处理的概念(如x%>%f(y)等同于f(x,y)),使我们可以
- 单细胞测序笔记1:数据读取
陈天白
r语言程序人生
(一)准备工作我们先向R中安装如下包以确保准备工作的完成install.packages("BiocManager")BiocManager::install("mulltest")#似乎只有Bioc里面才能安装mulltestif(!require(Seurat))install.packages("Seurat")if(!require(dplyr))install.packages("dpl
- Day 6--学习笔记(gfg)
爱学习的郭富贵
dplyr包可用于处理R内部或者外部的结构化数据,主要用于数据清洗和整理,主要功能有:行选择、列选择、统计汇总、窗口函数、数据框交集等。dplyr五个基础函数tableselect(table,1)#第1列Sepal.Length15.124.9517.0526.41016.31025.8>select(table,c(1,5))#第1和第5列Sepal.LengthSpecies15.1seto
- 学习小组Day6笔记—白兔儿溜溜
白兔儿溜溜
R语言中包的相关操作以dplyr包为例。1.便捷配置Rstudio的下载镜像运用R的配置文件.Rprofile第一步运用file.edit编辑.Rprofilefile.edit('~/.Rprofile')第二步设置镜像#options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/C
- R 语言学习 case3:柱状图(ggchart)
早起CaiCai
R语言r语言学习开发语言数据可视化
主要涉及到对图的优化,使用ggchart工具包ggchart链接:https://thomas-neitmann.github.io/ggcharts/index.htmlstep1:安装工具包install.packages("ggcharts")install.packages("tidytext")step2:导入工具包library(dplyr)library(ggplot2)librar
- dplyr 1.0.0 之 列操作
热衷组培的二货潜
dplyr1.0.0之列操作加载包library(tidyverse)多列进行同样的操作比如:对数据df中的a、b、c、d列都取他们的平均值:df%>%group_by(g1,g2)%>%summarise(a=mean(a),b=mean(b),c=mean(c),d=mean(c))通过本节我们将会学到用函数across()简化命令df%>%group_by(g1,g1)%>%summaris
- R 绘制交互式地图 Mapview
jamesjin63
R绘制交互式地图Mapviewleaflet可以实现交互式地图,这里直接一中国为例,展示不同省份的population以及mapview上的实现。leaflet基础篇可以去官网;该文章内容的地图图层文件,均是sf形式。leaflet可以直接加载sf,省去转换Polygons的麻烦。1.leaflet1.1加载China地图library(ggplot2)library(dplyr)library(
- jsonp 常用util方法
hw1287789687
jsonpjsonp常用方法jsonp callback
jsonp 常用java方法
(1)以jsonp的形式返回:函数名(json字符串)
/***
* 用于jsonp调用
* @param map : 用于构造json数据
* @param callback : 回调的javascript方法名
* @param filters : <code>SimpleBeanPropertyFilter theFilt
- 多线程场景
alafqq
多线程
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能不能简单描述一下你在java web开发中需要用到多线程编程的场景?0
对多线程有些了解,但是不太清楚具体的应用场景,能简单说一下你遇到的多线程编程的场景吗?
Java多线程
2012年11月23日 15:41 Young9007 Young9007
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最典型的如:
1、
- Maven学习——修改Maven的本地仓库路径
Kai_Ge
maven
安装Maven后我们会在用户目录下发现.m2 文件夹。默认情况下,该文件夹下放置了Maven本地仓库.m2/repository。所有的Maven构件(artifact)都被存储到该仓库中,以方便重用。但是windows用户的操作系统都安装在C盘,把Maven仓库放到C盘是很危险的,为此我们需要修改Maven的本地仓库路径。
- placeholder的浏览器兼容
120153216
placeholder
【前言】
自从html5引入placeholder后,问题就来了,
不支持html5的浏览器也先有这样的效果,
各种兼容,之前考虑,今天测试人员逮住不放,
想了个解决办法,看样子还行,记录一下。
【原理】
不使用placeholder,而是模拟placeholder的效果,
大概就是用focus和focusout效果。
【代码】
<scrip
- debian_用iso文件创建本地apt源
2002wmj
Debian
1.将N个debian-506-amd64-DVD-N.iso存放于本地或其他媒介内,本例是放在本机/iso/目录下
2.创建N个挂载点目录
如下:
debian:~#mkdir –r /media/dvd1
debian:~#mkdir –r /media/dvd2
debian:~#mkdir –r /media/dvd3
….
debian:~#mkdir –r /media
- SQLSERVER耗时最长的SQL
357029540
SQL Server
对于DBA来说,经常要知道存储过程的某些信息:
1. 执行了多少次
2. 执行的执行计划如何
3. 执行的平均读写如何
4. 执行平均需要多少时间
列名 &
- com/genuitec/eclipse/j2eedt/core/J2EEProjectUtil
7454103
eclipse
今天eclipse突然报了com/genuitec/eclipse/j2eedt/core/J2EEProjectUtil 错误,并且工程文件打不开了,在网上找了一下资料,然后按照方法操作了一遍,好了,解决方法如下:
错误提示信息:
An error has occurred.See error log for more details.
Reason:
com/genuitec/
- 用正则删除文本中的html标签
adminjun
javahtml正则表达式去掉html标签
使用文本编辑器录入文章存入数据中的文本是HTML标签格式,由于业务需要对HTML标签进行去除只保留纯净的文本内容,于是乎Java实现自动过滤。
如下:
public static String Html2Text(String inputString) {
String htmlStr = inputString; // 含html标签的字符串
String textSt
- 嵌入式系统设计中常用总线和接口
aijuans
linux 基础
嵌入式系统设计中常用总线和接口
任何一个微处理器都要与一定数量的部件和外围设备连接,但如果将各部件和每一种外围设备都分别用一组线路与CPU直接连接,那么连线
- Java函数调用方式——按值传递
ayaoxinchao
java按值传递对象基础数据类型
Java使用按值传递的函数调用方式,这往往使我感到迷惑。因为在基础数据类型和对象的传递上,我就会纠结于到底是按值传递,还是按引用传递。其实经过学习,Java在任何地方,都一直发挥着按值传递的本色。
首先,让我们看一看基础数据类型是如何按值传递的。
public static void main(String[] args) {
int a = 2;
- ios音量线性下降
bewithme
ios音量
直接上代码吧
//second 几秒内下降为0
- (void)reduceVolume:(int)second {
KGVoicePlayer *player = [KGVoicePlayer defaultPlayer];
if (!_flag) {
_tempVolume = player.volume;
- 与其怨它不如爱它
bijian1013
选择理想职业规划
抱怨工作是年轻人的常态,但爱工作才是积极的心态,与其怨它不如爱它。
一般来说,在公司干了一两年后,不少年轻人容易产生怨言,除了具体的埋怨公司“扭门”,埋怨上司无能以外,也有许多人是因为根本不爱自已的那份工作,工作完全成了谋生的手段,跟自已的性格、专业、爱好都相差甚远。
- 一边时间不够用一边浪费时间
bingyingao
工作时间浪费
一方面感觉时间严重不够用,另一方面又在不停的浪费时间。
每一个周末,晚上熬夜看电影到凌晨一点,早上起不来一直睡到10点钟,10点钟起床,吃饭后玩手机到下午一点。
精神还是很差,下午像一直野鬼在城市里晃荡。
为何不尝试晚上10点钟就睡,早上7点就起,时间完全是一样的,把看电影的时间换到早上,精神好,气色好,一天好状态。
控制让自己周末早睡早起,你就成功了一半。
有多少个工作
- 【Scala八】Scala核心二:隐式转换
bit1129
scala
Implicits work like this: if you call a method on a Scala object, and the Scala compiler does not see a definition for that method in the class definition for that object, the compiler will try to con
- sudoku slover in Haskell (2)
bookjovi
haskellsudoku
继续精简haskell版的sudoku程序,稍微改了一下,这次用了8行,同时性能也提高了很多,对每个空格的所有解不是通过尝试算出来的,而是直接得出。
board = [0,3,4,1,7,0,5,0,0,
0,6,0,0,0,8,3,0,1,
7,0,0,3,0,0,0,0,6,
5,0,0,6,4,0,8,0,7,
- Java-Collections Framework学习与总结-HashSet和LinkedHashSet
BrokenDreams
linkedhashset
本篇总结一下两个常用的集合类HashSet和LinkedHashSet。
它们都实现了相同接口java.util.Set。Set表示一种元素无序且不可重复的集合;之前总结过的java.util.List表示一种元素可重复且有序
- 读《研磨设计模式》-代码笔记-备忘录模式-Memento
bylijinnan
java设计模式
声明: 本文只为方便我个人查阅和理解,详细的分析以及源代码请移步 原作者的博客http://chjavach.iteye.com/
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
/*
* 备忘录模式的功能是,在不破坏封装性的前提下,捕获一个对象的内部状态,并在对象之外保存这个状态,为以后的状态恢复作“备忘”
- 《RAW格式照片处理专业技法》笔记
cherishLC
PS
注意,这不是教程!仅记录楼主之前不太了解的
一、色彩(空间)管理
作者建议采用ProRGB(色域最广),但camera raw中设为ProRGB,而PS中则在ProRGB的基础上,将gamma值设为了1.8(更符合人眼)
注意:bridge、camera raw怎么设置显示、输出的颜色都是正确的(会读取文件内的颜色配置文件),但用PS输出jpg文件时,必须先用Edit->conv
- 使用 Git 下载 Spring 源码 编译 for Eclipse
crabdave
eclipse
使用 Git 下载 Spring 源码 编译 for Eclipse
1、安装gradle,下载 http://www.gradle.org/downloads
配置环境变量GRADLE_HOME,配置PATH %GRADLE_HOME%/bin,cmd,gradle -v
2、spring4 用jdk8 下载 https://jdk8.java.
- mysql连接拒绝问题
daizj
mysql登录权限
mysql中在其它机器连接mysql服务器时报错问题汇总
一、[running]
[email protected]:~$mysql -uroot -h 192.168.9.108 -p //带-p参数,在下一步进行密码输入
Enter password: //无字符串输入
ERROR 1045 (28000): Access
- Google Chrome 为何打压 H.264
dsjt
applehtml5chromeGoogle
Google 今天在 Chromium 官方博客宣布由于 H.264 编解码器并非开放标准,Chrome 将在几个月后正式停止对 H.264 视频解码的支持,全面采用开放的 WebM 和 Theora 格式。
Google 在博客上表示,自从 WebM 视频编解码器推出以后,在性能、厂商支持以及独立性方面已经取得了很大的进步,为了与 Chromium 现有支持的編解码器保持一致,Chrome
- yii 获取控制器名 和方法名
dcj3sjt126com
yiiframework
1. 获取控制器名
在控制器中获取控制器名: $name = $this->getId();
在视图中获取控制器名: $name = Yii::app()->controller->id;
2. 获取动作名
在控制器beforeAction()回调函数中获取动作名: $name =
- Android知识总结(二)
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android
明天要考试了,速速总结如下
1、Activity的启动模式
standard:每次调用Activity的时候都创建一个(可以有多个相同的实例,也允许多个相同Activity叠加。)
singleTop:可以有多个实例,但是不允许多个相同Activity叠加。即,如果Ac
- 高洛峰收徒第二期:寻找未来的“技术大牛” ——折腾一年,奖励20万元
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工作项目管理
高洛峰,兄弟连IT教育合伙人、猿代码创始人、PHP培训第一人、《细说PHP》作者、软件开发工程师、《IT峰播》主创人、PHP讲师的鼻祖!
首期现在的进程刚刚过半,徒弟们真的很棒,人品都没的说,团结互助,学习刻苦,工作认真积极,灵活上进。我几乎会把他们全部留下来,现在已有一多半安排了实际的工作,并取得了很好的成绩。等他们出徒之日,凭他们的能力一定能够拿到高薪,而且我还承诺过一个徒弟,当他拿到大学毕
- linux expect
heipark
expect
1. 创建、编辑文件go.sh
#!/usr/bin/expect
spawn sudo su admin
expect "*password*" { send "13456\r\n" }
interact
2. 设置权限
chmod u+x go.sh 3.
- Spring4.1新特性——静态资源处理增强
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目录
Spring4.1新特性——综述
Spring4.1新特性——Spring核心部分及其他
Spring4.1新特性——Spring缓存框架增强
Spring4.1新特性——异步调用和事件机制的异常处理
Spring4.1新特性——数据库集成测试脚本初始化
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Spring4.1新特性——页面自动化测试框架Spring MVC T
- idea ubuntuxia 乱码
liyonghui160com
1.首先需要在windows字体目录下或者其它地方找到simsun.ttf 这个 字体文件。
2.在ubuntu 下可以执行下面操作安装该字体:
sudo mkdir /usr/share/fonts/truetype/simsun
sudo cp simsun.ttf /usr/share/fonts/truetype/simsun
fc-cache -f -v
- 改良程序的11技巧
pda158
技巧
有很多理由都能说明为什么我们应该写出清晰、可读性好的程序。最重要的一点,程序你只写一次,但以后会无数次的阅读。当你第二天回头来看你的代码 时,你就要开始阅读它了。当你把代码拿给其他人看时,他必须阅读你的代码。因此,在编写时多花一点时间,你会在阅读它时节省大量的时间。
让我们看一些基本的编程技巧:
尽量保持方法简短
永远永远不要把同一个变量用于多个不同的
- 300个涵盖IT各方面的免费资源(下)——工作与学习篇
shoothao
创业免费资源学习课程远程工作
工作与生产效率:
A. 背景声音
Noisli:背景噪音与颜色生成器。
Noizio:环境声均衡器。
Defonic:世界上任何的声响都可混合成美丽的旋律。
Designers.mx:设计者为设计者所准备的播放列表。
Coffitivity:这里的声音就像咖啡馆里放的一样。
B. 避免注意力分散
Self Co
- 深入浅出RPC
uule
rpc
深入浅出RPC-浅出篇
深入浅出RPC-深入篇
RPC
Remote Procedure Call Protocol
远程过程调用协议
它是一种通过网络从远程计算机程序上请求服务,而不需要了解底层网络技术的协议。RPC协议假定某些传输协议的存在,如TCP或UDP,为通信程序之间携带信息数据。在OSI网络通信模型中,RPC跨越了传输层和应用层。RPC使得开发