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医学统计SPSS主成分分析详解

关键词:SPSS、主成分分析

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    主成分分析(principal components analysis),是将多个数值变量或指标简化为少数几个相互独立的综合变量或指标的过程,整个过程是一个降维的过程。医学研究中,常用主成分分析对有多个观察指标或多个影响因素的数据进行指标整合,来降低分析工作的难度和工作量。

    本期,我们就来介绍主成分分析的基本原理、适用范围及其在SPSS中的具体操作。

下方为视频版和音频版,含软件操作步骤

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一、基本原理

    对于主成分分析,我们主要应掌握以下几点:

(1)主成分的贡献率和累积贡献率

    主成分分析把m个原始指标2d8a48fd12d2caa49f67c4fc9d996411.png的总方差分解为m个互不相关的综合指标387588b5df5586f4ed096dd4cda0a888.png的方差之和,使第一主成分的方差达到最大,最大方差为21ba1abb1b7530df22eccc1690b15eeb.pngae8820ef234d63d9bd89d1b31a486573.png表明了第一主成分f8f713d4c1754240f9d89c393f8d5506.png的方差在全部方差中所占的比值,即第一主成分的贡献率,贡献率的值越大,表明f8f713d4c1754240f9d89c393f8d5506.png这个指标综合原始指标2d8a48fd12d2caa49f67c4fc9d996411.png的能力越强。主成分是按特征值2d8a48fd12d2caa49f67c4fc9d996411.png的大小顺序排列的。

    则第i主成分的贡献率表示为:

7ca4ef6366a075bd81749681a4e86a9f.png

    则前k个主成分的累计贡献率表示为:

0cc52e9ef776e62ce171276c004f95a3.png

    (2)主成分个数的选取

    一般来说,主成分的保留按以下原则来确定:

    当前k个主成分的累计贡献率达到60%以上时,则保留前k个主成分;

    若主成分cec1050ddf49beb82597e9a5c5a5a9c5.png的特征值d1f2a3fe70149072d4a6c85b23371f39.png,则保留cec1050ddf49beb82597e9a5c5a5a9c5.png,否则就去掉该主成分;

   若碎石图的拐点位置出现在第k个主成分点,就尝试保留前k个主成分。

    (3)因子载荷

    因子载荷是第i主成分cec1050ddf49beb82597e9a5c5a5a9c5.png与第j原始指标d8402cc3b6c1b52df0c6cf2fd804dd4c.png之间的相关系数,反映了主成分cec1050ddf49beb82597e9a5c5a5a9c5.png与原始指标bcd0b3519ab1670f4c079956acb8eb4d.png之间联系的密切程度与作用方向,第i主成分cec1050ddf49beb82597e9a5c5a5a9c5.png的特征值的平方根6f17849069332329252ae7f5ee760939.png与第j原始指标d8402cc3b6c1b52df0c6cf2fd804dd4c.png的系数8099debdbd1e0020c384f5402098cfac.png的乘积,因子载荷的表示为:

9123164782f652cef2428ca54544d8cb.png

二、适用条件

    一般来说,主成分分析用于多个连续数值型的变量。

三、案例解读

    现收集了一份慢性阻塞性肺疾病的焦虑量表的评分数据,为了更进一步的综合考察这批患者的焦虑状况,欲采用主成分分析查找出少数几个相互独立的主成分,以便综合评价患者焦虑状况。在SPSS中,主成分分析是因子分析的一部分,具体操作如下:

    (1)在SPSS中的具体操作

    ①依次点击“分析——降维——因子”。

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    出现“因子分析”分析窗口。

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    将所有变量项选入“变量”框中,点击“描述”,勾选“KMO和巴特利特球形检验”。

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    点击“提取”,出现“因子分析:提取”对话框,勾选“碎石图”,提取方式为“基于特征值:特征值大于1”。

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    点击“旋转”,出现“因子分析:旋转”对话框,勾选“最大方差法”。

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   点击“得分”,出现“因子分析:因子得分”对话框,勾选“保存为变量”和“显示因子得分系数矩阵”。

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    ⑦点击“继续”、“确定”,得到分析结果。

(2)结果解读

    首先,查看“KMO和巴特利特检验”表,表中,KMO值=0.934>0.7,且巴特利球形检验显著性P=0.000<0.05,提示量表通过了KMO和巴特利特球形检验,量表非常适合做因子分析。

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   其次,查看“总方差解释”表,可以看到,本次提取的主成分有三个主成分特征值大于1,且前三个主成分的累计方差贡献率为73.762%;而第四主成分的特征值=0.946<1,第五主成分的特征值=0.893<1。

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    然后,查看碎石图,可以看到,图中拐点明显出现在第5主成分位置处,结合“总方差解释”表中主成分特征值的大小情况,尝试提取5个主成分。

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    ④重复上述主成分分析操作,在“因子分析”窗口,点击“提取”,在出现的“因子分析:提取”窗口中,选择“提取:因子的固定数目:要提取的因子数=5”,并点击“继续”、“确定”。

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    此时,“总方差解释”表的结果发生了变化,可以看到,提取了5个主成分,前5主成分的方差贡献率为82.957%大于之前的73.762%,提取的主成分对原指标的解释能力为82.957%,有所提高。由此,本例通过主成分分析,将原始共20个变量归类为5个综合性的主成分。

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   查看“旋转后的成分矩阵”表,可以看到各题项在5个主成分的得分情况,题项A1-A4在第3主成分上的得分要高于其在其他主成分上的得分,可以理解为第3主成分对题项A1-A4有更强的解释力。通过“旋转后的成分矩阵”表,我们可以根据各题项所属主成分,结合专业知识,对主成分进行命名,从而达到将20个变量归类为5个综合变量,以方便研究的目标。

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四、小  结

    本文介绍了在SPSS中对医学多个数值变量的主成分分析的基本原理及其在SPSS中的具体操作,事实上,主成分分析和因子分析的原理和在SPSS中的操作是类似的,因子分析可以说是主成分分析的更进一步的拓展。后续,我们将继续介绍因子分析的基本原理及其具体应用,敬请关注!

参考文献:

1、孙振球,徐勇勇.《医学统计学 第4版》.人民卫生出版社.

2、张文彤.SPSS 11统计分析教程(高级篇).北京希望电子出版社.

本期供稿:Dana

文本编辑:飞雪

内容审核:陈老师

语音讲解:陈老师

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