R 及 R包的安装问题

R 可以去官网去下载，按照一般软件安装流程即可，这里主要是介绍R包的一些安装方法
R 包的安装基本分为两种 ： （1）在线安装 （2）本地安装
（1）在线安装主要有两种方法，
a, install.packages("packages")
b,biocLite("packages") 因为有的包是在 bioconductor 下的，需要用 biocLite() 安装

（2）本地安装 ，下载好待安装的 R 包 ，
在 R 下 点 packages --> Install packages from local files ,选择下载好的R包
这种方法缺点是无法自动安装依赖包，需要后续再安装

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另外，介绍一种镜像设置的方法，因为默认的不是国内镜像，有时候下载速度贼慢，所以我们可以改成国内镜像
这里用的是清华的
（1）找到你计算机安装R文件夹下的 etc 文件夹（C:\Program Files\R\R-3.5.1\etc）， 编辑 etc 下的 Rprofile.site 文件，没有可自行创建，将下面代码复制进去即可设置成清华镜像（也可以改成其他的，自行搜索）

local creates a new, empty environment

This avoids polluting the global environment with

the object r

local({
r = getOption("repos")
r["CRAN"] = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN"
options(repos = r)
})
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")