查看本地WSI图像

为了观察WSI图像的整体情况,最直接的方法就是将其打开查看,但是由于WSI的分辨率较大,通常无法直接打开查看,针对于该问题,可以直接使用openslide缩略图查看,也可通过借助Flask和openslide库对其进行网页展示。本文以借助Flask和openslide库对其进行网页展示为例。
注意: 这里默认已有flask和openslide库
下面以Ubuntu20为例:

# 找到openslide库安装路径
cd /usr/share/doc/python-openslide-examples/examples/deepzoom
# /home/his/Camelyon16/training替换成自己的WSI路径
python3 deepzoom_multiserver.py -Q 100 /home/his/Camelyon16/training

查看本地WSI图像_第1张图片

  • 该链接复制到浏览器中即可看到WSI图像的缩略版
    查看本地WSI图像_第2张图片

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