所谓的聚类,就是将样本划分为由类似的对象组成的多个类的过程。聚类后,我们可以更加
准确的在每个类中单独使用统计模型进行估计、分析或预测;也可以探究不同类之间的相关性和主要差异。
聚类和上一讲分类的区别:分类是已知类别的,聚类未知
一、指定需要划分的簇[cù]的个数K值(类的个数);
二、随机地选择K个数据对象作为初始的聚类中心(不一定要是我们的样本点);
三、计算其余的各个数据对象到这K个初始聚类中心的距离,把数据对象划归到距离它最近的那个中心所处在的簇类中;
四、调整新类并且重新计算出新类的中心;
五、循环步骤三和四,看中心是否收敛(不变),如果收敛或达到迭代次数则停止循环;
六、结束
(1)聚类的个数K值怎么定?
答:分几类主要取决于个人的经验与感觉,通常的做法是多尝试几个K值,看分成几类的结果更好解释,更符合分析目的等。
(2)数据的量纲不一致怎么办?
答:如果数据的量纲不一样,那么算距离时就没有意义。例如:如果X1单位是米,X2单位是吨,用距离公式计算就会出现“米的平方”加上“吨的平方”开平方,最后算出的东西没有数学意义,这就有问题了。
优点:
(1)算法简单、快速。
(2)对处理大数据集,该算法是相对高效率的。
缺点:
(1)要求用户必须事先给出要生成的簇的数目K。 (2)对初值敏感。
(3)对于孤立点数据敏感。
K‐means++算法可解决2和3这两个缺点。
k-means++算法选择初始聚类中心的基本原则是:初始的聚类中心之间的相互距离要尽可能的远。
算法描述如下:(只对K-means算法“初始化K个聚类中心” 这一步进行了优化)
步骤一:随机选取一个样本作为第一个聚类中心;
步骤二:计算每个样本与当前已有聚类中心的最短距离(即与最近一个聚类中心的距离),这个值越大,表示被选取作为聚类中心的概率较大;最后,用轮盘法(依据概率大小来进行抽选)选出下一个聚类中心;
步骤三:重复步骤二,直到选出K个聚类中心。选出初始点后,就继续使用标准的K-means算法了。
系统聚类的合并算法通过计算两类数据点间的距离,对最为接近的两类数据点进行组合,并反复迭代这一过程,直到将所有数据点合成一类,并生成聚类谱系图。
系统(层次)聚类的算法流程:
一、将每个对象看作一类,计算两两之间的最小距离;
二、将距离最小的两个类合并成一个新类;
三、重新计算新类与所有类之间的距离;
四、重复二三两步,直到所有类最后合并成一类;
五、结束
肘部法则(Elbow Method):通过图形大致的估计出最优的聚类数量。
聚合系数折线图
画图前先对数据进行处理
聚合系数折线图的画法
确定K后保存聚类结果并画图
DBSCAN(Density-based spatial clustering of applications
with noise)是一种基于密度的聚类方法
聚类前不需要预先指定聚类的个数,生成的簇的个数不定(和数据有关)。
该算法利用基于密度的聚类的概念,即要求聚类空间中的一定区域内所包含对象(点或其他空间对象)的数目不小于某一给定阈值。
该方法能在具有噪声的空间数据库中发现任意形状的簇,可将密度足够大的相邻区域连接,能有效处理异常数据
DBSCAN算法将数据点分为三类:
• 核心点:在半径Eps内含有不少于MinPts数目的点
• 边界点:在半径Eps内点的数量小于MinPts,但是落在核心
点的邻域内
• 噪音点:既不是核心点也不是边界点的点
DBSCAN(D, eps, MinPts) {
C = 0
for each point P in dataset D {
if P is visited
continue next point
mark P as visited
NeighborPts = regionQuery(P, eps)
if sizeof(NeighborPts) < MinPts
mark P as NOISE
else {
C = next cluster
expandCluster(P, NeighborPts, C, eps, MinPts)
} } }
expandCluster(P, NeighborPts, C, eps, MinPts) {
add P to cluster C
for each point P' in NeighborPts {
if P' is not visited {
mark P' as visited
NeighborPts' = regionQuery(P', eps)
if sizeof(NeighborPts') >= MinPts
NeighborPts = NeighborPts joined with NeighborPts'
}
if P' is not yet member of any cluster
add P' to cluster C
} }
regionQuery(P, eps)
return all points within P's eps-neighborhood (including P)
main.m
clc;
clear;
close all;
%% Load Data
load mydata;
%% Run DBSCAN Clustering Algorithm
epsilon=0.5;
MinPts=10;
IDX=DBSCAN(X,epsilon,MinPts);
%% Plot Results
% 如果只要两个指标的话就可以画图啦
% PlotClusterinResult(X, IDX);
% title(['DBSCAN Clustering (\epsilon = ' num2str(epsilon) ', MinPts = ' num2str(MinPts) ')']);
DBSCAN.m
function [IDX, isnoise]=DBSCAN(X,epsilon,MinPts)
C=0;
n=size(X,1);
IDX=zeros(n,1); % 初始化全部为0,即全部为噪音点
D=pdist2(X,X);
visited=false(n,1);
isnoise=false(n,1);
for i=1:n
if ~visited(i)
visited(i)=true;
Neighbors=RegionQuery(i);
if numel(Neighbors)<MinPts
% X(i,:) is NOISE
isnoise(i)=true;
else
C=C+1;
ExpandCluster(i,Neighbors,C);
end
end
end
function ExpandCluster(i,Neighbors,C)
IDX(i)=C;
k = 1;
while true
j = Neighbors(k);
if ~visited(j)
visited(j)=true;
Neighbors2=RegionQuery(j);
if numel(Neighbors2)>=MinPts
Neighbors=[Neighbors Neighbors2]; %#ok
end
end
if IDX(j)==0
IDX(j)=C;
end
k = k + 1;
if k > numel(Neighbors)
break;
end
end
end
function Neighbors=RegionQuery(i)
Neighbors=find(D(i,:)<=epsilon);
end
end
PlotClusterinResult.m
function PlotClusterinResult(X, IDX)
k=max(IDX);
Colors=hsv(k);
Legends = {};
for i=0:k
Xi=X(IDX==i,:);
if i~=0
Style = 'x';
MarkerSize = 8;
Color = Colors(i,:);
Legends{end+1} = ['Cluster #' num2str(i)];
else
Style = 'o';
MarkerSize = 6;
Color = [0 0 0];
if ~isempty(Xi)
Legends{end+1} = 'Noise';
end
end
if ~isempty(Xi)
plot(Xi(:,1),Xi(:,2),Style,'MarkerSize',MarkerSize,'Color',Color);
end
hold on;
end
hold off;
axis equal;
grid on;
legend(Legends);
legend('Location', 'NorthEastOutside');
end
优点:
我的建议:
只有两个指标,且你做出散点图后发现数据表现得很“DBSCAN”,这时
候你再用DBSCAN进行聚类。
其他情况下,全部使用系统聚类吧。
K‐means也可以用,不过用了的话你论文上可写的东西比较少。