学习小组day5笔记--lee

今天开始R数据结构了

向量
矩阵
数组
数据框
因子
列表

向量是由多个元素组成的变量，元素可以是数字或者字符串 ，并且是有序排列
标量是由单个元素组成的变量

1.赋值

x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法，
意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数
（注意这里是逗号不是分号）
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

赋值

多次赋值只会保留最后一个

2. 从向量中提取元素

x[4] #第4个元素
x[-4] #排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

根据元素位置提取元素

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

根据值的大小

数据框

1.读取本地数据

read.table(file = "lee.txt",sep = "\t",header =T) 
#读取文件，分隔符为Tab，有表头 
a<-read.table(file = "lee.txt"
,sep = "\t",header =T)
#把这个数据框赋给一个变量a 

读取成功

2 设置行名和列名

X<-read.csv('lee.txt')
 #在示例数据里有lee.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #有的公司返回数据，
左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "lee.txt",sep = "\t",header 
=T,row.names=1)
#最后row.names的意思是修改第一列为行名

有点蒙圈了

3.数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

4.变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")保存其中一个变量
load("frame1.RData")再次使用RData时的加载命令

5.提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列（横着写，这是不够懒也不够优秀却能存在的写法）
- X[y]#第y列（竖着写，这是懒惰又优秀的写法）
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）
6.直接使用数据框中的变量

c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50)
> plot(c$case,c$values)

有点难懂

下面才是重点
方法1：attach
将数据框名添加到搜索环境中：attach（c）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)。

attach(c)
plot(case,values)
做完后将a删除出搜索环境 detach（c）

局限性：两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。

方法2：with
with(c,{+ plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，y也就是出了with循环仍有效。
})
x#运行完后打印x

这几天学习到R这里真的是蒙圈的状态，，有点难理解阿。。。得下功夫琢磨一下了

xmind