基因突变

突变文件

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突变类型很多

8
3_prime_UTR_variant
5888
5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
272
5_prime_UTR_variant
1203
disruptive_inframe_deletion
54
downstream_gene_variant
85400
exon_variant
8461
frameshift_variant
424
inframe_deletion
38
inframe_insertion
12
intergenic_region
179341
intragenic_variant
64
intron_variant
675461
missense_variant
6080
splice_acceptor_variant
197
splice_donor_variant
169
splice_region_variant
1126
start_lost
6
stop_gained
357
stop_lost
11
synonymous_variant
1993
upstream_gene_variant
82010

氨基酸改變.png

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保留有氨基酸改变的突变并注释基因

由百万行变成十万行左右

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文件变成这样

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删除了这个synonymous突变（因为没有氨基酸突变）

样本名为实验id加病人id

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得到基因和病人突变关系

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每个基因的突变个数

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瀑布图文件

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突变类型更改

瀑布图准备文件