需要打基础的内容:
Markdown语法快速上手指南:
小技巧的第二节我讲的就是markdown:https://www.bilibili.com/video/av25131640
学习markdown 可以先看看 基础语法:https://mp.weixin.qq.com/s/hZj91FWIaw4cS39_jgjl7g
学习编辑器,推荐typora:https://vip.biotrainee.com/d/82-typora-markdown/10
最后是关于记笔记:https://vip.biotrainee.com/d/268
markdown效果如下:https://raw.githubusercontent.com/jmzeng1314/my_WGCNA/master/readme.md
https://github.com/jmzeng1314/my_WGCNA/blob/master/readme.md
类似于上面这样的,就是markdown
其实还有rmarkdown更方便,参考我在腾讯课堂的免费视频:https://ke.qq.com/course/274681?tuin=4926c730
生信技能树的作业:
R语言的练习题
初级10 个题目,尽量根据参考代码理解及完成:http://www.bio-info-trainee.com/3793.html
中级要求是:http://www.bio-info-trainee.com/3750.html
高级要求是完成20题:http://www.bio-info-trainee.com/3415.html
统计专题 30题:http://www.bio-info-trainee.com/4385.html
可视化专题30题:http://www.bio-info-trainee.com/4387.html
LINUX的练习题:
最低要求是完成我的 linux 20题 http://www.bio-info-trainee.com/2900.html
其次完成生物信息学数据格式的习题(blast/blat/fa-fq/sam-bam/vcf/bed/gtf-gff),收集这些格式的说明书。
fasta和fastq格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3575.html
sam和bam格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3578.html
VCF格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3577.html
RNA-seq只有小考核
http://www.bio-info-trainee.com/3920.html
学徒培养的各种资料细节完善,代码在:
https://www.jianshu.com/p/49d035b121b8 给学徒的WES数据分析流程
https://www.jianshu.com/p/a84cd44bac67 原创10000+生信教程大神给你的RNA实战视频演练
https://www.jianshu.com/p/5bce43a537fd 给学徒的ATAC-seq数据实战
https://mp.weixin.qq.com/s/a4qAcKE1DoukpLVV_ybobA 给学徒ChIP-seq数据处理流程
讲义都是在:
学徒第一周:文档链接:https://mubu.com/doc/38tEycfrQg 密码:vl3q
学徒第二周:文档链接:https://mubu.com/doc/38y7pmgzLg 密码:p6fo
学徒第三周:文档链接:https://mubu.com/doc/1iDucLlG5g 密码:7uch
学徒第四周:文档链接:https://mubu.com/doc/11taEb9ZYg 密码:wk29