如何向Sequence Read Archive (SRA) 提交未组装的高通量测序reads？

基本简介

原始数据（Raw data) 指测序下机后未经处理的全部原始数据文件，SRA是NCBI中收录原始数据的主要数据库，有454，Illumina，SOLiD，IonTorrent，Helicos 和CompleteGenomics的下机数据，最为常见的是illumina 产生的fastq格式数据。

一：注册NCBI账号

点击NCBI主页my profile填写个人信息（用户名，密码，邮箱），并向NCBI发送邮件确认邮箱号，构建NCBI账号。如果已有账号，点击sign in直接登录。

链接：https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/

二：申请BioSample号和BioProject号

在提交原始数据前，我们需要先申请BioSample号和BioProject号，主要填写一些描述样本、测序方面的相关信息。点击New submission开始填写，下图为填写内容简介。链接：

https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/biosample/

https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/bioproject/

三：提交原始fastq格式文件至SRA

当完成上面两步时，已申请的Biosample和Bioproject号待用，点击New submission开始填写，下图是填写内容简介。链接：

https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/

总结

越来越多实验会涉及到测序。细菌、真菌、宏基因组、RNA-seq、16S等等。虽然测序公司帮助你做了数据分析，但是当你投文章的时候，难免会被编辑或者审稿人问道：你的原始数据提交到公共数据库了吗？或者请提供能找到测序数据的accseeion number?这个时候，如果你的样本少，数据量小，你可以考虑自己通过网页上传哦，再也不用担心文章发表时没上传原始数据了。