学习小组Day3笔记-姜洪利

一、bzip和Miniconda的下载和安装

1. bzip的下载和安装

• 首先在根目录下输入命令行

bzip2

• 腾讯云已经装备有bzip，无需安装;
• 如果需要安装的话，需要以下命令行

yum install -y bzip2            /////y参数表示是否自动安装

2. Miniconda的下载和安装
   Miniconda是conda的精简版本，继承了大部分的的生信软件。

• 确认服务器版本，在官网找到对应的版本，鼠标右键复制地址，为在linux下安装做准备。
• wget是linux的下载命令，相当于windows的另存为，后面接空格和安装地址就可以，用鼠标右键点一下，出来刚才复制的地址，如下所示

wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

• 下载完需要安装，网络查了bash的释义，难以消化，此处bash就是安装上述下载文件到本地。

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

• 回车到license接受yes，安装目录回车，添加环境变量yes，安装成功。
• 大坑，激活的命令的第一个字符一定要打对，否则死的很惨。

source ~/.bashrc
conda

• 关于添加路径or通道，因为没加在后续查找软件时显示失败，除了按照教程上添加通道外，还有如下简洁命令，不知区别在哪

conda config --add channels bioconda

二、Miniconda的使用

1. 查看当前软件列表

conda list

2. 搜索特定软件

conda search software_name

3. 安装特定软件

conda install -y software_name

4. 卸载特定软件

conda remove software_name -y