脂质代谢中的长非编码RNA：文献综述和物种间的保守性分析

文章：Long noncoding RNAs in lipid metabolism: literature review and conservation analysis across species

背景

脂质是细胞膜的构成，充当信号分子和重要的能量来源，脂质稳态过程失调是血脂异常的原因，引发疾病：例如肥胖，糖尿病，非酒精性脂肪肝疾病（NAFLD）或心血管疾病。

脂质包括油三酸酯（TG），胆固醇，脂肪酸和磷脂。甘油三酯中脂肪酸的储存是主要动物的能量储备，其在能量过剩时期构成，在能量缺乏时期动员。这种储存主要发生在脂肪细胞内的脂肪组织中。

lncRNA仔物种间保守性较低，作者在人/小鼠和鸡之间发现5种直系同源的lncRNA，可能在脂质代谢中起重要作用。

结果

通过文献分析，发现60种lncRNA参与脂质代谢

作者列出60个潜在参与脂质代谢的lncRNA 。这些lncRNA中的大多数已在人（34）和小鼠（19）、大鼠（1）、猪（5）和鸡（4）中鉴定。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab1/?report=objectonly

lncRNA的作用机制

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lncRNA的不同作用机制。a在转录水平上起作用的机制，b在转录后水平上起作用 c 对蛋白质起作用。d LncRNA具有小的非编码RNA宿主的作用。E LncRNAs通过一个小翻译ORF活动。红色，lncRNA；绿色，mRNA；蓝色，miRNA；绿色，黄色和蓝色的椭圆形球体是蛋白质。

文献报告了25种lncRNA的作用机制

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab2/?report=objectonly

lncRNA在物种间的保守性

作者根据基于基因组一致性的方法在鸡与人（或鼠）之间进行直系同源lncRNA搜索。CRNDE，DHCR24-DT，NFIA -AS1，PVT1和SRA1被认为是直系同源的，lncACACA，DYNLRB2–2，MeXis，PLA2G1Bat1和TRIBAL可能是直系同源的lncRNA。它们作用于该脂质代谢关键基因的表达，如关键酶基因（FASN，SCD，ACADS，ACADVL，ATGL），脂质转运基因（ABCA1，FABP4）或脂质代谢转录因子基因（PPARA，PPARG**）。因此这些lncRNA可能在脂质代谢中起重要作用。

人/小鼠和鸡基因组之间可能保守的10个lncRNA

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab3/?report=objectonly

lncRNA在人和鸡的胚胎，肝脏，脂肪组织和下丘脑中的表达

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a人和鸡之间保守的5个lncRNA 的表达。b针对此处研究的所有5种lncRNA，不同组织中所有lncRNA（淡色）的表达。胚胎（E），肝脏（L），脂肪组织（A），下丘脑（H）。

方法

文献搜索

PubMed组合术语搜索： “lncRNA” and “associated to apolipoprotein or to the 8 lipid classes”: **sterol (cholesterol胆固醇), prenol（早搏酚）, fatty acid, acylglycerol (triglyceride)甘油三酸酯, phosphoglyceride（磷酸甘油酯）, glycolipids（糖脂）, polyketides（聚酮化合物） and sphingolipids（鞘脂）.