生信入门-2

到现在更多了解之后，认为上一篇《生信入门》还是很扎实的。
学什么都是一个先放后收的过程
想做一个收束和延伸，于是就有了这篇文章。

统计基础、数据处理、作图是三大基础

统计基础就找一本医学统计学简单了解就可以了；
数据处理和作图的话还是看我之前推荐的两本R的书

生信学习分三块

1. 序列比对
   Linux上使用各种软件对原始测序结果进行分析；
   GWAS是很经典的方法，可以了解一下

2. 表达富集及差异分析
   建议阅读《advanced R》这本书中对数据结构的描述；
   这个过程就是积累方法和R包；
   学习R包先从经典的包开始，如limma、Deseq2等；
   学R包就是找其中几个关键的方法来看；
   学方法是学方法输入和输出的类及类的处理、方法有哪些关键参数

3. 机器学习
   回归和分类是大部分上述方面的基础，想深入了解这部分是要看的，看这部分要学一点基础的数学，比如线代；
   简单了解机器学习，推荐阅读《深入浅出python机器学习》；
   需要深入学习背后的理论，推荐阅读《普林斯顿概率论》；

其他

推荐生信入门还是从R语言开始，然后再到序列比对，机器学习的第二本书算是解惑用的；
无论是数据处理，还是作图，都可以作为专门的一个领域来研究了，平时要多练习，可以自己多创建随机数来训练；
《R packages》后面有空再读，再学习写R包；

后面有什么再补充