中科大生物信息学

python pip及常用国内镜像源

pip常用国内镜像源pip默认从国外的python下载会很慢，建议使用一些国内的镜像源，常用的国内镜像源如下：#清华镜像源https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple#中科大镜像源

sunny05296·2025-03-23 06:17

2025.03.22【读书笔记】| fastq-multx：高效barcode拆分数据解决工具

`fastq-multx`的特点2.安装方式通过源代码编译安装使用包管理器安装3.使用命令基本命令高级参数设置结语1.工具介绍在生物信息学的世界里，工具的选择至关重要。

穆易青·2025-03-22 19:26

ubuntu:E: 无法定位软件包yum解决方法

如果出现以下问题，则需要更新yum源yum源位于/etc/apt/sources.listyum源更新的网站有清华大学开源镜像中科大开源镜像1.此处更新yum源的时候先备份sudocp/etc/apt/

码农研究僧·2025-03-22 19:55

R语言绘图 | 环状柱状图+散点柱状组合图绘制

原文：R语言绘图|环状柱状图+散点柱状组合图绘制(点击访问)小杜的生信筆記，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!!

小杜的生信筆記·2025-03-19 12:11

计算基因组学需要计算机知识吗,生物信息学——计算基因组学的一些参考书

有两个都可以在新浪爱问资料Bioinformatics.For.Dummies.2nd.Ed.2007.pdfAnIntroductiontoBioinformaticsAlgorithms.pdf另外看到Virginia大学的一些课程The2012ComputationalGenomicsCoursehasbeenrescheduledtoNovember28-December4,2012用mo

weixin_39610422·2025-03-18 22:43

Python在生物信息学中的应用：基因组学与蛋白质组学

摘要：本文主要介绍了Python在生物信息学中的应用，特别是在基因组学和蛋白质组学领域。文章详细讲述了各个原理，并以代码实例展示了实际应用。

PyTechShare·2025-03-17 23:34

Python常用国内镜像源（清华、豆瓣、阿里云、中科大）

使用Python最便捷的就是下载使用各种“包”，然而往往长时间不用就容易忘记，在这里将网上一些资源收集整理，一是方便自己日后使用，二是与诸君共享。一、代码清华大学开源软件镜像站：https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple阿里云开源镜像站：https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/豆瓣：https://pypi.douban.

老马达·2025-03-17 04:38

数组中最长递增子序列问题的深入研究

二分查找优化四、算法设计4.1动态规划算法4.2二分查找优化算法4.3代码实现（Python）4.4代码解释五、复杂度分析5.1动态规划算法复杂度5.2二分查找优化算法复杂度六、实际应用6.1数据分析6.2生物信息学

cloudman08·2025-03-16 01:24

基于多模态大模型的不完整多组学数据特征选择策略

基于多模态大模型的不完整多组学数据特征选择策略是当前生物信息学和精准医学领域的一个前沿问题。

m0_65156252·2025-03-13 18:17

清华团队发布多模态“神探”Migician：24.94%性能碾压，解锁多图定位的无限可能—— 安防、自动驾驶、医疗影像的AI“鹰眼”革命

清华大学联合北交大、华中科大发布的Migician模型，凭借24.94%的性能碾压优势，让AI首次实现“跨图像精准狙击”。这个突破性工具，正在重新定义从安防到医疗的20+行业规则。

花生糖@·2025-03-08 13:15

生物信息学工作流（Bioinformatics Workflow）：概念、历史、现状与展望？

李升伟整理1.引言生物信息学工作流是指通过一系列计算步骤和工具，对生物学数据进行处理、分析和解释的系统化流程。

lisw05·2025-03-08 06:22

Ubuntu系统中下载安装使用Anaconda

确认安装协议4、确认安装位置5、初始化Anaconda6、查看是否安装成功三、base环境四、Anaconda管理虚拟环境一、下载官网下载地址：https://www.anaconda.com/download中科大镜像源官网

xxxn1102_·2025-03-07 12:28

中科大计算机网络第二章2.1应用层概述笔记

应用层笔记整理一、应用层概述应用层是计算机网络体系结构中的最高层，直接面向用户和应用程序，负责处理不同端系统间的数据交换与通信。其核心功能包括文件传输、电子邮件、远程登录、网页浏览等网络服务。在TCP/IP模型中，应用层对应OSI标准的会话层、表示层和应用层，通过应用层协议规范报文交换规则。二、应用层协议原理‌传输层服务模型‌‌可靠数据传输‌：确保数据无差错、按序交付（如TCP）。‌吞吐量与定时‌

镜中人★·2025-03-06 21:09

中科大《计算机网络》1.1什么是Internet笔记

什么是Internet1.网络核心概念与术语‌‌1.1网络与互联网的本质区别‌‌对比维度‌‌网络（Network）‌‌互联网（Internet）‌‌定义‌任意互连的计算设备集合（如局域网）由多个网络通过路由器互联形成的全球性网际网络‌组成‌单一管理域内的设备（如企业网）跨管理域的网络联盟（如ISP、跨国企业网）‌协议标准‌可自定义（如私有协议）强制遵循TCP/IP协议簇‌典型示例‌家庭WiFi、校

镜中人★·2025-03-03 06:56

中科大计算机网络原理第一章 1.6分组延迟、丢失和吞吐量笔记

分组延时、丢失和吞吐量笔记一、分组丢失及其原因‌分组丢失原因‌：路由器中的每条链路都对应一个队列。分组通过查路由表决定通过哪条队列和链路传输。如果队列已满，新到的分组将被丢弃。‌为什么队列不能无限长‌：太长的队列会导致传输延迟过高，用户无法忍受。网络传输有一个延迟上限，超过这个上限即使分组到达也变得没有意义。二、分组传输的延迟类型‌处理延迟‌：路由器检查分组错误、提取目标IP地址、查路由表及处理其

镜中人★·2025-03-03 05:50

LM_Funny-2-01 递推算法：从数学基础到跨学科应用

Gauss同余递推4第二章工程实现优化技术2.1内存压缩的革新方法滚动窗口策略分块存储技术2.2异构计算加速方案GPU并行递推量子计算原型第三章跨学科应用案例3.1密码学中的递推构造混沌流密码系统3.2生物信息学的序列分析

王旭·wangxu_a·2025-02-27 01:25

电子科大考研经验分享

举个栗子：今年中科大的软件，400多分的人有400多个，这意味着如果你初试成绩不在400以上，上岸的机会就很渺茫了，反观中山大学的人工智能，320多分就排到了第二名。所以正确评估自己

bugmaker.·2025-02-26 16:49

R语言安装生物信息数据库包

R语言安装生物信息数据库包在生物信息学领域，R语言是重要的数据分析工具。今天，我们就来聊聊在R语言环境下，安装生物信息数据库包（org.*.*.db）的步骤。

Bio Coder·2025-02-23 04:50

数学推理中在推理规模化下检查假阳性解

25年2月来自中科大和微软亚洲研究院的论文“ExaminingFalsePositivesunderInferenceScalingforMathematicalReasoning”。

硅谷秋水·2025-02-20 17:18

基于python使用scanpy分析单细胞转录组数据

Loompy的设计目标是提供一个快速、灵活且易于使用的工具，以支持生物信息学家和研究人员在单细胞水平上进行数据分析。python的单细胞转录组数据结构说明：da

探序基因·2025-02-20 15:26

从awesome xxx类型的GitHub项目的README.md文件中检索所有GitHub代码库链接，并将它们克隆到本地

脚本优化亮点：智能编码处理-新增URL解码功能，完美处理含中文等特殊字符的仓库名深度镜像支持-更新国内高校镜像源，提升克隆速度（新增清华、中科大镜像）智能重试机制-增加自动重试功能，网络波动时自动重试3

之群害马·2025-02-19 03:55

Perl 语言入门学习指南：探索高效脚本编程的奥秘

自1987年诞生以来，Perl凭借其灵活性、强大的内置功能库和广泛的社区支持，在Web开发、生物信息学、网络管理等多个领域发挥着重要作用。

我的运维人生·2025-02-09 16:03

gseapy python包GO、KEGG富集(注释)分析

gseapy.readthedocs.io/en/latest/gseapy_example.html#Over-representation-analysis-by-Enrichr-web-services简介：富集分析是一种常见的生物信息学分析方法

loong_XL·2025-02-09 05:39

Java 大视界 -- Java 大数据在生物信息学中的应用与挑战（67）

亲爱的朋友们，热烈欢迎来到青云交的博客！能与诸位在此相逢，我倍感荣幸。在这飞速更迭的时代，我们都渴望一方心灵净土，而我的博客正是这样温暖的所在。这里为你呈上趣味与实用兼具的知识，也期待你毫无保留地分享独特见解，愿我们于此携手成长，共赴新程！一、欢迎加入【福利社群】点击快速加入：青云交灵犀技韵交响盛汇福利社群点击快速加入2：2024CSDN博客之星创作交流营（NEW)二、本博客的精华专栏：大数据新视

青云交·2025-02-06 18:57

三甲医院大型生信服务器多配置方案剖析与应用（2024版）

一、引言1.1研究背景与意义在当今数智化时代，生物信息学作为一门融合生物学、计算机科学和信息技术的交叉学科，在三甲医院的科研和临床应用中占据着举足轻重的地位。

Allen_LVyingbo·2025-02-02 09:41

安装VIM遇到问题：软件包vim-gtk没有可安装候选

问题2：如图见：更改镜像源https://skysys.blog.csdn.net/article/details/108663145改成中科大的镜像源Ubuntu18.10cosmic换源_Ninedays-CSDN

逐梦156·2025-01-31 20:29

Python3 【集合】项目实战：3 个新颖的学习案例

李智 - 重庆·2025-01-30 14:09

记录python中常用的镜像源

pypi/simple/2、清华大学镜像https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple3、豆瓣镜像https://pypi.doubanio.com/simple/4、中科大镜像

Littlehero_121·2025-01-30 00:24

AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用

AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用关键词：人工智能、深度学习、生物信息学、基因组学、蛋白质结构预测、药物发现、个性化医疗文章目录AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用1.背景介绍2.

AI大模型应用之禅·2025-01-27 16:52

Docker 国内镜像源

目录概述步骤参考资料概述自2024-06-06开始，阿里，腾讯、中科大等国内的DockerHub镜像加速器相继停止服务，总结了网友整理出来一些其他国内DockerHub镜像源，经过测试可以使用。

季风泯灭的季节·2025-01-25 03:54

Spark GraphX原理与代码实例讲解

SparkGraphX原理与代码实例讲解作者：禅与计算机程序设计艺术/ZenandtheArtofComputerProgramming1.背景介绍1.1问题的由来随着互联网和大数据技术的迅猛发展，社交网络、推荐系统、生物信息学

AI大模型应用之禅·2025-01-22 07:34

R语言的计算机基础

它被广泛应用于统计学、数据科学、生态学、生物信息学等多个领域。由于其强大的功能和灵活性，R语言在学术界和工业界都得到了广泛的认可和应用。

java熊猫·2025-01-18 06:23

Web APP 阶段性综述

在医学与生物信息学领域，WebAPP扮演着重要角色。在生物信息学领域，诸多工具以WebAPP的形式呈现，相较之下，医学领域的此类应用数量相对较少。

预测模型的开发与应用研究·2025-01-18 00:09

Python镜像源

://pypi.python.org/pypi豆瓣：https://pypi.doubanio.com/simple/阿里：http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/中科大

「已注销」·2024-09-12 01:31

python镜像源

国内常见的镜像源清华：https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple中科大：https://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/阿里云：https

ct1027038527·2024-09-12 01:28

【机器学习】朴素贝叶斯方法的概率图表示以及贝叶斯统计中的共轭先验方法

朴素贝叶斯方法的概率图表示1.1节点表示1.2边表示1.3无其他连接1.4总结二、朴素贝叶斯的应用场景2.1文本分类2.2推荐系统2.3医疗诊断2.4欺诈检测2.5情感分析2.6邮件过滤2.7信息检索2.8生物信息学三

Lossya·2024-09-07 19:33

Ubuntu配置apt安装源（阿里源，中科大源，清华源，163源）

文章目录1.常用源阿里中科大清华1632.修改源配置文件更新软件列表到本地更新所有软件（非必要）1.常用源阿里debhttp://mirrors.aliyun.com/ubuntu/focalmainrestricteduniversemultiversedebhttp

玄德公笔记·2024-09-07 02:06

零基础入门生信数据分析——导读

零基础入门生信数据分析——导读生信数据分析，即生物信息学数据分析，是一个涵盖了生物学、计算机科学、数学和统计学等多个领域的交叉学科。

呆猪儿·2024-09-06 02:32

国内镜像源

pipinstall包名-ihttp://pypi.douban.com/simple/阿里镜像源pipinstall包名-ihttps://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/中科大镜像源

阴雨天343·2024-09-04 12:49

NCBI BLAST+：分析生物内在编码的工具

在生物信息学的广阔领域中，NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation，美国国立生物技术信息中心）开发的BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool

belldeep·2024-09-02 23:52

分布式基础——谷粒商城【一章节】

https://hub-mirror.c.163.com/阿里云镜像获取地址：https://cr.console.aliyun.com/cn-hangzhou/instances/mirrors登录后#中科大的镜像

杳杳博客·2024-09-02 16:47

【图论简介】

图论在计算机科学、网络理论、优化问题、生物信息学等多个领域都有广泛的应用。本文将简要介绍图论的基本概念、常见算法及其在实际中的应用。

WA-自动机·2024-09-02 13:26

生信圆桌：专业生信服务器与平台服务的提供者

生信圆桌是一个专注于提供生物信息学（生信）服务器和平台服务的领先企业，致力于为全球科研机构、企业和独立研究者提供高性能的生信分析解决方案。

生信圆桌x生信云服务器·2024-08-31 03:45

【web安全】从2022中科大hackgame web中学习pdflatex RCE和python反序列化

ctf比赛地址：https://hack.lug.ustc.edu.cn大佬博客里wp写的很清楚了，官方wp也写的很好，我比不过大佬，只能把基础多讲一些（大佬在tttang把wp全发了T0T)官方wp:https://github.com/USTC-Hackergame/hackergame2022-writeups大佬全WP：https://miaotony.xyz/?utm_source=tt

热心网友易小姐·2024-08-29 00:38

用Python实现生信分析——基序（Motif）识别详解

在生物信息学中，基序（Motif）是指在生物序列（如DNA、RNA或蛋白质序列）中具有特定功能或结构的短序列片段。基序通常在生物进化中得到保留，因为它们在生物学功能中起着重要作用。

写代码的M教授·2024-08-28 08:19

数据结构与算法——动态规划

LeetCode70题）2.斐波那契数列（LeetCode126题）3.最长公共子序列（LeetCode95题）引言动态规划（DynamicProgramming,简称DP）是一种在数学、计算机科学、经济学和生物信息学等领域广泛使用的算法设计技术

passion更好·2024-08-26 06:54

计算机专业考研书目（中科大）

考研408计算机学科专业基础综合一、数据结构1.教材：《数据结构》严蔚敏清华大学出版社清华大学严蔚敏的这本数据结构的教材是国内数据结构教材的权威。也是国内使用最广，其广度远远超越其他同类教材，计算机考研专业课命题必定以它为蓝本。这一本数据结构是2007年的最新版本，完全适合任何学校的考研数据结构的复习之用，是数据结构学习最权威的教材。2.辅导书：《算法与数据结构考研试题精析（第二版）》机械工业出版

FQLSY·2024-08-23 02:03

深度学习——概念引入

深度学习深度学习简介深度学习分类根据网络结构划分：循环神经网络卷积神经网络根据学习方式划分：监督学习无监督学习半监督学习根据应用领域划分：计算机视觉自然语言处理语音识别生物信息学深度学习简介深度学习（DeepLearning

韶光流年都束之高阁·2024-02-20 10:31

中科大计网学习记录笔记（十三）：UDP 套接字编程 | 传输层概述和传输层的服务

前言：学习视频：中科大郑烇、杨坚全套《计算机网络（自顶向下方法第7版，JamesF.Kurose，KeithW.Ross）》课程该视频是B站非常著名的计网学习视频，但相信很多朋友和我一样在听完前面的部分发现信息量过大

*Soo_Young*·2024-02-20 07:11

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