中科大生物信息学第8页

生物信息学 | 借助 AI 更高效地开启研究

By超神经生物信息学(Bioinformatics)是指利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法，研究生物学问题。

HyperAI超神经·2023-11-06 21:54

9. 《Bioinformatics Data Skills》之Unix Shell

由于UnixShell的2大哲学思想模块化与重定向，其成为生物信息学家常用的工作环境。模块化指的是一个程序只做好一件事情，然后将程序使用管道连接起来。

DataScience·2023-11-06 14:17

生活随感

最最主要的是他们夫妻恩爱，家庭和睦，孩子学习成绩也好，高二就要参考高考，考中科大少年班基本没什么问题，感觉人生赢家也不过如此！

瑶望远方·2023-11-06 12:17

中科大提出端到端的暗目标检测框架PE-YOLO

当前的目标检测模型在许多基准数据集上取得了良好的结果，但在暗光条件下检测目标仍然是一个巨大的挑战。为了解决这个问题，作者提出了金字塔增强网络（PENet）并将其与YOLOv3结合，构建了一个名为PE-YOLO的暗光目标检测框架。首先，PENet使用拉普拉斯金字塔将图像分解为4个具有不同分辨率的组件。具体来说，作者提出了一个细节处理模块（DPM）来增强图像的细节，其中包括上下文分支和边缘分支。此外，

xwz小王子·2023-11-06 06:49

《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 7

这一章来介绍NGS的下游分析富集分析简单的讲，富集分析就是一种统计分析的手段，用来筛选功能相类的一组基因是否富集中差异表达的基因中。当人们拿到了差异表达的基因时，很多时候因为差异表达的基因数量很多，面对这么多的基因，人们不知道如何找到合适的突破口进行下游的验证实验。于是从一堆差异表达的基因中找出有意义的基因进行RT-PCR验证以及基因敲除验证就需要使用到富集分析了选择正确的库(library,或者

小潤澤·2023-11-06 01:26

MacOS使用国内源安装Homebrew

首先执行命令如下/bin/zsh-c"$(curl-fsSLhttps://gitee.com/cunkai/HomebrewCN/raw/master/Homebrew.sh)"image.png按照提示可以选择中科大下载源

汗青fullstack·2023-11-05 21:29

anaconda源配置

（windows：C:\users\username\，linux：/home/username/）2.添加清华镜像和中科大镜像，文件内容如下：channels:-https://mirrors.tuna.ts

Geo_ffrey·2023-11-05 11:59

deepin15.10 Android 8.1 源码编译

参考使用清华或中科大AOSP源镜像下载Android源码Ubuntu下载完成AOSP后,reposync错误解决error:.repo/manifests/containsuncommittedchangesDeepin15.7Android8.1

Linn___·2023-11-05 04:24

更新刚刚安装的Kali && 安装增强功能以实现虚拟机任意大小缩放

、Kali系统更新源1.使用编辑器打开系统源文本vimleafpad/etc/apt/sources.list或者leafpadleafpad/etc/apt/sources.list2.填写更新源#中科大

DirtyMind·2023-11-05 04:55

单细胞转录组高级分析二：转录调控网络分析

然而单细胞转录组数据具有背景噪音高、基因检出率低和表达矩阵稀疏性的特点，给传统统计学和生物信息学方法推断高质量的GRNs带来了挑战。Sing

Seurat_Satija·2023-11-05 04:44

rcp2.6是什么意思_RCP Bioclipse版本2.2.0已发布

Bioclipse是基于EclipseRCP的化学和生物信息学的开源可视平台。

diluan6799·2023-11-04 12:18

2021-07-13顺正日课210-115-057

此时正是修身时〈约束日课〉1、修控情做到2、修仁爱做到3、读书《孟子》179-1814、修恒《大学》诵读第48天5、保身胎息早500晚500感恩敬畏慈悲6.格物致知今天无事，把时间给姑娘，她约了一个中科大的女孩

张铭顺正·2023-11-04 05:01

冯克勤先生访谈录

数学经纬网：老师，请您谈一谈您在中科大的求学经历。1958年中科大刚成立，学生和教员都不多。当时的带课风格和现在不一样。所有老师都是自己写讲义，当然参考书有很多，有

一万年太久_03f4·2023-11-04 03:35

macOS 安装brew

参考链接：https://mirrors4.tuna.tsinghua.edu.cn/help/homebrew/https://www.yii666.com/blog/429332.html安装中科大源的

Summer_Anny·2023-11-04 00:27

TCP / UDP 概念 + 实验(计网自顶向下)

(github.com)暂定打算分2步走，前置是中科大对应计网黑书的视频第1步完成14个WireShark实验，5个课后实验（共19个计网实验）第2步，还有时间的话，cs144的实验

千帐灯无此声·2023-11-03 21:06

linux npm 修改源_修改apt，pip，npm为国内镜像源

sudocp/etc/apt/sources.list/etc/apt/sources.list.bak编辑源列表文件sudovim/etc/apt/sources.list将原来的列表删除，添加如下内容(中科大镜像源

weixin_39867708·2023-11-03 18:07

pip修改为镜像源，window和linux修改方式

/simple/腾讯源：http://mirrors.cloud.tencent.com/pypi/simple/阿里源：https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/中科大

钟灵毓秀M·2023-11-03 18:23

生物信息学与功能基因组学（1）

生物信息学是一门集数学、计算基科学和生物学的工具与技术于一体的交叉学科，其研究内容涵盖了生物信息的获取、处理、存储、分配、分析和解释等各个方面。

顺昕如意·2023-11-03 06:22

生信必会格式：GFF和GTF的简介和转换

例子GFF转为GTF使用AGAT转换使用gffread转换使用GenomeTools转换其他工具：ea-utils、TransDecoder、Kentutils闲聊参考前言GFF和GTF两种格式，算是生物信息学中最基本最常用

万木春❀·2023-11-03 04:54

bedtools intersect用法详解

bedtools用法大全bedtools等工具号称是可以代替普通的生物信息学数据处理工程师的！

awk_bioinfo·2023-11-03 04:16

bedtools 用法大全

bedtools用法大全bedtools等工具号称是可以代替普通的生物信息学数据处理工程师的！

awk_bioinfo·2023-11-03 04:15

NGS基础 - GTF/GFF文件格式解读和转换

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析

生信宝典·2023-11-03 04:45

用maftools一行代码画出瀑布图

本文首发于微信公众号：生物信息学习昨天本科的一个师姐问我关于瀑布图的画法，想要画个瀑布图，问我有没有有什么工具可以画的，目标图如下：image.png于是给师姐介绍了maftools这个R包，这个R包功能非常强大

gtt儿_生物信息学习·2023-11-02 16:22

2021-03-03

核酸和蛋白质序列分析关键词：核酸序列蛋白质序列分析软件在获得一个基因序列后，需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。

85164760f6ac·2023-11-02 14:56

科研神器TBtools，拿来把你……

森言森语TBtools是一款优秀的生物信息学软件，也是我最早接触的生物信息学软件。从接触到现在差不多一年，边使用，边积累，算是学习路上的一款启蒙软件。

今日之森·2023-11-02 08:24

【生物信息学】单细胞RNA测序数据分析：计算亲和力矩阵（基于距离、皮尔逊相关系数）及绘制热图（Heatmap）

文章目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍三、实验内容0.导入必要的库1.读取数据集2.质量控制（可选）3.基于距离的亲和力矩阵4.绘制基因表达的Heatmap5.基于皮尔逊相关系数的亲和力矩阵6.代码整合一、实验介绍计算亲和力矩阵，一般按照以下步骤进行：导入数据：加载单细胞RNA测序数据集。数据预处理：根据需要对数据进行预处理，例如基因过滤、归一化等。计算亲和力：使用合适

QomolangmaH·2023-11-02 05:04

解决多模态大模型幻觉问题的秘密武器：“啄木鸟”免重训方法！哪里出问题啄哪里！

为了缓解这个问题，中科大开发了一种名为Woodpecker（啄木鸟）的新方法。这个方法可以从生成的文本中挑选出幻觉并进行纠正。具体来说，直接从模型给出的错误文

夕小瑶·2023-11-01 12:20

2023-在mac下安装Homebrew的国内镜像

您可以使用清华大学、中科大或阿里云的Homebrew镜像，以提高下载速度和可靠性。

itwangyang520·2023-11-01 10:38

计算机网络学习笔记7（协议层次和服务模型）

网课是b站中科大郑烇老师，杨坚老师课程，郑烇老师账号发布的图片均来自郑老师分享的PPT第一章计算机网络和互联网1.7协议层次和服务模型1、网络是一个复杂的系统网络功能繁杂：数字信号的物理信号承载、点到点

碧桃和露·2023-11-01 08:24

Windows子系统Linux安装简易指南(1)

最近接触到生物信息学Linux是处理生物信息学数据必备的工具之一，常用的笔记本或者电脑是windows系统但是处理较大数据时候不大方便，常见的是1.windows上面安装虚拟机然后在虚拟机上安装Linux

小乔爱科研·2023-11-01 07:10

可视化生信分析利器 Galaxy 之 Docker 部署

GalaxyProject（https://galaxyproject.org/）是很多年前在云计算背景下诞生的一个生物信息学可视化分析开源项目,是目前生物医学研究领域最受欢迎的在线生物信息分析工具之一

BioIT爱好者·2023-10-31 10:09

生物信息学之序列比对

针对DNA、RNA以及蛋白质序列，我们需要对其进行序列相似性搜索，来研究分析不同序列在结构和功能上相同与差异相似性【similarity】/一致性【identity】双序列比对（PairwisesequenceAlignment）同源性【homology】多序列比对（MultipleSequenceAlignment）旁系同源【paralogs】：同祖同种不同功直系同源【orthologs】：同祖

BHHANt·2023-10-31 09:51

生物信息学（1）——双序列比对之Needleman-Wunsch(NW)算法详解及C++实现

生物信息学系列博客索引生物信息学（1）——双序列比对之Needleman-Wunsch(NW)算法详解及C++实现生物信息学（2）——双序列比对之Smith-Waterman(SW)算法详解生物信息学（

大青儿·2023-10-31 09:19

生物信息学分析-blast序列比对及结果详细说明

1.软件说明Blast是一种基于序列比对的分析工具，可以用于寻找生物序列之间的同源性，它的全称是BasicLocalAlignmentSearchTool。Blast有多种版本和用途，最常见的是基于Web的Blast和本地安装的Blast程序。Web版Blast可以直接在NCBI网站上使用，而本地安装的Blast程序需要下载和安装在计算机上。Blast的使用流程一般为输入一个查询序列，与数据库中的

小果运维·2023-10-31 09:47

【计网 Socket编程】中科大郑烇老师笔记（九）

作者：海码007专栏：计算机四大基础专栏其他章节：网络快速入门系列、计网概述、计网应用层详解、计网Web和HTTP、计网FTP、计网EMail、计网DNS、计网P2P标题：【计网Socket编程】详解中科大郑烇老师笔记

海码007·2023-10-31 08:21

Manjaro、pip、conda更换国内源

在/etc/pacman.conf中添加以下命令，中科大源和清华源添加其中一个就可以了：[archlinuxcn]SigLevel=OptionalTrustedOnly#中科大源Server=https

盛夏的猫宁·2023-10-31 08:26

Ubuntu 镜像文件下载

指数定投小白·2023-10-31 07:12

「摸鱼快报003」哈佛生物信息学课程叫你乖乖呆家学习

https://github.com/harvardinformatics/learning-bioinformatics-at-home哈佛大学的科学家们为了让诸位乖乖呆在家里学习生物信息学，开始编撰一份学习清单方便大家在家里好好学习生物信息学

卖萌哥·2023-10-31 06:02

生物小工具

本文主要介绍一些生物小工具,尤其是在文章中的，还有就是生物信息学方面的，总而言之，言而总之，希望能够帮助到大家。

天明豆豆·2023-10-30 22:44

内趋力学习第6天

高考如愿考取了中科大，仍然“两耳不闻窗外事”，本

杨洁_4285·2023-10-30 20:14

mac 安装homebrew ,golang

一般选择中科大或者清华确认删除旧版

RSFeegg·2023-10-30 06:35

kali 安装 docker

否则就需要在每条命令前添加sudokali更新很慢，所以需要更换更新源#进入sources.lis重新编辑apt源vim/etc/apt/sources.list#清空里面的数据之后，复制以下的放入#其他apt源#中科大

可灵魂太重_·2023-10-30 05:13

【面试热点】2019安徽公务员面试热点：朋友圈大批量转发照片

【中科大云参考答案】将贴在设备上的封条贴在自家灶台上并通过网络传播，这是一种恶意诋毁执法机关的不良

中科大云教育·2023-10-29 16:28

【python】pip的使用

pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/阿里云：https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/豆瓣：https://pypi.douban.com/simple/中科大

想当运维的程序猿·2023-10-28 22:13

计算机网络学习笔记10（DNS）

网课是b站中科大郑烇老师，杨坚老师课程，郑烇老师账号发布的图片均来自郑老师分享的PPT第二章应用层目录第二章应用层2.4DNS：域名系统1、DNS的必要性2、DNS系统需要解决的问题问题1：如何命名设备

碧桃和露·2023-10-28 21:31

蛋白质PDB文件读取C++代码

在生物信息学中，PDB数据库是非常重要的蛋白质结构数据库。PDB数据文件的读取是进行蛋白质结构相关预测的重要步骤！

Jun-H·2023-10-28 03:53

【计网 CDN】计算机网络 CDN（Content Delivery Network）分布式网络架构详解：中科大郑烇老师笔记（八）

目录0引言1为什么需要分布式的网络架构？2视频流化服务2.1多媒体：视频2.2存储视频的流化（Streaming）服务2.3流媒体传输协议：DASH2.4面临挑战：服务器如何向上百万用户同时提供视频流化内容？CDN2.5CDN的一个简单应用案例2.6真实CDN应用场景Netflix（网飞）‍♂️作者：海码007专栏：计算机四大基础专栏其他章节：网络快速入门系列、计网概述、计网应用层详解、计网Web

海码007·2023-10-27 08:31

清华大学鲁志实验室内部生物信息学培训教材

授课的配套PPT都是共享在清华大学校园网盘：-[Bioinfo2020](https://cloud.tsinghua.edu.cn/d/b707e65b559549069938/?p=%2Fbioinfo2020%2FLectures&mode=list)-[Bioinfo2019](https://cloud.tsinghua.edu.cn/d/b707e65b559549069938/?p=

可以公开的秘密Scarlett·2023-10-27 00:07

【Python】使用Anaconda软件turtle画表格

听说镜像下载快中科大镜像网站：http://mirrors.ustc.edu.cn/官网：https://www.anaconda.com/download/#windows我用IDM在官网下载也有2-

云敬山·2023-10-26 23:49

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