分子动力学

HPC计算环境中的数学库

blacs,scalapck为线性方程库,主要用作物理化学软件中,最常用的为blas和lapack,Goto库为优化的blas库,性能比blas库提高很多. 2fftw库,主要为傅立叶变换库,主要用在分子动力学程序中
goldspring_1·2012-11-14 23:59

分子动力学简介

分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。
rogerzhanglijie·2012-10-18 10:00

蛋白质分子动力学模拟

1.系统的准备：假设有一个PDB文件含有500多个残基并且构成两条链。首先修饰PDB文件：除去remarks,connectivitydata和HETATMlines的数据(不包括晶体水)，然后增加TER标签在蛋白链间和改变一些氨基酸的名字如：HIStoHIE,HIDorHIP；和CYS。tleap-s-fleaprc.ff99SB   (告诉tleap将载入ff99SB力场，接下来载入蛋白）>m
rogerzhanglijie·2012-10-18 09:00

AMBER分子动力学简例

                   AMBER分子动力学简例（一）概述以下是使用AMBER包的简单教程，希望对开始学习分子动力学的同学有用处。
rogerzhanglijie·2012-10-18 09:00

分子模拟基础篇

此文为dddc_redsnow发表于biolover上的关于分子动力学的系列原创文章，相当经典与精彩，特此将系列文章整合，一起转载，望学习动力学的新手们共同学习，提高进步，在此特向dddc_redsnow
rogerzhanglijie·2012-09-05 13:00

利用TESLA GPU和MATLAB实现大规模型数据并行处理

Matlab2011在gpu上的应用华平2007Tesla宣布gpu有快速的浮点处理能力第一代的x86没有浮点处理单元，8087已经成为业界主流的架构512个核，非常适合做并行的运算真实的应用软件加速分子动力学基因的排序
frank2336·2011-07-22 08:00

关于级列设计理论

在某些领域，这一分析框架可以表现出完美的数学特性，如时频分析领域的小波分析(wavelet),统计学习理论中的支持向量机(SupportVectorMachine),分子动力学中的BBGKY级列等等。
canonical·2005-12-27 01:00

关于级列设计理论

在某些领域，这一分析框架可以表现出完美的数学特性，如时频分析领域的小波分析(wavelet), 统计学习理论中的支持向量机(Support Vector Machine), 分子动力学中的BBGKY级列等等
canonical·2005-12-27 01:00

关于级列设计理论

在某些领域，这一分析框架可以表现出完美的数学特性，如时频分析领域的小波分析(wavelet),统计学习理论中的支持向量机(SupportVectorMachine),分子动力学中的BBGKY级列等等。
canonical·2005-12-27 01:00

关于级列设计理论

在某些领域，这一分析框架可以表现出完美的数学特性，如时频分析领域的小波分析(wavelet),统计学习理论中的支持向量机(SupportVectorMachine),分子动力学中的BBGKY级列等等。
canonical·2005-12-27 01:00
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