医学图像

DICOM：Transfer Syntax传输语义之奇葩GE Private TS

TransferSyntax（暂定中文翻译为传输语义，8月初博客中提到的DICOM3.0标准中文版开源书籍计划顺利启动，后续会面临诸多专有名词的翻译工作，欢迎广大博友提意见）进行过多次的介绍，在DICOM医学图像处理
zssureqh·2015-08-03 00:00

关注自己所学所获

2015July8th美帝圣母大学陈子仪教授“computationalmedicine:problems.solutionsandresearchtrends”,关注计算医学和医学图像处理。
workerwu·2015-07-09 12:00

DR图像的畸变校正

而且在医学图像的三维重建中，未经校正的图像进行重建，还会带来一定的重影等干扰。因此，畸变校正是DR图像进行后续处理，不得不对待的一个问题。
轼辂·2015-07-07 15:44

DICOM的常用Tag分类和说明

1.前言：基于DICOM3.0标准的医学图像中，每一张图像中都携带着许多的信息，这些信息主要可以分为Patient,Study,Series和Image四类。
inter_peng·2015-06-16 08:18

DICOM的常用Tag分类和说明

前言：基于DICOM3.0标准的医学图像中，每一张图像中都携带着许多的信息，这些信息主要可以分为Patient,Study,Series和Image四类。
inter_peng·2015-06-16 08:00

DICOM：开源书籍之『DICOM标准中文版』启动计划

零零散散，原创博文也已写了上百篇，有“DICOM医学图像处理”专栏、有“踩坑填坑”、有“日积月累”，还有近期的“那时今日”
zssure·2015-06-14 01:37

[置顶] DICOM：开源书籍之『DICOM标准中文版』启动计划

零零散散，原创博文也已写了上百篇，有“DICOM医学图像处理”专栏、有“踩坑填坑”、有“日积月累”，还有近期的“那时今日”
zssureqh·2015-06-14 01:00

dcm4che2-Java Library for DICOM

1前言：     DICOM是所有医疗行业工作者都熟知的标准医学图像格式，但它又不止是一个图像格式那么简单。
inter_peng·2015-05-18 22:00

DICOM：DICOM3.0网络通信协议（续）

对于新知识点、新技术的涉猎会单独成文，对于与DICOM相关的知识统一放在了DICOM医学图像处理专栏里，其实DICOM英文全称是DigitalImagingandCommunicationsinMedicine
zssureqh·2015-03-15 17:00

DICOM医学图像处理：二零一四▪DICOM专栏一览

题记       二零一四刚过，新年伊始就发生了“外滩踩踏”恶性事件，告诫我们要珍爱生命，为自己更为家人……    回顾去年，有些许收获、有些许感慨……    曾经听过一个段子说两个在公司工作多年的老员工都要求涨薪，一个成功而另一个失败了，成功者是因为多年里一直在增长经验，而失败者却是一个经验用了多年。尤其是从事IT行业的我们，无论是偏向发展和更新快速的互联网，还是偏向相对稳固的传统行业，IT技术
zssureqh·2015-01-10 10:00

VTK 学习笔记--1 入门范例

采用的入门教材：《医学图像编程技术》电子工业出版社周振环伍云智赵明编著。上面这个教材听有人讲只是翻译了一下VTK的手册。但是我觉得还是值得看一看吧。
小王爷和老王爷·2014-12-31 16:00

DICOM医学图像处理：DICOM存储操作之 “多幅JPG图像数据存入DCM文件”

背景：    续上篇，继续介绍如何将多幅JPG图像数据存入DCM文件。即将有损压缩数据直接写入DCM文件，存储为Multi-frame形式。多幅JPG图像数据存入DCM文件：    为了避免引起歧义，这里着重说明一下。本博文的描述的场景是：假设我们手中有多张JPG文件，想把JPG文件写入DCM文件，即单个DCM文件包含多幅图像信息的Multi-Frame形式。该问题之前与CSDN博友y317215
zssureqh·2014-12-27 22:00

DICOM医学图像处理：DICOM存储操作之“多幅BMP图像数据存入DCM文件”

背景：本专栏“DICOM医学图像处理”受众较窄，起初只想作为自己学习积累和工作经验的简单整理。
zssure·2014-12-24 08:17

DICOM医学图像处理：DICOM存储操作之“多幅BMP图像数据存入DCM文件”

背景：    本专栏“DICOM医学图像处理”受众较窄，起初只想作为自己学习积累和工作经验的简单整理。
zssureqh·2014-12-24 08:00

DICOM医学图像处理：开源库mDCM与DCMTK的比较分析（一），JPEG无损压缩DCM图像

背景介绍：最近项目需求，需要使用C#进行最新的UI和相关DICOM3.0医学图像模块的开发。
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：Deconstructed PACS之Orthanc

背景：    此篇博文介绍一个开源的、基于WEB的DICOMServer软件。该开源软件完全使用C++编写，不依赖于第三方数据库（内置了SQLite数据库）或其他框架，支持RESTfulAPI设计模式。官网上提供了源代码，同时也给出了编译后的Windows和Linux系统的二进制安装包。Orthanc是PACS领域的一种改革，提出了“解构PACS概念”，即DeconstructedPACS，用户可
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：基于DCMTK工具包学习和分析worklist

背景：    DICOM3.0协议中有介绍关于worklist的部分。简而言之，worklist可以看做是放射科设备从医院RIS系统中自动读取患者信息的一种“通信协议”，可以指存储在RIS系统中的患者数据库，主要包括患者的基本信息（如年龄、性别、身高、体重、出生年月等），这与DCM文件信息头MetaInfo中的多数字段重合。因此从RIS系统中自动获取worklist是医院信息化的必要组成部分。下面
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：全面分析DICOM3.0标准中的通讯服务模块

背景：    最近在做关于PACS终端与RIS系统之间进行worklist查询的相关调试工作，因此又重新对DICOM3.0标准中关于网络传输的部分进行了阅读，在此将本周的工作进行一下总结，以加深对DICOM3.0标准的认识，从底层更加清晰的了解worklist查询、C-STORE、C-FIND等各种服务。要点：1）名词简称    该部分中会出现很多的常见名词的缩写，因此为了更好的理解其含义，先给出
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：DIMSE消息发送与接收“大同小异”之DCMTK fo-dicom mDCM

背景：    从DICOM网络传输一文开始，相继介绍了C-ECHO、C-FIND、C-STORE、C-MOVE等DIMSE-C服务的简单实现，博文中的代码给出的实例都是基于fo-dicom库来实现的，原因只有一个：基于C#的fo-dicom库具有高封装性。对于初学者来说实现大多数的DIMSE-C、DIMSE-N服务几乎都是“傻瓜式”操作——构造C-XXX-RQ、N-XXX-RQ然后绑定相应的OnR
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：Deconstructed PACS之Orthanc

背景：    此篇博文介绍一个开源的、基于WEB的DICOMServer软件。该开源软件完全使用C++编写，不依赖于第三方数据库（内置了SQLite数据库）或其他框架，支持RESTfulAPI设计模式。官网上提供了源代码，同时也给出了编译后的Windows和Linux系统的二进制安装包。Orthanc是PACS领域的一种改革，提出了“解构PACS概念”，即DeconstructedPACS，用户可
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DCMTK开源库类继承结构与DICOM3.0标准元素定义的对应关系图

在处理相关的DCM医学图像时使用了DCMTK开源库，废话不多说，直接贴图：图一：DCMTK开源库的类继承关系（主要是dcmdata模块的类继承关系，对于一般的DCM图像处理该模块绰绰有余）图二：DICOM3.0
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：DCMTK的wiki资料学习之PACS调试

背景：前段时间着重从dcmtk和fo-dicom（mDCM）源码角度进行剖析，期望加深对DICOM协议的理解。知其然，知其所以然。如果“所以然”很不好懂，那我们还是先多多“知其然”吧。搞清楚原理的目的不也是为了更好的运用于实践么？所以理论和实践应该彼此交错进行，理论搞不动了就搞搞应用，应用久了就钻研钻研理论。以前上DCMTK官网仅仅是浏览关于开源库中各个类的设计模式、依赖关系。最近在打开DCMTK
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：深入剖析Orthanc的SQLite，了解WADO & RESTful API

背景：    上一篇博文简单翻译了Orthanc官网给出的CodeProject上“利用OrthancPluginSDK开发WADO插件”的博文，其中提到了Orthanc从0.8.0版本之后支持快速查询，而原本的WADO请求需要是直接借助于Orthanc内部的RESTAPI逐级定位。那么为什么之前的Orthanc必须要逐级来定位WADO请求的Instance呢？新版本中又是如何进行改进的呢？此篇博
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：WEB PACS初谈三，PHP扩展骨架

背景：    最近两篇专栏博文讲解的都是有关WEBPACS环境的搭建，如果搭建的平台后端不进行DICOM的相关操作，其实跟PACS压根就一点关系也没有，所以最近几篇看似有些跑题，不过大家不要着急，开发环境的搭建本身就是一项巨大而且艰难的工程，等调试好环境后续的PACS相关开发就会如单机版一样得心应手，再忍耐一会，近期马上会开始介绍在平台上进行WEBPACS的研发。C/C++编写PHP扩展的环境搭建
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：Orthanc Plugin SDK实现WADO服务

背景：    Orthanc是博主发现的一个很完美的DICOM和HTTP服务端开源软件，前几篇分别介绍了Orthanc的基本使用。Orthanc从0.8.0版本之后给出了PluginSDK，通过该SDK可以利用Orthanc内建的RESTAPI实现WADO服务，下面就参照官网给出的说明介绍一下如何使用SDK实现WADO服务，并且对官网的实例进行更新，采用最新的方式直接实现WADO服务。官方说明中文
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：WEB PACS初谈四，PHP DICOM Class

背景：    预告了好久的几篇专栏博文一直没有整理好，主要原因是早前希望搭建的WML服务器计划遇到了问题。起初以为参照DCMTK的官方文档wwwapp.txt结合前两天搭建的WAMP服务器可以顺利的实现WML服务，借此就可以同时完成WEBPACS系列以及搭建DicomWML服务器的两篇博文。可是在实际部署过程中发现了几个严重的问题，一时无法解决。但是在搜索解决方案的时候，偶然间找到了在DCMTK论
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：fo-dicom网络传输之 C-Echo and C-Store

背景：    上一篇博文对DICOM中的网络传输进行了介绍，主要参照DCMTKWiki中的英文原文。通过对比DCMTK与fo-dicom两个开源库对DICOM标准的具体实现，对理解DICOM标准有一个更直观的认识。此篇博文是对上一篇博文的补充，因为专栏前面的示例大多是利用DCMTK工具包来进行的，此次借着分析fo-dicom源码结构的机会，参照fo-dicom的README.md，给出C-ECHO
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：深入剖析Orthanc的SQLite，了解WADO & RESTful API

背景：    上一篇博文简单翻译了Orthanc官网给出的CodeProject上“利用OrthancPluginSDK开发WADO插件”的博文，其中提到了Orthanc从0.8.0版本之后支持快速查询，而原本的WADO请求需要是直接借助于Orthanc内部的RESTAPI逐级定位。那么为什么之前的Orthanc必须要逐级来定位WADO请求的Instance呢？新版本中又是如何进行改进的呢？此篇博
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：WEB PACS初谈四，PHP DICOM Class

背景：    预告了好久的几篇专栏博文一直没有整理好，主要原因是早前希望搭建的WML服务器计划遇到了问题。起初以为参照DCMTK的官方文档wwwapp.txt结合前两天搭建的WAMP服务器可以顺利的实现WML服务，借此就可以同时完成WEBPACS系列以及搭建DicomWML服务器的两篇博文。可是在实际部署过程中发现了几个严重的问题，一时无法解决。但是在搜索解决方案的时候，偶然间找到了在DCMTK论
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：Deconstructed PACS之Orthanc，Modification & Anonymization

在常规的PACS系统中还未出现对于DCM图像的修改和匿名化操作，因此此次重点介绍Orthanc利用RESTAPI实现对DCM医学图像的修改（modification）和匿名化（anonymization
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DCMTK开源库的学习笔记4：利用ini配置文件对dcm影像进行归档

由于医学图像的特殊性，每一个患者（即所谓的Patient）每做一次检查（即Study）都至少会产生一组图像序列（即Series），而每一组图像序列下会包含大量的dcm文件（例如做一次心脏CTA的诊断，完整的一个心脏断层扫描序列大约有
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：fo-dicom网络传输之C-FIND and C-MOVE

背景：    该系列博文同属于DICOM协议中的“网络传输”部分，前两篇系列文章分别介绍了DCMTK和fo-dicom开源库对DICOM标准的具体实现（http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/41016091），以及给出了fo-dicom库对C-ECHO和C-STORE的简单实现（http://blog.csdn.net/zssureqh/art
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：开源库mDCM与DCMTK的比较分析（一），JPEG无损压缩DCM图像（续）

背景：    上周通过单步调试，找出了开源库mDCM与DCMTK在对DICOM图像进行JPEG无损压缩时的细小区别，并顺利实现了在C++和C#环境下对DICOM图像的压缩。但是问题接踵而至啊，随着项目的深入，发现在单独的测试工程中可以实现的mDCM版本，在嵌入到项目整体中后，却意外地出现了错误，并未顺利实现DICOM图像的JPEG无损压缩。因此需要继续详细对比分析mDCM与DCMTK两者，期望寻找
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：DCMTK在VS2012中的配置

背景：最近由于项目需要，将原本的开发IDE环境由VS2008升级到了VS2012。本以为编译完成后的DCMTK开源库可以直接从VS2008移植到VS2012。但是通过项目属性添加完包含目录和依赖库后，编译会出现大量的链接错误（大多是跟dcmdata.lib、oflog.lib有关）。解决方法：重新按照原本的博客前辈柳北风儿（大神目前已经博客转移到网易：http://blog.163.com/qim
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：WEB PACS初谈

背景：    周末看到了一篇原公司同事的文章，讲的是关于新的互联网形势下的PACS系统。正好上一篇专栏文章也提到了有想搭建一个worklist服务器的冲动，所以就翻箱倒柜将原本学生时代做课题时搭建的简易WebPACS找了出来，借着再次搭建的机会学习一下WebPACS相关的技术，例如WADO标准、CGI或者FastCGI等技术。WEBPACS技术浅谈：    WEBPACS是一种利用互联网技术，跨越
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：storescp.exe与storescu.exe源码剖析，学习C-STORE请求

此次通过结合早些时间的博文DICOM医学图像处理：基于DCMTK工具包学习和分析worklist，对DCMTK开源库中提供的storescp.exe和storescu.exe工具的源码进行剖析，从底层深入了解
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：DICOM网络传输

背景：    专栏取名为DICOM医学图像处理原因是：博主是从医学图像处理算法研究时开始接触DICOM协议的。
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：利用fo-dicom发送C-Find查询Worklist

背景：    如上一篇专栏博文所描述，Worklist可以看做是PACS系统、MODALITY设备和RIS系统之间的信息交换。从RIS系统到MODALITY通过Worklist可以提供诸如患者个人信息（姓名、年龄、生日等）和其他管理数据，以及提供关于成像过程和产生图像相关的一个唯一UID等信息。基本的结构如下图：（具体来源不清楚了，非本人原创）问题提出：    上一次利用DCMTK开源库顺利的模拟
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：Dcmtk与fo-dicom保存文件的不同设计模式之“同步VS异步”+“单线程VS多线程”

一、背景：    最近一直在做DCM相关的编程工作，以前项目使用C++居多，所以使用DCMTK开源库，而目前团队使用C#居多，所以需要转向使用fo-dicom库，由于前一篇专栏文章DICOM医学图像处理
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：AETitle在C-FIND和C-MOVE请求中的设置问题

背景：    最近去医院部署设备，调试PACS系统，遇到了一个奇葩的问题。基本场景是：医院内部网络情况复杂，多个楼层的诊室都安装了看图端，都需要访问顶楼机房的PACS服务器。起初为了调试关闭了防火墙，并确保各楼层的看图端与PACS服务器之间可以ping通，端口也顺利开放。但是具体部署调试过程中发现“有些楼层可正常进行worklist查询和Query/Retrieve查询，而有些楼层只能正常进行wo
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：WEB PACS初谈二，图像的传输

背景：    如前一篇专栏博文所述，借助于CGI或FastCGI技术转发浏览器发送过来的用户请求，启动本地的DCMTK和CxImage库响应，然后将处理结果转换成常规图像返回到浏览器来实现WebPACS。本博文通过实际的代码测试来验证这一模式的可行性，同时对C语言编写CGI脚本提出了一些问题。难题：    计划参照DCMTK自带工具dcm2pnm.exe的源码，通过DicomImage将DCM文件
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：浅析SWF、WML、SPS、MPPS

背景：    最近重新花时间阅读了DICOM标准，顺带着看了一下HL7标准和IHE，对标题中提到的SWF、WML、SPS和MPPS有了更进一步的认识，现将自己的理解整理出来，算作读书笔记吧。通过对比学习DICOM、HL7和IHE，从而更全面、更清晰的了解医疗信息行业。IHE、HL7与DICOMDICOM    IHE、HL7与DICOM，先介绍DICOM，即DigitalImagingandCom
zssure_thu·2014-12-11 08:00

DICOM医学图像处理：深入剖析Orthanc的SQLite，了解WADO & RESTful API

背景：    上一篇博文简单翻译了Orthanc官网给出的CodeProject上“利用OrthancPluginSDK开发WADO插件”的博文，其中提到了Orthanc从0.8.0版本之后支持快速查询，而原本的WADO请求需要是直接借助于Orthanc内部的RESTAPI逐级定位。那么为什么之前的Orthanc必须要逐级来定位WADO请求的Instance呢？新版本中又是如何进行改进的呢？此篇博
zssureqh·2014-12-10 21:00

DICOM医学图像处理：Orthanc Plugin SDK实现WADO服务

背景：    Orthanc是博主发现的一个很完美的DICOM和HTTP服务端开源软件，前几篇分别介绍了Orthanc的基本使用。Orthanc从0.8.0版本之后给出了PluginSDK，通过该SDK可以利用Orthanc内建的RESTAPI实现WADO服务，下面就参照官网给出的说明介绍一下如何使用SDK实现WADO服务，并且对官网的实例进行更新，采用最新的方式直接实现WADO服务。官方说明中文
zssureqh·2014-12-10 01:00

DICOM医学图像处理：DIMSE消息发送与接收“大同小异”之DCMTK fo-dicom mDCM

背景：    从DICOM网络传输一文开始，相继介绍了C-ECHO、C-FIND、C-STORE、C-MOVE等DIMSE-C服务的简单实现，博文中的代码给出的实例都是基于fo-dicom库来实现的，原因只有一个：基于C#的fo-dicom库具有高封装性。对于初学者来说实现大多数的DIMSE-C、DIMSE-N服务几乎都是“傻瓜式”操作——构造C-XXX-RQ、N-XXX-RQ然后绑定相应的OnR
zssureqh·2014-12-06 22:00

PhotoShop算法实现--算术乘法和除法（十三）

gmail.comhttp://blog.csdn.net/kezunhai     基本代数乘法和除法在图像处理中也是应用广泛（乘法可以作为掩膜屏蔽图像的某些区域，如需要保留的掩膜值255，需去除的掩膜置0；除法在气象学和医学图像方面有很大的应用
kezunhai·2014-12-01 22:00

DICOM医学图像处理：fo-dicom网络传输之C-FIND and C-MOVE

背景：    该系列博文同属于DICOM协议中的“网络传输”部分，前两篇系列文章分别介绍了DCMTK和fo-dicom开源库对DICOM标准的具体实现（http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/41016091），以及给出了fo-dicom库对C-ECHO和C-STORE的简单实现（http://blog.csdn.net/zssureqh/art
zssureqh·2014-12-01 00:00

DICOM医学图像处理：Deconstructed PACS之Orthanc，Modification & Anonymization

在常规的PACS系统中还未出现对于DCM图像的修改和匿名化操作，因此此次重点介绍Orthanc利用RESTAPI实现对DCM医学图像的修改（modification）和匿名化（anonymization
zssureqh·2014-11-29 14:00

使用局部标准差实现图像的局部对比度增强算法。

      图像的对比度增强算法在很多场合都有着重要的应用，特别是在医学图像上，这是因为在众多疾病的诊断中，医学图像的视觉检查时很有必要的。而医学图像由于本身及成像条件的限制，图像的对比度很低。
kezunhai·2014-11-27 21:00

DICOM医学图像处理：Deconstructed PACS之Orthanc

背景：    此篇博文介绍一个开源的、基于WEB的DICOMServer软件。该开源软件完全使用C++编写，不依赖于第三方数据库（内置了SQLite数据库）或其他框架，支持RESTfulAPI设计模式。官网上提供了源代码，同时也给出了编译后的Windows和Linux系统的二进制安装包。Orthanc是PACS领域的一种改革，提出了“解构PACS概念”，即DeconstructedPACS，用户可
zssureqh·2014-11-24 00:00
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