医学图像

对python读取CT医学图像的实例详解

需要安装OpenCV和SimpleItk。SimpleItk比较简单，直接pipinstallSimpleItk即可。代码如下：#coding:utf-8importSimpleITKassitkimportcv2#LKDS-00058,-102.655469971,108.188810974,438.759994507,12.2279986879if__name__=='__main__':fi
rongyongfeikai2·2019-01-24 09:18

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小，拍摄日期等等，那么如何可视化图像呢？importcv2importSimpleITKassitkimportmatplotlib.pyplotaspltimportnumpyasnpimage=sitk.ReadImage(path)image=sitk.GetArrayFromImage(image)#image=np.squee
Darlewo·2019-01-24 09:20

关于SimpleITK

ITK是一个功能很强大的医学图像处理公开库，搭配VTK用以显示图像，可以实现几乎所有医学图像处理的功能需要。ITK通常以C++包进行提供，当然也可以自己编译为Python包，不过编译过程比
iamcfb_·2019-01-22 20:15

U-Net模型

U-Net模型是一种改进的FCN结构，因其结构经论文作者画出来形似字母U而得名，应用于医学图像的语义分割。
iamcfb_·2019-01-16 16:45

基于 keras的全卷积网络u-net端到端医学图像多类型图像分割（一）

搜索结果，是用u-net做医学图像分割的较多，于是决定使用u-net。关于FCN的介绍，看这个博客吧，本文着重于代码实现！FCN介绍考虑到任务的价
Lynn_Chan·2019-01-11 11:11

全卷积神经网络图像分割(U-net)-keras实现

最近在研究全卷积神经网络在图像分割方面的应用，因为自己是做医学图像处理方面的工作，所以就把一个基于FCN（全卷积神经网络）的神经网络用keras实现了，并且用了一个医学图像的数据集进行了图像分割。
勇气与自信·2019-01-06 14:34

如何利用迁移学习提升医学影像分析效率|超级公开课NVIDIA专场预告

2018年11月28日，NVIDIA推出基于深度学习的医学影像的迁移学习工具包（TLT）和AI医学图像标注工具包，就是为了帮助开发者解决这些挑战。
智东西·2019-01-04 00:00

Conditional Generative Adversarial Network for Structured Domain Adaptation

ConditionalGenerativeAdversarialNetworkforStructuredDomainAdaptationAbstract近年来，深度神经网络已经战胜了许多计算机视觉问题，包括语义分割，这是新兴自动驾驶和医学图像诊断应用中的关键任务
而濡木染·2018-12-25 11:11

【数据集】一文道尽医学图像数据集与竞赛

文章首发于微信公众号《有三AI》【数据集】一文道尽医学图像数据集与竞赛在AI与深度学习逐渐发展成熟的趋势下，人工智能和大数据等技术开始进入了医疗领域，它们把现有的一些传统流程进行优化，大幅度提高各种流程的效率
言有三·2018-12-14 07:09

3Dslicer中的坐标系统（一）

一、简介我们在处理医学图像和相关应用时，首先需要我们了解的事情就是不同坐标系统之间的差异，在图像处理应用领域用的比较多比较常见的为以下三种坐标系统：世界坐标系，解刨坐标系和图像坐标系，本文我们主要介绍它们之间的差异和应用
似水~年华·2018-12-13 22:31

PACS医学影像知识记录梳理

1.了解pacs定义和术语PACS:(PictureArchiveandCommunicationSystem)医院用于和影像设备通信并存档医学图像以及提供诊断工作站的专业信息系统.RIS:(RadiologyInformationSystem
巨蟹小丸子·2018-12-12 19:26

PACS医学影像知识记录梳理

1.了解pacs定义和术语PACS:(PictureArchiveandCommunicationSystem)医院用于和影像设备通信并存档医学图像以及提供诊断工作站的专业信息系统.RIS:(RadiologyInformationSystem
巨蟹小丸子·2018-12-12 19:26

医学图像分割常用的损失函数

本文主要介绍医学图像中常用的损失函数，包括crossentropy,generalizeddicecoefiicients,focalloss 等。    
Biyoner·2018-12-03 17:44

【Unet系列】Unet & Unet++

U-net概述细节部分1、结构的解析2、一些小点resultUnet++概述细节部分resultsummaryU-netU-Net是一篇基本结构非常好的论文，主要是针对生物医学图片的分割，而且，在今后的许多对医学图像的分割网络中
One__Coder·2018-11-27 13:12

医学图像处理与深度学习

医学图像数据格式医学图像采用数字成像和通信（DICOM）作为存储和交换医学图像数据的标准解决方案。这个标准的第一个版本是在1985年发布的。发展到现在，该方案有了一些改变。
Monologue_thl·2018-11-20 10:47

多任务学习 Multi-task learning

但是，包括医学图像分析在内的一些应用无法满足这种数据要求，因为标注数据需要很多人力劳动。在这些情况下，多任务学习（MTL）可以通过使用来自其它相关学习任
DRACO于·2018-11-16 16:12

CT图像加窗显示

医学图像预处理PythonCT图像加窗显示 算法如下， 如果需要显示高对比度的图像，那么根据上述算法，将CT值映射到指定范围，即可获取清晰的图像了。
LD.·2018-11-06 18:01

(Tensorflow)手把手CNN入门：手写数字识别

通过卷积神经网络，我们已经能够创建自动驾驶汽车系统、面部检测系统和自动医学图像分析等等。在本文中，我将向你展示卷积神经网络的基本原理以及如何自己创建一个对手写数字进行分类的系统。
阿里云云栖社区·2018-11-05 00:00

医学图像了解

医学图像医学图像是反映解剖区域内部结构或内部功能的图像，它是由一组图像元素——像素（2D）或立体像素（3D）组成的。医学图像是由采样或重建产生的离散性图像表征，它能将数值映射到不同的空间位置上。
范中豪·2018-10-27 17:00

如何用基于resnet的Unet进行图像分割 基于Pytorch-0.5版本

1、关于UnetUnet主要用于医学图像的很多论文中，以及Kaggle竞赛和一些其他竞赛中“少类别”的图像分割。从我做实验的经验来说，像VOC这种类别比较多的分割任务，不容易收敛，效果较为差。
Hi_AI·2018-10-22 16:34

基于深度学习的医学图像分割综述

摘要：医学图像分割是决定医学图像在临床诊疗中能否提供可靠依据的关键问题。
echo_1994·2018-10-20 15:49

NiftyNet项目介绍

NiftyNet项目介绍简述NiftyNet是一款开源的卷积神经网络平台，旨在通过实现医学图像分析的深度学习方法和模块，支持快速原型和再现性，由WEISS(WellcomeEPSRCCentreforInterventionalandSurgicalSciences
范中豪·2018-10-16 20:00

深度学习（七）U-Net原理以及keras代码实现医学图像眼球血管分割

原文作者：aircraft原文链接：https://www.cnblogs.com/DOMLX/p/9780786.html有没有大佬们的公司招c++开发/图像处理/opengl/opencv/halcon实习的啊，带上我一个呗QAQ最近秦老师叫我研究深度学习与指静脉结合，我就拿这篇来做敲门砖，并且成功将指静脉的纹理特征提取用u-net实现了，而眼球血管分割则给我提供了很大的帮助。现在就分享给大家
aircraft·2018-10-13 10:00

深度学习（七）U-Net原理以及keras代码实现医学图像眼球血管分割

原文作者：aircraft原文链接：https://www.cnblogs.com/DOMLX/p/9780786.html有没有大佬们的公司招c++服务端开发实习的啊，带上我一个呗QAQ最近秦老师叫我研究深度学习与指静脉结合，我就拿这篇来做敲门砖，并且成功将指静脉的纹理特征提取用u-net实现了，而眼球血管分割则给我提供了很大的帮助。现在就分享给大家吧。。DRIVE数据集下载百度云链接：链接：h
weixin_34326558·2018-10-13 10:00

限制对比度自适应直方图均衡化（自我理解）

CLAHE算法对于医学图像，特别是医学红外图像的增强效果非常明显。
mjiansun·2018-10-10 17:53

使用Keras处理和识别医学图像

最近在做医学图像的处理，简单的记录一下。预处理已知的数据集是通过labelimg工具打好标签的图片(如下图所示)，总共区分三种病例。
zhangnengkai·2018-10-09 19:19

医学图像数据增强

图像数据增强介绍2种图像增强的方法导入需要的模块importrandomimportcv2介绍2种使用的比较多的方法：旋转和翻转defrandom_rotate_img(img,min_angle,max_angle):'''randomrotationanimage:paramimg:imagetoberotated:parammin_angle:minangletorotate:paramma
Adm1rat1on·2018-09-26 17:40

ISIC2018比赛经验分享

ISIC2018皮肤病分类比赛分享比赛概况2018年5月到7月28号，我们实验室（我们实验室的网址，欢迎加入我们实验室～）参与了由医学图像顶级会议MICCAI组织的2018ISIC皮肤病理图像分割和分类比赛
fatetail·2018-09-26 16:32

基于深度学习的CT图像肺结节自动检测技术一——数据预处理（归一化，数据增强，数据标记）

—>存储为png二、图像增强：（旋转，平移）三、准备U-net训练数据—数据标记开发环境Anaconda:jupyternotebook/pycharmpipinstallSimpleItk#读取CT医学图像
SongpingWang·2018-09-22 18:23

数字图像处理&&图像运算

一、图像的代数运算（医学图像处理、图像误差检测）首先把图像转换成与Matlab基本代数符类型相容的双精度浮点型，再利用Matlab的代数运算符实现图像的代数运算。
H轩轩轩轩哥哥·2018-09-21 15:47

基于深度学习的医学图像分割综述

转载：https://blog.csdn.net/weixin_41783077/article/details/80894466摘要：医学图像分割是决定医学图像在临床诊疗中能否提供可靠依据的关键问题。
jieshaoxiansen·2018-09-12 18:16

医学图像处理SCI期刊介绍

医学图像处理SCI期刊介绍SCIJournalsforMedicalImageProcessingTitleImpactfactorBrain10.870JournalofNeuroscience7.869CerebralCortex7.463Neuroimage7.063TechnicalNoteHumanBrainMapping7.032Bioinformatics6.911Applicati
三世·2018-09-03 09:25

DICOM图像像素值、灰度值与CT值

做医学图像处理会涉及DICOM图像，初学者应该要对图像像素有一定了解，在对像素处理中会一些算法会利用的更好。图像灰度值的概念是什么？灰度也可以认为是亮度，简单说就是色彩的深浅程度。
GlassySky0816·2018-08-28 11:18

基于深度学习的目标检测算法及其在医学影像中的应用

本文介绍了目前发展迅猛的深度学习方法在目标检测中的最新应用进展，然后介绍了基于深度学习的目标检测算法在医学图像领域的应用，最后讨
愿十四亿神州尽舜尧·2018-08-24 15:07

关于医学图像分类问题的一些归纳

1.医学图片与自然场景图片的区别医学图像检测与自然图像检测差别还是比较大的，自然图像的目标检测由于需要检测的类别非常多，现在的目标是更深的网络（提高目标的特征表示能力，resnet），更快的检测速度（最终需要商用
HelloWorld_SDK·2018-08-14 20:44

机器学习ground truth

比如，对某医学图像，含解剖结构，找某个医生进行边缘勾画，这个参考值，就成为了算法评价采用的真实值。
Byrd·2018-08-06 11:03

【SimpleITK教程】SimpleITK读取Dicom序列

医学图像数据常用的格式为dcm或者nrrd。
JianJuly·2018-07-26 09:02

tensorflow读取自己的数据集

注意：我自己是用来训练医学图像生成新的医学图像的，所以我的label都是1（或者其他数值），因为在GAN训练的时候完全用不到，只有分类的问题才能用到。
Eric2016_Lv·2018-07-25 22:18

DCGANs: 用DCGAN生成图片（MNIST）

由于接下来要做医学图像的东西，老板先让我跑着TF来玩玩积累经验。作为一个非计算机科班出身的人，写代码与理解代码的能力尤为重要。
Eric2016_Lv·2018-07-25 17:40

单张或多张jpg格式图像转换成dcm图像格式 。

在进行医学图像操作时，可以发现医学图像格式一般为dcm或者nii格式的3D图像。因为dcm文件包含的信息比一般的jpg文件多很多。这里可以发现单个dcm文件中包含了很多病人的信息。
skyfengye·2018-07-23 15:23

影像组学利器--pyradiomics简介

pyradiomics是一个开源的python包，用于医学图像的影像组学特征提取。
北海尚易·2018-07-16 14:43

unet做医学图像分割

关于unet网络医学分割的网址unet，大家可以在该网站中学习有关unet的知识我将我的版本上传上了github，这是用keras实现的，运行data.py就可以将图片转换成.npy格式，这里我已经生成数据了，直接运行unet.py就可以了大家可以在这里下载：https://github.com/huangshaoyin/U-net（具体参考的是哪个开源项目，我已经忘了，如有抄袭，可以联系我）打开
huangshaoyin·2018-07-14 10:05

医学图像分割中常用的度量指标

接下来给大家介绍一下医学图像中常用的几个度量指标,主要参考MICCAI2007-首先定义以下标识符:VgtVgt代表的是groundtruth的分割结果,VpredVpred代表的是预测的分割结果.
UpCoderXH·2018-06-04 21:42

【python进阶】python动态数组

在医学图像处理领域，我们经常会需要读取大量病人的图像。如何将这些图像全部读取进来并存成一个数组是一个经常遇到的问题。
JianJuly·2018-06-02 16:14

随机游走图像切割

随机游走算法很容易用于医学图像切割后处理。
lihanlun·2018-05-29 10:14

【python基础】HDF5之数据存储

因此在计算机视觉、医学图像处理领域推荐使用。HDF5在python中的使用主要依赖于h5py这个包。因此，在使用之前应该先进行安装。HDF5主要的对象有两种：datasets和groups。
JianJuly·2018-05-26 15:35

基于图像融合的变形轮廓线（一）

（3）医学图像处理，（
slicing·2018-05-06 10:51

医学图像分割--U-Net的颅内血管的分割 keras 实现

最近在进行医学图像的处理研究，主要是进行了颅内血管的CT图像的分割研究。现阶段进行深度学习的图像分割的研究基本就是几种比较成熟的几个方法，FCN，u-netdeeplab等一些方法。
skyfengye·2018-05-03 11:27

2018-04-27 MITK

算法实现：Gooood基于MITK的医学图像三维重建及其交互技术研究Comparisonofphotogrammetrysoftware发展历史：基于影像序列的三维重建的研究与实践效果图：基于MITK实现区域生长分割的介绍
七点水Plus·2018-04-27 10:45

2018-04-26 CT/VTK

医学图像三维可视化工具入门篇(VolPack,VTK,VolView,MITK)医疗信息化及医学影像处理常用名词ITK没有实现可视化的功能，在VTK中可以实现可视化，所以医学影像系统中，在用ITK进行分割的基础上
七点水Plus·2018-04-26 17:18
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