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宏基
NGS005 NGS方法小结
小型微生物基因组的测序对公共卫生领域的食品检测、传染性疾病监控、分子流行病学研究和环境
宏基
因组学很有用。从头
caoqiansheng
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2020-05-14 14:50
[R] 如何快速生成许多差异明显的颜色?
在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本,比如
宏基
因组中的物种分析:image.png方法一:自定义自定义颜色:优点是选择差异明显的颜色,缺点是费时费力,不知选多少种,眼睛都要挑花。
米源MY
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2020-04-27 15:25
中尚国际黄敏:一定是有品味的人引领未来商业。
当联想,惠普,
宏基
等等技术男品牌混战的时候,苹果以其美丽外观第一时间实现了差异化竞争。
坏孩子互联网金融
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2020-04-11 19:56
坐在电脑边上的教师
再后来386,486,586,一直到什么台湾
宏基
,再到联想,方正,戴尔……电脑技术如同日月变幻,换了一茬又一茬。
东营一般人
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2020-04-09 04:12
宏基
笔电系统重装记
上门见机,发现:
宏基
、i5、1t加载win7龟速进桌面龟速任何操作均龟速且出错!
海惊涛
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2020-04-09 00:49
007二班“六月飞扬”组金句萃取(20170621)
感情类:金婷、续亚萍、蔡高小碧进化类:张鹏、郑
宏基
投资理财类:孟慧果、罗飞。这次作业雨的质量有非常大的提升,大家都在成长中,祝贺战友们。陈周清|007-121,作业迟交,已发红包。
此生与你同行
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2020-04-07 16:12
宏基
因组分析流程
分析内容如下图所示:
宏基
因组分析具体分析步骤如下:数据质控,使用kneaddata软件,该软件先调用Trimmomatic过滤数据,然后利用bowtie2或bmtagger比对宿主数据库去除宿主数据(也可以去除核糖体数据
超人立志做国王
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2020-04-06 12:59
每天好消息分享
宏基
董事长陈俊圣只身空降,挽救亏损200亿的老店,出手的第一招就是「好事专线」。不断强调正向的事情那时候整个公司很闷的情况下,我就不断强调正向的事情。
周明达老师
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2020-04-06 02:19
微生物多样性知识点
微生物多样性或者
宏基
因组分析中,往往有几个出现频率很高的词,比如OTU,群落结构,alpha多样性,beta多样性。今天就来通过分析思路上(主要围绕微生物多样性)给大家解释一下这些高频词汇。
thinkando
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2020-04-05 02:22
IGC 数据库
https://db.cngb.org/microbiome/genecatalog/genecatalog_human/人肠道参考基因集2010年,人体肠道菌群
宏基
因组参考基因集的构建工作发表于Nature
thinkando
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2020-04-01 02:36
疫情中发挥重要作用的「
宏基
因组测序」,在本季度获得资本追捧
↑点击上方蓝字「IT桔子」每天了解一点创业投资作者:许梦翘来源:IT桔子(itjuzi521)基因测序技术在此次疫情中起到了至关重要的作用,我国科研单位在一个月之内迅速发现了正确的致病病毒并完成测序,得到了WHO「创纪录短的时间」的赞许。我国科学研究者对病毒序列、变异、核酸检测手段的分享也为全世界应对COVID-19疫情带来了极有力的支持。在病毒检测过程中,一种测序技术获得了市场的广泛关注,这个技
IT桔子
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2020-03-31 00:00
二班十二月高莹小组好文推荐——20171221
2、郑
宏基
军师姐姐
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2020-03-30 00:49
宏基
因组分析7-binning(Maxbin,metaBAT,CONCOCT)
maxbinhttps://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html安装cd/home/llt/softwarewgethttps://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/getfile.php?MaxBin-2.2.6.tar.gzmv'g
l_lightning
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2020-03-28 21:07
W6L3-商业基础-产业链W6L4-商业基础-供应链
因为微笑曲线造就了PC产业发展,微笑曲线能使
宏基
继续成长。微笑曲线的内涵实际是企业和行业价值链的体现。
P22121714
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2020-03-28 09:59
软件密钥过期怎么办-看这里——
宏基
因组基因预测软件MetaGeneMark
导读MeteGeneMark软件的gm_key经常过一段时间就会失效,因此为了以后重新下载秘钥方便,将其过程记录下来,防止各位看众的不知所措软件下载网址(为软件的下载界面):http://topaz.gatech.edu/GeneMark/license_download.cgi选择MetaGeneMarkLinux64版本,如下图所示:image注册信息:如下图image进入下载界面:image
Dayueban
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2020-03-27 09:07
Swift学习笔记-1:小马哥微博项目
**宏定义:**Swift中没有宏,使用其他的方法替代宏的功能,创建一个Swift文件:(使用起来和
宏基
本一样)。
赛赛_lzx
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2020-03-26 15:35
省新闻书画家协会丰庆书院苑揭牌暨书画惠民日在西安丰庆公园举行
省市有关领导姚增战、程万钧、李彬、任中南、杨宝珊、宁保忠、边江、王行舟、于媛等和省新闻书画家协会主席陈五季、监事长杨金良、顾问李少颇、副主席马师雄、刘
宏基
、王仁贵、张陇得、张魁、桂维平以及丰庆公园领导陈智欢
1d8d99731e97
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2020-03-23 03:37
2018-04-19
宏基
因组实战qiime2-201802(五)Alpha and beta diversity analysis
其实应该好好理解一下这些分析背后的意义,但是我感觉我还是在跑程序。。这一步主要做Alpha和beta多样性分析还是中文版和英文版一次参考一下先上代码-计算多样性qiimediversitycore-metrics-phylogenetic\--i-phylogenyrooted-tree.qza\--i-tabletable.qza\--p-sampling-depth1109\--m-metad
小郑的学习笔记
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2020-03-22 20:27
做时间的主人
关于刚毕业的、李宜展的116分、姚翌光的希望批评、李元恒的K值永远为正数、朱
宏基
的外国语作业。李莹的20000个跳绳,戚梦媛的馒头就水,杨思藩的逆袭一中,做优
雨风兼程
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2020-03-22 15:43
宏基
因组要不要混着拼呀?
许多人跟我交流,自己的
宏基
因组和宏转录组要不要拼接?然后拼接要不要混这拼?对于这些问题,其实我没有很多的实战经验跟大家分享,所以以前跟大家交流的都是在文献中看到的内容。
沈梦圆1993
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2020-03-22 09:42
股票行情图:需求概述
原本同事处理的,他其他原因,由我研究K线滑动这一块,在上一文《MPAndroidChart文章(我曾经的参考)》提到参考了A-Jiang的文章,有因为实际和Demo之间的区别,有一些功能无法实现,继续参考了庄
宏基
的
博麟K
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2020-03-19 17:28
晨间日记2018.8.15
3:昨晚下班买了一台手提电脑,牌子是
宏基
,质量保三年。售货员服务态度很好,帮我下载了很多软件。但是回来太晚了,没时间用,明天晚上再进行练习,有了手提电脑,
玉石精品
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2020-03-17 01:56
2月14日:金句总结践行007-87~98
目标清晰意向强烈完整计划迫切行动调整心态修正行为面对现实自律坚持持续地做系统地做死磕地做007-88郑
宏基
《一个包罗万“相”的“二
清香在变美变瘦变有钱
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2020-03-11 00:12
成为顶级战略高手的商科学习方法
王丰,和君集团副总裁,战略咨询专家南京大学本科,复旦大学硕士,北大博士,清华博士后在和君集团、和君商学院以产业洞察和战略思想闻名经手潮
宏基
、立思辰等多个经典案例团队主要服务上市公司,战略咨询费比肩国际一流咨询公司绝对的国家级战略咨询大拿近几年
一块白板走天下
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2020-03-05 21:31
操氏族谱汇总
1、安徽怀宁分支:儒兴振文广,子世云致希;启思明道显,国用建
宏基
。礼乐昭先泽,同敦一本传;运开英俊集,福衍万枝全。【儒兴振文广,子世云致希;启思明道显,国用建
宏基
。
PonyBillion
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2020-03-05 19:42
宏基
因组分析概述
ORF预测:Prodigal拼接和装箱binning——组装拼接:Megahit;组装评估quast;;基因注释:prokka;构建非冗余基因集:CD-HIT;基因组可视化(Circos,Vizbin);
宏基
因组中鉴定单菌
小王的学习杂记
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2020-03-01 11:49
宏基
因组mapping和binning笔记整理
1、mapping(bowtie2)比对,估计基因丰度2、利用contig的核酸组成和丰度的算法来binning,之后再进行单菌组装、
宏基
因组关联分析等Mapping简介:序列的两种分析策略:read-based
小王的学习杂记
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2020-02-29 14:50
linux,想说爱你并不容易
从我拥有电脑到现在毕业工作,在此期间,我可怜的
宏基
牌
春秋一语
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2020-02-27 05:00
买房未必要本事
买房未必要本事郎朗乾坤2013-2-156:17买房未必要本事
宏基
花园桥头有一位残疾人,靠修鞋挣钱,在这个年头里也买上了一套不错的住房;我单位一个最最老实巴交的职工颜玉锦,平时很少主动与人说话,夫妻俩利用下班后的时间
室静兰香a
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2020-02-26 21:52
电商专业学习嵌入式软件开发第二十三天
预科第十二天今天讲的内容有点多,老师先给我们讲了函数,然后讲了函数指针和函数的应用,中间还给我们穿插讲了部分
宏基
础。这部分内容够我消化几天了,再加上前几天还没消化完的,真担心后面会跟不上。
雨打梨花闭门寒
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2020-02-25 06:38
从CONCOCT入手理解
宏基
因组binning
目录1.
宏基
因组binning简介2.binning原理2.1.可用于binning的特征2.2.从哪些序列下手进行binning?
宇宙实验媛
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2020-02-23 20:17
第一次外宿,这些东西一定要带着!
潮
宏基
18K金手链、兰蔻情人节口红礼盒520现金红包等等...而且囤囤菌每
新氧
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2020-02-21 00:00
企业生存危机的三个通病
宏基
2000年做变革时总结过企业存在的三大问题:1.赏罚不明,晋升无标准;2.老大和公务员心态,缺乏危机感,按部就班,奉命执行;3.主管对公司策略的执行偏低,目标成为口号。
张振业
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2020-02-20 08:39
BMG多功能酶标仪快速筛选肠道微生物
近日,昆士兰大学迪亚曼蒂纳学院微生物学和
宏基
因组研究实验室,采用德国BMG多功能酶标仪进行肠道细菌群快速分离筛选研
伯齐科技
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2020-02-17 11:29
2018-04-20
宏基
因组实战qiime2-201802(六)物种分类和差异分析
物种分类第一步,下载注释看官方文档的介绍We’lldothatusingapre-trainedNaiveBayesclassifierandtheq2-feature-classifierplugin.ThisclassifierwastrainedontheGreengenes13_899%OTUs,wherethesequenceshavebeentrimmedtoonlyinclude25
小郑的学习笔记
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2020-02-15 09:33
二班 | 5月肖钧组作业统计-第4周
一、总体情况本组一共13位战友(其中围观1人)系统迟交:3位请假:1位二、本期优秀文章郑
宏基
《一次奇幻之旅》推荐理由:作者以亲自经历来阐述告之人性的念贪婪,看到的听到的或许都是巧合。
肖凤钧
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2020-02-15 08:06
宏基
因组基础知识
宏基
因组(metagenomics)
宏基
因组学(Metagenomics)也称为元基因组学,是以样品中的微生物群落作为整体进行研究的学科。自然界中约有99%的微生物是不能在实验室条件下进行纯化培养的。
bioinfo2011
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2020-02-13 05:58
联合出品人在行动|赤峰
宏基
集团捐赠160余万元物资支援疫情防控
疫情发生以来,赤峰
宏基
集团党委发挥基层党组织战
中外管理杂志
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2020-02-13 00:00
From 16S rDNA测序 To
宏基
因组学研究—技术发展及异同点
主要内容:1.16SrDNA测序2.
宏基
因组测序3.
宏基
因组的由来及发展过程4.16SrDNA测序与
宏基
因组的优势和局限性5.16srDNA测序与
宏基
因组技术差异————————————————————
JarySun
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2020-02-12 05:00
常见排序分析方法及R语言实现
它们对物种(或基因、功能)的分析具有重要作用,因而频频出现在16S测序及
宏基
因组测序中。以上分析本质上都属于排序分析(Ordinationanalys
thinkando
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2020-02-09 14:55
2019微生物组——扩增子16S分析和功能预测专题培训开课啦!
在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《
宏基
因组》在2019年1月1-3日北京鼓楼推出《扩增子有参无参分析和功能预测》专题培训第二期,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子实战分析学习和交流的机会
Larrylu007
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2020-02-09 08:32
NG-meta-profiler
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/367755v1.article-infoNG-meta-profiler,一个用于
宏基
因组的快速分析器,它执行序列预处理
YX_Andrew
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2020-02-09 07:20
题材及个股公告
【个股减持】希努尔(002485):终止回购公司股份潮
宏基
(002345):股东汇光国际拟减持不超2.98%股份兴森科技(002436):股东大成兴森1号和金宇星拟合计减持不超6.96%股份合力泰(002217
虎鲸信息
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2020-02-08 23:49
因为新型冠状病毒,它又登上了热搜...
大家知道,这次新型冠状病毒的自然宿主很可能是蝙蝠,而中间宿主一直没能找到...2月7日,华南农业大学宣称,通过分析1000多份
宏基
因组样品,发现穿山甲分离大病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%.
乌鸦电影
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2020-02-08 00:00
八月我的值月总结
各位战友大家晚上好:我是8月的值月生姚冬梅,同时也身兼一个志愿小组的组长,非常高兴大家在过去一个月里的支持和配合,非常感谢我们的志愿者们,文宜、张鹏、
宏基
、清香、园园,更感谢班长高莹给予的支持和帮助,有了他们的鼎力相助
此生与你同行
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2020-02-07 18:31
Qiime1-17.PICRUSt-16S预测
宏基
因组?
16S扩增子测序是对细菌中具有代表性的序列进行测序,相比
宏基
因组测序,16S扩增子测序无法提供基因功能信息,只能给出菌群丰度信息。
jlyq617
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2020-02-06 17:35
智慧路灯建设,要面对的问题
互联网基础设施建设中移动通信传统
宏基
站的确面临着基站选址难、建设难和保有难的“三大难”问题。
上海熙枚
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2020-02-06 07:30
宏基
因组基因预测软件
Prodigal也即ProkaryoticDynamicProgrammingGenefindingAlgorithm(原核生物动态规划基因查找算法,https://github.com/hyattpd/Prodigal/),主要应用于细菌和古生菌基因预测,如果要对meta样品做基因预测,prodigal还专门提供了meta的版本。相对与glimmer基因预测工具,prodigal步骤简单更加好用
thinkando
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2020-02-05 14:19
宏基
因组组装:从what 到how
宏基
因组分析教程microPITA|
宏基
因组测序前,你可以这样筛选样本microPITA加拿大安大略研究所建立的生物信息网1.什么是组装?
周运来就是我
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2020-02-05 02:06
5G时代已来,但运营商正面临诸多难题,需耗费巨资却业绩下滑
首先是5G网络的建设难度太大,前工信部部长李毅中预计中国要建成覆盖全国的5G网络,5G基站至少要达到600万座,较当前的4G网络多四分之一,而且这还仅仅是
宏基
站。
柏颖漫谈
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2020-01-24 22:41
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