用k-mer分析进行基因组调查:(四)用GenomeScope评估基因组特征+用Smudgeplot估计倍性
(全文约3500字)【推荐】用Smudgeplot评估物种倍性后,用组合jellyfish+GenomeScope1.0做二倍体物种的基因组调查,用组合KMC+GenomeScope2.0做多倍体物种的基因组调查。1.k-mer进行基因组调查的软件概况k-mer进行基因组调查分为k-mer频数统计和基因组特征评估两步。GenomeScope可以实现第二步基因组特征评估。需要在jellyfish/K