病历质控

单细胞测序-scRNA-seq数据的预处理与质控

scRNA-seq与bulk-RNA-seq同样是RNA的通量测序数据，在前期质控与后期分析都有什么异同？
作图丫·2022-02-09 00:50

抑郁远去，快乐出发！

我不知道有多少产后妈妈和我一样经历过这些，也不知道多少抑郁症患者不敢给别人看自己的病历，偷偷去看心理医生，偷偷的无助，最后发现谁也没法帮助自己。
黑色铝合金·2022-02-08 19:42

清晰表达五原则

很多专业文件都写得像八股文，无论是医师写的病历，
杨金社·2022-02-08 18:29

去PCR冗余

PrefixPE/1TACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT>PrefixPE/2GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTTrimmomatic等通常的质控软件
苏牧传媒·2022-02-08 14:28

第4篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（一）——phantompeakqualtools

学习目标：探讨ChIP-seq数据质量低的来源理解链交叉相关性（strandcross-correlation）使用phantompeakqualtools计算交叉相关性和其他相关的质控度量值评估交叉相关图
六六_ryx·2022-02-08 14:16

你值得给自己一个小小文案

生日前的晚上，因为忙于完成诊断学头次写病历的作业，耽搁时久，小先生两次起疑问到是否又在写两千字的文案（如同去年），我说没有，到今天也还不知道他当时信是不信。
静长·2022-02-08 10:45

实习第三周的尴尬记

周二，病历朗诵会。师姐：“你明天还来吗？”我：“当然来啊！”师姐：“你下个月还来吗？”我：“下个月就去心电图啦！”师姐：“明天不就是下个月？”周三，上课。下午跟导师门诊。
萧瑶剑客·2022-02-08 10:09

4. 蛋白质组学数据分析基础（1）

主要知识点：--质谱数据格式--结果报告的质控--DDA模式的工作原理质谱数据格式话说，蛋白质质谱从十几年前就形成了固定的数据结构和格式。
bioin·2022-02-07 17:53

元宵节快乐！但我想说点别的事

现在疫情这么严重，不时的爆出哪里又增加了确认病历，人心惶惶不可终日。以为安全了，其实，还有好多没有发病出来的，潜伏期太长了，等到发病的时候，已经传染好多人了。
甜甜的小葡萄·2022-02-07 17:47

单细胞交响乐4-归一化

因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExperiment单细胞交响乐2-scRNAseq从实验到下游简介单细胞交响乐3-scRNA的细胞质控
刘小泽·2022-02-07 15:51

Seurat学习与使用（一）

简介  Seurat是一个r包，被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析。Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源，同时提供整合不同类型的单细胞数据的函数。
小胡子老爷·2022-02-07 14:39

变天

今天的环节质控督导工作，查看手术病人的保暖工作是否做落实到位。嗯，每个人都非常细心的把自己的手术病人照顾的很暖和。术中保暖已经成为手术专科护理中
笑笑_a436·2022-02-07 04:38

【基因课】测序数据过滤和质控

1.课程大纲基础知识数据质控Fastqc结果解读数据过滤2.学习笔记2.1基础知识2.1.1测序原理SamplePrep：DNA随机打断加adapter；ClusterGeneration：桥式PCR；
猪猪头看世界·2022-02-07 03:57

扎根土壤向阳生，破茧成蝶终有日（持续更新中~~）

一、自我实现1.在公司二0一七年度评优评先活动中被评为先进个人2.统筹科室“新梦想•再起航”暨武汉格力旺季评优评先活动，奖项申报相关工作3.荣获质控部2018年旺季“最佳奋斗者”4.在公司申报武汉市质量奖中完成对
自强不息进化·2022-02-06 20:14

单细胞交响乐17-不同单细胞R包的数据格式相互转换

因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExperiment单细胞交响乐2-scRNAseq从实验到下游简介单细胞交响乐3-细胞质控单细胞交响乐
刘小泽·2022-02-06 08:43

单细胞交响乐10-数据集整合后的批次矫正

因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExperiment单细胞交响乐2-scRNAseq从实验到下游简介单细胞交响乐3-细胞质控单细胞交响乐
刘小泽·2022-02-06 04:23

我们都在勇往直前的路上，请端好你的那杯水

即使太阳比我下班还早，但她的余热仍旧蒸烤着这片天地，蒸烤着进进出出着医院大门的病人，或许厚厚的病历单和一项项检查结果比这闷热的天气更能焦灼人心吧。
twinkle国文307·2022-02-05 17:56

周检视（2018.6.18-2018.6.24）

本周计划1.完成病历工作（部分完成）2.清淡饮食，减脂，护肤（完成）3.完成天使班作业（完成）一、健康1.坚持六点前早起，十点半之前睡觉。图片发自App2.坚持晚7点以后不吃零食。
Ella_麦移群星·2022-02-05 13:57

你有一瓶涂改液未用

如今这家医院已不再手写病历，机打后处方后，医生仅仅手
暴走的小饼干·2022-02-05 07:33

关于利用脚本批量下载、转换、质控

首先我们明确一下操作流程1、利用Aspera批量下载文件2、利用FastQC语需要.fastq.gz文件，所以我们需要利用SRA-toolkits做格式转换3、利用FastQC做质控我的需要批量下载的序列放在
Better_man1·2022-02-05 05:27

日更第十二天

有一次，二宝丫生病，我拿病历本去找医生给看病。医生我的病历本时，来一位带小孩看病的大人。由于医生把两本病历互换，我看病历本回来没注意看。在等我看名字时，人已经走远了。我好激动，好难过，好担心，好害怕。
娰悦·2022-02-05 03:29

单细胞测序-scRNA-seq数据的标准化处理

我们都知道，从数据质控开始已经进入了scRNA分析阶段，在这个阶段开始测试代码，进行实操是很重要的。测试过程中出现的各种问题可能成为你学习路上的拦路虎。
作图丫·2022-02-04 21:12

单细胞测序-scRNA-seq数据的降维和可视化

在scRNA-seq数据通过一些列的预处理，质控以及标准化之后，后续分析步骤需要通过识别细胞间的基因表达差异来进行聚类，分析不同细胞群的差异性。
作图丫·2022-02-03 14:45

复训《重建价值大楼》练习五

——质控查病历二、这件事涉及的元素/材料是什么？——病历内容，医嘱，日常需要检查的项目，医政医保的要求三、这件事的步骤和流程是什么？
SUE用生命起舞·2022-02-03 07:31

单细胞交响乐21-实战四 批量处理并整合多个10X PBMC数据

因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExperiment单细胞交响乐2-scRNAseq从实验到下游简介单细胞交响乐3-细胞质控单细胞交响乐
刘小泽·2022-02-03 06:24

谁不是看过细水长流，最后变卑微

不知道从什么时候开始，桌子的角落里堆起了瓶瓶罐罐的各种药品，一直空白的病历本的前两页竟
倾城ccccc·2022-02-03 05:04

初心不改

QQ，刷的最多的就是抖音和快手了，最喜欢看里面的军人在训练，整齐的步伐，铿锵有力的声音，五.六个小时的军姿站得闻风不动，令我无比羡慕，看着通知书上的服军役通知，心中也燃起想去部队的冲动，可是看着医院给的病历单
文勤有方·2022-02-03 01:42

困囧之静心（一）

电话说：你30日在某超市购物结账时，与一新冠病历密接者在同一时间段在一个较近距离之内，需要说明一些情况。赶紧追问：你是哪里？答：市疾控中心。你的购物时间和金额是这样的吧？。嗯，属实。
飘逸的云5812·2022-02-02 23:38

周日核酸检测

从十天前的1个病例，到昨天新发5个病例，大部分病历都有冷库的工作经历。冬季气温低，新冠病毒比较活跃，这在2020年冬季新冠疫情出现时就有专家反复强调了。
鱼儿的七秒记忆·2022-01-23 16:05

【晚间复盘日记】2022-01-20

【成功日记】1，去质控办找了黄院长两次，关于那个学习的事情2，沟通耗材的事情，最后定于明天早上9点半一起沟通3，明天晚上一起吃饭，大家聚餐4，其他的没有了【反思日记】关于承担，关于家庭，当多了一个人的事情
木子的远方·2022-01-20 22:24

西安封城日记19 (2022-01-19)

今天是封城的第28天,但对于西安来说，是非常有意义的一天，今天是西安新增本土病历清零的日子，所以在下午的时候，已经宣布有三个区终于解封了，可以自由出入小区了。
萍聚0120·2022-01-19 22:29

【晚间复盘日记】2022-01-18

【成功日记】1，整理文件柜里的资料，两年了，把那些不适合全部粉碎，极简主义，做到电子化2，为湘东联系了临床路径的学习，质控办杨主任3，关于湘东的三大中心接口前期会议4，阅读1个半小时，安排明天的事项，完成了小红书的手抄金句
木子的远方·2022-01-18 22:14

【晚间复盘日记】2022-01-13

5，联系了质控科的黄主任，他说要年后再来参观学习【反思日记】今天主要是反思啥呢，自己做的决定容易受到外人的劝导而改变，立场不坚定，
木子的远方·2022-01-13 22:19

随笔‖向奋战在抗疫一线的所有人致敬

今天西安新增本土病历15例，这应该是这些日子以来新增人数最少的一天。我那颗揪着的心并没有轻松很多，因为陕西的邻居河南，多地疫情形势也变得异常严峻。
紫云婵·2022-01-11 09:32

疫情又一次来了

午休后朋友圈铺天盖地都是滑县的确认病历信息，没过一个小时，安阳报出来包括滑县在内的两例，一例是一名在汤阴上学的高中学生，一例是滑县的这位27岁的小伙子。
攀东者·2022-01-09 00:27

我的大西安，加油！

不断增加的阳性病历，让人忧心忡忡。西安是我的故乡，是我大学求学的地方，我的很多同学、朋友都留在了这座城市，这座城市，有太多让我牵挂的人。
萧寒晨夕·2021-12-23 23:19

益凤：开心

今日工作复盘：完成工作日常、完成科室考核表、完成考勤表，完成质控学习。国网预报名成功，省网信息保存。最为开心的是档案处盖章解决了，最初的焦虑不堪，到瞬间柳暗花明。想到发青同学，虽上次电话
天天向上的树·2021-12-23 23:20

单细胞转录组双细胞判别软件scDblFinder

在后续数据质控分析中，线粒体基因占比和双细胞率均很高，用scDblFinder进行双细胞预测，双细胞占率竟然高达34%。我很好奇，双细胞率为什么会这么高，如何审视这个结果？
whitebird·2021-12-22 13:44

2021-12-14

感谢病案室医生，细致询问，复印病历资料。感谢社区工作人员，工作认真负责，专业温情。感谢老公，开车陪着我跑了一上午，回来让我打下手，做烩面吃。感谢弟弟，积极配合帮助，解释情况。
海岛种植园·2021-12-14 22:38

用前端表格技术构建医疗SaaS 解决方案

电子健康档案（ElectronicHealthRecords,EHR）是将患者在所有医疗机构产生的数据（病历、心电图、医疗影像等）以电子化的方式存储，通过在不同的医疗机构之间共享，让患者面对不同的医生，
·2021-12-09 14:14

用前端表格技术构建医疗SaaS 解决方案

电子健康档案（ElectronicHealthRecords,EHR）是将患者在所有医疗机构产生的数据（病历、心电图、医疗影像等）以电子化的方式存储，通过在不同的医疗机构之间共享，让患者面对不同的医生，
·2021-12-08 10:29

用前端表格技术构建医疗SaaS 解决方案

电子健康档案（ElectronicHealthRecords,EHR）是将患者在所有医疗机构产生的数据（病历、心电图、医疗影像等）以电子化的方式存储，通过在不同的医疗机构之间共享，让患者面对不同的医生，
葡萄城技术团队·2021-12-08 10:00

RNA-Seq data analysis

数据准备数据来源测序下机数据直接进行质控和后续分析；已发表数据以“ThePP2A-interactorTIP41modulatesABAresponsesinArabidopsisthaliana”，这篇文章为例
胡小兵plus·2021-12-03 15:22

益凤：复盘

多年来的质控检查一直轻描淡写，今年却令我印象最深。见识了人品的浅薄，看到了现实的残酷，收到了整改的方向。
天天向上的树·2021-11-20 06:17

益凤：检查日

终于迎来质控检查，每一次来的都是新面孔，每一次都会有新的发现，形形色色，七七八八。
天天向上的树·2021-11-18 08:27

虚惊一场

我心想：遭了，是不是我们这座楼里有新冠的确诊病历了？回到家跟女儿一说，女儿顿时紧张起来。我安慰她说：不要紧张，这个老人我好像从来都没有见过，肯定不是我们这层楼的。
享瘦·2021-11-18 07:46

老妈闺蜜的心愿

我妈去探望，她问我妈，“病历上写了啥，怎么有个肝字？”我妈答“没啥，检查肾的时候，顺便给你查了肝，好着呢。”我妈又问“医生临走时嘱咐啥？”她答，“没啥，也不用顾忌啥？想吃啥就吃啥？
拈花一笑了之·2021-11-10 19:43

益凤：记录

忙完高校体检又是质控检查，与此同时好运来得太突然，在疫苗登记时遇到检查官相识的人，开玩笑之余也了解了一番，可爱的阿姨还亲自打电话过去，提醒检查时别吓到小姑凉了，哈哈。
天天向上的树·2021-11-10 06:46

4.单细胞 RNA-seq：质控分析

学习目标：构建QC指标和相关图便于直观地查看数据质量评估QC指标并设置过滤条件去掉低质量细胞单细胞RNA-seq：质量控制image此工作流程的每一步都有自己的目的和挑战。对于我们原始数据的QC，它们包括：目标：筛选数据，使其仅包含高质量的真实细胞，这样当我们对细胞进行聚类时，就更容易识别不同的细胞类群识别任何不合格的样本，并尝试挽救数据或将其从分析中删除，此外，还要尝试了解样本失败的原因挑战：从
denghb001·2021-11-08 16:21

3.单细胞 RNA-seq：质控分析设置

单细胞RNA-seq：质量控制设置image基因表达量化后，我们需要将此数据读入R中，执行QC的指标。我们将讨论可以预期的数据格式，以及如何将其读入R以便我们可以继续流程中的QC步骤。我们还将讨论我们将使用的数据集和相关的metadata。探索示例数据集我们将使用单细胞RNA-seq数据集，该数据集是Kang等人于2017年进行的一项较大研究的一部分。在本文中，作者提出了一种计算算法，该算法利用遗
denghb001·2021-11-08 16:16
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