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统计学-R语言
基于
R语言
APSIM模型应用
随着数字农业和智慧农业的发展,基于过程的农业生产系统模型在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农田固碳和温室气体排放等领域扮演着越来越重要的作用。APSIM(AgriculturalProductionSystemssIMulator)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。APSIM模型有Classic和NextGeneration两个系列模型,能模拟几十种农作物、牧
PhyliciaFelicia
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2024-02-19 16:51
生态
R语言
气象
r语言
开发语言
用通俗易懂的话来讲什么是假设检验,什么是置信区间,什么是零假设和备择假设
在
统计学
中,我们有一个“被告”——这就是我们的零假设((H_0)),通常是一种没有变化或效果的状态,比如“这个药物没有效果”。备择假设((H_1))则是与零假设相对立的假设,比如“这个药物有效”。
ALGORITHM LOL
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2024-02-19 15:20
人工智能
算法
深度学习
机器学习
R语言
:改造corrgram包画复合型相关性热图
corrgram用来画相关性热图很不错,因为此包可以使上下半个三角用于显示不同的图和信息,从而让热图信息比较充实。此函数内置了很多参数,比如可以通过lowe.pancel或者upper.panel的自带方法在上下半区显示:颜色热图,相关性系数,散点图,bar图等等。corrgram(data,diag=panel.density,lower.panel=panel.fill,#相关系数显示颜色up
蟒茶
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2024-02-19 14:05
R小系列
r语言
R语言
绘制热图
运用
R语言
绘制热图本文主要讲述绘制热图的两种方式,分别为利用pheatmap包和ggplot2包目录运用
R语言
绘制热图一、热图概念二、热图绘制方法1.利用pheatmap包2.利用ggplot2包一、概念热图是一种很常见的图
小潘的生信笔记
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2024-02-19 14:05
R语言
r语言
开发语言
1024程序员节
R语言
画相关性热图
R语言
进行聚类热图install.packages("corrplot2")install.packages("Hmisc")install.packages("pheatmap")library(Hmisc
还没秃头的程序猿-D
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2024-02-19 14:02
研究牲
r语言
开发语言
R语言
如何绘制相关性热图(14)
1.什么是相关性热图?相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。当两个变量之间存在非常强烈的相互依赖关系的时候,我们就可以说两个变量之间存在高度相关性。若两组的值一起增大,我们称之为正相关,若一组的值增大时,另一组的值减小,我们称之为负相关。默认一般使用皮尔逊算法算相关性。皮尔逊相关系
心有灵犀啦
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2024-02-19 14:31
R语言绘图
r语言
R语言
corrplot相关性热图制作
R语言
corrplot相关性热图制作使用
R语言
制作相关性热图,使用corrplot这个包,本文进行简略的介绍,函数的具体内容见文档:https://cran.r-project.org/web/packages
梦剧场zjugis
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2024-02-19 14:01
可视化
R语言
数据分析
r语言
数据可视化
数据分析
R语言
绘制相关性热图
1.ggplot2包ggplot函数绘制相关性热图###1.ggplot2包ggplot函数绘制相关性热图rm(list=ls())head(mtcars[,1:6])#查看前六行六列cormtcars%#将矩阵转换成数据框 mutate(x=rownames(cormtcars))%>% #新建一列x,是11种属性变量 melt(id='x')%>% #将宽数据转换成长数据,更适
qq_27390023
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2024-02-19 14:01
r语言
R语言
linkET包绘制相关性组合网络热图
能绘制热图的R包很多,既往我们已经介绍了《
R语言
pheatmap包绘制热图》,今天咱们来介绍一下
R语言
linkET包绘制相关性组合网络热图。
天桥下的卖艺者
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2024-02-19 14:29
R语言
科研绘图
r语言
开发语言
利用
R语言
绘制相关性热图
数据示例(归一化处理后):install.packages("corrplot")install.packages("ggplot2")install.packages("ggpubr")library(corrplot)install.packages("GGally")library(GGally)library(ggplot2)library(ggpubr)library(readxl)#读
陆小吉1212
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2024-02-19 14:53
r语言
python
开发语言
CDF和PDF的比较
以下内容来自ChatGPT,科技改变生活CumulativeDistributionFunction(CDF)(累积分布函数)和ProbabilityDensityFunction(PDF)(概率密度函数)是
统计学
和概率论中两个重要的概念
武小胖儿
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2024-02-19 14:31
数学知识
R语言
基本数据管理学习
“数据是一件麻烦事——一件非常非常麻烦的事。《星际迷航》本章内容1.操纵日期和缺失值2.熟悉数据类型的转换3.变量的创建和重编码4.数据集的排序,合并与取子集5.选入和丢弃变量1.创建新变量x%%y为求余;x%/%y整数除法。5%/%2的结果为2。利用$符号,也可以为为数据框添加新的一列,eg:mydata$sumx2.变量的重编码将一个连续型变量修改为一组类别值将误编码的值替换为正确值基于一组分
超人快飞
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2024-02-19 13:05
R语言
|绘制曼哈顿图
曼哈顿图(manhattanPlot)是一种散点图,因形似曼哈顿摩天大楼而命名,常用于全基因组关联研究(GWAS)以显示重要的SNP。曼哈顿图作为经典的可视化方式,通常用于显示具有大量数据点,许多非零振幅和更高振幅值分布的数据,不仅可以展示数据全貌,又能快速找到目标基因或OTU,同时可知目标的具体位置和分类、显著程度等信息。小编今天给大家分享一下manhattanPlot的绘制方法,使用R的qqm
维凡生物
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2024-02-19 13:06
RapidMiner缺失数据处理——去掉数据大量缺失的变量
和
R语言
相比,RapidMiner在数据处理方面要简单直观得多。虽然RapidMiner的功能可能不如R强大。
carlwu
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2024-02-19 11:59
数据挖掘
RapidMiner
数据挖掘
RapidMiner
Java
R语言
RapidMiner数据挖掘
根据KDnuggets在2011年的一次投票显示,从使用率来看该软件比之
R语言
还要略胜一筹。因为其具备GUI特性,所以很适合于数据挖掘的初学者入门。
arrow8071
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2024-02-19 11:28
data
mining
数据挖掘
线性回归:大体介绍
线性回归是一种常见的
统计学
和机器学习方法,用于建立一个线性关系模型来预测一个连续型目标变量。它假设自变量和因变量之间存在线性关系,并且通过最小化预测值与实际观测值之间的差异来确定最佳拟合直线。
Galaxy银河
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2024-02-19 11:56
计算机
/
人工智能
语言/方式/工具/模型/软件
大赏
人工智能
机器学习
R语言
课程论文-飞机失事数据可视化分析
数据来源:AirplaneCrashesSince1908(kaggle.com)代码参考:ExploringhistoricAirPlanecrashdata|Kaggle数据指标及其含义指标名含义Date事故发生日期(年-月-日)Time当地时间,24小时制,格式为hh:mmLocation事故发生的地点Operator航空公司或飞机的运营商Flight由飞机操作员指定的航班号Route事故前
talle2021
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2024-02-19 11:45
数据分析
r语言
数据分析
数据可视化
代码+视频基于
R语言
进行K折交叉验证
在如何划分2个集合的问题上,
统计学
界提出了多种方法:简单交叉验证、留一
天桥下的卖艺者
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2024-02-15 09:11
代码+视频系列
R语言
r语言
开发语言
异常检测-基于
统计学
的方法-学习笔记-2
1.概述
统计学
⽅法对数据的正常性做出假定。它们假定正常的数据对象由⼀个统计模型产⽣,而不遵守该模型的数据是异常点。
Rank_Fan007
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2024-02-15 05:37
跟着Nature学作图:
R语言
ggplot2频率分布直方图
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分组图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的Figure2c频率分布直
小明的数据分析笔记本
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2024-02-15 04:29
机器可能比你自己更了解你——《魔鬼
统计学
》告诉你原因
打开头条和抖音,你会看到你感兴趣的内容;打开淘宝和京东,你经常买的东西就会映入眼帘;甚至你只是在搜索引擎搜过几个关键词,在你浏览各种网站的时候,相关的信息也会铺天盖地向你涌来——很显然,我们已经进入了一个时刻被人“惦记”的时代。这背后到底发生了什么呢?我们的社会又是为什么会变成现在这个样子的呢?如果你也是和数据打交道的人,你可能知道,在这些应用的背后,大数据技术和人工智能技术正在主导着一切。但对于
书山指路侠
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2024-02-15 01:12
ggplot2不能截断纵坐标肿么办
R语言
实现数据和原图dfWarning:Removed1rowscontainingmissingvalues(position_stack).library(ggplot2)ggplot()+aes(
小洁忘了怎么分身
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2024-02-15 01:02
我和学员之间那些不由想要炫耀耀的事
她分享个人的经历激励学员好好学习.她带领其他班委一起做做好公告、消息搬运,及时回复,活跃班级的氛围,并且在课程完成后,帮功我
统计学
员的学习完成情况。说她是得力干将毫不为过
小武秘
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2024-02-15 00:03
R语言
ggplot2绘图拟合曲线的置信区间边框变成虚线
https://stackoverflow.com/questions/57988682/how-to-remove-filled-area-on-se-when-plot-geom-smooth-in-ggplot2library(ggplot2)ggplot(data=mtcars,mapping=aes(x=wt,y=mpg))+geom_point(size=2)+geom_smooth(
小明的数据分析笔记本
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2024-02-14 20:28
R语言
学习之基本文字处理代码
...getwd()setwd("")is()rm()q()字符串的处理常用代码切割strsplit()子集substr()大小写toupper()tolower()文字连接paste()paste0()替代文字gsub()去除前后空格strtrim()举例strsplit("hello,world",",")substr("hello,world",start=2,stop=4)toupper(
佐博伊森
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2024-02-14 17:26
R语言
从拍摄照片生成色卡用于统计图
ok.pngex_2021-04-29_02-10-25.pngex_2021-04-29_02-13-55.png图片1.jpg微信图片_20210429013555.jpg#ThuApr2901:37:232021-#字符编码:UTF-8#R版本:Rx644.0.5forwindow10#
[email protected]
#个人笔记不负责任,拎了个梨.rs.restartR()requir
youmigo
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2024-02-14 16:14
AI面试第六弹(评价指标)
分类问题指标分类问题的评价指标多是基于以下混淆矩阵·真实值是positive,模型认为是positive的数量(TruePositive=TP)·真实值是positive,模型认为是negative的数量(FalseNegative=FN):这就是
统计学
上的第二类错误
加油11dd23
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2024-02-14 13:26
8、python多项式贝叶斯文本分类(完整)
1、贝叶斯定理(BayesTheorem)朴素贝叶斯分类(NaiveBayesClassifier)贝叶斯分类算法,是
统计学
的一种分类方法,它是利用贝叶斯定理的概率统计知识,对离散型的数据进行分类的算法
UP Lee
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2024-02-14 13:32
数据挖掘实战
多项式贝叶斯
文章分类
R语言
入门学习笔记(2)
课程源代码:https://github.com/miwu8512/IntroToR视频地址:https://www.youtube.com/watch?v=rPj5FsTRboE&list=PLBTcf4SwWEI9_kCOJ-1o-Jwr-_Qb6bkegLecture2数据集的结构和作图的主要变量1understandingthedataset1.1Vector向量Define:Vector
DC小白
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2024-02-14 12:45
【图文】央视新闻报道我校学生党员党性教育活动
统计学
院学生党员罗紫丹说:“进入新时代,青年人对红色基因的传承,关系到党和国家的发展,关系到中华民族的复兴,关
山东工商学院
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2024-02-14 11:17
R语言
作业-20题
1.安装包代码在https://github.com/jmzeng1314/5years/blob/master/learn-R/tasks/3-r-20-codes.R二.2、了解ExpressionSet对象,比如CLL包里面就有data(sCLLex),找到它包含的元素,提取其表达矩阵(使用exprs函数),查看其大小3、了解str,head,help函数,作用于第二步提取到的表达矩阵sup
鱼啸九天
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2024-02-14 11:17
【量化干货合集】你想要的,都在这里!
(以下很多策略均包含源码分享供参考,欢迎大家多多交流谈论)资料分享Python、研究报告、计量经济学、投资书籍、
R语言
等!
水哥哥123
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2024-02-14 09:01
量化分析
量化
python
talib
Hadoop+Spark+MongoDB+MySQL+C#大数据开发项目最佳实践
为此,本文拟利用医院现有的历史数据,挖掘出有价值的基于
统计学
的医学规则、知识,并基于这些信息构建专业的临床知识库,提供诊断、处方、用药推荐功能,基于强大的关联推荐能力,极大地提高医疗服务质量,减轻医疗人员的工作强度
yiyidsj
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2024-02-14 07:08
大数据
人工智能
互联网
spark
Hadoop
MySQL
大数据开发
大数据学习
R语言
的ggplot2画图去掉图例的灰色背景
R语言
默认的图例如下library(ggplot2)ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+geom_point(aes(color=Species
小明的数据分析笔记本
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2024-02-14 06:09
单细胞测序最好的教程(一):质量控制
但是,其在国内的推广有两个不足:(一)全英文教程;(二)
R语言
与Python混合。二者限制了其在国内的推广
Starlitnightly
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2024-02-14 06:18
python
Python版RNA-seq分析教程:DEseq2差异表达基因分析
在omicverse中,除了最简单的ttest外,在这里,我们介绍一种类似
R语言
中的Deseq2等包的模型来计算差异表达基因。
Starlitnightly
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2024-02-14 06:48
python
开发语言
PySCENIC(一):python版单细胞转录组转录因子分析
关于单细胞转录组转录因子的分析我们之前在单细胞系列讲过
R语言
版本的,参考:跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):转录组因子分析,但是
R语言
分析起来速度非常慢,如果你动辄上万的单细胞可能要运行好几周,这显然不现实
TS的美梦
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2024-02-14 06:47
python
r语言
开发语言
单细胞
转录因子
HMM 隐马尔可夫模型初学(一)
笔记首先总结概括HMM相关理论知识,再通过生信序列的
R语言
实操对HMM深入了解1、MM,Markovmodel马尔科夫模型(1)天气举例假设只有晴、阴、雨三种天气情况。
小贝学生信
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2024-02-14 03:48
横向柱状图
横向柱状图正负值分开,颜色区分标签:
R语言
f3cb8856-be9b-4e46-a8cc-97656aa14e56.png上面的示意图中我们要注意的问题:横向柱状图正负值区分颜色赋值画柱状图两侧柱子标签
假装自己90斤
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2024-02-14 02:34
想学习关于人工智能的技术,去哪里学习比较好?
人工智能是多学科交叉领域,是需要有计算机软件,
统计学
,数学等多学科支撑的复杂技术。如果想从事人工智能的相关工作,那就需要具备一定的专业背景和强大的学习能力。
程序猿蓝天
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2024-02-14 02:18
思考快与慢(24)——外部意见和内部意见
当苍白无力的
统计学
信息和我们对个案的印象冲突时,这些信息总是会被舍弃。在与
持续学习持续成长
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2024-02-14 02:45
跟着BMC genomics学作图:
R语言
ggplot2+ggtree进化树拼接三角热图
image.png有读者在公众号留言问这个图的实现办法,今天的推文介绍一下这个图的
R语言
实现代码这个图示物种的进化树,热图展示的是kaks的值首先是进化树的数据image.pngnwk格式的树文件还有一个物种的分组文件
小明的数据分析笔记本
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2024-02-13 22:30
零基础自学数据分析经验分享
《深入浅出
统计学
》看到理解不了为止目标二:掌握SQL的7大核心语句以及表连接和子查询正确认知SQLimage夯
IT孔乙己
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2024-02-13 22:35
Python 3 时间序列可视化指南
简介时间序列分析属于
统计学
的一个分支,涉及对有序的、通常是时间性的数据进行研究。当适当应用时,时间序列分析可以揭示意想不到的趋势,提取有用的统计数据,甚至预测未来的趋势。
张无忌打怪兽
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2024-02-13 19:17
Python
python
开发语言
00005. 在朴素Bayes模型中,为什么需要Laplace平滑?
统计学
上,在计算实例的概率时,如果某个量x,在观察样本库(训练集)中没有出现过,会导致整个实例的概率结果是0。
deBroglie
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2024-02-13 15:31
Ps:统计
Ps菜单:文件/脚本/统计Scripts/Statistics统计Statistics脚本命令提供了一种高效的方法来处理和分析大量图像,使用户能够自动执行复杂的图像分析任务,并在多个图像间应用
统计学
方法
MediaTea
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2024-02-13 14:24
多个总体均值的比较(多元方差分析)
多元方差分析是什么多元方差分析是一种统计方法,用于比较两个或更多组的均值在一个或多个自变量上的差异是否具有
统计学
意义。它可以同时考虑多个自变量对因变量的影响,以及自变量之间的交互作用。
亦旧sea
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2024-02-13 14:53
均值算法
算法
机器学习入门--支持向量机原理与实践
其原理是基于
统计学
习理论中的结构风险最小化原则。SVM的主要思想是将数据通过一个高维特征空间进行映射,使得在
Dr.Cup
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2024-02-13 13:36
机器学习入门
支持向量机
机器学习
算法
R语言
-dplyr包进行条件均值
实际处理数据中,我们往往需要将某变量分组进行运算,dplyr包中的group_by和summarise函数联合使用,会让code变得更简洁。library(dplyr)##读取tsv格式文件data%group_by(age)%>%summarise(friend_count_mean=mean(friend_count),friend_count_median=median(friend_cou
PriscillaBai
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2024-02-13 13:27
R语言
群组变量选择、组惩罚group lasso套索模型预测分析新生儿出生体重风险因素数据和交叉验证、可视化
原文链接:http://tecdat.cn/?p=25158原文出处:拓端数据部落公众号本文拟合具有分组惩罚的线性回归、GLM和Cox回归模型的正则化路径。这包括组选择方法,如组lasso套索、组MCP和组SCAD,以及双级选择方法,如组指数lasso、组MCP。还提供了进行交叉验证以及拟合后可视化、总结和预测的实用程序。本文提供了一些数据集的例子;涉及识别与低出生体重有关的风险因素。结果是连续测
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2024-02-13 13:46
数据挖掘深度学习人工智能算法
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