近交系数

群体遗传学--近交系数

Hardy-Weinberg定律的重要前提；但是实际中，群体间经常会发生近亲交配，特别是在植物群体中，在近亲交配的群体中，婚配关系并不随机，导致群体中纯合体的比例上升，杂合体的比例下降；因此，为了衡量群体的近交程度，近交系数诞生了
zhu_si_tao·2023-09-19 02:50

ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS

连续纯合片段（runsofhomozygosity,ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数，它比传统系谱计算的期望近交系数更加准确，而且不再依赖于系谱记录的准确性和完整性
琴酒martini·2023-08-17 21:22

GATK中如何计算Inbreeding coefficient（近交系数）

cover[注]本文同时发布于我的个人博客关于近交系数是什么的定义，除了英文资料，中文上也给出了清晰的定义，这里引用一下：近交系数（inbreedingcoefficient）是指根据近亲交配的世代数，
黄树嘉·2021-04-23 11:49

plink计算近交系数

1.提取个体listbcftoolsquery-lSNP.filtered.vcf>ind.txt2.计算近交系数#不能有multiallelbcftoolsview-M2-vsnpsbsz_maf_filtered.vcf
铃_0d92·2020-12-19 21:40

群体遗传学数学基础

4.2S(G)=2S(A)遗传多态性1.描述遗传多态性2.杂合度H，群体基因的多样度总结群体中亲属关系研究1.有限个状态（值）的二维离散型随机变量的联合分布2.当X和Y为数量性变量3.当X和Y不能量化4.近交系数
ruby912·2020-07-11 22:36

《遗传学》课程-学习笔记之二

写在前面了解近交系数与亲缘系数近交系数的计算实例平均近交系数果蝇有XY染色体，但其性别决定机制是X染色体与常染色体的比例决定这个图片似乎让我想起了很久很久以前的考卷题目....其实，做过分析的人都会很清楚
生信札记·2020-06-27 21:32

群体遗传分化

FIS,是Hi相对于Hs减少量的比值，也就是地方群体平均近交系数。Fst，是Hs相对于Ht减少量的比值，可理解为有亲缘关系地方群体间的平均近交系数。Fit，是H
WooWoods·2020-03-14 03:34

常见实验室小鼠的命名规则~

参考标准：中国国家质量监督检验检疫总局发布的〖实验动物哺乳类实验动物的遗传质量控制〗（GB14923-2010）1、近交系近交系是指近交系数大于99%、近交程度相当于20代以上连续全同胞或亲子交配，群体遗传基因高度纯合稳定的动物群
汐阳_f871·2020-02-06 07:47

Genome-wide Complex Trait Analysis（GCTA）

目前GCTA工具可实现以下功能：1评估全基因组SNP的亲缘关系（遗传关系）2评估全基因组SNP的近交系数3评估所有的常染色体SNP对于变异的解释度（遗传度）4评估遗传方差与X-染色体的关联5检测遗传方
又是一只小菜鸟·2019-07-04 21:25

根据系谱计算近交系数和亲缘关系系数（How to）

##把近亲系数为0的列去掉colnames(real_xishu)IDSireDam1NANA2NANA31241NA543652调用GetASremlInfor函数，会在工作路径下输出两个Excel近交系数
育种数据分析之放飞自我·2017-07-31 13:23

Charlesworth 2009近交衰退

近交系数个
董八七·2016-12-05 17:24
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