BioInfo 第2页

R语言中的生存分析

本文出自于http://www.bioinfo-scrounger.com生存分析是研究生存时间的分布规律，以及生存时间和相关因素之间关系的一种统计分析方法其主要应用领域：Cancerstudiesforpatientssurvivaltimeanalyses

disuibing1805·2020-07-14 09:47

python练习题2 从两个DNA序列中找到突变位点的数量

#_*_coding:utf-8_*file=open('E:\\bioinfo\study\data\\text6.txt',

shenny!·2020-07-11 15:38

matlab实现最短路径

求某两点间最短距离利用matlab的bioinformaticsToolbox中的graphshortestpath具体使用见MathWorks文档http://cn.mathworks.com/help/bioinfo

mei2532·2020-07-11 13:08

STAR对RNA seq进行map

STAR本文出自于http://www.bioinfo-scrounger.com第一次听说START这款比对软件是因为其是ENCODE计划的御用软件，ENCODE计划(ENCyclopediaOfDNAElements

disuibing1805·2020-07-09 15:06

31、NGS 常用分析软件

转载：http://www.zilhua.com/2081.html参考资料：http://bioinfo.mc.vanderbilt.edu/NGS/software.htm1.MappingBFAST

Rki-dor·2020-07-08 13:07

宏基因组分析4-宏基因组组装(MEGAHIT,IDBA)

MegaHithttp://www.l3-bioinfo.com/products/megahit.htmlhttps://github.com/voutcn/megahit安装sudoaptinstallg

l_lightning·2020-07-06 21:16

学习Linux常用命令网站链接整理[持续]

://man.linuxde.net/Linux命令大全完整版http://blog.csdn.net/first_starrysky/article/details/745741072、生物信息学(BioInfo

xcaryyz·2020-06-29 23:54

bioinfo100 —— 第35题 RNA-Seq 数据的定量之RPKM和FPKM

https://zhuanlan.zhihu.com/p/50811365Hello大家好！好久不见了！之前手头上一直有很多事情，因此咱们的生物信息学100个基础问题（BBQ100）也耽误了一阵子，给大家鞠躬道歉，以后希望能够保持一定的更新速度，早日填完我们这个立下的Flag！根据之前的规划，我们将用接下来的几期问题来探索一下RNA-Seq定量的问题，也就是要探索一下我们常说的RPKM，FPKM，

RachaelRiggs·2020-05-26 15:54

bioinfo100-第（4&5）题-illumina II&adapter

可参考zhn博客mhw知乎mhw100题第4题，illumina测序技术细节探究II1.Illumina目前主流的测序仪都有哪几种型号？各自大概的通量是多少？（也就是1个run能跑出多少数据）目前主流的测序仪及其通量主要是Hiseq2500（50-1000Gb）、Hiseq3000（125-750Gb）、Hiseq4000（125-1500Gb）、HiseqXFive（900-1800Gb）和Hi

RachaelRiggs·2020-05-10 22:14

bioinfo100-第6题-读懂FastQC报告 Part I

zhn-blogmhw-zh读懂FastQC报告PartI通过前面的5个问题，我相信大家对Illumina测序，测序的储存文件格式，一些简单的建库原理已经有了一个初步的认识。那么接下来，我们就要用我们学到的知识去解决一些问题啦。在实际操作和处理过程中，我们拿到的Illumina测序数据应该是.fastq.gz格式，其中gz表示的是使用gzip进行压缩，fastq表示使用fastq格式进行存储。获得

RachaelRiggs·2020-05-10 22:53

ASCP软件安装

condasearch-chccaspera-cliLoadingchannels:done#NameVersionBuildChannelaspera-cli3.7.70hcchttps://www.bioinfo-scrounger.com

佳名·2020-05-10 20:50

[Python] 爬取生信坑论坛 bioinfo帖子相关信息 (requests + openpyxl + pymysql)

转载请注明：陈熹[email protected]（号：半为花间酒）若公众号内转载请联系公众号：早起Python写在开头：本文运行爬虫的示例网站为生信坑https://www.bioinfo.info

半为花间酒·2020-05-02 09:55

Samtools工具的几个强大功能_2019-05-11

原文来自：http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/245flags10x1这序列是PE双端测序20x2这序列和参考序列完全匹配，没有错配和缺失40x4这序列没有

宁静的胡杨·2020-04-12 05:14

【生物信息笔记】fastq-bam (dry-5)

p=2103BWAblog.sciencenet.cn/blog-1339458-815241.htmlwww.chenlianfu.com/bioinfo

Ternq8·2020-04-05 20:02

Bioinfo: LEfSe 安装问题及解决办法 (Linux)

下载软件wikiinstallfromsource具体看第四步，将文件下载到Linux上并解压缩前置要求RRlibraries:splines,stats4,survival,mvtnorm,modeltools,coin,MASSpythonlibraries:rpy2(v.2.1orhigher),numpy,matplotlib(v.1.0orhigher),argparse在运行LEfSe

APRIL_data·2020-03-24 06:12

选课指南(2016秋)

---2/3daysperreport---ProgramminglanguageandmethodologyNoexaminations,sevenprogramlanguagetoprogram.Bioinfo

挖矿的菜鸡·2020-03-16 11:45

circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库

从名称可以看出,circR2Disease是一个疾病相关的环状RNA数据库,网址如下http://bioinfo.snnu.edu.cn/CircR2Disease/该数据库中包含以下3个物种的相关信息

生信修炼手册·2020-02-26 00:13

MirSNP:miRNA相关SNP位点数据库

MirSNP数据库就是一个存储了miRNA相关SNP位点的数据库，网址如下http://bioinfo.

生信修炼手册·2020-01-05 19:05

GSCALite：联合多数据库，研究癌症基因组学必备神器

网址：http://bioinfo.life.hust.edu.

vegene·2019-12-29 11:45

2019-01-06可视化kegg通路-pathview包

原贴地址：http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/639Pathview是一个用于整合表达谱数据并用于可视化kegg通路的一个R包，其会先下载kegg官网上的通路图

苏慕晨枫·2019-01-06 16:51

生物信息学(BioInfo) - Linux 常用操作

切换目录cd参数效果无参数或~返回home目录..切换到上级目录-切换至之前工作的目录打印文件（目录）列表ls（不作特殊说明时，下文“所有文件及目录”等表达指不包含隐藏文件的所有文件及目录）参数效果-a列出当前目录所有文件及目录，包括以”.”开头的隐藏文件、以”..”开头的有父目录的文件-A列出当前目录所有除”.”、”..”开头的文件及目录-l列出当前目录所有文件、目录及其所有者、文件大小、修改日

QimaoRyan·2017-01-17 17:11

XML文件要有根标签（Extra content at the end of the document in file 错误）

转自：http://bioinfo.ustc.edu.cn/seagven/?

yasi_xi·2013-07-23 17:00

算法网站汇总

electrical-engineering-and-computer-science/6-046j-introduction-to-algorithms-sma-5503-fall-2005/卜东波算法网站bioinfo.ict.ac.cn

zhaoyue007101·2012-12-31 10:00

GenBank filetype to Fasta filetype

Bioinfo~~~ GenBank filetype to Fasta filetype .gb -> .fasta public class G2F { private

bachelor007·2009-11-24 14:00

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