MeRIP

RNA m6A甲基化检测方法

corrplot展示m6a甲基化基因表达相关性☞m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值☞m6a甲基化相关基因根据临床信息分组绘制boxplot并显示p值m6A检测方法最近几年来m6A研究迅速发展，正是得益于meRIP-seq

生信交流平台·2023-10-08 13:48

易基因： MeRIP-seq等揭示组蛋白乙酰化和m6A修饰在眼部黑色素瘤发生中的互作调控｜肿瘤研究

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。组蛋白去乙酰化抑制剂(HDACis)在多种恶性肿瘤中显示出令人鼓舞的结果。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是最普遍的mRNA修饰，在肿瘤发生调控中起重要作用。然而，对组蛋白乙酰化和m6ARNA修饰之间的互作研究仍然未知。2023年7月19日，上海交通大学医学院附属第九人民医院眼科庄艾、XiangGu、TongxinGe为第一作者，上海交通大学

易基因科技·2023-09-18 14:07

易基因：MeRIP-seq等揭示mRNA m6A甲基化调控拟南芥的抗寒性分子机制｜植物抗逆

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。植物通过改变数千个基因的mRNA丰度以促进其生理和代谢过程，从而对低温应激进行响应。在转录后水平上，这些冷应激应答转录本经历可变剪接、microRNA介导的调控和可变多腺苷酸化等。最近研究表明，m6A、m5C等RNA修饰可以影响RNA调控和鉴定mRNA修饰稳定性，从而揭示了另一层在调控基因表达中发挥重要作用的转录后调控。m6A在植物生长

易基因科技·2023-09-18 14:36

m6A都有哪些相关验证实验？来看一下吧

话不多说，接下来我们就细数一下MeRIP-seq，都有哪些相关的验证实验吧~一、m6A区域验证首先，如果需要对m6A修饰位点进行严格的验证，可以用下面这个方法：1、m6A-IP-qPCRm6A-IP-qPCR

嘉因小助手·2023-09-17 09:25

RNA甲基化修饰m6A检测热门技术—MeRIP-seq

MeRIP-seq（高通量测序法）作为m6A修饰的检测方法，其具有针对全基因组范围内检测m6A的存在；能够明确每个基因的修饰水平，进行组与组之间比较等优势。

felix108·2023-09-11 06:20

易基因：MeRIP-seq等揭示ALKBH5介导m6A去甲基化调控皮肤创面再上皮化分子机制｜科研进展

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。哺乳动物的损伤皮肤屏障完整性恢复通过创面愈合基本机制实现，这是一个包括凝血、炎症、再上皮化（re-epithelialization）、肉芽组织形成和疤痕重塑的多步骤过程。再上皮化是决定创面成功愈合的重要因素，再上皮化受损是创伤、糖尿病、血管疾病、感染或辐射导致的所有慢性创面无法愈合的原因。因此研究创面再上皮化调控机制具有重要的临床意义

易基因科技·2023-08-29 13:41

易基因｜m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析

甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验怎么做？从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。

易基因科技·2023-06-22 16:18

易基因：MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在结直肠癌PD-1免疫治疗中的作｜Gut

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。结直肠癌（colorectalcancer，CRC）是全球最常见的癌症之一，转移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫检查点阻断（Immunecheckpointblockade，ICB）对CRC患者表现出良好疗效，然而只有一小部分高微卫星不稳定（MSI-H）或肿瘤错配修复缺失（dMMR）的患者对ICB响应。N6-甲基腺苷(m6A)是

易基因科技·2023-06-09 18:41

易基因｜干货：m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析

易基因｜干货：m6ARNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。

易基因科技·2023-04-03 12:16

m6A原始数据识别差异甲基化——使用RADAR分析MeRIP-seq数据

Step1：原始数据的准备从EMBL数据库根据SRR号下载SRAxxxxxxx.fastq.gz文件（有的是单端测序，有的是双末端测序）EMBL数据库网站连接：https://www.ebi.ac.uk/ebisearch/error.ebi数据展示：双末端：SRR7763560_1.fastq.gzSRR7763560_2.fastq.gz；单末端：SRR9029562.fastq.gz数据下载

Apache_lin·2023-04-02 12:03

表观转录组调控之meRIP（m6A甲基化修饰）

RNA修饰过去的研究基础是认为RNA在核酸结构上的化学微调，随着科学技术发展以及相关产品化抗体出现，对RNA修饰的研究不只是停留在结构微调，当前发现RNA修饰在转录组水平广泛存在，并且是可逆的动态调控状态，参与生物进程钟的多方面，包括：细胞分化、性别决定、肿瘤的发生和转移、DNA的损伤修复等生物学功能，今天带给大家的是RNA甲基化修饰研究内容。RNA甲基化发生在RNA分子上不同位置的甲基化修饰现象

博士苑·2023-03-15 17:34

易基因｜RNA m7G甲基化测序（m7G-MeRIP-seq）

对于m7GRNA甲基化修饰的检测，易基因采用基于抗体富集的m7G-MeRIP-seq，利用m7G特异性抗体富集发生m7G甲基化

易基因科技·2022-12-17 07:41

易基因技术推介｜m1A RNA甲基化测序（MeRIP-seq/m1A-seq）

m1ARNA修饰的检测，易基因采用基于抗体富集的甲基化RNA免疫沉淀测序方法（MeRIP-seq/m1

易基因科技·2022-11-19 11:57

易基因｜典型案例：MeRIP-seq综合分析肺腺癌中的转录组m6A甲基化组

ComprehensiveAnalysisoftheTranscriptome-widem6AMethylomeinLungAdenocarcinomabyMeRIPSequencing”为题在《FrontiersinOncology》杂志上发表研究论文，通过MeRIP-seq

易基因科技·2022-11-19 11:54

表观组学：call peak概念和MACS2算法原理，最简明清晰的call peak一文通

在诸如：ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我们常常听到一个词CallPeak。CallPeak究竟是什么东西，得到的结果又有什么生物学意义呢？

xizzy·2021-10-27 20:50

易基因 | 微量样本RNA甲基化m6A技术比较 — 技术解读

RNA免疫沉淀后通过高通量测序（MeRIP-seq），是转录组范围内检测m6A修饰位置最为有力的技术方法。常规免疫沉淀富集需要上百微克的总RNA，这限制了其在许多领域的应用。

E_GENE·2021-08-17 16:58

ScorpioGirl的m6A调研笔记

methyladenosine链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7981787/代码：https://github.com/al-mcintyre/merip_reanalysis_scripts

ScorpioGirll·2021-06-25 22:14

微量样本RNA甲基化m6A技术比较