OpenFold

PSP - 配置 AlphaFold2 Multimer 的模型训练参数

spike.blog.csdn.net/article/details/133377559整理配置AlphaFold2Multimer的模型训练参数,参考相关论文、AlphaFoldv2.3.0TechnicalNote、OpenFold
SpikeKing·2023-09-29 09:57

PSP - 蛋白质结构预测 OpenFold Multimer 重构训练模型的数据加载

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132602155OpenFoldMultimer在训练过程的数据加载时，需要将MSA与Template信息转换成Feature，再进行训练，这样速度较慢。通过修改数据集类OpenFoldSingleMultimerData
SpikeKing·2023-09-01 02:06

PSP - 蛋白质结构预测 OpenFold Multimer 模型训练参数与配置

基于OpenFold的单体预测框架，利用深度学习技术，结合序列、进化和互作信息，来推断蛋白质之间的相互作用界面和空间排列。Openfol
SpikeKing·2023-08-31 18:55

PSP - 开源框架 OpenFold 模版 (Template) 逻辑与 HHsearch 搜索模版

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132473686HHsearch是基于HMM-HMM比较的算法实现的搜索工具，可以用来检测蛋白质的远缘同源性，生成高质量的序列比对，用于同源建模和功能预测。优点是可以利用蛋白质序列的共进化信息，提高搜索的灵敏度和准确度。还
SpikeKing·2023-08-27 04:26

PSP - 基于开源框架 OpenFold Multimer 蛋白质复合物的结构预测与BugFix

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132410296AlphaFold2-Multimer是一个基于AlphaFold2的神经网络模型，可以预测多链蛋白复合物的结构。该模型在训练和推理时都可以处理多链输入，并且考虑了链之间的对称性和遗传信息。对于AlphaF
SpikeKing·2023-08-23 08:18

PSP - 开源可训练的蛋白质结构预测框架 OpenFold 的环境配置

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132334671Paper:OpenFold
SpikeKing·2023-08-17 18:49

【论文分享】Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold

Outline论文正文内容梳理团队介绍背景介绍预测方法分类预测效果算法框架1.模型输入2.Evoformer3.StructureModuleLossFunctionAF2推理生成结果训练过程Openfold
zoetu·2022-12-14 19:33

首个大众可用PyTorch版AlphaFold2复现，哥大开源OpenFold，star量破千

刚刚，哥伦比亚大学系统生物学助理教授MohammedAlQuraishi在推特上宣布，他们从头训练了一个名为OpenFold的模型，该模型是Al
Tom Hardy·2022-12-06 14:47

vim中tagbar配置以及打字时隐藏鼠标的方法

在plugin/tagbar.vim里面的键映射改成:\['nexttag',''],\['prevtag',''],\['showproto','f'],\['openfold',['u','+','
·2020-11-13 10:28
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