Multimer

PSP - 蛋白质复合物结构预测 Template 的 Multichain Mask 2D (二维多链掩码)

spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/134406459在蛋白质复合物结构预测中，AlphaFold2Multimer

SpikeKing·2023-11-16 13:42

文心生物计算大模型重磅升级，构象预测准确度全面提升！

文心生物计算大模型家族又迎来了重磅的升级：蛋白质-小分子对接构象预测模型HelixDock，以及蛋白-蛋白复合物结构预测模型HelixFold-Multimer准确度全面提升。

飞桨PaddlePaddle·2023-11-15 13:54

PSP - 蛋白质复合物 AlphaFold2 Multimer MSA Pairing 逻辑与优化

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/134144591在蛋白质复合物结构预测中，当序列(Sequence)是异源多链时，无论是AB，还是AABB，都需要MSA配对，即MSAPairing。在MSA的搜索过程中，按照单链维度进行搜索，通过MSAPairing进行

SpikeKing·2023-10-31 18:12

PSP - 配置 AlphaFold2 Multimer 的模型训练参数

https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/133377559整理配置AlphaFold2Multimer

SpikeKing·2023-09-29 09:57

PSP - 蛋白质结构预测 OpenFold Multimer 重构训练模型的数据加载

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132602155OpenFoldMultimer在训练过程的数据加载时，需要将MSA与Template信息转换成Feature，再进行训练，这样速度较慢。通过修改数据集类OpenFoldSingleMultimerData

SpikeKing·2023-09-01 02:06

Colossal-AI 团队联合百图生科发布xTrimo Multimer

Colossal-AI团队(https://github.com/hpcaitech/ColossalAI)联合百图生科成功加速蛋白质单体与复合物的结构预测，行业内最前沿的同时支持蛋白质单体(Monomer)与复合物(Multimer

潞晨科技官方·2023-08-31 18:26

PSP - 蛋白质结构预测 OpenFold Multimer 模型训练参数与配置

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132575709OpenFoldMultimer是用于预测蛋白质多聚体结构的计算方法。基于OpenFold的单体预测框架，利用深度学习技术，结合序列、进化和互作信息，来推断蛋白质之间的相互作用界面和空间排列。Openfol

SpikeKing·2023-08-31 18:55

PSP - 基于开源框架 OpenFold Multimer 蛋白质复合物的结构预测与BugFix

CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132410296AlphaFold2-Multimer

SpikeKing·2023-08-23 08:18

蛋白质结构预测 AlphaFold2、ColabFold、Uni-Fold、ESMFold

AlphaFold2：官方地址https://github.com/deepmind/alphafoldColabFold：高效封装加速AlphaFold2及Alphafold2-multimer（四级结构

loong_XL·2023-04-01 08:40

linux下多定时器的实现-(multimer implementation under linux)

概论定时器属于基本的基础组件，不管是用户空间的程序开发，还是内核空间的程序开发，很多时候都需要有定时器作为基础组件的支持，但使用场景的不同，对定时器的实现考虑也不尽相同，本文讨论了在Linux环境下，应用层和内核层的定时器的各种实现方法，并分析了各种实现方法的利弊以及适宜的使用环境。首先，给出一个基本模型，定时器的实现，需要具备以下几个行为，这也是在后面评判各种定时器实现的一个基本模型[1]：St

fengshi2172·2023-04-01 07:39

AI制药 - AlphaFold Multimer 的 MSA Pairing 源码

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/本文地址：https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/129794694目前最新版本是v2.3.1，2023.1.12AlphaFoldmultimerv1于2021年7月发布，同时发表了一篇描述其方法和结果的论文。AlphaFoldmultimerv1使用了

SpikeKing·2023-04-01 07:54

alphafold-multimer环境部署

在openscience的召唤下，deepmind团队在2021年10月6号上线了Alphafold-multimer，一款针对复合

python-码博士·2022-12-31 11:04

Alphafold2/multimer本地安装+报错处理

Alphafold2本地部署常见的有两种方式：一、构建Docker镜像；二、Conda部署。尝试了一下第一种方法碰到了无法运行（不报错，但不执行计算）的问题，加上对Docker不熟悉，所以放弃，转而选择第二种。安装硬件设备：CPU:64核磁盘:4T系统:Ubuntu18.04RAM:64G显卡：NVIDIAGV102CUDA版本：11.7显卡驱动版本：515.43.041、安装conda2、配置运

grosetta·2022-12-11 15:28

比AlphaFold2快10倍！国产开源项目加速蛋白质预测，超长序列22分钟就搞定

它在支持蛋白质单体（Monomer）和复合物（Multimer）的同时，还能大幅提升蛋白质预测速度。面对2

QbitAl·2022-08-25 07:46

推荐频道