R语言从入门到放弃

Coding and Paper Letter（八十）

ElegantBookdown3.R语言包lifecycle，生命周期提供了一组工具和约定来管理导出功能的生命周期。
胖胖雕·2024-01-07 19:50

C++ 从入门到放弃 (Day-03)

引用的本质◼引用的本质就是指针，只是编译器削弱了它的功能，所以引用就是弱化了的指针◼一个引用占用一个指针的大小汇编语言◼汇编语言的种类8086汇编(16bit)x86汇编(32bit)x64汇编(64bit)ARM汇编(嵌入式、移动设备)......◼x64汇编根据编译器的不同，有2种书写格式IntelAT&T◼汇编语言不区分大小写x64汇编–寄存器image.pngx64汇编–寄存
麦兜兜买兜兜·2024-01-07 17:31

生信人R语言

09.任意基因任意癌症表达量和临床性状关联#视频中的代码rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)#OvarianserousCystadenocarcinoma(TCGA,Nature2011)#AllcompleteTumors(316samples)/1Genes#GeneSet/Pathwayisalteredin28(8.9%)ofqueriedsa
Yinwen(o^^o)·2024-01-07 16:52

生信人R语言

05.热图#测试数据#pheatmap绘制聚类热图的R包a1=rnorm(100)#rnorm()生成随机数dim(a1)=c(5,20)a2=rnorm(100)+2dim(a2)=c(5,20)library(pheatmap)#cluster_rows表示对行进行聚类#cluster_cols表示进行列的聚类pheatmap(a1,cluster_rows=F,cluster_cols=F)
Yinwen(o^^o)·2024-01-07 16:21

生信 R语言

11.芯片表达矩阵下游分析​rm(list=ls())#清除所有变量options(stringsAsFactors=F)#BiocManager::install("CLL")suppressPackageStartupMessages(library(CLL))data("sCLLex")sCLLex##ExpressionSet(storageMode:lockedEnvironment)#
Yinwen(o^^o)·2024-01-07 16:20

基于R语言分析自带数据集heart

本文将对R语言中自带的heart数据集进行分析。本文会包含所有代码，尽可能多的使用有关可视化的函数以及数据分析的模型。
觉醒的欢乐马·2024-01-07 16:09

R语言绘制世界地图采样图

如果要发文章的话，可以做一个世界地图采样图（不知道是不是叫这个），显得数据量很足，有说服力，比如这样https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(19)30341-1?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867419303411%3Fshowa
CAAS_IFR_zp·2024-01-07 12:14

2019-06-03绘制带有误差线的折线图

小伙伴说要画一个简单的带误差线的折线图，graphpad用不了，我琢磨一下，可以用R语言。
森尼啊·2024-01-07 09:07

R语言【ecospat】——ecospat.occ.desaggregation()：删除数据框中比指定距离阈值更接近的物种记录

Packageecospatversion4.0.0Parametersecospat.occ.desaggregation(xy,min.dist,by)参数【xy】：具有xy坐标的数据框（x列必须命名为'x'，y列必须命名为'y'）。参数【min.dist】：子数据框中点之间的最小距离。此参数的单位根据数据框而定。参数【by】：数据框中的分组元素（例如，species,NULL）。Detail
ALittleHigh·2024-01-07 06:11

R语言【base】——tempfile()：返回一个字符串向量，这些字符串可以用作临时文件的名称

Packagebaseversion4.2.0Parameterstempfile(pattern="file",tmpdir=tempdir(),fileext="")tempdir(check=FALSE)参数【pattern】：一个非空字符向量，给出名称的初始部分。参数【tmpdir】：提供目录名称的非空字符向量。参数【fileext】：提供文件扩展名的非空字符向量。参数【check】：逻辑
ALittleHigh·2024-01-07 06:04

跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2画流程图

论文Ahighlyconservedcorebacterialmicrobiotawithnitrogen-fixationcapacityinhabitsthexylemsapinmaizeplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31113-w本地pdfs41467-022-31113-w.pdf数据代码链接https://github.
小明的数据分析笔记本·2024-01-07 01:51

精选顶级期刊中的三幅可复现图表

小编有话说：以下三幅图选自领域内顶级期刊，虽然并非采用R语言进行绘制，但图形绘制的关键知识点小编都总结过。由于时间和精力有限，目前未对这些图进行一一复现。
庄闪闪·2024-01-07 00:02

报错：ERROR: lazy loading failed for package

ERROR:lazyloadingfailedforpackage常用的服务器崩了只能换台服务器，新的服务器好多R包都没有安装，今天安装DESeq2居然报错了各种R包，如果不在R语言官网上，那它极有可能在
微光**·2024-01-06 14:41

基于R语言（SEM）结构方程模型教程

详情点击链接：基于R语言（SEM）结构方程模型教程01、R/Rstudio(2)R语言基本操作，包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等(3)R语言数据文件读取、整理（清洗）、结果存储等（含tidverse
夏日恋雨·2024-01-06 06:47

R语言频率分布直方图绘制教程

本篇笔记分享R语言绘制直方图的方法，通过多种展示风格对数据进行可视化，主要用到ggplot、ggpubr等包。什么是直方图？
生信分析笔记·2024-01-06 06:17

[原创][R语言]股票分析实战[8]:因子与subset的关系

[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父·2024-01-06 05:28

OpenHarmony从入门到放弃（四）

设计一款使用Harmony开发的App接下来我会通过设计并开发一款资讯类的App来入门OpenHarmony；以下是我对App的设计想法；一、模块划分内容模块：App的核心模块，负责管理和展示资讯内容，具体包括内容获取与处理（负责从各种来源（如新闻网站、社交媒体等）获取和解析资讯内容）、内容分类与标签（对获取的资讯进行分类和标签化，方便用户浏览和搜索）、内容推荐系统（利用机器学习算法，根据用户的阅
Kevin写代码·2024-01-06 05:23

OpenHarmony从入门到放弃（三）

OpenHarmony从入门到放弃（四）OpenHarmony最新的已经使用Ets进行开发了，但是我在使用过程中需要兼容更低的版本，而且大部分的第三方库还是不能使用，所以接下来我还是使用Java进行开发
Kevin写代码·2024-01-06 05:53

ggplot2绘制经典散点图

了解如何重现著名的gapminder散点图在本教程中，您将学习如何再现由HansRosling开发的世界上最著名的数据可视化之一喜欢的小伙伴可以关注个人公众号R语言数据分析指南在此先行拜谢了！！！
R语言数据分析指南·2024-01-05 23:46

跟着PNAS学作图：R语言ggplot2绘制面积图

论文中公布了部分作图代码，作图使用到的是R语言的ggplot2。跟着其中的代码学习一下。论文本地
小明的数据分析笔记本·2024-01-05 16:10

R语言数据可视化参考书籍

会不断更新.....https://rkabacoff.github.io/datavis/https://z3tt.github.io/beyond-bar-and-box-plots/
队长的生物实验室·2024-01-05 14:14

R语言在生态环境领域中的实践技术应用

R语言作为新兴的统计软件，以开源、自由、免费等特点风靡全球。生态环境领域研究内容广泛，数据常多样而复杂。利用R语言进行多元统计分析，从复杂的现象中发现规律、探索机制正是R的优势。
梦想的初衷~·2024-01-05 13:58

【蓝桥杯学习笔记】7. 哈曼夫树

质数判断【蓝桥杯学习笔记】5.矩阵乘法【蓝桥杯学习笔记】6.一图看懂差分数组+《小明的彩灯》文章目录系列文章目录前言一、曼哈夫树简介二、代码实现list实现queue库实现总结前言蓝桥本笔记-----从入门到放弃本片文章使用
Master_L u·2024-01-05 11:16

【R语言】Error in file(file, “rt“) : 无法打开链结

一、问题描述R语言在使用read.table()时报错：Errorinfile(file,"rt"):无法打开链结此外:Warningmessage:Infile(file,"rt"):无法打开文件'data.txt
哇咔咔哇咔·2024-01-05 09:24

如何下载R语言的最新版本和旧版本

由于种种原因，可能导致我们得下载旧版本的R语言来配合Rstudio使用，接下来进行保姆级教学如何下载最新版本和旧版本的R语言。
哇咔咔哇咔·2024-01-05 09:23

突破技术边界：R与jsonlite库探秘www.snapchat.com的数据之旅

那么，我们如何用R语言来爬取和分析Snapchat的数据呢？本文将介绍一种利用R的jsonlite库来解析和处理Sn
亿牛云爬虫专家·2024-01-05 05:08

R语言学习笔记（15）-R函数(1)

一、R函数类似Linux中的命令，每个命令有特定功能。困难之处也在于函数的数量多R函数.png函数必须加括号返回值一般函数都有返回值，但这个返回值是多种多样的（1）返回函数结果如ls()，列出当前环境中的对象sys.date()，返回当前系统时间（2）无返回结果如rm()，直接删除指定变量，若成功则无任何反馈（3）返回计算结果需要清楚返回值类型，数据输出输入格式。之前所学习的数据结构，便是为此打基
Akuooo·2024-01-05 05:35

数量生态学：R语言的应用—第四章聚类分析2-解读和比较层次聚类结果

数量生态学：R语言的应用—第四章聚类分析2今天来给大家介绍一下如何解读和比较层次聚类结果由于今天内容比较多，所以我们先来看看思维导图，看看大致有什么解读和比较层次聚类结果这里强调一下，聚类分析是一种探索性分析
fafu生信小蘑菇·2024-01-04 23:53

R语言快速入门

START为什么要使用R？多数商业统计软件价格不菲，投入成千上万美元都是可能的。而R是免费的！R拥有顶尖水准的制图功能。如果希望复杂数据可视化，那么R拥有最全面且最强大的一系列可用功能。R是一个可进行交互式数据分析和探索的强大平台。R是一个无与伦比的平台，在其上可使用一种简单而直接的方式编写新的统计方法。它易于扩展，并为快速编程实现新方法提供了一套十分自然的语言。R可运行于多种平台之上，包括Win
我脱下短袖·2024-01-04 19:51

结构方程模型（SEM）

我们前期推出的《基于R语言结构方程模型》课程通过结构方程原理介绍、结构方程全局和局域估计、模型构建和调整、潜变量分析、复合变量分析及结构方程贝叶斯方法实现等一系列专题的介绍及大量案例讲解，由浅入深地系统介绍了结构方程模型的建立
思考的小猴子·2024-01-04 18:25

which函数的用法

R语言的which函数主要是用于条件筛选，在R语言里面用的非常多，因为很多时候我们都需要筛选满足一些特定条件的数据记录。
大数据技术派·2024-01-04 16:34

R语言rayrender包，glossy光滑的材料

R语言rayrender包，glossy光滑的材料#ThuJul0101:44:172021-#字符编码：UTF-8#R版本：Rx644.1forwindow10#[email protected]
youmigo·2024-01-04 14:24

r语言mfrow全程_第二篇——用几分钟了解R语言入门知识（续）

命令行——写代码用的数据对象——暂时只需要记住向量(vector)、列表(list)、数据框(dataframe)函数——重要！马上讲。par——马上讲。六、函数在R里面，我们每天都在和函数打交道。但函数究竟是什么？我希望大家先记住一个函数，叫做function()。正所谓太极生两仪，两仪生四象。R中本来并没有那么多函数，然而R给我们提供了两样东西——一系列基本函数，以及一个叫做function(
weixin_39936403·2024-01-04 07:52

聚类分析8—顺序聚类和模糊聚类（数量生态学：R语言的应用 第四章）

数量生态学：R语言的应用第四章聚类分析8—顺序聚类和模糊聚类今天是数量生态学：R语言的应用第四章聚类分析最后一部分内容了，不知不觉已经过了一周了，内容还是很多的，不知道你掌握了多少，不会的话的好好理理，
fafu生信小蘑菇·2024-01-04 02:50

OpenHarmony从入门到放弃（二）

OpenHarmony从入门到放弃（一）一、HelloHarmonyOS打开DevEcoStudio选择CreateProject创建工程；选择Application->EmptyAbility，这里也可以选择其他的
Kevin写代码·2024-01-04 02:09

OpenHarmony从入门到放弃（一）

OpenHarmony从入门到放弃（二）一、OpenHarmony的基本概念和特性OpenHarmony是由开放原子开源基金会孵化及运营的开源项目，其目标是构建一个面向全场景、全连接、全智能的时代的智能终端设备操作系统
Kevin写代码·2024-01-04 02:39

cka从入门到放弃

无数次想放弃，最后选择了坚持监控pod日志监控名为foobar的Pod的日志，并过滤出具有unable-access-website信息的行，然后将写入到/opt/KUTR00101/foobar#解析监控pod的日志，使用kubectllogspod-namekubectllogsfoobar|grepunable-access-website>/opt/KUTR00101/foobar监控po
漫漫行程路·2024-01-04 01:01

R语言【base】——rm/remove()：从指定环境中删除对象

Packagebaseversion4.2.0Parametersremove(...,list=character(),pos=-1,envir=as.environment(pos),inherits=FALSE)rm(...,list=character(),pos=-1,envir=as.environment(pos),inherits=FALSE)参数【...】：要删除的对象，如名称（
ALittleHigh·2024-01-04 00:12

R语言【BIEN】——BIEN_occurrence_family 可从 BIEN 数据库中提取指定科（或多个科）的所有记录。

PackageBIENversion1.2.6ParametersBIEN_occurrence_family(family,cultivated=FALSE,new.world=NULL,observation.type=FALSE,all.taxonomy=FALSE,native.status=FALSE,natives.only=TRUE,political.boundaries=FALS
ALittleHigh·2024-01-04 00:42

R语言【CoordinateCleaner】——cc_inst()：识别生物多样性机构附近的记录

PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_inst(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",species="species",buffer=100,geod=TRUE,ref=NULL,verify=FALSE,verify_mltpl=10,value="clean",verbose
ALittleHigh·2024-01-04 00:10

R语言代码实现聚论文的复现：关于聚类标准误的问题（2009,RFS) -Estimating Standard Errors in Finance Panel Data Sets Co···

论文原文：在公司融资和资产定价的实证工作中，研究人员经常使用面板数据。在这些数据集中，残差可能在不同公司或不同时间之间存在相关性，OLS(普通最小二乘)标准误可能存在偏差。本文研究了文献中应对的不同方法，说明为什么不同的方法有时会给出(相同)不同的答案，并为研究者提供使用指导。众所周知，当残差独立同分布时，OLS标准误是无偏的。当残差在各观测值之间存在相关性时，OLS标准误可能存在偏差。虽然面板数
亦旧sea·2024-01-03 21:36

R语言：一致性聚类 ConsensusClusterPlus

什么情况下会用到一致性聚类？顺手策个文章套路：比较常用到聚类分析的就是肿瘤亚型识别的文章吧。这类文章一般会对表达量或甲基化等数据进行聚类分析，选出最优聚类数；对聚出的类组进行差异化表达分析得到DEGs，差异表达基因做GO、pathway一系列分析，在分析一下与生存的关系、免疫细胞丰度的区别，等等。。。要是一不小心找出了这几组免疫细胞有区别、生存有区别，是不是一篇揭示XX癌免疫应答异质性的文章就来了
生信频道·2024-01-03 20:47

R语言机器学习与临床预测模型56--Logistic回归（逻辑回归）

本内容为【科研私家菜】R语言机器学习与临床预测模型系列课程你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01Logistic回归逻辑斯蒂回归就是以对数发生比为响应变量进行线性拟合，即log(
科研私家菜·2024-01-03 16:45

《高效R语言编程》笔记汇总

《高效R语言编程》笔记高效R编程高效使用R笔记3《高效R语言编程》4-高效工作流《高效R语言编程》5-高效输入输出[1]6.
zd200572·2024-01-03 14:20

代码+视频，手把手教你R语言ggrcs包绘制限制立方样条图+阈值效应分析

代码+视频，手把手教你R语言ggrcs包绘制限制立方样条图+阈值效应分析library(ggrcs)library(rms)library(ggplot2)library(scales)library(
天桥下的卖艺者·2024-01-03 10:38

代码+视频，手把手教你R语言使用scitb包绘制倾向性评分匹配后的标准化平均差图

什么是倾向性评分匹配？倾向评分匹配（PropensityScoreMatching，简称PSM）是一种统计学方法，用于处理观察研究（ObservationalStudy）的数据，在SCI文章中应用非常广泛。在观察研究中，由于种种原因，数据偏差（bias）和混杂变量（confoundingvariable）较多，倾向评分匹配的方法正是为了减少这些偏差和混杂变量的影响，以便对实验组和对照组进行更合理的
天桥下的卖艺者·2024-01-03 10:03

R语言最佳学习路线和常用数据挖掘包

对于初学R语言的人，最常见的方式是：遇到不会的地方，就跑到论坛上吼一嗓子，然后欣然or悲伤的离去，一直到遇到下一个问题再回来。当然，这不是最好的学习方式，最好的方式是——看书。
丨程序之道丨·2024-01-03 09:48

R语言——数据操作（四）

目录一、数据转换二、取子集三、数据框的翻转四、对数据框进行计算五、apply的用法六、数据的中心化与标准化七、参考一、数据转换读取文件adata4<-t(data)rev()：反向修改数据框中的值transform(data,colname)colname命名新的名字，则会生成新的一列数据框排序sort是对向量进行排序，返回排序后的结果order也可以对向量进行排序，返回的是对应值所在的位置，而不
Billie使劲学·2024-01-03 06:51

R语言【base】——do.call()：根据名称或函数以及要传递给它的参数列表构造并执行函数调用

Packagebaseversion4.2.0Parametersdo.call(what,args,quote=FALSE,envir=parent.frame())参数【what】：命名要调用的函数的函数或非空字符串。参数【args】：函数调用的参数列表。参数【args】的names属性为参数提供名称。参数【quote】：指示是否引用参数的逻辑值。参数【envir】：用于评估调用的环境。如果调
ALittleHigh·2024-01-03 06:17

R语言——reshape2包、tidyr包、dplyr包（五）

目录一、数据转换之reshape2包：melt与dcast函数二、数据转换之tidyr包：gather与spread函数，separate与unite函数三、据转换之dplyr包四、参考一、数据转换之reshape2包：melt与dcast函数merge函数使用merge函数x7)#过滤函数。函数前面加上“包名::”是为了防止dplyr包中的函数名与其他函数产生冲突dplyr::distinct(
Billie使劲学·2024-01-03 06:46
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