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R语言入门系列
统计学-
R语言
-8.2
文章目录前言双因子方差分析数学模型主效应分析交互效应分析正态性检验绘制3个品种产量数据合并后的正态Q-Q图(数据:example8_2)练习前言本篇将继续介绍方差分析的知识。双因子方差分析考虑两个类别自变量对数值因变量影响的方差分析称为双因子方差分析(two-wayanalysisofvariance)(分析两个因子(因子A和因子B)对实验结果的影响)分析时有两种情形:只考虑两个因子对因变量的单独
柔雾
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2024-01-28 06:31
统计学-R语言
r语言
开发语言
R语言
【taxlist】——match_names():字符和 taxlist 对象之间的搜索匹配
Packagetaxlistversion0.2.4Description字符向量中提供的名称将使用函数stringsim()与存储在类taxlist对象中的插槽taxonNames中的名称进行比较。Usagematch_names(x,object,...)##S4methodforsignature'character,character'match_names(x,object,UsageI
ALittleHigh
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2024-01-28 06:30
taxlist
r语言
数据库
前端
统计学-
R语言
-8.3
文章目录前言例题例题一例题二例题三例题四例题五例题六例题七总结前言本篇介绍的是有关方差知识的题目介绍。例题例题一(数据:exercise7_3.RData)为研究上市公司对其股价波动的关注程度,一家研究机构对在主板、中小板和创业板上市的190家公司进行了调查,得到如下数据:检验上市公司的类型对股价波动的关注程度是否独立。(α=0.05)解:提出假设:H0:上市公司的类型对股价波动的关注程度是独立的
柔雾
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2024-01-28 06:29
统计学-R语言
r语言
开发语言
Coding and Paper Letter(八十)
ElegantBookdown3.
R语言
包lifecycle,生命周期提供了一组工具和约定来管理导出功能的生命周期。
G小调的Qing歌
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2024-01-28 05:26
Rstudio安装包下载慢怎么办?
刚开始学习
R语言
,安装R和Rstudio过程中碰到了一些问题。这两个软件从官网下载安装包都炒鸡慢。R的话还好可以从国内的镜像网站下载,我用的是清华镜像。
朱诚镛
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2024-01-28 02:22
DAY4-谢小发(
R语言
基础)
框架
R语言
基础.png准备工作预先打开电脑中任意文件夹,查看文件夹名称为中文还是英文如若前面是中文,则将其改为英文,如此才可以使下载的Rstudio可用,否则打开后界面可能问空白,并且不能正常运行有时Rstudio
谢小发
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2024-01-28 02:30
【
R语言
】rep函数的使用
我们在做数据分析的时候,经常需要产生一些重复序列。例如,GEO芯片数据差异表达分析时需要用到的分组变量,cytoscape构建ceRNA网络的节点文件中的RNAtype列等等。今天小编就来给大家介绍一下R中生成重复序列的函数rep。你可以把它看作时repeat这个英文单词的缩写,就很容记住了。函数形式:rep(x,time=,length=,each=,)参数说明:x:代表的是你要进行复制的对象,
生信交流平台
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2024-01-28 01:08
【R画图学习11.1】圈图学习1---circlize
所以我们后面会陆陆续续介绍有关
R语言
圈图的绘制。circlize是Circos的
R语言
实现,但并不是生成Circos配置文件的前端封装,而是完全基于
R语言
风格的统计和图形语法实现的。比如下
jjjscuedu
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2024-01-28 00:02
群体分布——如何用
R语言
绘制群体地理分布
Nathan写于2020.08.15群体的地理分布,是做文章经常放的第一张图,其表明你的群体材料在地理上分布的情况(感觉是一句废话)01input首先输入数据是样品分组,以及每个样品对应的经纬度。实例数据如下:随便编的数据有了这个数据就直接用下面的R代码进行画图就可以了。library(ggplot2)library(sp)library(maps)library(maptools)library
只看不写_nathan
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2024-01-27 16:43
空间绘图 |
R语言
克里金插值绘图
上篇推文我们介绍了使用Python-pykrige包实现了克里金(Kriging)插值计算及对应的可视化结果绘制,详细内容点击下方链接:Python-pykrige包-克里金(Kriging)插值计算及可视化绘制,相比你也感受到了Python的简单方便性。本期推文,我们就推出使用R-gstat包实现克里金(Kriging)插值的计算及对应结果的可视化绘制,主要知识点如下:gstat.krige()
数据魅力(DataCharm)
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2024-01-27 15:30
数据可视化
人工智能
python
算法
r语言
数据可视化
论文阅读
R语言
_layout()函数用法
前言:微博参与话题#给你四年时间你也学不会生信#————导师赠与之醒世名言ApplyaFunctionOveraRaggedArray|x-y绘图Usagelayout(mat,widths=rep.int(1,ncol(mat)),heights=rep.int(1,nrow(mat)),respect=FALSE)layout.show(n=1)lcm(x)Arguments|参数mat:是矩
谢俊飞
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2024-01-27 07:22
看书笔记【
R语言
数据分析项目精解:理论、方法、实战 8】
看书笔记——
R语言
Chapter8从数据中寻找优质用户8.1项目背景、目标和方案8.1.1项目背景8.1.2项目目标8.1.3项目方案8.2项目技术理论简介8.2.1逻辑回归的基本概念8.2.2建模流程
小胡涂记
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2024-01-27 07:20
R语言资料实现
笔记
r语言
数据分析
看书标记【
R语言
数据分析项目精解:理论、方法、实战 7】
看书标记——
R语言
Chapter7构建用户画像7.1项目背景、目标和方案7.1.1项目背景7.1.2项目目标7.2项目技术理论简介7.2.1用户画像的基本概念7.2.2用户画像应用领域7.2.3用户画像分类
小胡涂记
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2024-01-27 07:50
R语言资料实现
r语言
数据分析
开发语言
看书标记【数据科学:
R语言
实战 1】
看书标记——
R语言
Chapter1模式的数据挖掘1.1聚类分析1.1.1k-means聚类用法示例1.1.2k-medoids聚类用法示例1.1.3分层聚类用法示例1.1.4期望最大化(EM)用法示例1.1.5
小胡涂记
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2024-01-27 07:50
R语言资料实现
r语言
开发语言
看书标记【
R语言
数据分析项目精解:理论、方法、实战 6】
看书标记——
R语言
Chapter6变量筛选技术6.1项目背景、目标和方案6.1.1项目背景6.1.2项目目标6.1.3项目方案6.2项目技术简介6.2.1变量相关性1.定类变量和定类变量2.定序变量与定类变量
小胡涂记
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2024-01-27 07:49
R语言资料实现
r语言
数据分析
开发语言
看书标记【
R语言
数据分析项目精解:理论、方法、实战 3】
看书标记——关于
R语言
chapter3互联网运营指标的建立3.1项目背景、目标及方案3.1.1项目背景3.1.2项目目标3.1.3项目方案3.2项目技术理论简介3.2.1骨灰级流量指标1.PV(pageviews
小胡涂记
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2024-01-27 07:49
R语言资料实现
r语言
数据分析
开发语言
统计学-
R语言
-8.1
文章目录前言方差分析方差分析的原理什么是方差分析误差分解单因子方差分析数学模型效应检验练习前言本片开始介绍有关方差分析的知识。方差分析方差分析的基本原理是在20世纪20年代由英国统计学家RonaldA.Fisher在进行实验设计时为解释实验数据而首先引入的。方差分析是一种统计方法。目前,方差分析方法广泛应用于分析心理学、生物学、工程和医药的实验数据。本章首先介绍方差分析的基本原理,然后介绍只涉及一
柔雾
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2024-01-27 07:41
r语言
开发语言
看书标记【数据科学:
R语言
实战 2】
看书标记——
R语言
Chapter2序列的数据挖掘2.1模式2.1.1Eclat频繁项集的挖掘用法用eclat找到成年人行为的相似点查找数据集中的频繁项目集中于最高频率的示例2.1.2arulesNBMiner
小胡涂记
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2024-01-27 07:39
r语言
开发语言
Vue.js
入门系列
(1)--三种安装方法
在进行安装之前,先来了解一下Vue到底是什么东西一、Vue是什么1.定义:简单的说,Vue是一套构建用户界面的渐进式的框架(渐进式指由浅入深,由简单到复杂)2.特点①体积小 压缩后仅仅33k②更高的运行效率 基于虚拟DOM,一种预先通过JavaScript进行计算,把最终的DOM操作计算出来并优化的技术,因为此操作没有直接操作在DOM身上,而是预处理操作,所以叫虚拟DOM③双向数据绑定
外星人_863d
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2024-01-27 01:30
2020-02-22
Day4——西府
R语言
基础认识R和RstudioR是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。
西府_9763
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2024-01-27 00:57
如何用强化学习优化广告投放中的A/B Test
公众号后台回复“图书“,了解更多号主新书内容作者:会痛的stone来源:
R语言
工程化A/BTest是决策科学的最常见方法之一。以广告投放为例,将客户群分为两组或多组,每组群体展示不同的广告形式。
IT农民工1
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2024-01-26 21:54
算法
人工智能
python
大数据
机器学习
Seer*Stat乳腺癌数据预测模型-Step1数据清洗和预处理
这里写自定义目录标题通过
R语言
进行数据的清洗进入R官网下载环境下载IDE:Rstudio一些基本的小命令使用Rstudio对Seer乳腺癌数据进行清洗通过
R语言
进行数据的清洗由于刚从Seer上面下载的数据需要进行预处理
m0_51876286
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2024-01-26 20:45
r语言
算法
R语言
【taxlist】——count_taxa():统计 taxlist 对象中的类群数量
Packagetaxlistversion0.2.4Description统计taxlist对象或包含分类单元名称的字符向量中的分类单元的数量。Usagecount_taxa(object,data,...)##S4methodforsignature'character,missing'count_taxa(object,na.rm=TRUE,...)##S4methodforsignature
ALittleHigh
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2024-01-26 16:01
taxlist
r语言
开发语言
跟着Nature Metabolism学作图:
R语言
ggplot2一次性展示很多个饼图
论文Single-cellprofilingofvascularendothelialcellsrevealsprogressiveorgan-specificvulnerabilitiesduringobesityhttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00674-x#Sec58s42255-022-00674-x.pdfhttps://github
小明的数据分析笔记本
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2024-01-26 14:02
学习小组Day5笔记—白兔儿溜溜
R语言
数据结构新手笔记R的赋值符号不是等号,而是<-在Console控制台输入命令,相当于Linux的命令行R的代码都是带括号的,括号必须是英文!!!的。向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
白兔儿溜溜
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2024-01-26 11:24
R语言
【taxlist】——clean_strings():清理字符串
Packagetaxlistversion0.2.4Description多个前导的和后随的空格以及错误的编码可能会在处理分类学名称的信息中导致严重的问题。clean_strings()方法可以清除这些错误。Usageclean_strings(x,...)##S4methodforsignature'character'clean_strings(x,from="utf8",to="utf8",
ALittleHigh
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2024-01-26 09:10
taxlist
r语言
开发语言
统计学基于
r语言
第六章和第七章答案
#6.1(1)load('C:/exercise/ch6/exercise6_1.RData')par(mfrow=c(1,2),cex=0.8,mai=c(0.7,0.7,0.2,0.1))qqnorm(exercise6_1$零件误差,xlab="期望正态值",ylab="观测值",datax=TRUE,main="正态Q-Q图")qqline(exercise6_1$零件误差,datax=T
大瘦丝儿
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2024-01-26 09:40
r语言
统计学-
R语言
-7.5
文章目录前言假设检验单个总体均值的假设检验单样本Wilcoxon符号秩检验两个总体均值的假设检验两个配对样本的Wilcoxon符号秩检验总结前言本篇介绍的是剩余的部分了练习题。假设检验单个总体均值的假设检验一家公司声称它的员工月工资平均为3500元。下表是随机挑选的该公司的15名员工的月工资。该样本的均值为3056.667元,人们因此想检验厂家所声称的平均工资是否属实,α=0.05。设:该厂家的员
柔雾
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2024-01-26 09:34
r语言
开发语言
统计学-
R语言
-7.4
文章目录前言非参数检验两个独立样本的Mann-Whitney检验练习前言本片是对非参数检验最后的介绍。非参数检验两个独立样本的Mann-Whitney检验Mann-Whitney检验也称为Mann-WhitneyU检验(Mann-WhitneyUtest)或称为Wilcoxon秩和检验,它是由HenryB.Mann和D.R.Whitney于1947年提出的。用于确定两个总体间是否存在差异的一种非参
柔雾
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2024-01-26 09:33
r语言
开发语言
R语言
【taxlist】——clean():移除孤立的记录
Packagetaxlistversion0.2.4Description对于taxlist类对象的操作可能会产生独立的条目。clean()方法就是用来删除这样的条目,并恢复taxlist对象的一致性。Usageclean(object,...)##S4methodforsignature'taxlist'clean(object,times=2,...)Arguments参数【object】:一
ALittleHigh
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2024-01-26 09:33
taxlist
数据库
前端
r语言
统计学-
R语言
-7.3
文章目录前言总体方差的检验一个总体方差的检验两个总体方差比的检验非参数检验总体分布的检验正态性检验的图示法Shapiro-Wilk和K-S正态性检验总体位置参数的检验练习前言本篇文章继续对总体方差的检验进行介绍。总体方差的检验一个总体方差的检验在生产和生活的许多领域,方差的大小是否适度是需要考虑的一个重要因素。一个方差大的产品意味着其质量或性能不稳定。相同均值的产品,方差小的自然要好些。与总体方差
柔雾
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2024-01-26 09:02
r语言
开发语言
R语言
【taxlist】——dissect_name():将科学名的各个组分解析出来
Packagetaxlistversion0.2.4Description根据命名法的解析程度和特定角色,包含分类单元用法名称(学名)的字符串由不同部分组成。因此,带有名称的字符串可以分解成这些部分,同时部分的数量可能表明了分类等级。该方法是strsplit()的包装器,如果在参数【repaste】中指明的话,还可以重新粘贴名称组分。Usagedissect_name(x,split="",fix
ALittleHigh
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2024-01-26 04:10
taxlist
r语言
开发语言
R语言
【taxlist】——get_children(),get_parents():检索分类概念的子类群或父类群
Packagetaxlistversion0.2.4Description检索所查询分类单元概念的所有子概念或父概念。Usageget_children(taxlist,...)##S3methodforclass'taxlist'get_children(taxlist,ConceptID,...)get_parents(taxlist,...)##S3methodforclass'taxlis
ALittleHigh
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2024-01-26 04:10
taxlist
r语言
数据库
开发语言
R语言
【taxlist】——taxlist 包中已经废弃的方法
Packagetaxlistversion0.2.4下面已经废弃的方法中的大多数已经被更新后的方法所取代。add_parent()add_trait()add_level()replace_view()taxlist2taxmap()taxmap2taxlist()taxmap2taxlist()tnrs()
ALittleHigh
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2024-01-26 04:10
taxlist
r语言
R语言
应用-1:数据整理
基础篇----R环境安装及基本语句:(65条消息)windows下载R和Rstudio,以及
R语言
基本使用_up_xin的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/weixin_41427508
up_xin
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2024-01-26 04:40
r语言
开发语言
r语言
进行go富集分析_GO富集分析可视化:
R语言
GOplot包——准备自己的数据
GO注释和富集分析GO注释和富集分析使用TBtools完成,具体步骤可以参考TBtools作者在腾讯课堂开设的一系列视频课程本文使用的数据是甜樱桃叶绿体蛋白编码基因做GO注释,然后挑部分基因做富集分析,挑选的基因是rpoC1rpoBrpoArpoC2atpIatpFatpEatpHatpBatpAaccDrbcLrpl22rpl23rpl20rps8rps7rps16rps15rps14rps18
weixin_39868663
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2024-01-26 04:39
r语言进行go富集分析
R语言
学习——数据框
x=c(42,7,64,9)y=1:4z.df=data.frame(INDEX=y,VALUE=x)z.dfdim(z.df)#查看几行几列colnames(z.df)#查看列名rownames(z.df)#查看行名z.df[,1]z.df[1,]z.df[c(1,2),c(1,2)]df1=data.frame(C1=c(1,5,14,1,54),C2=c(9,15,85,9,42),C3=c
帅锅不识字
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2024-01-26 04:09
R语言学习
r语言
学习
python
r语言
集合补集_
R语言
数据整理利器——dplyr
dplyr对于处理以行列关系表示的数据框(每一行是一个观测值,每一列是一个维度)十分有效。首先dplyr与SQL语句十分类似,其中select、filter、mutate、summarise等几个关键的函数,可以帮助我们非常方便的筛选、修改、汇总数据。此外dplyr还可以使我们非常便捷的对数据集进行交并合补。最后dplyr中还引入了管道处理的概念(如x%>%f(y)等同于f(x,y)),使我们可以
深渊号角 mkq0.~
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2024-01-26 04:09
r语言集合补集
R语言
【taxlist】——df2taxlist():将数据帧和字符串转换为 taxlist 对象
Packagetaxlistversion0.2.4Descriptioin将数据框转换为taxlist对象。此外,包含分类名称的字符向量将被转换,但不会返回任何关于分类等级和亲本分类群的信息。Usagedf2taxlist(x,...)##S3methodforclass'data.frame'df2taxlist(x,taxonTraits,taxonViews,levels,clean_st
ALittleHigh
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2024-01-26 04:39
taxlist
r语言
开发语言
R语言
数据高效处理指南——基本数据处理
1数据集基本探索str、summary、head这三个函数,是对数据框进行探索性分析的“三板斧”。>str(iris)'data.frame':150obs.of5variables:$Sepal.Length:num5.14.94.74.655.44.654.44.9...$Sepal.Width:num3.533.23.13.63.93.43.42.93.1...$Petal.Length:n
m0_61027476
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2024-01-26 04:39
r语言
跟着Microbiome学作图:
R语言
ggplot2画堆积柱形图展示微生物门水平的相对丰度
论文Reduceddiversityandalteredcompositionofthegutmicrobiomeinindividualswithmyalgicencephalomyelitis/chronicfatiguesyndrome本地文件Giloteaux2016_Article_ReducedDiversityAndAlteredComp.pdfimage.png今天的推文我们来重复
小明的数据分析笔记本
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2024-01-26 04:46
Day 4 生信小组学习笔记 御风而行
今日任务:
R语言
基础1
R语言
基础环境配置无需云服务器,直接在windows操作系统进行注意避免中文安装路径,否则无法识别(已提前安装成功)Rstudio调节镜像源Rstudio内可直接调节默认设置安装Rpackagesinstallpackages
sario0416
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2024-01-25 22:11
R语言
可视化分面图、假设检验、单变量分组多水平t检验并指定参考水平、可视化单变量分组多水平分面箱图(faceting boxplot)并添加显著性水平、指定显著性参考水平
R语言
可视化分面图、假设检验、单变量分组多水平t检验并指定参考水平、可视化单变量分组多水平分面箱图(facetingboxplot)并添加显著性水平、指定显著性参考水平目录
statistics.insight
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2024-01-25 15:45
r语言
人工智能
开发语言
R语言
数据排序
#数据排序#在R中,可以使用Order()函数对一个数据框进行排序。默认的排序顺序是升序。#在排序变量的前面加一个减号即可得到降序的排序结果#例子#order()函数返回的是被排序的列从小到大的依次的位置order(leadership$age)newdata<-leadership[order(leadership$age),]newdata#降序newdata<-leadership[orde
小白15138
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2024-01-25 12:12
R语言
R语言
ggplot画双坐标-柱状图、折线图
ggplot一般不用来画双坐标,有些图双坐标结合起来看比较好,比方说条形图和柱状图。1.画双坐标要用到函数scale_y_continuous,这个函数规定次坐标与主坐标的换算关系,用sec_axis(~./57.69231)来设置,其中57.69231这个换算系数可以根据实际情况调整;2.画了双坐标,需要指定谁在次坐标上显示,那么在次坐标要缩小的倍数,在需要显示在次坐标的数据就需要提升多少倍,这
daydayup8888
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2024-01-25 12:37
R语言
r语言
开发语言
R语言
-检验正态性
1.为什么要检验正态性首先需要明确正态性与正态分布是有区别的,正态分布(标准分布)是统计数据的分布方式,是个钟形曲线,已平均值为对称轴,数据在对称轴两侧对称分布。正态性是检验实际数据与标准正态分布的相似程度,相似程度高,说明具有正态性。很多的统计方法是基于正态分布使用的,如T检验、方差检验等,因此需要检验数据的正态性。2.检验正态性的方法检验正态性常用的方法包括:1.看分布正态分布是个钟形分布,因
daydayup8888
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2024-01-25 12:34
r语言
开发语言
R语言
VRPM包绘制多种模型的彩色列线图
列线图,又称诺莫图(Nomogram),它是建立在回归分析的基础上,使用多个临床指标或者生物属性,然后采用带有分数高低的线段,从而达到设置的目的:基于多个变量的值预测一定的临床结局或者某类事件发生的概率。列线图(Nomogram)可以用于多指标联合诊断或预测疾病发病或进展。近些年来在高质量SCI临床论文中用的越来越多。列线图将回归模型转换成了可以直观的视图,让结果更容易判断,具有可读性,例如:咱们
天桥下的卖艺者
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2024-01-25 12:34
R语言
r语言
开发语言
R语言
【taxlist】——对多样性记录的物种列表使用 taxlist 的指南
1.起步(安装与加载)taxlist包通过一个对象类和功能(方法)处理分类数据。同名对象类taxlist可以进一步与生物多样性记录联系起来(例如,用于植被样地的观测)。taxlist包是在repositoryGitHub(https://github.com/kamapu/taxlist)上开发的,可以使用devtools包安装在R-session中:library(devtools)instal
ALittleHigh
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2024-01-25 12:04
taxlist
r语言
开发语言
C# Queryable类
Queryable类中的方法大致分类三、与Lambda表达式结合使用四、Queryable与java的Stream相比较基本概念查询语法QueryableStream性能和延迟执行实际项目选择考虑因素总结前言C#学习
入门系列
TE-茶叶蛋
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2024-01-25 11:19
.Net
c#
solr
开发语言
R语言
read.csv函数读取数据时的一个报错
读取数据用到的命令是df<-read.csv("example.csv",header=T,row.names=1)报错信息是Errorinmake.names(col.names,unique=TRUE):invalidmultibytestring1解决办法:重新将这个csv文件另存为一个新的csv文件,注意选择下面的CSV(逗号分隔)(.csv),而不是CSVUTF-8(逗号分隔)(.csv
小明的数据分析笔记本
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2024-01-25 10:39
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