R语言数据分析与可视化

解决 docker 中 OpenGL 版本过低的问题

查看EGL对应的OpenGL版本，发现版本过低，没有使用openglshader语言；查看显卡型号：lspci|grepVGA查看使用的是哪个版本的OpenGLDRI_PRIME=1glxinfo|grep"OpenGLrenderer
comedate·2024-01-28 21:23

R语言--23

聚类实例step1：计算距离dist(x,method="euclidean")step2:聚类hclust(d,method="complete")step3:cutree函数进行分支>df1#注意输入的数据框的结构，每行为一个样本，计算样本间两两间的距离heightweightBMItom1807523.14815cindy1655821.30395jimmy1757223.51020sam1
白猫警长ic·2024-01-28 14:22

R语言【taxlist】——print_name()：为发表文章准备可用的格式化名称

Packagetaxlistversion0.2.4Description在撰写关于生物多样性的文章时，可以使用名称自动插入到文件中，包括学名不同元素的典型斜体格式。函数print_name既可以应用于Markdown文档，也可以应用于图形。在Rmarkdown文档中，使用*Cyperuspapyrus*L.插入格式化的物种名称。Usageprint_name(object,...)##S3met
ALittleHigh·2024-01-28 14:59

R语言【taxlist】——replace_x，replace_idx，replace_na，insert_rows()：数据操作

Packagetaxlistversion0.2.4Description这是一系列功能，旨在快速编码替换，既作为内部功能，也用于处理存储在向量和数据帧中的信息的工作流中。此类函数在处理存储在taxlist对象中的功能特征时特别有用。replace_x（）用于替换向量中的值。replace_idx（）通过匹配索引或条件来更改向量中的值。函数replace_na（）的工作方式与replace_idx
ALittleHigh·2024-01-28 14:29

R语言【taxlist】——id_generator()，id_solver()：构建标识符

Packagetaxlistversion0.2.4Description为数据库中的新元素创建标识符。id_solver()方法将比较一组标识符并修改第二个标识符以避免重复的id。Usageid_generator(len,minvalue=1,nchar=10,mode=c("numeric","character"),...)id_solver(insert,to,suffix=c("num
ALittleHigh·2024-01-28 14:58

学习小组Day5笔记--邓陶

今天的学习内容是R语言的基本数据结构：Day5学习内容.png在这些数据类型里，我们主要学习的是向量与数据框这两种。
邓陶·2024-01-28 08:32

25Apply 函数族管道操作

基础数据结构image.pngapply族函数概述apply族函数是R语言数据处理的一组核心函数，它们对array（包括vector、matrix）、dataframe或list按照元素或元素构成的子集合进行迭代
Jachin111·2024-01-28 07:16

R语言【rWCVP】——rWCVP：世界维管植物名录的R包

rWCVP：世界维管植物名录的R包介绍1.参照github安装与简单例子1.1安装rWCVP1.2安装rWCVPdata1.3github的例子2.rWCVP原始文献阅读2.1前言（背景）2.2功能概要2.2.1名称匹配（wcvp_match_names(),wcvp_match_exact(),wcvp_match_fuzzy()）2.2.2匹配后名称解析2.2.3空间整合和分布映射（wcvp_
ALittleHigh·2024-01-28 06:06

R语言【taxlist】——levels()：获取或设置分类等级列表

Packagetaxlistversion0.2.4Description分类层次结构可以设置为taxlist对象中的级别，按从低到高的顺序排列。在taxlist对象中为特定分类概念添加分类级别。此外，概念限制的变化可能涉及其分类层次结构的变化。Usagelevels(x)##S3methodforclass'taxlist'levels(x)levels(x)<-value##S3replace
ALittleHigh·2024-01-28 06:06

R语言【taxlist】——merge_taxa()：整合概念和移除名称

Packagetaxlistversion0.2.4Description将分类概念合并为单个taxlist对象。Usagemerge_taxa(object,...)##S3methodforclass'taxlist'merge_taxa(object,concepts,level,print_output=FALSE,...)Arguments参数【object】：taxlist对象。参数【
ALittleHigh·2024-01-28 06:06

R语言【taxlist】——indended_list()：将层级结构输出为缩进列表

Packagetaxlistversion0.2.4Description将taxlist对象打印分类层次结构（等级和父子关系）输出为缩进列表。Usageindented_list(object,...)##S4methodforsignature'taxlist'indented_list(object,filter,keep_children=TRUE,keep_parents=TRUE,ra
ALittleHigh·2024-01-28 06:36

统计学-R语言-8.2

文章目录前言双因子方差分析数学模型主效应分析交互效应分析正态性检验绘制3个品种产量数据合并后的正态Q-Q图（数据：example8_2）练习前言本篇将继续介绍方差分析的知识。双因子方差分析考虑两个类别自变量对数值因变量影响的方差分析称为双因子方差分析（two-wayanalysisofvariance）（分析两个因子(因子A和因子B)对实验结果的影响）分析时有两种情形：只考虑两个因子对因变量的单独
柔雾·2024-01-28 06:31

R语言【taxlist】——match_names()：字符和 taxlist 对象之间的搜索匹配

Packagetaxlistversion0.2.4Description字符向量中提供的名称将使用函数stringsim（）与存储在类taxlist对象中的插槽taxonNames中的名称进行比较。Usagematch_names(x,object,...)##S4methodforsignature'character,character'match_names(x,object,UsageI
ALittleHigh·2024-01-28 06:30

统计学-R语言-8.3

文章目录前言例题例题一例题二例题三例题四例题五例题六例题七总结前言本篇介绍的是有关方差知识的题目介绍。例题例题一（数据：exercise7_3.RData）为研究上市公司对其股价波动的关注程度，一家研究机构对在主板、中小板和创业板上市的190家公司进行了调查，得到如下数据：检验上市公司的类型对股价波动的关注程度是否独立。（α=0.05）解：提出假设：H0:上市公司的类型对股价波动的关注程度是独立的
柔雾·2024-01-28 06:29

Coding and Paper Letter（八十）

ElegantBookdown3.R语言包lifecycle，生命周期提供了一组工具和约定来管理导出功能的生命周期。
G小调的Qing歌·2024-01-28 05:26

Rstudio安装包下载慢怎么办？

刚开始学习R语言，安装R和Rstudio过程中碰到了一些问题。这两个软件从官网下载安装包都炒鸡慢。R的话还好可以从国内的镜像网站下载，我用的是清华镜像。
朱诚镛·2024-01-28 02:22

DAY4-谢小发（R语言基础）

框架R语言基础.png准备工作预先打开电脑中任意文件夹，查看文件夹名称为中文还是英文如若前面是中文，则将其改为英文，如此才可以使下载的Rstudio可用，否则打开后界面可能问空白，并且不能正常运行有时Rstudio
谢小发·2024-01-28 02:30

【R语言】rep函数的使用

我们在做数据分析的时候，经常需要产生一些重复序列。例如，GEO芯片数据差异表达分析时需要用到的分组变量，cytoscape构建ceRNA网络的节点文件中的RNAtype列等等。今天小编就来给大家介绍一下R中生成重复序列的函数rep。你可以把它看作时repeat这个英文单词的缩写，就很容记住了。函数形式：rep(x,time=,length=,each=,)参数说明：x：代表的是你要进行复制的对象，
生信交流平台·2024-01-28 01:08

【R画图学习11.1】圈图学习1---circlize

所以我们后面会陆陆续续介绍有关R语言圈图的绘制。circlize是Circos的R语言实现，但并不是生成Circos配置文件的前端封装，而是完全基于R语言风格的统计和图形语法实现的。比如下
jjjscuedu·2024-01-28 00:02

群体分布——如何用R语言绘制群体地理分布

Nathan写于2020.08.15群体的地理分布，是做文章经常放的第一张图，其表明你的群体材料在地理上分布的情况（感觉是一句废话）01input首先输入数据是样品分组，以及每个样品对应的经纬度。实例数据如下：随便编的数据有了这个数据就直接用下面的R代码进行画图就可以了。library(ggplot2)library(sp)library(maps)library(maptools)library
只看不写_nathan·2024-01-27 16:43

空间绘图 | R语言克里金插值绘图

上篇推文我们介绍了使用Python-pykrige包实现了克里金(Kriging)插值计算及对应的可视化结果绘制，详细内容点击下方链接：Python-pykrige包-克里金(Kriging)插值计算及可视化绘制，相比你也感受到了Python的简单方便性。本期推文，我们就推出使用R-gstat包实现克里金(Kriging)插值的计算及对应结果的可视化绘制，主要知识点如下：gstat.krige()
数据魅力(DataCharm)·2024-01-27 15:30

R语言_layout()函数用法

前言:微博参与话题#给你四年时间你也学不会生信#————导师赠与之醒世名言ApplyaFunctionOveraRaggedArray|x-y绘图Usagelayout(mat,widths=rep.int(1,ncol(mat)),heights=rep.int(1,nrow(mat)),respect=FALSE)layout.show(n=1)lcm(x)Arguments|参数mat:是矩
谢俊飞·2024-01-27 07:22

看书笔记【R语言数据分析项目精解：理论、方法、实战 8】

看书笔记——R语言Chapter8从数据中寻找优质用户8.1项目背景、目标和方案8.1.1项目背景8.1.2项目目标8.1.3项目方案8.2项目技术理论简介8.2.1逻辑回归的基本概念8.2.2建模流程
小胡涂记·2024-01-27 07:20

看书标记【R语言数据分析项目精解：理论、方法、实战 7】

看书标记——R语言Chapter7构建用户画像7.1项目背景、目标和方案7.1.1项目背景7.1.2项目目标7.2项目技术理论简介7.2.1用户画像的基本概念7.2.2用户画像应用领域7.2.3用户画像分类
小胡涂记·2024-01-27 07:50

看书标记【数据科学：R语言实战 1】

看书标记——R语言Chapter1模式的数据挖掘1.1聚类分析1.1.1k-means聚类用法示例1.1.2k-medoids聚类用法示例1.1.3分层聚类用法示例1.1.4期望最大化（EM）用法示例1.1.5
小胡涂记·2024-01-27 07:50

看书标记【R语言数据分析项目精解：理论、方法、实战 6】

看书标记——R语言Chapter6变量筛选技术6.1项目背景、目标和方案6.1.1项目背景6.1.2项目目标6.1.3项目方案6.2项目技术简介6.2.1变量相关性1.定类变量和定类变量2.定序变量与定类变量
小胡涂记·2024-01-27 07:49

看书标记【R语言数据分析项目精解：理论、方法、实战 3】

看书标记——关于R语言chapter3互联网运营指标的建立3.1项目背景、目标及方案3.1.1项目背景3.1.2项目目标3.1.3项目方案3.2项目技术理论简介3.2.1骨灰级流量指标1.PV（pageviews
小胡涂记·2024-01-27 07:49

统计学-R语言-8.1

文章目录前言方差分析方差分析的原理什么是方差分析误差分解单因子方差分析数学模型效应检验练习前言本片开始介绍有关方差分析的知识。方差分析方差分析的基本原理是在20世纪20年代由英国统计学家RonaldA.Fisher在进行实验设计时为解释实验数据而首先引入的。方差分析是一种统计方法。目前，方差分析方法广泛应用于分析心理学、生物学、工程和医药的实验数据。本章首先介绍方差分析的基本原理，然后介绍只涉及一
柔雾·2024-01-27 07:41

看书标记【数据科学：R语言实战 2】

看书标记——R语言Chapter2序列的数据挖掘2.1模式2.1.1Eclat频繁项集的挖掘用法用eclat找到成年人行为的相似点查找数据集中的频繁项目集中于最高频率的示例2.1.2arulesNBMiner
小胡涂记·2024-01-27 07:39

2020-02-22

Day4——西府R语言基础认识R和RstudioR是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。
西府_9763·2024-01-27 00:57

ChatGPT4助力Python数据分析与可视化、人工智能建模及论文高效撰写

2022年11月30日，可能将成为一个改变人类历史的日子——美国人工智能开发机构OpenAI推出了聊天机器人ChatGPT3.5，将人工智能的发展推向了一个新的高度。2023年4月，更强版本的ChatGPT4.0上线，文本、语音、图像等多模态交互方式使其在各行各业的应用呈现了更多的可能性。2023年11月7日，OpenAI首届开发者大会被称为“科技界的春晚”，吸引了全球广大用户的关注，GPT商店更
Mr.靳靳477302280·2024-01-26 22:05

如何用强化学习优化广告投放中的A/B Test

公众号后台回复“图书“，了解更多号主新书内容作者：会痛的stone来源：R语言工程化A/BTest是决策科学的最常见方法之一。以广告投放为例，将客户群分为两组或多组，每组群体展示不同的广告形式。
IT农民工1·2024-01-26 21:54

Seer*Stat乳腺癌数据预测模型-Step1数据清洗和预处理

这里写自定义目录标题通过R语言进行数据的清洗进入R官网下载环境下载IDE:Rstudio一些基本的小命令使用Rstudio对Seer乳腺癌数据进行清洗通过R语言进行数据的清洗由于刚从Seer上面下载的数据需要进行预处理
m0_51876286·2024-01-26 20:45

R语言【taxlist】——count_taxa()：统计 taxlist 对象中的类群数量

Packagetaxlistversion0.2.4Description统计taxlist对象或包含分类单元名称的字符向量中的分类单元的数量。Usagecount_taxa(object,data,...)##S4methodforsignature'character,missing'count_taxa(object,na.rm=TRUE,...)##S4methodforsignature
ALittleHigh·2024-01-26 16:01

跟着Nature Metabolism学作图:R语言ggplot2一次性展示很多个饼图

论文Single-cellprofilingofvascularendothelialcellsrevealsprogressiveorgan-specificvulnerabilitiesduringobesityhttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00674-x#Sec58s42255-022-00674-x.pdfhttps://github
小明的数据分析笔记本·2024-01-26 14:02

学习小组Day5笔记—白兔儿溜溜

R语言数据结构新手笔记R的赋值符号不是等号，而是<-在Console控制台输入命令，相当于Linux的命令行R的代码都是带括号的，括号必须是英文！！！的。向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。
白兔儿溜溜·2024-01-26 11:24

R语言【taxlist】——clean_strings()：清理字符串

Packagetaxlistversion0.2.4Description多个前导的和后随的空格以及错误的编码可能会在处理分类学名称的信息中导致严重的问题。clean_strings()方法可以清除这些错误。Usageclean_strings(x,...)##S4methodforsignature'character'clean_strings(x,from="utf8",to="utf8",
ALittleHigh·2024-01-26 09:10

统计学基于r语言第六章和第七章答案

#6.1(1)load('C:/exercise/ch6/exercise6_1.RData')par(mfrow=c(1,2),cex=0.8,mai=c(0.7,0.7,0.2,0.1))qqnorm(exercise6_1$零件误差,xlab="期望正态值",ylab="观测值",datax=TRUE,main="正态Q-Q图")qqline(exercise6_1$零件误差,datax=T
大瘦丝儿·2024-01-26 09:40

统计学-R语言-7.5

文章目录前言假设检验单个总体均值的假设检验单样本Wilcoxon符号秩检验两个总体均值的假设检验两个配对样本的Wilcoxon符号秩检验总结前言本篇介绍的是剩余的部分了练习题。假设检验单个总体均值的假设检验一家公司声称它的员工月工资平均为3500元。下表是随机挑选的该公司的15名员工的月工资。该样本的均值为3056.667元，人们因此想检验厂家所声称的平均工资是否属实,α=0.05。设：该厂家的员
柔雾·2024-01-26 09:34

统计学-R语言-7.4

文章目录前言非参数检验两个独立样本的Mann-Whitney检验练习前言本片是对非参数检验最后的介绍。非参数检验两个独立样本的Mann-Whitney检验Mann-Whitney检验也称为Mann-WhitneyU检验（Mann-WhitneyUtest）或称为Wilcoxon秩和检验，它是由HenryB.Mann和D.R.Whitney于1947年提出的。用于确定两个总体间是否存在差异的一种非参
柔雾·2024-01-26 09:33

R语言【taxlist】——clean()：移除孤立的记录

Packagetaxlistversion0.2.4Description对于taxlist类对象的操作可能会产生独立的条目。clean()方法就是用来删除这样的条目，并恢复taxlist对象的一致性。Usageclean(object,...)##S4methodforsignature'taxlist'clean(object,times=2,...)Arguments参数【object】：一
ALittleHigh·2024-01-26 09:33

统计学-R语言-7.3

文章目录前言总体方差的检验一个总体方差的检验两个总体方差比的检验非参数检验总体分布的检验正态性检验的图示法Shapiro-Wilk和K-S正态性检验总体位置参数的检验练习前言本篇文章继续对总体方差的检验进行介绍。总体方差的检验一个总体方差的检验在生产和生活的许多领域，方差的大小是否适度是需要考虑的一个重要因素。一个方差大的产品意味着其质量或性能不稳定。相同均值的产品，方差小的自然要好些。与总体方差
柔雾·2024-01-26 09:02

R语言【taxlist】——dissect_name()：将科学名的各个组分解析出来

Packagetaxlistversion0.2.4Description根据命名法的解析程度和特定角色，包含分类单元用法名称（学名）的字符串由不同部分组成。因此，带有名称的字符串可以分解成这些部分，同时部分的数量可能表明了分类等级。该方法是strsplit()的包装器，如果在参数【repaste】中指明的话，还可以重新粘贴名称组分。Usagedissect_name(x,split="",fix
ALittleHigh·2024-01-26 04:10

R语言【taxlist】——get_children()，get_parents()：检索分类概念的子类群或父类群

Packagetaxlistversion0.2.4Description检索所查询分类单元概念的所有子概念或父概念。Usageget_children(taxlist,...)##S3methodforclass'taxlist'get_children(taxlist,ConceptID,...)get_parents(taxlist,...)##S3methodforclass'taxlis
ALittleHigh·2024-01-26 04:10

R语言【taxlist】——taxlist 包中已经废弃的方法

Packagetaxlistversion0.2.4下面已经废弃的方法中的大多数已经被更新后的方法所取代。add_parent()add_trait()add_level()replace_view()taxlist2taxmap()taxmap2taxlist()taxmap2taxlist()tnrs()
ALittleHigh·2024-01-26 04:10

R语言应用-1：数据整理

基础篇----R环境安装及基本语句：(65条消息)windows下载R和Rstudio，以及R语言基本使用_up_xin的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/weixin_41427508
up_xin·2024-01-26 04:40

r语言进行go富集分析_GO富集分析可视化：R语言GOplot包——准备自己的数据

GO注释和富集分析GO注释和富集分析使用TBtools完成，具体步骤可以参考TBtools作者在腾讯课堂开设的一系列视频课程本文使用的数据是甜樱桃叶绿体蛋白编码基因做GO注释，然后挑部分基因做富集分析，挑选的基因是rpoC1rpoBrpoArpoC2atpIatpFatpEatpHatpBatpAaccDrbcLrpl22rpl23rpl20rps8rps7rps16rps15rps14rps18
weixin_39868663·2024-01-26 04:39

R语言学习——数据框

x=c(42,7,64,9)y=1:4z.df=data.frame(INDEX=y,VALUE=x)z.dfdim(z.df)#查看几行几列colnames(z.df)#查看列名rownames(z.df)#查看行名z.df[,1]z.df[1,]z.df[c(1,2),c(1,2)]df1=data.frame(C1=c(1,5,14,1,54),C2=c(9,15,85,9,42),C3=c
帅锅不识字·2024-01-26 04:09

r语言集合补集_R语言数据整理利器——dplyr

dplyr对于处理以行列关系表示的数据框(每一行是一个观测值，每一列是一个维度)十分有效。首先dplyr与SQL语句十分类似，其中select、filter、mutate、summarise等几个关键的函数，可以帮助我们非常方便的筛选、修改、汇总数据。此外dplyr还可以使我们非常便捷的对数据集进行交并合补。最后dplyr中还引入了管道处理的概念(如x%>%f(y)等同于f(x,y))，使我们可以
深渊号角mkq0.~·2024-01-26 04:09

R语言【taxlist】——df2taxlist()：将数据帧和字符串转换为 taxlist 对象

Packagetaxlistversion0.2.4Descriptioin将数据框转换为taxlist对象。此外，包含分类名称的字符向量将被转换，但不会返回任何关于分类等级和亲本分类群的信息。Usagedf2taxlist(x,...)##S3methodforclass'data.frame'df2taxlist(x,taxonTraits,taxonViews,levels,clean_st
ALittleHigh·2024-01-26 04:39
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