R语言数据科学第6页

跟着ISEM学作图：R语言ggtree+ggplot2组合进化树和气泡图

论文Conservedandreproduciblebacterialcommunitiesassociatewithextraradicalhyphaeofarbuscularmycorrhizalfungiimage.png今天的推文我们来重复一下论文中的Figure2image.png没有找到论文提供的原始数据，这里数据我自己构造一份首先是左侧的进化树文件(((A8:0.9735669859

小明的数据分析笔记本·2024-02-10 17:59

R语言编程-Tidyverse 书籍 - 第三章 - 统计建模

1整洁模型结果-broom包tidyverse主张以‘‘整洁的”数据框作为输入，但是lm,nls,t.test,kmeans等模型的输出结果，却是‘‘不整洁的”列表。broom包实现将模型输出结果转化为整洁的tibble，且列名规范一致，方便后续取用；另外，与tidyr包中的nest()/unnest()函数以及purrr包中的map_*()系列函数连用，非常便于批量建模和批量整合模型结果。bro

Hello育种·2024-02-10 16:12

NumPy：Python的强大数值计算库

本文将介绍NumPy的主要特点、常用功能和应用场景，以展示它在数据科学领域的重要性和价值。NumPy的主要特点NumPy具有以下主要特点：多维数组对象：NumP

爱编程的鱼·2024-02-10 14:44

从入门到实战，32节时间序列实战课！

模块一基础：认识数据科学家模块二进阶：时间序列预测概论+论文和代码讲解模块三项目实战：基于股价和零售的时序项目实战模块四比赛实战：数据科学入门赛+回答准确性预测赛模块五时序前沿：前沿机器学习与时序+

机器学习与AI生成创作·2024-02-10 11:52

在Python和R语言中使用Auto ARIMA构建高性能时间序列模型

作为一个数据科学家，你会把这个问题归类为什么？当然是时间序列建模。从预测产品的销售到估计家庭的用电量，时间序列预测是任何数据科学家都应该知道的核心技能之一，如果不是精通的话。

公子曼步·2024-02-10 07:17

R语言|CMplot包绘制环形曼哈顿图

R包-CMplot绘制环形曼哈顿图今天小编给大家分享的是R语言绘制环形曼哈顿图的方法，主要用到的是CMplot包，它是绘制SNP密度、曼哈顿图和QQ图的一个很实用的R包。大家感兴趣的话可以瞅瞅。

维凡生物·2024-02-10 05:10

基于R语言的微生物群落组成多样性分析——物种丰度计算及可视化

引言在对样本的微生物群落组成多样性分析过程中，除了Alpha多样性与Beta多样性的分析，最重要的一个部分就是对样本中微生物具体的群落结构组成情况进行分析。一般我们从门水平及属水平上计算优势物种的相对丰度并通过表格或者柱状堆积图进行展示。正文—代码设置工作目录并加载包rm(list=ls())#clearGlobalEnvironmentsetwd('D:\\桌面\\物种丰度计算及可视化'

科研那点事儿·2024-02-10 01:26

anaconda数据科学和机器学习的开源工具和库指南---官网白皮书

anaconda数据科学和机器学习的开源工具和库指南---官网白皮书一基础数据科学工具和库jupyterPandasSciPyNumpy二机器学习Tensorflow和KerasPytorchScikit-learn

杨叶辰·2024-02-10 01:18

TCGA新版数据库表达矩阵提取

本文首发于公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。

医学和生信笔记·2024-02-10 00:22

23个Python爬虫开源项目代码：微信、淘宝、豆瓣、知乎、微博...

来源：Python数据科学今天为大家整理了23个Python爬虫项目。

互联网架构·2024-02-10 00:59

Meta分析入门工具介绍

主要目的是先能够简单的复现一些论文的研究方法，按照计划是了解Revman，stata与R语言的相关分析方法即可。

Jabes·2024-02-09 22:00

每日一看大模型新闻（2023.12.18）OpenAI官方的Prompt工程指南：你可以这么玩ChatGPT；有效提高视频编辑一致性，美图&国科大提出基于文生图模型新方法EI²；openAI灰度测试

腾讯云推出高性能应用服务HAI发布时间：2023-12-18腾讯讯云推出高性能应用服务HAI10分钟即可创建AI应用_部署_模型_用户主要内容：AI提供即插即用的算力和常见环境，支持快速部署语言模型、AI作画、数据科学等高性能应用

超爱玩大模型·2024-02-09 22:48

数据科学 - 日志

日志记录对于了解运行程序时发生的事件非常有价值。例如,如果您在夜间运行模型,并看到它在第二天产生了荒谬的结果,日志消息可以真正帮助您更好地了解发生这种情况的上下文。让我们了解使日志消息有效的特性。日志消息日志记录是记录消息以描述运行软件时发生的事件的过程。让我们看几个例子,并学习编写好日志消息的提示。小贴士:要专业、清晰Bad:Hmmm...thisisn'tworking???Bad:idk..

IntoTheVoid·2024-02-09 22:50

DAY5-zzw

6.表格在R语言中改名叫数据框_7.别只复制代码，要理解其中的命令、

张纸薇·2024-02-09 21:39

R语言可视化学习笔记之ggridges包

作者：严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源。严涛老师的绘图教程还有：gganimate|诺奖文章里面的动图布局教程来了！！

生信宝典·2024-02-09 21:25

基于R语言如何实现偏最小二乘法判别分析（PLS-DA）？

偏最小二乘法判别分析，即我常说的PLS-DA（PartialLeastSquaresDiscriminantAnalysis），经常被用来处理分类和判别问题。这种方法和PCA分析方法是比较类似的，区别在于二者是否有监督，一般PCA是无监督的，而PLS-DA是有监督的。当碰到样本组间差异大而组内差异小的情况，常见的PCA分析方法是可以很好地区分组间差异的，但是遇到样本组间差异不大的情

科研那点事儿·2024-02-09 17:27

R语言ggplot2：第九章数据操作

第9章数据操作9.1plyr包简介plyr包中的ddply()函数能够同时在数据的多个子集上做统计汇总。ddply(.data,.variables,.fun,...):data是用来作图的数据，variables是对数据取子集的分组变量，fun是要在各子集上运行的统计汇总函数。subset()用来对数据取子集的函数，选择数据中前n个（x%）个观测值，或者再某个阈值之上或下的观测值。transfo

王叽叽的小心情·2024-02-09 15:45

statsmodels专栏4——深度解析：Python中的Statsmodels库时间序列分析

时间序列分析在数据科学领域中占据着重要地位，它不仅帮助我们理解数据的趋势和模式，还能够提供对未来趋势的预测。

theskylife·2024-02-09 14:31

如何选择数据科学最好的Python IDE？

点击上方"程序员小乐"关注,星标或置顶一起成长每天凌晨00点00分,第一时间与你相约每日英文Fiverulestobehappy:Freeyourheartfromhatred.Freeyourmindfromworries.Livesimply.Givemore.Expectless.快乐的五条法则：不憎恨，不焦虑，简单地生活，多一点付出，少一点期待。每日掏心话有的人本来很幸福，看起来却很烦恼；

程序员小乐·2024-02-09 11:41

精选 | 2018年3月R新包推荐

JosephRickert翻译：黄小伟，先后从事游戏、社交及金融数据研究及应用，目前就职网易杭州2018年3月份，共有约200个R新包收录于CRAN，本文选摘了其中40个新包加以功能简述，主要包括：计算方法、数据、数据科学

黄小伟Yeah·2024-02-09 11:34

政安晨：示例演绎Python语言外部库的使用

但是Python最好的地方之一（特别是对于数据科学家而言）是它所拥有的大量高质量的自定义库。其中一些库是“标准库”，意味着你可以在任何运行P

政安晨·2024-02-09 09:36

python截取指定位置的字符串

Python是一种高级编程语言，广泛应用于数据科学、人工智能和Web开发等领域。在Python编程中，字符串是不可变的序列，也是一种常见的数据类型。

Python栈_基·2024-02-09 07:22

R语言中,cbind和rbind区别

cbind：根据列进行合并，即叠加所有列，m列的矩阵与n列的矩阵cbind()最后变成m+n列，合并前提：cbind(a,c)中矩阵a、c的行数必需相符rbind：根据行进行合并，就是行的叠加，m行的矩阵与n行的矩阵rbind()最后变成m+n行，合并前提：rbind(a,c)中矩阵a、c的列数必需相符————————————————Rversion3.6.2(2019-12-12)--"Dark

Seurat_·2024-02-09 06:55

MySQL数据库基础第二篇（函数）

数值函数1.练习代码2.读出结果四、日期函数1.练习代码2.读出结果五、流程控制函数1.练习代码2.读出结果在当代技术世界中，掌握数据库设计和操作的知识和技能，尤其是对SQL的理解，早已成了计算机科学、数据科学和一系列其他技术领域中的必备技能

半夜敲代码的夜猫子·2024-02-09 06:53

R语言rmarkdown使用

1、安装install.packages('rmarkdown')library(rmarkdown)install.packages('tinytex')tinytex::install_tinytex()2、新建RMarkdown3、基本框架红色框内为YAML：包括标题、作者和日期等黄色框内为代码块：执行后面的代码，并可以设置展示的结果。蓝色框内为Markdown文本4、运行代码产出结果5、导

weixin_49320263·2024-02-09 05:50

由内而外释放R的力量||摘自《R大数据分析实用指南》

数据必须读入内存R核心是单线程的R是一种解释语言使用ff和ffbase超越内存限制主要用于大数据的转换聚合与建模：深入ffandffbaseR语言操作my

周运来就是我·2024-02-09 05:37

探索XGBoost：参数调优与模型解释

导言XGBoost是一种高效的机器学习算法，广泛应用于数据科学和机器学习任务中。本教程将介绍XGBoost的中级用法，重点关注参数调优和模型解释。

Echo_Wish·2024-02-09 04:52

真正干货！小白学习Python的正确姿势！

不仅如此，学习Python还可以让你在软件工程、web开发、移动开发或数据科学等领域谋一份好差事，在职业提升的道路上助你一臂之力。

Python小白集训营·2024-02-09 04:26

快速上手Python三剑客--Pandas篇

Pandas是一个开源的数据分析和数据处理库，它是基于Python编程语言的Pandas提供了易于使用的数据结构和数据分析工具，特别适用于处理结构化数据，如表格型数据（类似于Excel表格）Pandas是数据科学和分析领域中常用的工具之一

~聊音小生。·2024-02-08 23:22

从列表中删除元素|自学生信Python（第十六天）

了解到生物信息学要有编程基础，尤其是要会一门编程语言，例如：R语言、Python、Perl等，还要熟悉Linux系统，作为生信小白，听说Python挺简单的，于是就自学了Python，花了两天时间了解了

天明豆豆·2024-02-08 22:40

r语言svr模型_使用R语言建立一个决策树回归模型

决策树是一种简单但使用广泛的分类算法，根据目标变量的类型，决策树分为分类决策树(目标变量为因子型)与回归决策树(目标变量为连续数值型)。在这里，我们使用R建议一个回归决策树模型。决策树简单介绍对于一个分类问题，我们可能需要多个属性值来构建问题，通过回答这些问题(比如长度大于多少，宽度大于多少，重量大于多少)，有序地得到问题的答案，并重复问题到我们得到最后的分类，把上面的过程(问题、答案)有组织的组

weixin_39849888·2024-02-08 20:22

【R语言入门与数据分析-2】数据的读取与写入

使用过程中发现自己的R语言基础太差了，回头补课。P28-P33所学视频：https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?

森尼啊·2024-02-08 13:15

开源软件对技术以及行业发展的影响

行业影响：各个行业都能从开源社区中受益，无论是在数据科学、人工智能、云计算还是其他领域。开源软件使得创新变得更加容易，帮助企业更好地应对业务挑战。2.降低成本和加速开发：技术发展：

lolitaline·2024-02-08 11:35

DoWhy：Python 中的因果推断库

DoWhy是一个在Python中开发的因果推断库，旨在帮助研究人员和数据科学家分析和理解因果关系。它提供了一个框架，使得因果推断变得简单而直观，同时充分利用了现有

爱编程的鱼·2024-02-08 10:36

02.心电图心跳信号多分类预测挑战赛【数据分析】

1.导入数据科学及可视化包#coding:utf-8#导入warnings包，利用过滤器来实现忽略警告语句。

Ai星辰大海·2024-02-08 09:28

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2一次性画好多个饼状图

今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8b，很多个饼状图放到一起image.png最基本的想法就是单独画好多个饼状图，然后通过拼图实现，但是因为之前重复

小明的数据分析笔记本·2024-02-08 08:56

非约束排序1—概述（数量生态学：R语言的应用第五章）

非约束排序1—概述（数量生态学：R语言的应用第五章）在这之前我们已经学习了聚类分析，聚类分析的目的在于寻找数据的间断性，排序的目的就在于寻找数据的连续性（通过连续的排序轴展示数据的主要趋势）。

fafu生信小蘑菇·2024-02-08 07:20

in r, 找出所有重复的元素，包括第一个 R语言｜如何筛选所有的重复行（包括第一行重复在内）

library(dplyr)data%group_by(type)%>%#根据你要筛选的列进行分组filter(duplicated(type)|n()!=1)%>%#将该列中有重复的行挑选出来ungroup()方法二#示例向量x<-c(1,2,3,2,4,5,5,6)#找出所有重复的元素（包括第一次出现的）duplicates<-duplicated(x)|duplicated(x,fromLa

生信小博士·2024-02-08 02:36

docker数据科学与spark镜像源与使用常见问题疑难解答

DreamNotOver·2024-02-08 01:16

46期生信第五天-一加一等于几

（6）表格在R语言中改名叫数据框_（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命

茶黄素·2024-02-08 00:34

梯度提升树系列5——使用GBDT进行特征选择

特征选择是机器学习和数据科学中至关重要的一环，它不仅可以提高模型的性能，还能显著减少模型训练所需的时间和资源。

theskylife·2024-02-07 23:56

跟着Nature Communications学作图：R语言ggtern包画三元相图（Ternary plots ）

论文Ahighlyconservedcorebacterialmicrobiotawithnitrogen-fixationcapacityinhabitsthexylemsapinmaizeplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31113-w本地pdfs41467-022-31113-w.pdf数据代码链接https://github.

小明的数据分析笔记本·2024-02-07 22:30

R语言入门笔记2.3

for循环for循环用于多次执行相似的代码。其基本语法如下：for(variableinsequence){#在每次迭代中执行的代码}其中：variable是一个变量，用于在每次迭代中存储序列中的当前元素。sequence是一个向量，可以是数字序列、字符序列或其他可迭代对象。在每次迭代中，variable会依次取sequence中的每个元素的值，然后执行for循环中的代码块。例1：>n=c(1,2

Mrji1995·2024-02-07 19:04

R语言入门笔记2.2

ifelse语句结构：ifelse(条件,表达式1,表达式2)#满足条件，则进入表达式1，否则为表达式2例1：>a=1>ifelse(a<0,"a小于0",ifelse(a==0,0,"a大于0"))[1]"a大于0"a=1-这行代码给变量a赋值为1。ifelse(a<0,"a小于0",ifelse(a==0,0,"a大于0"))-这是一个嵌套的ifelse语句。它的结构是ifelse(condi

Mrji1995·2024-02-07 19:03

【DELM回归预测】基于深度学习极限学习机DELM实现数据回归预测附matlab代码

matlab科研助手·2024-02-07 15:32

R语言机器学习与临床预测模型35--分类回归树

本内容为【科研私家菜】R语言机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】[图片上传失败...

科研私家菜·2024-02-07 14:22

FIS 如何使用 Amazon OpenSearch Service 摄取和搜索向量数据以快速解决工单问题

此博文由FIS高级数据科学经理SheelSaket和亚马逊云科技高级架构师RupeshTiwari撰写。您有没有发现自己疲于应付多种缺陷记录机制、分散的项目管理工具和分散的软件开发平台？

亚马逊云开发者·2024-02-07 13:29

数据库从事什么工作_我如何开始从事数据科学

为什么要学习数据科学？WhatExactlyisMachineLearning(ML)inDataScience?数据科学中的机器学习(ML)到底是什么？

weixin_26713457·2024-02-07 13:46

R语言基础语法

R语法1.赋值操作符号“a；表示将2赋值给a等于符号，表示方式：a=3；表示将3赋值给a2.输出变量cat()函数：cat('text',var)print()函数：print('text',var)3.变量的数据类型R属于动态类型语言，变量的数据类型取决于输入变量类型函数：class()a=1print(class(a))output:numeric4.查找变量查找所有变量，应使用ls()函数代

地平线上的背影·2024-02-07 10:06

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