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R语言深入学习
终于告一段落
下阶段准备利用业余时间多多读书,
深入学习
写作。每天还是坚持在上更新内容,多多练习。期待与简友的互动,学习。有没有哪位大佬可以给推荐基本好书来学习的。有那种指导读书,
青春为谁朽
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2023-11-30 09:02
R语言
:利用rhdf5包分别创建单组学,多组学.h5文件
最近在跑的方法需要.h5作为输入文件,就学习了一下怎么创建.h5文件,原有数据结构如下:生成单组学.h5文件的代码如下:library(rhdf5)library(dplyr)library(patchwork)rna.data<-Read10X(data.dir='Processed_dataset/RNA',gene.column=1)atac.data<-Read10X(data.dir='
hyena_7
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2023-11-30 08:04
R
数据分析
r语言
生物信息
如何用
R语言
优雅地玩转PubMed-RISmed包的使用
PubMed是最大的生命科学文献数据库之一,在开展课题使用关键词搜索时,会检索出大量文献。如何对这些文献进行筛选,出了巧妙使用关键词组合外,还可以使用R将相关文献信息一键提取,实现文献的快速浏览。RISmed是一个用于从PubMed数据库获取和分析医学文献数据的R包。它可以帮助你进行文献检索、下载文献摘要、获取作者信息等操作。其具体应用如下。#安装加载包#install.packages("RIS
一个人旅行*-*
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2023-11-30 08:31
java
数据库
服务器
scitb包1.5版本发布—增加了统计值的结果和自动判断数据是否正态分布的功能
目前,本人写的scitb包1.5版本已经正式在
R语言
官方CRAN上线,scitb包是一个为生成专业化统计表格而生的R包。目前只能绘制基线表一。
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:23
R语言
我写的R包
r语言
基线表
表一
R语言
提取文字(字符串)中的内容--正则式(2)
科学研究中有时候咱们收集到的数据很乱,不能马上进行分析,如SEER数据,用过都知道,咱们需要对数据进行清洗,从数据中提取咱们需要的东西,才能进行分析,这时候有个有用的东西叫正则式,对于我们在字符串中提取数据非常实用,上一章《
R语言
提取文字
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:23
R语言
r语言
开发语言
R语言
dlnm包在时间序列空气污染数据的分布滞后线性和非线性模型的应用(2)
本期应粉丝要求复现一篇6分左右文章的图片,文章名称是:Airpollutionandcoronaryheartdisease–relatedhospitalvisitsinBeijing,China:time-seriesanalysisusingageneralizedadditivemode(空气污染和冠心病相关医院访问,中国北京:时间序列分析应用广义加性模型)作者研究了多种空气污染物与冠心病
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:23
R语言
r语言
开发语言
R语言
基于Matching包进行倾向评分匹配(PSM)
倾向评分匹配(PropensityScoreMatching,简称PSM)是一种统计学方法,用于处理观察研究(ObservationalStudy)的数据,在SCI文章中应用非常广泛。在观察研究中,由于种种原因,数据偏差(bias)和混杂变量(confoundingvariable)较多,倾向评分匹配的方法正是为了减少这些偏差和混杂变量的影响,以便对实验组和对照组进行更合理的比较。为什么需要做倾向
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:22
R语言
r语言
开发语言
R语言
rhdf5读写hdf5文件(.h5)展示文件组织结构和数据索引
h5只是一种简单的数据组织格式【层级数据存储格式(HierarchicalDataFormat:HDF)】,该格式被设计用以存储和组织大量数据。在一些单细胞文献中,作者通常会将分析的数据上传到GEO数据库保存为.h5格式文件,而不是我们常见的工程文件(rds文件,表格数据等),所以为了解析利用这些数据需要对hdf5格式的组织结构有一定的了解。(注:在Seurat包中有现成的函数Seurat::Re
Nh_code
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2023-11-30 08:19
r语言
Linux 下用
R语言
打开hdf5(.h5)文件异常的解决方案
6月10日从GEO数据库下载了作者上传的表达矩阵h5格式文件,需用从中提取出表达矩阵然后重构Seurat分析对象;该exp_matrix.hdf5文件在我的Window系统上,可以通过rhdf5::H5Fopen和hdf5r::H5File$new两种方法打开读取文件内容。但是由于文件太大,有6个G,在我24G内存的Windows系统上没办法完全加载出矩阵。于是就把文件上传到服务器集群进行处理,以
Nh_code
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2023-11-30 08:19
r语言
R语言
gWQS包在加权分位数和回归模型的应用
在流行病学研究中,相较于单一因素的暴露,多因素同时暴露的情况更为常见。传统模型在评价多因素联合暴露时存在数据维度高、多重共线性等问题.WQS回归模型的基本原理是通过分位数间距及加权的方法,将多种研究因素的效应综合成为一个指数,再进行回归分析。不同因素赋予的权重反映了其对结局的影响程度。使用该模型时应满足各研究因素对结局影响的方向相同这一基本假设.模型的一般形式为:式中:c表示污染物种类;β0表示截
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:16
R语言
r语言
回归
kotlin
Android基础之J2se学习规划
如果你确实要
深入学习
的话确实要花许多功夫但是知识基础的话就三个字简单简单简单额,这里好像只有两个字。好了,不废话上目录!类实例化的方法(你不会以为只有一种办法new吧?)
软件星
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2023-11-30 08:40
Java使用手册
android
j2se
多线程
框架
数学
LiteFlow规则引擎框架
LiteFlow规则引擎框架
深入学习
在每个公司的系统中,总有一些拥有复杂业务逻辑的系统,这些系统承载着核心业务逻辑,几乎每个需求都和这些核心业务有关,这些核心业务业务逻辑冗长,涉及内部逻辑运算,缓存操作
养一头猪
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2023-11-30 07:35
java
R语言
学习DAY04:回归分析
Allmodelsarewrong,butsomeareuseful—GeorgeBoxR本身是一门统计语言,主要用于统计分析,前面的语法部分算是基础,接下来开始进入统计模型应用。首先从最常用的回归分析说起。有关线性回归分析模型的基本假定需要注意:1)关于随机干扰项的高斯-马尔科夫定理;2)关于自变量的:不存在共线性;3)关于模型的:模型设定正确。模型拟合lm函数:用最小二乘法估计模型参数x<-s
sonder_943f
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2023-11-30 07:54
R语言
ggplot2绘制Y轴截断柱形图
有时候做柱形图如果其中某一两个数值非常大,作图的时候其他柱子就非常低,看起来就不是很美观,其中一种办法是对Y轴进行截断,如果单纯使用ggplot2的代码实现起来还是相对比较麻烦的,Y叔(ggtree/clusterProfiler等R包的作者)开发的ggbreak可以很方便的实现Y轴截断参考链接SetAxisBreakforggplot2(r-project.org)
小明的数据分析笔记本
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2023-11-30 03:37
“最后一公里”不能出现“断头路”,稳步提升基层党组织建设
2020年6月29日,中共中央政治局就“
深入学习
领会和贯彻落实新时代党的组织路线”举行第二十一次集体学习。
欣悦静欢
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2023-11-30 02:08
深入学习
Composer原理(一)
Composer作为PHP的包管理工具,为PHPer们提供了丰富的类库,并且让PHP重焕新生,避免被时代淘汰的悲剧。可以说,Composer和PHP7是现在PHP开发者的标配,如果你还没用过Composer或者在PHP7的环境下工作,那么还真是有点落伍了哦!这次的系列文章将一步步的解析Composer原理,不会去讲解Composer的命令或者如何使用,这方面的内容您可以稳步Composer中文网:
ZyBlog
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2023-11-30 01:26
R语言
绘制小RNA丰度条形图
R语言
绘制小RNA丰度条形图小RNA中的丰度分布十分不均,少数种类小RNA的丰度占全部的比例较高,研究重点也都放在丰度较高的小RNA上,小RNA长度分布图可以有效筛选丰度较高的小RNA,我们以文献CharacterizationofmouseserumexosomalsmallRNAcontent
纪伟讲测序
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2023-11-30 00:09
IF:4+ 鉴定与股骨头坏死软骨氧化应激相关的Hub基因和通路
点击关注,桓峰基因桓峰基因生物信息分析,SCI文章撰写及生物信息基础知识学习:
R语言
学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你75篇原创内容-->公众号现在肿瘤的文章已经很多很多了
90066456ace6
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2023-11-30 00:53
学习小组Day4-Bossa
day4mind.png初识
R语言
软件的安装R软件的安装从官网下载对应版本,下载地址为:
R语言
官网。
七比比
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2023-11-30 00:57
大学计算机早知道这套方法,超越90%的大学生!
目录第一点:一定要自学第二点:找学习资源第三点:找工作的加分项第一点:一定要自学不要指望把大学课程学完了就能找到一份好工作,一定要私下去寻找自己的发展方向并开始
深入学习
。
「已注销」
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2023-11-29 23:05
学习
开发语言
网络安全
经验分享
2020-05-13 常用的数据分析与挖掘工具
常用的数据分析与挖掘工具
R语言
是由奥克兰大学统计系的Robert和Ross共同开发的,并在1993年首次亮相。其具备灵活的数据操作、高效的向量化运算、优秀的数据可视化等优点,受到用户的广泛欢迎。
程凉皮儿
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2023-11-29 19:39
R绘制堆积柱形图
前面给大家讲了☞【
R语言
】百分比表格删除两行重新计算百分比,有小伙伴对文中的两个堆积柱形图比较感兴趣。那么今天我们就来聊聊这两张图是如何绘制出来了。
生信交流平台
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2023-11-29 19:15
《
R语言
实战》自学笔记56-方差分析术语
第9章方差分析9.1术语速成为便于理解方差分析的相关名词,我构建一个案例:假如我们研究氮肥用量和玉米品种对玉米产量影响。设置一个田间试验,试验包括氮肥用量两个N1(200kg/ha)和N2(300kg/ha),玉米品种两个先玉335(XY335)和郑单958(ZD958),3次重复,测定指标为玉米产量。1、田间试验相关概念试验处理(experimentaltreatments):事先设计好的实施在
zjh9280
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2023-11-29 19:12
Python之内置函数和模块
各位小伙伴,如果您:想系统/
深入学习
某技术知识点…一个人摸索学习很难坚持,想组团高效学习…想写博客但无从下手,急需写作干货注入能量…热爱写作,愿意让自己成为更好的人…文章目录一、内置函数1.1、什么是内置函数
哥的时代
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2023-11-29 17:39
Python
python
开发语言
R语言
rvest包网络爬虫
R语言
网络爬虫初学者指南(使用rvest包)钱亦欣发表于今年06-0414:505228阅读作者SAURAVKAUSHIK译者钱亦欣引言网上的数据和信息无穷无尽,如今人人都用百度谷歌来作为获取知识,了解新鲜事物的首要信息源
weixin_33883178
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2023-11-29 15:26
r语言
爬虫
runtime
【Redis6快速
深入学习
04】Redis字符串(String)的使用和原理
Redis字符串(String)4.1Redis中String的简介String是Redis五种最基本的类型之一,在使用时可以理解成与Memcached一模一样的类型,一个key对应一个value。String类型是二进制安全的。意味着Redis的string可以包含任何数据。比如jpg图片或者序列化的对象。String类型是Redis最基本的数据类型,一个Redis中字符串value最多可以是5
_之桐_
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2023-11-29 15:00
——
redis
——
学习
redis
数据库
物理层之编码与调制(非归零编码、慢车斯顿编码、差分曼彻斯特编码、归零编码、反向不归零编码、4B/5B编码)
各位小伙伴,如果您:想系统/
深入学习
某技术知识点…一个人摸索学习很难坚持,想组团高效学习…想写博客但无从下手,急需写作干货注入能量…热爱写作,愿意让自己成为更好的人…文章目录一、基带信号与宽带信号1、基带信号
哥的时代
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2023-11-29 13:44
计算机网络
网络
物理层之三种数据交换方式(电路交换、报文交换、分组交换(数据报方式、虚电路方式))
各位小伙伴,如果您:想系统/
深入学习
某技术知识点…一个人摸索学习很难坚持,想组团高效学习…想写博客但无从下手,急需写作干货注入能量…热爱写作,愿意让自己成为更好的人…文章目录前言一、电路交换二、报文交换三
哥的时代
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2023-11-29 13:44
计算机网络
计算机网络
物理层
MyBatis-Plus简介和入门操作
各位小伙伴,如果您:想系统/
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某技术知识点…一个人摸索学习很难坚持,想组团高效学习…想写博客但无从下手,急需写作干货注入能量…热爱写作,愿意让自己成为更好的人…文章目录一、MyBatis-Plus
哥的时代
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2023-11-29 13:14
Java
mybatis
java
物理层之码分复用(内含相关例题)
各位小伙伴,如果您:想系统/
深入学习
某技术知识点…一个人摸索学习很难坚持,想组团高效学习…想写博客但无从下手,急需写作干货注入能量…热爱写作,愿意让自己成为更好的人…文章目录一、码分复用二、例题详解1、
哥的时代
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2023-11-29 13:42
计算机网络
计算机网络
物理层
码分复用
R语言
实现MapReduce的协同过滤算法
原文地址:http://www.tuicool.com/articles/63EjqiAuthor:张丹(Conan)Date:2013-04-07Weibo:@Conan_ZEmail:
[email protected]
:http://www.fens.me/blogAPPs:@晒粉丝http://www.fens.me@每日中国天气http://apps.weibo.com/chin
张小琦
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2023-11-29 12:28
数据挖掘
深入Android S(12.0)探索Framework之SystemServer进程的启动详解
深入学习
AndroidFramework第三:深入AndroidS(12.0)探索Framework之SystemServer进程的启动详解文章目录
深入学习
AndroidFramework前言一、Android
neuHenry
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2023-11-29 11:11
源码分析
Android
学习
android
Framework
R sort、rank、order、arrange排序函数
本文转载自:https://www.cnblogs.com/hider/p/10019536.html
R语言
中排序有几个基本函数:sort()、rank()、order()、arrange()一、总结sort
淡水鱼Ada
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2023-11-29 11:31
四、synchronized之锁优化
1.概述刚学Java并发的时候,多线程情况的处理一般都是用synchronized来实现,我们称其为“同步”,但随着我们
深入学习
才知道,它是一个重量级锁,相对于Lock,显得非常笨重,严重影响程序的效率
liyf155
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2023-11-29 11:33
“SRP模型+”多技术融合在生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价及拓展应用
生态环境脆弱性驱动力研究生态环境脆弱性研究热点二、文献可视化软件介绍及常用功能介绍VOSViewer文献可视化及研究热点分析;Citespace文献可视化及研究热点分析;ArcGIS软件介绍及安装技巧
R语言
环境部署
Teacher.chenchong
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2023-11-29 08:18
生态
经验分享
SRP模型丨生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价;地理探测器运行等;集成云端、桌面端等环境,结合遥感云计算、GIS空间分析、
R语言
统计分析的优势
集成云端、桌面端等环境,结合遥感云计算、GIS空间分析,
R语言
统计分析的优势,以分析生态环境脆弱性的时空演变为主线。
小艳加油
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2023-11-29 08:47
生态
SRP模型
生态环境脆弱性评价
时空格局演变分析
RSEI
指数
地理探测器
shell语言练习for循环和if判断的小脚本
目录需求:ping一下当前网段下的所有地址,能ping通的加入一个文件,不能ping通则加入另一个文件这个fo
r语言
写法是仿C写法,可能是之前语言的印象比较深吧,也可以使用foriin{1..254}for
丨析木丨
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2023-11-29 07:32
linux
shell
linux
服务器
网络
Extjs图书管理系统源码 智能化图书管理系统源码
该源码图书管理系统功能实现不是重点,重点是演示对Extjs二次封装使用,进行
深入学习
。比较适合对Extjs的学习和进阶。模式:WebForm(B/S,需要IIS支持)框架:FrameWorkV2.
淘源码d
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2023-11-29 06:10
图书管理
源码
Extjs
《应急响应》记一次“XMR门罗币挖矿木马病毒”处置
原创作者:逸尘一、背景概述故事的起因于26号下午做渗透测试时,登录跳板机发现CPU进程拉满到200%,qiao哥看了一眼直接说是XMR挖矿,这句话勾引起我的兴趣,由于应急是我的薄弱项也没有时间
深入学习
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「已注销」
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2023-11-29 06:58
应急响应
安全
网络安全
金塔大队“六点”扎实开展“正确看待荣誉·岗位建功奉献”荣誉观专题教育
召开专题学习会,把学习宣传贯彻习近平总书记重要系列讲话精神作为教育核心内容,同
深入学习
习近平总书记授旗训词精神结合起
田继鹏
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2023-11-29 05:47
r语言
相关性作图_
R语言
:多个基因的相关性分析与展示
R语言
:多个基因的相关性分析与展示。关于批量相关性分析,我们发过两个帖子。单基因批量相关性分析的妙用,又是神器!基于单基因批量相关性分析的GSEA。
weixin_39747721
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2023-11-29 03:03
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_用
R语言
进行相关性分析:画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值...
excel表格的,对于读取excel,此处有一个小技巧读取excel方法1.把excel文件另存为CSV文件1png2.png3.png4.png2.按照读取csv文件方法读取dat此名为excel1文件被
R语言
读取二
JunyuanLI
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2023-11-29 03:03
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_
R语言
绘图:相关性分析及绘图展示
rm(list=ls())#先把我们的R清空一下datafile="C:\\Users\\gaom\\Desktop\\
R语言
绘图\\相关性分析\\",header=T,=1,sep="\t")#读取数据
董振业
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2023-11-29 03:02
r语言
相关性作图
ROC及曲线面积汇总学习
目录ROC基础生成模拟数据率的计算
R语言
计算测试ROCR:pROCROC绘制单个ROC两个ROCLogistic回归的ROC曲线timeROCROC基础ROC曲线的横坐标是假阳性率,纵坐标是真阳性率,需要的结果是这个率表示疾病阳性的率
hx2024
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2023-11-29 03:32
学习
r语言
相关性作图_
R语言
做相关性分析
衡量随机变量相关性的方法主要有三种:pearson相关系数,spearman相关系数,kendall相关系数:1.pearson相关系数,亦即皮尔逊相关系数pearson相关系数用来衡量两个随机变量之间的相关性
R语言
中求两个随机变量
黑潮制作所
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2023-11-29 03:32
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_R绘图:相关性分析与作图
公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程:生物信息学教学相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并用不同的R包展示。load(file="mRNAdata.Rda")#加载数据library(tidyv
知乎剧综
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2023-11-29 03:32
r语言
相关性作图
走访慰问暖人心牢记嘱托向未来
为
深入学习
习近平总书记在庆祝中国共产主义青年团成立100周年大会上的重要讲话精神,根据共青团中央《关于开展2022年全国大中专学生志愿者暑期文化科技卫生“三下乡”社会实践活动的通知》的文件精神,江西财经大学现代经济管理学院开展
乡间萤火虫
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2023-11-29 01:12
R语言
rayrender包,microfacet微面材料
R语言
rayrender包,microfacet微面材料#TueJul1303:14:532021-#字符编码:UTF-8#R版本:R4.1x64forwindow11#cgh163email@163.
youmigo
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2023-11-28 23:58
新时代民航强国建设新征程
现阶段,我们作为一名民航工作人员,我们要
深入学习
贯彻习近平新时代中国特色社会主
清汉喜乐也
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2023-11-28 22:22
2022-10-18
在检查过程中,教育引导干部员工
深入学习
贯彻落实省、市分行下发的《深入贯彻落实中央八项规定精神的通知》,认真贯彻落实中央八项规定精神及其实施细则,严格遵守厉行节约、廉洁自律的有关规定,严明纪律,坚决杜绝“
辛勤金融人
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2023-11-28 19:00
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