Rcpp

MAC中Rcpp导致部分包安装不上问题及解决方法

报错信息ld:warning:directorynotfoundforoption'-L/usr/local/lib/gcc/x86_64-apple-darwin13.0.0/4.8.2'ld:librarynotfoundfor-lgfortranclang:error:linkercommandfailedwithexitcode1(use-vtoseeinvocation)make:***

PriscillaBai·2024-01-28 04:55

R包安装

ERROR:failedtocreatelockdirectory‘/home/me/src/Rlibs/00LOCK-Rcpp’Thebestwaytoavoidthisistousethe'--no-lock'argumentonthecommandline

WooWoods·2023-11-28 17:08

【R Error系列】r - fatal error : RcppEigen. h:没有这样的文件或目录

在头文件那要有//[[Rcpp::depends(RcppEigen)]]即：#include#includeusingnamespaceRcpp;usingnamespaceEigen;//[[Rcpp

饮食有度的元气少女·2023-11-13 13:19

在RStudio中检查编写的C++代码是否正确

第二步：可以直接在R中，写Rcpp代码，并且将其保存为一个字符串对象，然后利用sourceCpp()加载这个对象。

饮食有度的元气少女·2023-11-12 22:10

【R Cpp Error系列】 Rcpp::sugar::Vectorized＜exp, true, Rcpp::sugar::Times_Vector_Vector＜14, true, Rcpp::

目录一、代码遇到的错误编辑二、运行正确的类似代码三、对照修改自己的代码一、代码遇到的错误运行下面代码：sourceCpp(code='#includeusingnamespaceRcpp;//[[Rcpp

饮食有度的元气少女·2023-11-12 22:40

R语言有关模型方面的函数（model.）介绍-model.matrix

简单作用提取设计矩阵对有序因子与无序因子的处理（模型相关）手动编写contr.系列的函数写在最后引言最近闲暇时间大量阅读了一些机器学习方面的R包源码，在此对阅读过程中的一些实用但是不常见的函数进行了整理，不论以后大家是使用R建模，还是使用R或者Rcpp

嘛里嘛里哄·2023-10-19 11:17

安装R包Error failed to lock directory

报错命令行安装R包的时候出现了如下错误:install.packages("Rcpp")##报错信息的后面是这样的ERROR:failedtocreatelockdirectory'/home/luna

dulunar·2023-10-10 23:29

R中当并行运算遇到C++函数时，让foreach+Rcpp一起工作

目录方案一：C++函数在R包中方案二：C++函数在本地，通过Rcpp::sourceCpp("fun_name.cpp")使用方案三：将C++函数写在当前脚本中题外话：为什么要研究foreach+Rcpp

饮食有度的元气少女·2023-08-31 02:15

创建R包-2.2：在RStudio中使用Rcpp制作R-Package(更新于2023.8.23)

目录4-添加C++函数5-编辑元数据6-启用Roxygen，执行文档化。7-单元测试8-在自己的计算机上安装R包：9-程序发布参考：为什么要写这篇文章的更新日期？因为R语言发展很快，很多函数或者方式，现在可以使用，不代表之后的若干年之后，还可以用，可能那个时候有更方便且快捷的操作方式。4-添加C++函数有的时候，为了让R代码运行速度快一些，可能会借助一些编译语言，如C++。R是一门高级的、富有表现

饮食有度的元气少女·2023-08-24 14:00

创建R包-2.1：在RStudio中使用Rcpp制作R-Package(更新于2023.8.23)

通过R函数创建新包2.2在RStudio通过菜单来创建一个新包2.3关于R包创建的说明3-添加R自定义函数4-添加C++函数0-前言目标：在RStudio中创建一个R包，这个R包中包含C++函数，接口是Rcpp

饮食有度的元气少女·2023-08-24 07:00

Rcpp+R并行parallel

关键词：Rcpp,parallel,parLapply问题：将通过C++中的函数引用到R中，即将用C++编写的自定义函数直接通过Rcpp包，编程R中的自定义函数，这个过程不需要修改自定义函数名，直接在R

饮食有度的元气少女·2023-08-09 02:56

Rsutido使用功能包出现不存在叫“Rcpp”这个名字的程辑包或ERROR：compilation failed for package‘Rcpp’

install.packages("bibliometrix")准备运行，显示不存在叫“Rcpp”这个名字的程辑包。既然不存在，那我就下载这个包。

研究僧-彬彬·2023-07-17 10:21

linux中conda升级R到4.0？

但现在有好些R包必须要用更新到R4.0以上才能用了（主要是Rcpp版本太低），有的包本身升级时也要考虑不同版本的R，不更新一些函数功能用不了。今天又碰到了这个问题，看来是时候更新R了。

Seurat_·2023-06-09 13:41

address 0x20, cause 'memory not mapped'

运行R程序时候，遇到报错***caughtsegfault***address0x20,cause'memorynotmapped'可以通过重新安装Rcpp解决该问题install.packages('

安哥生个信·2023-04-21 08:50

Rcpp包运行C++代码

Rcpp包提供了R和C++之间的接口。

qq_27390023·2023-03-31 14:19

R语言which函数详解以及Rcpp改写

R语言which函数详解以及Rcpp的改写引言which函数的介绍which函数的一些小例子12which函数的改进以及时间对比引言首先来介绍一下R语言which函数的作用：which函数在向量、矩阵、

嘛里嘛里哄·2023-01-21 01:23

【ONE·R || R与C++交互使用简单介绍】

文章目录总言1、汇报目的２、RCPP2.1、简单介绍：2.2、简单使用演示：2.1.1、Rcpp包与RTools2.2.2、上手尝试1.0：一个helloworld小程序。

执鹤千山·2023-01-10 15:32

R语言神经网络模型通过学生成绩判别学生性别

R语言神经网络模型通过学生成绩判别学生性别install.packages("RSNNS")library(Rcpp)library(RSNNS)install.packages('xlsx')library

江姐vior·2022-12-14 17:03

Rcpp 与 bigmemory

学习连接：bigmemory第一个例子我们先放一个官网的例子：cpp#include//Thenextlineisallittakestofindthebigmemory//headers--thankstothemagicofRcppattributes,//andasbigmemorynowaccessesBoostheadersfromtheBHpackage,//weneedtomakes

小潤澤·2022-11-24 22:48

python vs C++ 谁更快

我的第一门语言就是R语言，然后在比较掌握R语言之后，又花了很长一段时间学习RCPP。我觉得不管是会R还是说会python，都应该会C\C++。C\C++运行效率太顶了。牛！

yuanzhoulvpi·2022-09-15 14:25

R语言which函数介绍及Rcpp改写详解

目录引言which函数的介绍which函数的一些小例子which函数的改进以及时间对比总结引言首先来介绍一下R语言which函数的作用：which函数在向量、矩阵、数据框，列表、因子这些数据结构中有这重要的作用，可以查找特定的元素返回其在数据中的索引，因此非常方便操作数据。which函数的介绍which函数中的参数：function(x,arr.ind=FALSE,useNames=TRUE)wh

·2022-07-12 13:02

R语言中使用RCPP并行计算指数加权波动率

原文链接：http://tecdat.cn/?p=17829原文出处：拓端数据部落公众号指数加权波动率是一种波动率的度量，它使最近的观察结果有更高权重。我们将使用以下公式计算指数加权波动率：S[t]^2=SUM（1-a）a^i（r[t-1-i]-rhat[t]）^2，i=0…inf其中rhat[t]是对应的指数加权平均值rhat[t]=SUM（1-a）a^ir[t-1-i]，i=0…inf上面的公

·2022-04-29 15:13

SAIGE用户手册笔记1

总览简介SAIGE是与Rcpp一起开发的R包，用于大规模数据集和生物库中的全基因组关联测试。方法基于广义混合模型的样本相关性允许使用全遗传关系矩阵或稀疏遗传关系矩阵（GRM）进行模型拟合适用于数量和

zd200572·2022-03-23 15:06

R/Finance 2018

2018年RFinace芝加哥的会议2018年6月1日星期五08:00至09:00可选的会前教程DirkEddelbuettel：Rcpp：从简单的例子到机器学习（pdf）R.DouglasMartin

Liam_ml·2022-02-17 09:02

R语言技巧Rcpp与Eigen库之间的相互转换

当我们在使用Rcpp时，进行矩阵运算最简单的是使用Eigen库进行相关操作，可以很轻松地讲R中向量化与矩阵化的思想应用到C++代码上，从而对代码进行加速。

·2021-11-08 18:27

R语言入门使用RStudio制作包含Rcpp代码的R包

目录1.创建项目2.修改一些文件3.打包4.使用Eigen或其它依赖库会出现的问题前面博客中有提及，当我们进行模拟想要再次进行提速时，通常都会使用Rcpp将我们的R代码改成C++代码。

·2021-11-08 12:31

R包制作后出现not available for错误问题解决解决

目录解决方法NAMESPACE文件最终形态有一段时间没有做过R包了今天在尝试制作R包时，制作、生成、载入都没有遇到问题，但在载入R包内用Rcpp写得函数时出现了如下问题（做的包名叫RI，调用的函数也是RI

·2021-11-08 12:20

Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

func.cpp头文件示例test_h.h2.创建R包步骤新建RPackageR包的文件结构修改DESCRIPTION文件3.C++11标准问题1.预先准备Windows下需要安装Rtools，R中装好Rcpp

·2021-11-06 16:51

R语言学习Rcpp基础知识全面整理

.成员函数6.语法糖6.1算术和逻辑运算符6.2.常用函数7.STL7.1.迭代器7.2.算法7.3.数据结构7.3.1.Vectors7.3.2.Sets7.3.3.Maps8.与R环境的互动9.用Rcpp

·2021-11-06 16:21

R语言学习RcppEigen进行矩阵运算

文件代码示例其他矩阵操作命名基础用法定义矩阵对矩阵的一些基础操作1基础操作2矩阵基础运算1矩阵基础运算2求最小最大值、迹等点乘等特征值与特征向量形式转换矩阵初始化0Map等操作求解Ax=b前面我们介绍了一些基本的Rcpp

·2021-11-06 16:19

Rcpp入门R代码提速方法过程

目录在RStudio中创建C++文件详细说明更多内容总结当我们使用R进行论文模拟时，通常会涉及到许多的循环。一般比较容易的提速方法是将我们的for循环改写为apply族的方法进行向量化运算，但这个方法速度提升的有限，在真实模拟时，如果要与其他算法进行速度的比较，除非自己的算法非常出色，否则还是很难与一些成熟包中的算法相庭抗礼。这时想要再次进行提速，有多种方法，常见的几种是将代码改写为Fortran

·2021-11-06 16:48

R语言学习初识Rcpp类型List

目录当我们想将Rcpp中的多种类型的对象通过一个return函数返回时，此时就需要将我们的所有对象整理成一个Rcpp::List型，然后再进行返回。

·2021-11-06 12:13

R语言RcppEigen计算点乘与矩阵乘法连乘算法错误解决

计算点乘与矩阵乘法连乘计算错误当我们想将R中的连乘（如下公式所示）修改成Rcpp代码时,t(X)^2%*%X理论上我们只用在.cpp代码中输入下述语句即可（默认使用了RcppEigen库）：X.adjoint

·2021-11-06 12:13

R语言用Rcpp加速Metropolis-Hastings抽样估计贝叶斯逻辑回归模型的参数

这篇文章就此问题进行了研究，以展示Rcpp如何帮助克服这一瓶颈。TLDR：只需用C++编写log-posterior而不是矢量化R函数，我们就可以大大减少运行时间。

·2021-08-11 18:24

《高效R语言编程》7--高效优化

需要用到的包：microbenchmark,ggplot2movies,profvis,Rcpp代码分析首先是确定哪个是瓶颈，Rprof()是可以分析的一个内置工具，但是这个结果不确定，取决于外部环境，

zd200572·2021-07-16 16:55

R调用C++函数

【1】在RStudio中新建c++file,添加代码如下：#includeusingnamespaceRcpp;#includeusingnamespacestd;//[[Rcpp::export]]voidhell

我没有那种天分·2020-09-16 06:21

R中prophet包说明文档（二）

平台：R（3.2.3以上版本），Rcpp（0.12.0以上版本）载入包：dplyr,extraDistr,ggpl

莉莉丫丫的海角·2020-09-12 10:54

R中prophet包说明文档（一）

平台：R（3.2.3以上版本），Rcpp（0.12.0以上版本）载入包：dplyr,extraDistr,ggplot2,g

莉莉丫丫的海角·2020-09-12 10:54

R语言里调用C++

使用Rcpp可以很方便地在.r脚本里调用C++函数。

sanqima·2020-09-10 17:10

RStudio制作包含Rcpp代码的R包

前面博客中有提及，当我们进行模拟想要再次进行提速时，通常都会使用Rcpp将我们的R代码改成C++代码。

Kanny广小隶·2020-08-25 17:15

如何使用Rstudio创建带c++程序的R语言包

鱼鱼峰峰·2020-08-25 16:56

让你的R代码更快——Rcpp入门

由于Rcpp包的

Kanny广小隶·2020-08-25 15:12

[R]Rstudio中建立包含Rcpp的R包

初步学习：Rstudio中建立包含Rcpp的R包。过程不顺利：花了2天时间解决问题，主要是此方面相对系统的资料很少。

Lucky和小白·2020-08-25 14:12

R语言对于Machine learning的代码以及研究

ROCR")install.packages("glmnet")install.packages("Metrics")install.packages("DMwR")install.packages("Rcpp

yumengzhang17·2020-07-15 11:30

在Ubuntu中安装R的几种方式总结

这里简单解释下bignmf包的用处，它是基于Rcpp和Rcp

G小调的Qing歌·2020-07-07 06:47

提升R代码运算效率的11中方法

本文将介绍几种适用于大数据领域的方法，包括简单的逻辑调整设计、并行处理和Rcpp的运用，利用这些方法你可以轻松地处理1亿行以上的数据集。

qq_16365849·2020-07-02 16:36

获取差异基因

bioconductor.org/biocLite.R")biocLite()getwd()setwd("D:/RWork/Rlearning")library(GEOquery)biocLite("Rcpp

Stone_Stan4d·2020-06-26 23:13

R语言进行词云分析

jiebaR是一款高效的R语言中文分词包，底层使用的是C++，通过Rcpp进行调用很高效。结巴分词基于MIT协议，就是免费和开源的，感谢国人作者的给力支持，让R的可以方便的处理中文文本。

iseeyounow2017·2020-06-23 18:07

R 及 R Studio 配置历史记录

zypperinosc，敲回车，显示如下：linux-j8ze:~#zypperinoscLoadingrepositorydata...Readinginstalleddependencies‘rlang’,‘Rcpp

mapleaf_soar·2020-03-29 19:23

R调用C++示例

sourceCpp{Rcpp}：SourceC++CodefromaFileorStringsourceCpp(file="",code=NULL,env=globalenv(),embeddedR=TRUE

叮叮当当sunny·2020-03-13 10:00

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