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Survival
coxphfit+matlab,计算Cox比例风险模型的coxph和cph函数有什么区别?
您可以通过查看help(package="rms")找到函数的帮助文件下面是源代码的摘录,所以你可以看到那里的cph函数调用coxph.fit功能(的coxph在
survival
包胆量)>cph[...
Mandy Liu
·
2025-01-28 05:25
coxphfit+matlab
如何快速绘制论文的表1(基本特征三线表)?tableone包你值得拥有
一.加载包library(tableone)二.加载并查看数据#该数据是梅奥诊所原发性胆汁性肝硬化的数据library(
survival
)data(pbc)#查看数据前6行head(pbc)先看一下不对数据进行任何处理做出来的表
R语言与SPSS学习笔记
·
2024-02-13 10:48
单因素Cox回归循环function
Uni_coxquantile(exprSet[gene,],0.5),'high','low')
survival
_datmedian(gene),'high','low')if(table(table
陈宇乔
·
2024-02-07 05:33
R语言提高效率的技巧方法(1)
1、批量导入包library(pacman)p_load("dplyr","
survival
")2、查看R包使用方法help(package="
survival
")3、查看R包内所有函数library(
weixin_49320263
·
2024-02-05 18:21
常用方法
r语言
开发语言
2万个基因的生存分析
一、生存分析R语言基础我们将使用两个R包:
survival
用于计算存活分析survminer用于总结和可视化生存分析结果library(
survival
)library(survminer)结果展示:fit2
芋圆学徒
·
2024-02-03 23:33
2022-04-10
install.packages(glmnet)install.packages(
survival
)install.packages(ISLR)install.packages(class)install.packages
TXJY
·
2024-01-24 16:26
重回正轨的练习日
Materials:TheresearcherssayanykindofCPRimprovedchancesofthepatients'
survival
.Buttheysaidthosepeopletreatedwithonlychestpressessufferedlessbraindamage.Facts
卸妆_65f4
·
2024-01-23 22:12
R 安装 devtools 报错信息
时可以不加入编译在安装R环境和一些依赖包时遇到一些问题Rscript-e"install.packages(c('knitr','rmarkdown','devtools','testthat','e1071','
survival
第一次看海
·
2024-01-17 15:00
r语言
java
开发语言
Survival
curve for TCGA
cgdsrlibrary(cgdsr)library(DT)mycgds=CGDS("http://www.cbioportal.org/")test(mycgds)###allcancerstudiesall_tcga_studies%droplevels()time_status$PERSON_NEOPLASM_CANCER_STATUS%droplevels()time_status$PER
osho_c837
·
2024-01-15 07:51
生存分析序章3——生存分析之Python篇:介绍生存分析和scikit-
survival
库
在Python生态系统中,有一个强大的工具——scikit-
survival
库,专门用于处理生存分析问题。
theskylife
·
2023-12-30 01:24
数据分析
数据挖掘
python
数据分析
数据挖掘
人工智能
机器学习
生存分析
survival
_analysis_COXmodel_python实现
什么是生存分析?生存分析(在工程中也称为可靠性分析)的目标是建立协变量与事件发生时间之间的联系。该算法起源于临床医学研究,往往主要目标是预测死亡时间,即生存。生存分析是一种回归问题(人们想要预测一个连续的值),它与传统回归的不同之处在于,部分训练数据只能被部分观察到(它们被删减了)。例如:考虑一项临床研究,该研究调查了冠心病,时间跨度为1年。如图所示。患者A在3个月后失去随访,无心血管事件记录,患
沉住气CD
·
2023-12-29 03:00
机器学习常用算法
python
算法
机器学习
人工智能
数据挖掘
奇奇怪怪的知识又增加了--R语言创建文章流程图
今天咱们使用R语言来制作流程图需要用到hgutils包,这是一个很有意思的R包,废话不多说,下面立即开始,先导入R包和数据,library(hgutils)library(ggplot2)dataset=
survival
天桥下的卖艺者
·
2023-12-25 05:22
R语言
r语言
流程图
开发语言
生存曲线绘制出现Error in data.frame(..., check.names = FALSE) : arguments imply differing number of r...
遇到的问题:生存分析进行过程中,一直发生报错,代码及错误如下:load("surv_data.Rdata")library(
survival
)library(survminer)fit<-survfit
芋圆学徒
·
2023-12-23 20:54
第二天多套GEO数据集联合分析流程
零编程基础分析GEO数据https://mp.weixin.qq.com/s/UYI61Rl0Jf5LPe3MxjXyAA(网速太渣明天继续o(╥﹏╥)o)install.packages(c("shiny","
survival
沙丘上的小fox
·
2023-11-26 16:45
R语言cox森林图绘制
杀杀cox森林图绘制cox的结果多为数据,绘制成表格较为不便,因此可以用森林图进行美化展示R语言中森林图的实现代码较为简单:library(forestplot)library(
survival
)library
不会生信哟
·
2023-11-21 13:16
JVM面试题(面试必备)
2.堆里面的分区:Eden,
survival
(from+to),老年代,各自的特点。3.GC的两种判定方法4.MinorGC与FullGC分别在什么时候发生?
识时务者-HJJ
·
2023-11-19 23:52
HandsomeForum
jvm
面试
java
学习
R神包export的使用
install.packages("export")library(export)作一个生存曲线图library("
survival
")library("survminer")data("lung")fit
鱼啸九天
·
2023-11-19 13:09
Java面试题(每天10题)-------连载(21)
三、内存模型以及分区,需要详细到每个区放什么四、堆里面的分区:Eden,
survival
(from+to),老年代,各自的特点。五、对象创建方法,对象的内存分配,对象的访问定位。
秃头的Tomcat
·
2023-11-17 09:36
java
开发语言
生存分析 R语言(六)—— Extended and Stratified Cox
library(
survival
)anderson=read.table(choose.files(),col.names=c('time','censor','sx',
cigarrrr
·
2023-11-15 01:33
生存分析R实现
r语言
R语言生存分析 Cox回归模型
survival
analysis
1.安装软件包并加载install.packages(c("
survival
","survminer"))library("
survival
")library("survminer")2.调用内置数据data
鱼啸九天
·
2023-10-31 16:25
[U3D Learning Note] Unity C#
Survival
Guide (1) -- Quick Tips and Assets
ChangeGameObjectPositionKEY:transform.positontransform.position=newVector3(1,2,3);//orpublicVector3newposi;transform.position=newposi;脚本已附加在某个GameObject上时transform.position就是该物体的坐标UserInput获取键盘的输入进行操作
无用理想家
·
2023-10-20 19:54
#
Unity
C#
Survival
Guide
Unity
3D
unity
unity3d
R语言实现计算预测模型的C指数(1)
#生成模拟数library(prodlim)set.seed(13)dat<-SimSurv(100)#3种Cox模型library(
survival
)cox12<-coxph(Surv(time,status
weixin_49320263
·
2023-10-10 13:54
模型评价
r语言
Survival
Shooter Tutorial 笔记
SurvivalShooterTutorial是Unity官方提供的一个3D生存类游戏的一个资源包,里面包含了做一个简单3D射击游戏的通常所需要使用到的功能代码以及资源,也可以了解到资源的一些调整和设置,总体来说是一个对于没有做过3D游戏的初学者来说是一个很不错的资源,并且代码注释也比较完整,理解难度也不高。适用Unity版本:4.7.1资源下载界面花了点时间看了下这个资源,理解起来并不难,也是刚
Kim_9527
·
2023-10-06 12:19
2020-07-05##生存曲线+置信区间+风险表
install.packages("survminer")library(survminer)library(
survival
)fit<-survfit(Surv(time,status)~sex,data
海阔天空周
·
2023-10-05 04:39
科学数据分析和图形绘制软件GraphPad Prism 9 mac中文版特点介绍
Prism9mac软件特点1.多种数据分析功能:Prism9提供了多种常见的数据分析工具,包括线性回归、ANOVA、t检验、非参数检验、
Survival
分析等,方便用户进行科学数据分析和建模。
mac116
·
2023-09-23 17:04
数据分析
苹果mac
GraphPad
Prism
windows
JVM面试题(一)
二、堆里面的分区:Eden,
survival
(from+to),老年代,各自的特点。三、对象创建方法,对象的内存分配,对象的访问定位。
程序打工仔
·
2023-09-19 01:01
面试
jvm
java
开发语言
day19 20190111
TheresercherssayanykindofCPRinprovedchancesofthepatients’
survival
.
火凤凰涅槃
·
2023-09-13 19:00
JVM系列 运行时数据区
系列文章目录第一章运行区实验文章目录系列文章目录前言一、堆(Heap)1.1、新生代/Young区1.1.1、Eden区1.1.2、
Survival
区1.2、年老代(old区)二、虚拟机栈(Stack)
青花锁
·
2023-09-12 07:12
面试
Java基础
JVM
jvm
运行时数据区
内存管理
2019-01-11
1.原材料引用(Materials)TheresearcherssayanykindofCPRimprovedchancesofthepatients'
survival
.
Cherish1990
·
2023-09-07 07:44
Mortality and
survival
in Game of Thrones: Who will live and who will die?
图片发自AppWithanewseasonaroundthecornerandwinterhavingfinallyarrived,researchersofanewstudypublishedinInjuryEpidemiologycasttheireyestothefantasyworldofWesteros,delvingintotheshow’sinfamouslyhighmortalit
文津阁
·
2023-09-06 11:57
【学习笔记】懂你英语 核心课 Level 6 Unit 1 Part 1(V)对话
Survival
in the Outback
【学习笔记】懂你英语核心课Level6Unit1Part1(V)对话SurvivalintheOutbackWhatwouldyoudoifyoueverfoundyourselflostinthewild?【跟读】Tofindout,youcanjoinaweekendsurvivalcourseinAustralia'sOutbackDesert.Thisvastareaisfamousfor
豚之大
·
2023-09-05 22:58
开源的本质动机是什么?
这些类型依次是“生存”(
survival
)、“社会生活”(sociallife
开源社
·
2023-09-04 17:52
2020-02-21 单因素/多因素分析-R语言
www.bioinfo-scrounger.com/archives/647/#注意该文章中,部分代码前面多了>符号https://www.jianshu.com/p/2da6645e0a86#两篇文章采取的函数略有不同library("
survival
清水煮竹笋
·
2023-09-01 05:40
TCGA生存分析
require(
survival
))install.packages("
survival
")if(!
数据控的迷妹
·
2023-08-26 16:53
基因表达矩阵和生存时间的合并
代码如下:#生存时间和基因表达矩阵的合并setwd("~/test_ty/
survival
/")#这里你设置你自己的文件路径就可以了options(stringsAsFactors=F)rm
米开朗巨魔
·
2023-08-23 23:32
从生存到生活 From
Survival
To Living
很多时候,我们会没有觉知地用小时候习得的方式来应对今天的生活。无论现在年龄几何,生活状况如何不同,我们的模式和思维却没有转变,对待世界的方式依然是小时候让我们得以生存下来的策略。比如我,童年比较苦逼,所以我的应对策略就是努力学习,让成绩和知识成为我的护身符和在这个世界的通行证。学习成为我生存的策略。高三一年每日熬夜拼搏,考上很好的大学,逆转人生这件事情似乎被编程入我的DNA系统,让我的身体习惯于在
光行者Stella
·
2023-08-23 17:29
R语言生存分析算法的简单组合
library(
survival
)library(randomForestSRC)#生成模拟数据set.seed(123)n<-200time<-rexp(n,rate=0.1)status<-rbinom
weixin_49320263
·
2023-08-15 08:15
机器学习
r语言
R语言实现随机生存森林(2)
library(
survival
)library(randomForestSRC)help(package="randomForestSRC")#构建普通的随机生存森林data(cancer,package
weixin_49320263
·
2023-08-15 08:45
机器学习
r语言
数据挖掘
R语言生存分析(机器学习)(1)——GBM(梯度提升机)
#1清空rm(list=ls())gc()#2导入包library("
survival
")library("gbm")help(pa
weixin_49320263
·
2023-08-15 08:40
机器学习
r语言
机器学习
单因素和多因素cox回归分析
我们用R的
survival
包自带的一套肺癌的数据来举例#安装下面两个R包install.packages(c("
survival
","survminer"))#加载这两个R包library("
survival
生信交流平台
·
2023-08-09 22:30
Stable Diffusion 硬核生存指南:WebUI 中的 VAE
苏洋创建时间:2023年07月30日统计字数:11485字阅读时间:23分钟阅读本文链接:https://soulteary.com/2023/07/30/stable-diffusion-hardcore-
survival
-guide-vae-in-webui
FMsunyh
·
2023-08-03 21:07
stable
diffusion
stable
diffusion
晨读第18天 day 1.11.2019
原材料引用(Materials):TheresearcherssayanykindofCPRimprovedchancesofthepatients’
survival
.Buttheysaidthosepeopletreatedwithonlychestpressessufferedlessbraindamage
酥酥叶
·
2023-07-29 15:46
R语言Nomo图制作---DynNom以及shinyPredict
二元logistic-Nomo-lrm#数据准备-data5#install.packages("rms")rm(list=ls())library(
survival
)library(rms)library
MRI_lab
·
2023-07-26 04:57
r语言
开发语言
R—生存分析—Kaplan-Meier + Log-rank test + Cox回归
参考教程:http://www.sthda.com/english/wiki/
survival
-analysis-basics假设有228个被诊断患有肺癌的病人开始长期的随访,如果病人死亡;则随访结束,
小贝学生信
·
2023-07-22 07:13
医学统计学 生存分析2020-04-03
丁香公开课学习笔记生存分析(
survival
)概念:将时间的结局和发生这个结局所经历的的时间因素综合起来分析的一种统计方法。它能处理截尾数据,并对整个生存过程进行分析或比较。
dongyuting
·
2023-07-17 22:50
Graphpad Prism7 绘制生存曲线
1、打开Prism→选择
survival
→选择想要的生存曲线图格式→点create2、录入生存数据,数据的排列格式如下:这里直接copy了上述参考资料里的图,主要是想说明,两组
滴滴_54f1
·
2023-07-17 07:56
R语言生存分析:Cox回归
Cox回归使用
survival
包中的lung数据集用于演示,这是一份关于肺癌患者的生存数据。time是生存时间,以天为单位,status是生存状态,1代表删失,2代表死亡。
医学和生信笔记
·
2023-06-21 19:42
医学统计学
r语言
回归
开发语言
【统计模型】生存分析——绘制生存曲线图
目录一、代码二、结果1.生存曲线2.分性别生存曲线3.检验结果一、代码#生存分析#绘制生存曲线#生存分析R包#install.packages("
survival
")library(
survival
)Lung
数据人的自我救赎
·
2023-06-19 04:00
统计模型
数学建模
再说提升模型:癌症治疗后的生存分析
我们将使用R中
survival
包中“B/C期结肠癌化疗”的数据。文件链接("https://stat.ethz.ch/R-manual/R-d
金朝老师
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2023-06-13 01:52
超详细ggforest绘制森林图(只需要方程,不用整理个格式哦)
二次整理”,有点浪费时间,前段时间学习surminer包的时候发现其中有个ggforest函数,可以直接应用数据集和构建的cox回归方程绘制森林图,非常方便以下为主要参数用法主要参数实战代码library(
survival
灵活胖子的进步之路
·
2023-06-10 14:07
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