【统计模型】生存分析——绘制生存曲线图

目录

一、代码

二、结果

1.生存曲线

2.分性别生存曲线 

3.检验结果

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一、代码

#生存分析
#绘制生存曲线
#生存分析R包
#install.packages("survival")
library(survival)
Lung<-lung
head(Lung)
??lung
View(Lung)

#把time和status转变为生存结构数据
Lusurv<-Surv(time=Lung$time,event=Lung$status)
summary(Lusurv)
Lusurv
help(lung)#status=1代表删失数据
#算不同时间点的S(t)
Lufit<-survfit(Lusurv~1)
Lufit#中位寿命median=310,一半的人活过310
par(mfrow=c(1,2))
plot(Lufit)#绘制生存曲线，阶梯状下降，虚线代表置信区间
plot(Lufit,conf.int="none")#不带置信区间，去掉虚线

Lufit1<-survfit(Lusurv~Lung$sex)#计算不同性别的S(t)
Lufit1
plot(Lufit1,conf.int="none")#不同性别的生存函数曲线
abline(h=0.5,survdiff(Lusurv~Lung$sex))#加横线
par(mfrow=c(1,1))
plot(Lufit1,conf.int="none",col=c("red","blue"),lwd=2)#加粗,红色男性，女性蓝色，颜色区分性别
legend("topright",c("女性","男性"),cex=1.5,fill=c("red","blue"))
abline(h=0.5,lty=2)#加水平线，中位寿命
abline(v=270,lty=2)#加竖线
abline(v=426,lty=4)#加竖线

time   
survdiff(Lusurv~Lung$sex)#做假设检验，看男女生存曲线是否有统计学差异性

二、结果

1.生存曲线

2.分性别生存曲线 

3.检验结果

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