ggplot 第14页

ggplot箱线图之如何添加最大值最小值线(whisker-ends)

ggplot作为R语言画图的瑞士军刀，相比于基础的R包，语法更加易于理解和掌握，不需要掌握很多的命令就能画出整洁美观的图表。

风过无归处·2023-04-10 17:33

ggplot2学习（四）

ggplot2基础（4）——主题ggplot2基础（1）ggplot2基础（2）——坐标轴ggplot2基础（3）——注释ggplot2基础（4）——主题ggplot2基础（5）——配色与图例在R自带的绘图中

韧心222·2023-04-10 14:10

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画世界地图的简单小例子

论文中写道画图是使用ggplot2，作图数据来自theNatu

小明的数据分析笔记本·2023-04-10 03:22

【R语言】--- ggplot2绘制折线图

本文介绍ggplot2包的geom_line()函数绘制折线图。绘制方法是首先调用ggplot()函数选定数据集，并在aes参数中指明横轴纵轴。

生态数据·2023-04-10 01:19

2021-03-13 # 终极练习题：优秀学员选拔行动

1.使用循环，对iris的1到4列分别画点图（plot）library(ggplot2)par(mfrow=c(2,2))#par(no.readonly=TRUE)irisiris[,1:4]for(

乔帮主_d2ac·2023-04-09 17:55

R语言之空间数据操作

栅格数据的四则运算2、栅格数据的均值、最值、求和计算3、栅格重分类矢量数据的读取5、栅格裁剪(Crop)6、栅格掩膜(Mask)裁剪与掩膜需要注意的地方关于数据投影信息的问题空间数据存储可视化制图(基于ggplot2

Giser@lin·2023-04-09 10:42

ggplot2绘制线图

www.cnblogs.com/ljhdo/线图中的常用参数：group：线的分组alpha：线的透明度color：线的颜色size：线的粗细linetype：线的类型，R中可用的类型如下图所示：一，绘制线图使用ggplot2

onlyme_862a·2023-04-09 01:05

收藏｜12个ggplot2拓展程序助你强化R可视化

本文将为大家简要介绍12个ggplot2拓展程序，包括它们让R可视化更强大的原因以及相应的具体示例。自2007年推出以来，ggplot2已经成为世界上下载最频繁、应用最广泛的R包之一。

weixin_43298663·2023-04-08 19:45

gggenes绘制多物种基因结构比较

https://wilkox.org/gggenes/gggenes是ggplot2的扩展包，用于绘制基因结构图、多物种基因比较图的很好玩的工具。

生信宝典·2023-04-08 19:06

R语言实践——ggplot2+ggrepel绘制散点+优化注释文本位置

简介书接adjustText实践——调整matplotlib散点图标签，避免重复上文中，matplotlib+adjustText对于我的实例来说并没有起到很好的效果。所以，博主决定在R中利用gglot2+ggrepel绘制，期待效果。操作过程博主不常使用R，在此过程中详细记录每一步骤，以作备忘。1.R读取数据（openxlsx）library(openxlsx)fossils=read.xlsx

ALittleHigh·2023-04-08 18:28

5-数据基本统计及ggplot2画图全过程

表示按行统计，prop.col表示按列统计，prop.t表示按整个表格统计，所以“申报渠道”的综合信息应该在tb表的prop.t列下面，查看一下：tb$prop.tprop.t#加载dplyr包（数据整理）和ggplot2

wonphen·2023-04-08 17:04

【R】画图实践

32.pheatmap修改颜色bar王鹏提供代码library(pheatmap)GO_dat%mutate(total=up+down)dat2###Step1：显示加和结果ggplot(data=data.frame

caokai001·2023-04-08 12:29

跟着Nature学作图：R语言ggplot2分组折线图添加误差线

论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的

小明的数据分析笔记本·2023-04-08 02:56

ZT:改动ggplot2中的某些标签

originaladdress:https://www.datanovia.com/en/blog/how-to-change-ggplot-labels/library(ggplot2)theme_set

felixhell·2023-04-07 11:27

R语言ggplot2：第四章用图层构建对象

第4章用图层构建对象目录4.1ggplot2简介4.2创建绘图对象4.3图层添加4.4数据4.5图形属性映射4.6几何对象4.7统计变换4.8位置调整4.9整合4.1简介一个图层由5部分组成：数据，必须是一个数据框

王叽叽的小心情·2023-04-07 10:02

一起学画图：气泡图—常用于富集分析

本期使用R包gapminder中现有数据集，基于ggplot2制作气泡图Part2：图像与代码在加载数据并对

生信小书生·2023-04-07 09:49

R绘图_ggsignif添加显著性标识

R绘图做生物学显著性统计，然后添加显著性标记，但是都是手动，比较繁琐，好在ggplot2有个扩展包ggsignif，提供更加人性化的方法。

谢俊飞·2023-04-07 03:46

2021-03-02

用户消费行为分析importnumpyasnpimportpandasaspdimportmatplotlib.pyplotasplt%matplotlibinlineplt.style.use('ggplot

愿向阳_c100·2023-04-06 23:26

[R语言可视化-精美图形绘制系列]--散点图+箱线图组合图

本期内容为[R语言可视化-精美图形绘制系列]--散点图+箱线图组合代码部分：导入相关包和数据library(ggExtra)library(ggplot2)####导入数据cdatacdata[1:5,1

小杜的生信筆記·2023-04-06 17:32

ggplot2||分面图facet_grid()/facet_wrap()自定义标签顺序

A11,...但是出来的效果却是A1,A11,...,A2,A21,...,A3,...因此：起因数据来源作图rm(list=ls(all=TRUE))library(reshape2)library(ggplot2

CopLee·2023-04-06 15:35

用R画韦恩图，柱状图，饼图，barplot和violin

4.hist首先加载R包ggplot2和reshapelibrary(ggplot2)library(reshape)若没有这两个包，则用下面的方法安装source("http://bioconductor.org

gtt儿_生物信息学习·2023-04-06 10:41

如何在散点图里添加特定标签

有的时候我们用ggplot2画了图，比如说散点图，那么如何在一堆点里标出我们关注的点呢？

生信start_site·2023-04-06 08:48

ggplot2绘图

在geom设置和scale设置之后，要想把图画的漂亮，theme设置是比不可少的在theme设置中element_text()是一项很重要的内容element_text(family=NULL,face=NULL,colour=NULL,size=NULL,hjust=NULL,vjust=NULL,angle=NULL,lineheight=NULL)参数family表示字体样式参数face表示

大道无形x我有型·2023-04-06 07:40

ggplot2绘制带误差线的折线图(经典版)

本节来介绍如何通过ggplot2绘制带误差线的折线图，介绍2种方法一种传统方法&经典方法加载R包library(tidyverse)library(ggsci)library(patchwork)传统方法传统方法依然是先整理数据

R语言数据分析指南·2023-04-05 20:48

R学习笔记(13)：使用ggplot2进行图形化沟通（上）

《R数据科学》的第21章主要是讲解如何用ggplot2绘制“良好图形”，这篇笔记包括“标签”和“注释”两部分。

TOP生物信息·2023-04-05 07:20

【无标题】PCA分析基于文献

#来自小明的数据分析笔记source("D:/R/work/pca_and_ggplot2.R")getwd()library(ggplot2)library(ggpubr)library(cowplot

植保小萌新·2023-04-05 04:16

压砂地年终重新作图(涉及方差分析、图片合并、标准差与标准误的转化)

#宁夏中卫压砂地蝗虫对不同景观格局的响应.libPaths()rm(list=ls())install.packages(agricolae)library(agricolae)library(ggplot2

植保小萌新·2023-04-05 04:45

R · R 包开发 | 保姆级教程

比如说，安装ggplot2包提供了可视化数据的方法。R中很多强大的功能都来自开发者贡献的包。什么是包技术上，包只不过是一套函数、文档和数据的合集，以一种标准的格式保存。

一只小蛮要·2023-04-05 01:56

ggplot2---Guide:axes and legends---Legend guide

Legendguide图例说明Legendtypeguideshowskey(i.e.,geoms)mappedontovalues.Legendguidesforvariousscalesareintegratedifpossible.图例上显示关键字(即:(geoms)映射到值上。如果可能的话，图例可以整合到各种各样的标尺上。guide_legend(title=waiver(),title.

汪汪2017·2023-04-04 14:16

R语言学堂推文索引 - 2023年3月

数据处理通识专辑1.1base-R1.2dplyr和tidyr工具包1.3文本/日期/分类数据处理1.4向量化运算1.5文档沟通1.6面向对象的编程1.7数据获取方法2制表与可视化专辑2.1基础绘图系统2.2ggplot2

R语言学堂·2023-04-04 10:22

跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并在坐标轴添加分组标记

论文EvolutionaryoriginsoftheSARS-CoV-2sarbecoviruslineageresponsiblefortheCOVID-19pandemicimage.png本地文件s41564-020-0771-4.pdf代码和数据下载链接https://github.com/plemey/SARSCoV2origins今天的推文我们来重复一下论文中的Figure2中的簇状柱

小明的数据分析笔记本·2023-04-03 23:10

万能转换，R图和统计表转成发表级的Word，PPT，Excel，HTML，LaTeX，矢量图等

你和PPT高手之间，就只差一个I幻灯片式Excel改变了你的基因名，30％相关自然文章受影响，NCBI也受波及特点可以用命令将交互式R图或ggplot2，Lattice或baseR保存到MicrosoftWord

生信宝典·2023-04-03 18:40

ggpur-ggplot2还是太难

如果觉得ggplot2对你来说还是太难，可以尝试用ggpur...ggplot2,byHadleyWickham,isanexcellentandflexiblepackageforelegantdatavisualizationinR.Howeverthedefaultgeneratedplotsrequiressomeformattingbeforewecansendthemforpublic

xmu_zhang_lab·2023-04-03 17:14

跟着Nature Communication学作图：R语言ggplot2画世界地图展示采样地点

论文StructureandfunctionofthesoilmicrobiomeunderlyingN2Oemissionsfromglobalwetlandshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29161-3#Sec21没有找到论文的代码，但是论文的数据是公开的，可以用论文中的数据复现一下论文中的结果，今天的推文试着复现一下论文中的figure

小明的数据分析笔记本·2023-04-03 16:07

infercnv运行测试10--1300细胞2h

1300细胞运行2h>rm(list=ls())>options(stringsAsFactors=F)>library(Seurat)>library(ggplot2)>library(infercnv

Seurat_Satija·2023-04-03 00:33

R语言ggplot2：第六章标度、坐标轴和图例

第6章标度、坐标轴和图例目录6.1简介6.2标度的工作原理6.3用法6.4标度详解6.5图例和坐标轴6.1简介标度（scale）控制着数据到图形属性（位置、颜色、形状、大小和线条类型）的映射。执行标度的过程分为三步：变换、训练和映射。标度的另外一个重要角色，是生成一个允许读者从图形属性到数据空间进行反向映射的引导元素（guide）6.2标度的工作原理标度的定义域：数据空间；标度的值域：图形属性空间

王叽叽的小心情·2023-04-02 14:38

R语言学习.4-R包

例如：作图包ggplot2，差异分析包limma等等。2.R包来源(1)CRAN网站http://cran.r-p

Seurat_·2023-04-01 23:28

ggplot2主题

本文有两个部分：ggplot2自带主题主题包ggthemesggthemrggplot2自带主题theme_gray()#默认theme_bw()theme_linedraw()theme_light(

Liam_ml·2023-04-01 20:50

《R数据科学》学习笔记|Note8:使用dplyr处理关系数据

使用dplyr处理关系数据往期文章《R数据科学》学习笔记|Note1:绪论《R数据科学》学习笔记|Note2:使用ggplot2进行数据可视化(上）《R数据科学》学习笔记|Note3:使用ggplot2

木舟笔记·2023-04-01 20:17

跟着Nature学作图：R语言ggplot2箱线图和堆积柱形图完整示例

论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8s41586-022-04808-9.pdf没有找到论文里的作图的代码，但是找到了部分做图数据，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推

小明的数据分析笔记本·2023-04-01 18:38

7000字长文，R 中的10 个错误以及如何修复它们（建议收藏）

.不匹配的括号、大括号、方括号或引号2.使用未安装或加载的功能3.函数、变量、数据集、对象或包名称中的拼写错误4.函数中缺少、不正确或拼写错误的参数5.错误、不合适或不一致的数据类型6.忘记ggplot2

天桥下的卖艺者·2023-04-01 17:19

R语言使用glmnet包的glmnet函数拟合lasso回归模型：使用predict函数和训练好的模型进行预测推理、使用ggplot2可视化预测值和实际值的曲线进行对比分析

R语言使用glmnet包的glmnet函数拟合lasso回归模型：使用predict函数和训练好的模型进行预测推理、使用ggplot2可视化预测值和实际值的曲线进行对比分析目录

statistics.insight·2023-04-01 16:21

跟着Environmental Research学作图：R语言ggplot2堆积柱形图叠加折线图（2）

论文是Globalburdenoflungcancerattributabletoambientfineparticulatematterpollutionin204countriesandterritories,1990–2019image.png一位公众号读者留言问到下图的实现方法image.png这个图涉及到3个知识点一个是堆积柱形图一个是两条折线图之间填充颜色还有一个是双坐标轴的实现办法这

小明的数据分析笔记本·2023-04-01 15:27

R语言ggplot2画点和连线展示Mantel检验的结果~示例数据和代码可以获取

image.png最近看到好几个群里都在讨论这个图，今天的推文就来介绍一下这个图左下角基于散点和带弧度的线段实现办法，右上角关于方块热图之前介绍过代码，大家感兴趣的可以翻翻之前的推文第一步是准备数据首先是黑色点的坐标位置，这个是取决于右上角热图的数据多少，比如开头的图热图展示的是13个变量，那对角线那一列黑色的点的位置坐标x是1-14，y也是1-14数据格式如下image.png读取数据然后作图l

小明的数据分析笔记本·2023-04-01 13:00

跟着Plos Biology学作图：R语言ggplot2散点图和误差线

论文Largevariationintheassociationbetweenseasonalantibioticuseandresistanceacrossmultiplebacterialspeciesandantibioticclasses数据代码链接https://github.com/orgs/gradlab/repositories今天的推文重复一下论文中的Figure3Aimage.

小明的数据分析笔记本·2023-04-01 02:47

【R语言】--- 散点图

散点图可以用R自带的plot()函数绘制，也可以用ggplot2包的geom_point()和geom_dotplot()函数来绘制，当使用geom_dotplot()绘图时，point的形状是dot，

生态数据·2023-04-01 00:00

R语言与医学统计图形-【28】ggplot2扩展包ggrepel、ggsci、gganimate、ggpubr

ggplot2绘图系统——扩展包ggrepel、ggsci、gganimate、ggpubr等部分扩展包可在CRAN直接下载，有些需借助devtools包从Github下载。

Bioinfarmer·2023-03-31 22:11

我用R的ggplot2实现可视化，对数据为所欲为

作者丨阿左来源丨医数思维云课堂（ID:Datamedi）上次小编带大家学习了ggplot2的相关内容，今天我们继续深入学习一下，跟进我的步伐，不要掉队哟！

医数思维云课堂·2023-03-31 22:55

R 数据可视化 —— ggplot 标度（一）

前言标度（scale）控制着数据映射到图形属性的具体细节，用于将数据转化为我们在视觉上能够感知的东西。如颜色、大小、位置、形状和透明度等。每个标度都有一个对应的函数，用于将数据空间的值（即函数的定义域）映射到图形属性空间（即函数的值域）。通过使用这些函数，就能够将我们的数据与图形属性连接起来。图形中的每种属性都有一个默认的标度函数。在前一节的例子中，我们并没有显示使用这些标度函数，因为在默认情况下

名本无名·2023-03-31 17:17

R语言常用数据集 | msleep：哺乳动物的睡眠时间

msleep数据集属于ggplot2包，包含了83种不同哺乳动物的睡眠和体重等数据。

简佐义的博客·2023-03-31 16:43

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