ggplot 第16页

24-使用ggplot2进行数据可视化

参考资料：根据《R数据科学(中文完整版）》第一章内容总结。1、散点图library(pacman)p_load(tidyverse)df%tbl_df();str(df)##Classes'tbl_df','tbl'and'data.frame':19obs.of5variables:##$name:Factorw/19levels"Alfred","Alice",..:2351011121516

wonphen·2023-03-15 19:01

Coding and Paper Letter（七十五）

geospatial3.ggplot2的相关资源整理。awesomeggplot24.Earthaxiv的一篇论文相关代码。

G小调的Qing歌·2023-03-15 14:21

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画热图展示基因表达量

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一

小明的数据分析笔记本·2023-03-15 02:04

热图7：ggplot2/ComplexHeatmap做离散型热图

此外，这篇文章的内容是补充之前的不足，因为没有涉及到离散型热图的做法，这里我们以一篇Cell文章为引子，展示下ggplot2/ComplexHeatmap做离散型热图，这样热图系列就完善了。

KS科研分享与服务·2023-03-14 22:17

R语言ggplot2画个月饼送给你，祝你中秋节快乐！

今天的推文就简单画一个月饼吧，没有想到太好的办法，基本的逻辑就是用ggplot2添加已经做好的图片实现代码library(ggimage)library(ggplot2)library(patchwork

小明的数据分析笔记本·2023-03-14 04:55

R 数据可视化 —— ggplot 主题

ggplot2采用数据与非数据分离的方式，在绘图时，首先确定数据的展示，然后在通过主题系统对细节进行调整。

名本无名·2023-03-13 23:20

[跟着NC学作图]-绘制频率分布图（图中图）

一、数据输入options(stringsAsFactors=FALSE)library(ggplot2)library(plyr)library(dplyr)library(cowplot)##导入数据

小杜的生信筆記·2023-03-13 07:17

通用色彩设计 Color Universal Design (CUD)

http://jfly.iam.u-tokyo.ac.jp/color/#pdfhttp://www.cookbook-r.com/Graphs/Colors_(ggplot2)/#a-colorblind-friendly-palette

farland·2023-03-13 04:10

版本报错 | Updating ggplot2 code for new version

Ref|Updatingggplot2codefornewversionSinceinstallingthelatestversionofggplot2(0.9.1),Ihavebeengettingmessagesfrommyoldcodeincluding:>warnings()Warningmessages:1:'opts'isdeprecated.Use'theme'instead.See

biogeeker·2023-03-12 17:08

R语言主成分分析（PCA）加置信椭圆

使用R语言为PCA散点图添加置信区间，可以使用ggplot2，ggord去绘制。使用R自带数据集iris的前4列进行主成分分析，主要使用R的prcomp()基础函数。

灰常不错·2023-03-12 16:09

画图笔记：ggplot2优化柱形图（添加误差线、差异比较分析）

图片要优雅的输出结果图片「ggplot2中柱状图基本绘制函数常用geom_bar()」参数介绍：「data和mapping是ggplot的基本参数，数据和映射。」

Evil_Genius·2023-03-12 14:08

「r<-包」使用 ezcox 进行批量 Cox 模型处理

参考：「r载入需要的程辑包：ggplot2forest_model(res$models$model[[1]])forest_model(res$models$model[[2]])knitr::kable

数据控的迷妹·2023-03-12 08:08

2021-02-18用ggprism包标注P值

ggplot2标注P值的方法有很多种，大多比较繁琐，今天发现一种简便的！！！

iColors·2023-03-12 06:19

更改ggplot2绘图参数的简便方法

更好的阅读体验>>本文将介绍如何使用ggpubr包中的ggpar()函数简单轻松地更改ggplot2绘图参数。

Boer223·2023-03-12 01:56

【R语言】给富集分析的气泡图加个好看的配色

写在前面ggplot2是一款风靡全球的绘图R包，可惜的是，我对它的理解只能到入门的水平，本着在实战中学习的理念，我就搜索一下往后可能用得到的图，进行揣摩和优化，然后我发现了一个师兄的公众号，遂跟着这个师兄学习

巩翔宇Ibrahimovic·2023-03-11 20:21

R 数据可视化 —— 相关系数图

名本无名·2023-03-11 16:42

Seurat中默认颜色配方提取

开心参考的文章是如何从已知的ggplot对象中提取颜色等信息1.Di

Aji·2023-03-11 07:41

绘图

分享一些绘图散点图最常见的图可能就是散点图了：options(scipen=999)#turn-offscientificnotationlike1e+48library(ggplot2)theme_set

Liam_ml·2023-03-10 04:13

ggplot2图例调成一列，终于找到了解决办法

有时图例较多，用ggplot2画图时候会出现图例占据图的半壁江山，想让图例排成一列，解决方法如下：guides(fill=guide_legend(ncol=1,byrow=TRUE))

生信汪·2023-03-09 18:38

解决ggplot2无法显示文本信息的问题

这个问题很小，但是问题答案不容易找到，不管是在中文网站还是英文网站，所以记录一下，能帮助到遇到同样问题的朋友。解决方案就是下载showtext包，library(showtext)DimPlot(...)+showtext_auto()

小孟在充电·2023-03-09 12:47

R语言ggplot2做柱形图添加误差线并且自动添加显著性星号

,header=T)dferrorbar_up<-function(x){mean(x)+sd(x)}errorbar_down<-function(x){mean(x)-sd(x)}library(ggplot2

小明的数据分析笔记本·2023-03-09 02:36

ggplot2之颜色设置

eg：红色外框的条形图>ggplot(df,aes(x=type,y=number))+geom

礼元_·2023-03-03 21:09

使用 ggplot2 画一个饼图【R语言】

前言最近，可能会需要饼图，所以提前整理一下，用的时候直接翻出来，思路很简单，就是把柱状图换成极坐标的需要什么在R语言中，使用ggplot2做可视化，dplyr做数据整理：library("ggplot2

万木春❀·2023-02-28 06:42

统计建模-数据可视化

Seaborn对Matplotlib进一步封装，减少了一些参数设置，更加易用Plotnine类似于R语言中的ggplot2，通过添加图层更简便地绘制数据可视化

noTe····2023-02-26 07:16

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画变种火山图

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一

小明的数据分析笔记本·2023-02-18 05:43

ggplot2绘制堆积柱状图

R语言用ggplot2绘制堆积柱状图遇到的问题（y轴顺序、facet_wrap分面顺序）-需要将名称因子化1、用ggplot2绘制菌的堆积柱状图时，y轴的顺序是按照菌属的首字母排序的，而不是按照我表格中顺序

小龙虾笨死·2023-02-17 22:22

passing parameters to ggplot

wouldliketocreateafunctionthatgeneratesgraphsusingggplot.Forthesakeofsimplicity,thetypicalgraphmaybeggplot(car,aes(x=speed,y=dist))+geom_point()ThefunctionIwouldliketocreateisofthetypef<-function(DS,x

Liam_ml·2023-02-17 21:01

关于双分组（每组组分均大于3）柱状图的绘制（带散点，带mean+sd，带显著性）

ggplot2版本library(ggpubr)library(scales)library(Rmisc)library(readxl)library(RColorBrewer)library(tidyverse

leoxiaobei·2023-02-17 18:13

使用R语言（ggplot2）绘制分组条形图，并添加误差线和显著性说明

最近要处理实验数据，觉得Excel画的图打印出来太不清晰了，所以试了一下R语言的ggplot2。最后画出的图可以导出eps格式，再用adobeillustrator进一步修改。

Seurat_Satija·2023-02-17 12:54

ggplot2图例位置legend.position调整

时间：2020.10.15ggplot2画图时进行图例位置的调整。

小杜的生信筆記·2023-02-17 08:15

ChIP-seq 分析：Mapped 数据可视化（4）

mappedReads<-idxstatsBam("SR_Myc_Mel_rep1.bam")TotalMapped<-sum(mappedReads[,"mapped"])ggplot(mappedReads

·2023-02-16 22:03

转录组不求人系列(十三): GO、KEGG富集个性化作图

一、常规柱状图（ggplot2）横轴为genecounts，或者用-logP也行，填充相应的用P值或者genecounts。ggplot画图的好处就是可以进行很多调整。

KS科研分享与服务·2023-02-16 22:48

R语言ggplot2 title设置教程(main,axis和legend titles)

目录1.ggplot2中添加title函数2.实际应用（1）添加title、xlab和ylab（2）修改legend名字（3）修改title的字体，位置，颜色等（4）删除xlab和ylab总结1.ggplot2

·2023-02-16 21:41

ggplot画 ump 和tsne 从seurat中使用addmodule得到的umap 使用ggplot画图

ggplot画ump和tsne从seurat中使用addmodule得到的umap使用ggplot画图输入炎性基因#对给定的基因集合进行打分All.merge=AddModuleScore(All.merge

YoungLeelight·2023-02-07 13:06

单细胞UMAP降维图的修饰（一些偏僻问题）

每个点都是有边框的，这不就是ggplot中选择shape=21的形状吗？很显然，Dimplot是实现不了的。UMAP降维图本质也是散点图，只需要将作图数据导出，ggplot2就可以实现

TS的美梦·2023-02-07 13:35

利用ggplot2绘制折线图（均值+误差棒）

成品图如下image.png直接上代码1.读入数据library(ggplot2)library(Rmisc)library(cowplot)#读入数据W1head(W1)#SubjectValueTime

shenghuanjing·2023-02-07 02:47

每天码zi挑战之--ggplot2

qplot(carat,price,data=diamonds)qplot(carat,price,data=diamonds,alpha=I(1/10),colour=I("red"),geom=c("point","smooth"),size=I(2))qplot(carat,data=diamonds,colour=I("blue"),geom=c("histogram"))qplot(ca

smyang2018·2023-02-06 20:42

ggplot2作图之PCA图

library(tidyverse)theme_set(theme_test())library(vegan)pca.data%mutate(Sepal.Length=scale(Sepal.Length),Sepal.Width=scale(Sepal.Width),

编码农夫·2023-02-06 07:22

ggplot2 多个柱状图比较_2. 主成分分析（PCA）与ggplot2绘图

现在陆续附上个人总结的PCA、NMDS、CCA和RDA分析与ggplot2表达的部分代码。当然在使用时还需要对ggplot2表达进行优化。

weixin_39688035·2023-02-06 07:51

matlab话pca的双标图biplot,r – 用ggplot2绘制pca biplot

也许这将有所帮助–它是从我写的一段时间后的代码改编而成。它现在也绘制箭头。PCbiplot#PCbeingaprcompobjectdataplotplotdatapcmult(max(data[,y])-min(data[,y])/(max(datapc[,y])-min(datapc[,y]))),(max(data[,x])-min(data[,x])/(max(datapc[,x])-mi

weixin_39726044·2023-02-06 07:51

R、主成分分析（PCA）、ggplot2

R、主成分分析（PCA）、ggplot2 在生态环境领域中，作为非约束排序的方法之一，主成分分析（PCA）是我们常用的分析方法。

吴苏·2023-02-06 07:50

利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图

学习笔记的主要内容是在R语言中利用ggplot2进行PCA分析和绘图，包括简单分析与操作流程，对比不同方式得到的结果差异，提供脚本代码供练习.PCA分析的原理在处理基因差异表达数据时，有时候需要分析其中因素的影响最大

生信分析笔记·2023-02-06 07:49

R语言PCA主成分分析可视化3D版

R语言主成分分析R语言主成分分析可视化(颜值高，很详细)今天说一下如何提取数据用ggplot2画PCA图，以及三维PCA图。提取数据还是使用鸢尾花数据集。

医学和生信笔记·2023-02-06 07:19

R语言ggplot2 | PCA分析及其可视化

主成分分析主成分分析(PCA)的基本介绍PCA常用的参数标准化特征值和特征向量载荷得分R语言实现PCA分析逐步计算PCA分析中的参数prcomp函数princomp函数自定义函数实现PCA分析及其可视化咱们常提到的PCA分析全称是PrincipalComponentsAnalysis，即主成分分析，这是降维中最常见的一种方法。我相信，数据维度大家应该都比较清楚，这里就不再一一赘述。因此，与大家

酷二的R语言记录册·2023-02-06 07:49

R tidyverse 学习

Tidyverse是一系列优秀R包的合集，其中最常用的7个package包括ggplot2/tibble/tidyr/readr/purrr/dplyr/stringr/forcat。

生信小白2018·2023-02-05 20:53

ggcorrplot相关系数可视化-R语言

ggcorrplot包可以使用ggplot2轻松可视化相关系数矩阵。一个矩阵的两列之间，可以算出相关系数。还可以同时计算出相关系数和p值。

M78_a·2023-02-05 20:08

R-plotly|交互式甘特图（Gantt chart）-项目管理/学习计划

本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/CGz51qOjFSJ4Wx_qOMzjiw更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号。

生信补给站·2023-02-05 14:57

R语言常用画图函数小结

ggplot2geom_point,scale_size,调整点labs,xlim,theme,ggtitle,subtitle,调整画布scale_colour_gradientn,scale_color_manual

Steven潘·2023-02-05 12:29

重复单细胞it-ChIP文章小图

Tips:最近看单细胞ChIP-seq文章一个图，本来作者用baseplot画的，因此尝试用ggplot2画出baseplot风格。

caokai001·2023-02-05 00:00

2020-09-02-R语言绘制PCA图

CSV文件，header=TRUE保证表头不被当成表格数据，sep=","用逗号把数据分开mydata<-read.table("abc.csv",header=TRUE,sep=",")library(ggplot2

麦冬花儿·2023-02-04 23:12

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