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ggplot
2021-05-04
ggplot
2绘制雷达图
devtools::install_github("JaseZiv/worldfootballR")#安装包library(worldfootballR)#用于网页信息爬取library(tidyverse)#
ggplot
iColors
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2023-04-21 17:08
DAY4 竟然还在学
ggplot
统计变换根据现有的数据,从新的角度进行统计得出新的数据的算法叫做统计变换(stat)(例子:比如现有数据知道小朋友A吃了某种糖果多少个,小朋友B吃了某种糖果多少个,小朋友C。。。直到最后一个小朋友。。。最后统计每种糖果各被吃了多少个就叫做统计变换)每种几何对象函数(就是geom_bar,geom_boxplot等等)与每种统计变换函数一一映射,可以通过?[所想查看的几何对象](如?[geom_ba
粥酱_ZZ
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2023-04-21 15:12
ggExtra
ggplot
2边缘加上更多元素
简介ggExtra的核心函数是ggMarginal,主要目标是在
ggplot
2的散点图边缘加上直方图/密度图/箱型图。
吴十三和小可爱的札记
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2023-04-21 11:42
ggpubr 包是基于
ggplot
2包,非R数据专业人员可用ggpubr包绘制图表
ggpubr/index.html及http://www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/ggpubr包是基于
ggplot
2
Seurat_
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2023-04-21 08:18
infercnv运行测试2---这个只有15步就完成了
1.代码>rm(list=ls())>options(stringsAsFactors=F)>library(Seurat)>library(
ggplot
2)>library(infercnv)>expFile
Seurat_Satija
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2023-04-20 12:17
跟着Plos Biology学作图:R语言
ggplot
2分组拟合曲线和95%置信区间
论文image.png今天的推文我们重复一下论文中的Figure1Aimage.png首先是读取数据library(readr)data.use%mutate(year_month=paste(as.character(year),as.character(str_pad(month,2,pad="0")),sep="-"))%>%mutate(x=dense_rank(year_month))-
小明的数据分析笔记本
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2023-04-19 09:00
Fig2-c 纵轴log化的带标签散点图Scatter Plot的绘制 2020-12-14
image.png重点:1)散点图上带标签2)纵轴log化(即:
ggplot
2::scale_y_log10()的应用)具体实现如下:3.7.1数据格式image.png读取数据:l1<-read.csv
RashidinAbdu
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2023-04-18 16:00
ggplot
2:在一幅图中插入另外一幅图
需求我用
ggplot
2做了两幅图:柱形图library(
ggplot
2)df<-data.frame(x=LETTERS[1:10],y=10:1)dfggplot()+geom_bar(data=df
小明的数据分析笔记本
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2023-04-18 06:23
R package:
ggplot
2画中国地图
1.安装包install.packages("rgdal")install.packages("
ggplot
2")2.读取地图2.1读取省界地图m1<-rgdal::readOGR("..
佳名
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2023-04-18 04:11
R语言可视化之
ggplot
2——KEGG通路富集分析
之前分享了如何用
ggplot
2可视化GO分析的结果。既然做了GO,当然少不了KEGG了。1.数据准备同样的,我们从DAVID获取KEGGpathway的结果。
zrh_h
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2023-04-18 03:06
anaconda安装matplotlib_matplotlib可视化-1、什么是matplotlib?
很多其它的python绘图库是基于matplotlib开发的,比如seaborn、
ggplot
、plotnine、holoviews、b
weixin_39929465
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2023-04-17 21:43
matplotlib
标签
python
matplotlib
地图
『R画图脚本进阶』单个基因结构绘制
就用
ggplot
2撸出来了。国际惯例,上图Gh_A08G039000.jpg方法和原理其实就是把gff文件可视化一下,看GFF文件的介绍:陈连福大佬的博客-GFF3格式介
ShawnMagic
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2023-04-17 12:31
矩阵转为
ggplot
2画图的数据格式
作者:ahworld链接:转换矩阵为
ggplot
2的输入格式来源:微信公众号-seqyuan著作权归作者所有,任何形式的转载都请联系作者。
seqyuan
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2023-04-17 11:23
PCA原理解读和绘制方法
⚠️该教程的PCA绘图基于
ggplot
2,可以根据
ggplot
2语法对图片进行额外的修改和保存。1.基础PCA:全称PrincipalComponentMethods,也就是主成分分析。
Hayley笔记
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2023-04-17 09:28
gganimate:
ggplot
2拓展之让你的数据high起来
gganimate:让
ggplot
2图随时而动。
码农郭
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2023-04-17 08:15
使用
ggplot
2画 点图、箱线图、小提琴图、蜂窝图、云雨图
使用
ggplot
2画点图、箱线图、小提琴图、蜂窝图、云雨图加载包library(tidyverse)library(cowplot)library(ggrepel)library(ggsci)library
μμ豆奶
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2023-04-17 07:27
r语言
r语言
单细胞基因个性化作图之气泡图
Seurat包自带做气泡图的函数DotPlot,可以通过
ggplot
修饰,对图形的外形,颜色等修改,具体操作如下。marker<-c("ACKR1","RAM
KS科研分享与服务
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2023-04-16 16:49
R-
ggplot
2-今天来说说坐标轴在绘图过程中出现乱序的问题
目录0.问题导入1.随机生成示例数据2.默认数据可视化(图1)3.字母加数字内置顺序排列错误排除4.字母+数字内置顺序排列错误排除后结果可视化(图2)5.字符串排列问题示例数据生成6.R中字符串顺序排列示例(图3)7.自定义横轴顺序8.自定义横轴顺序后结果可视化(图4)9.本篇总结10.本文所用到package(若没有需要通过install.packages进行安装)11.致谢0.问题导入有时候,
TroyShen
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2023-04-16 13:21
个人博客文章合集
不定期更新链接:博客文章合集:data.table学习笔记
ggplot
2分面填充色与字体大小
ggplot
2画箭头
ggplot
2坡度图iTOL修饰进化树NMDS分析OPLS-DA在R语言中的实现PCA和PERMANOVA
研究僧小蓝哥
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2023-04-15 19:52
plotly for R
简介交互式绘图工具,提供python,R,js接口,以R接口为例api类似,需要注意在参数中涉及子项的在R中使用列表,在python中使用字典支持管道符操作%>%,类似
ggplot
2的+详细教程参见(https
nnlrl
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2023-04-15 05:12
R可视化学习-- (8) 环形柱状图
柱状图可谓是论文最常见的图表了,但有时候这种笔直排列一排的柱状图用腻了,换种呈现方式(比如拐个弯)也可换个心情嘛,今天就先来介绍俩种构建环形柱状图的方法,分别基于
ggplot
2和其他的R包来绘制。
凯凯何_Boy
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2023-04-15 02:07
ggplot
2绘图学习
学习书籍:
ggplot
2:数据分析与图形艺术R语言常用函数(参考来源)通过上周R语言基础的学习,这周复习上周知识并查找资料对于R语言的整体函数进行总体性了解与针对性学习;1.R语言基础R语言基础主要是一些数据的基本结构数据类型和字符类型结构
262153
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2023-04-14 23:38
R语言
ggplot
2 绘图入门
R语言最擅长的绘图包是
ggplot
2,由于很多朋友没有接触过
ggplot
2,必须要对其语言方式有个初步的认识。所以入门学习是必须的。
张朝辉_b688
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2023-04-14 12:58
学习小组Day4笔记--apple
做好不断报错的准备,其实慢慢掌握来自于不断解决各种报错,所以心态一定摆好,报错是常有的事在输入代码的过程中,包括各种标点符号都要用英文输入法,不然会报错电脑的路径设置改成都是英文,前期因为这个吃了不少亏
ggplot
2
apple仔_6967
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2023-04-14 07:19
R语言
ggplot
2作图的两套配色方案备选
这个不管了,啥产品自己也买不起哈哈哈,第一眼见到感觉配色确实很好看,如果应用到我们的科研数据可视化里应该也不错image.png把颜色摘下来做个柱形图看看library(
ggplot
2)df<-data.frame
小明的数据分析笔记本
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2023-04-14 04:21
R绘图应用实例:成组的t检验及绘图
计算结果录入Excel,如下:图片.png#loadthedatalibrary(
ggplot
2)result<-read.table("C:/U
谢俊飞
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2023-04-14 02:56
R语言中
ggplot
2绘制热图,美化热图流程
ggplot
2是一款强大的绘图R包,今天的笔记内容是学习使用
ggplot
2来绘制一幅热图,并进行美化调整。需要加载的包有两个:
ggplot
2、reshape2。
生信分析笔记
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2023-04-13 16:39
程序人生
R语言绘图(
ggplot
2、ggpubr)从入门到精通04--柱状图美化之调色
本课程将从最基本的绘图开始讲解,深入浅出的带大家理解和运用强大而灵活的
ggplot
2包。内容包括如何利用
ggplot
2绘制散点图、线图、柱状图、添加注解、修改坐标轴和图例等。
生信师兄
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2023-04-13 08:50
R 3.5.1 安装
ggplot
2 packages
a.在Ri3863.5.1程序中install.package(“
ggplot
2”)不知道是网络问题还是什么问题,有时候失败,有时候成功,但是安装
ggplot
是绝对不行,说
ggplot
不适用3.5.1b
五人王
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2023-04-13 00:28
跟着Nature Genetics学画图:R语言
ggplot
2画图展示SNP位点的碱基类型
Pan-genomeanalysishighlightstheextentofgenomicvariationincultivatedandwildriceimage.png今天重复的图是来自于论文中的figure3bimage.png之前的推文已经介绍过上半部分的基因结果的画法,今天的推文介绍下半部分SNP位点的碱基类型的实现办法,背景颜色这里借助的是
ggplot
2
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 21:53
跟着Nature学作图:R语言
ggplot
2箱线图/堆积柱形图完整示例
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分组图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataF
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 14:14
可能会用到的R语言包~2
aplotY叔开发,拼图解决坐标对齐的问题extrafont解决
ggplot
2绘图导出pdf文件中文字体乱码的问题对应的B站介绍视频https://www.bilibili.com/video/BV1ke411p7B4
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 09:03
【R画图学习9.1】双向柱状图
命令也很简单,就是
ggplot
()+geom_bar()就可以实现了。我们今天学习另外一个画柱状图的小技巧,比如这是下面一个paper中简单的柱状图,但是是双向的。Y轴也在坐标系的中间。
jjjscuedu
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2023-04-12 09:17
《qqplot2: 数据分析与图形艺术》第3章学习笔记
第3章语法突破3.2耗油量数据
ggplot
2
冬之心
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2023-04-12 03:03
100-非监督学习之DBSCAN密度聚类
>library(pacman)>p_load(dplyr,dbscan,
ggplot
2)k-means(K均值)和分层聚类衡量行间、及行与中心点的距离。
wonphen
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2023-04-12 03:40
infercnv运行测试8--ref_group_names=NULL
5000个细胞1.4h>rm(list=ls())>options(stringsAsFactors=F)>library(Seurat)>library(
ggplot
2)>library(infercnv
Seurat_Satija
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2023-04-12 02:35
答疑|
ggplot
绘制火山图并添加文字标签
答疑|火山图加文字标签后台有几个同学对之前的教程跟着CELL学作图|1.火山图提出了几点疑问:能不能直接用
ggplot
来画如何给自己想要的基因/蛋白加上文字标签今天简单的解答一下。
木舟笔记
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2023-04-12 00:28
ggplot
2画分组蜜蜂图
replace=T),variable=sample(c("g1","g2","g3"),300,replace=T),value=rnorm(300,mean=50,sd=10))开始画图library(
ggplot
2
旭日_太阳的后裔
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2023-04-11 22:51
ggplot
2回顾(3): 图层语法基础
library(
ggplot
2)library(tidyverse)library(scales)library(nlme)1.图层图层五要素数据集:每个图层都可以有自己的数据集一组图形属性的映射:设定和映射之间的区别几何对象
TOP生物信息
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2023-04-11 19:49
跟着Plos Biology学作图:R语言
ggplot
2散点图并添加误差线和带置信区间的拟合曲线
论文Largevariationintheassociationbetweenseasonalantibioticuseandresistanceacrossmultiplebacterialspeciesandantibioticclasses数据代码链接https://github.com/orgs/gradlab/repositories今天的推文重复一下论文中的Figure1Bimage.
小明的数据分析笔记本
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2023-04-11 14:52
Coding and Paper Letter(二十一)
psychmeta2.开源项目trugggplot2,2018年1月,Tampa的R用户会议关于
ggplot
2语法的ppt。
weixin_34302798
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2023-04-11 14:08
跟着Nature学作图:R语言
ggplot
2频率分布直方图/堆积柱形图/散点图
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8s41586-022-04808-9.pdf没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分做图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推
小明的数据分析笔记本
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2023-04-11 11:44
2020-05-18
GGplot
2主题和拓展包
ggplot
2Theme调整主题格式速查!!!
iColors
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2023-04-11 09:44
ggplot
2: 第二章 -全网最全的教程
ggplot
2:数据分析与图形艺术第一章简介第二章从qplot入门-Date:2019年9月23日现在正在学习
ggplot
()画图,因此记录每一本,为后续的复习做准备,以及为刚开始进行学习的同学有一个参考
小杜的生信筆記
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2023-04-11 05:24
R语言
ggplot
2可视化:自定义设置X轴上的时间间隔(以日、月、年为单位)
需求用
ggplot
2简单绘制了一个散点图,x轴为时间。但是时间刻度太密集了,所以x轴是下面这样的:因此需要修改x轴标签的密度。
小八四爱吃甜食
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2023-04-11 02:35
r语言
开发语言
R语言处理数据——
ggplot
2去掉网格线和背景色
ggplot
2去掉网格线和背景色#
ggplot
2去掉网格线和背景色+theme_bw()+theme(panel.grid.major=element_line(colour=NA),panel.background
小八四爱吃甜食
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2023-04-11 02:35
开源项目
R语言
r语言
跟着Cell学作图:R语言
ggplot
2做散点图并添加拟合曲线和文字标签
论文https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867421008916#da0010Ancientandmoderngenomesunraveltheevolutionaryhistoryoftherhinocerosfamilyimage.png犀牛本地论文1-s2.0-S0092867421008916-main.pdf数据和
小明的数据分析笔记本
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2023-04-11 01:52
R语言的
ggplot
2做平滑的折线图简单小例子
之前的图文跟着NatureGenetics学画图~
ggplot
2画折线图并在指定区域添加灰色背景画折线图的遇到的一个问题是:
ggplot
2默认的折线图画出来基本都是带尖的,有没有办法将折线图变得平滑一点呢
小明的数据分析笔记本
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2023-04-11 01:11
如何发现数据的规律?教你4种Python方法
可以使用Python中的Matplotlib、Seaborn或R中的
ggplot
2等可视化工具。分组和
IT自学妹
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2023-04-10 23:38
python
开发语言
Python数据
零基础
Python编程
R语言~绘制对半小提琴图
该功能来自网址https://stackoverflow.com/questions/35717353/split-violin-plot-with-
ggplot
2。
Oodelay
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2023-04-10 18:49
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