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ggplot
使用ggstatsplot简化数据探索:一步完成数据可视化和统计建模 | 简说基因 Recommend...
ggstatsplot是
ggplot
2的一个扩展包,它提供9个函数用于
简佐义的博客
·
2023-03-31 16:43
信息可视化
20180409-D · NFL Positional Salaries ·
ggplot
2 ggbeeswarm 绘制抖动散点图 · R 语言数据可视化 案例 源码
所有作品合集传送门:TidyTuesday2018年合集传送门:2018NFLPositionalSalariesNFLPositionalSalariesTidyTuesday在GitHub上的传送地址:ThomasMock(2022).TidyTuesday:AweeklydataprojectaimedattheRecosystem.https://github.com/rfordatasc
数绘小站
·
2023-03-31 15:02
#
Tidy
Tuesday
(2018)
r语言
ggplot
版本的网络图终于可以替代igraph了
[toc]之前我们微生物生态网络基于igraph进行出图,这是基础包写的出图函数,近年来,随着
ggplot
的普及,使用
ggplot
出图似乎成了部分人的基本功,plot函数为代表的基本包已经很少有人去学习了
wentaomicro
·
2023-03-31 00:55
R for data science chap21——使用
ggplot
2进行图形化沟通
library(tidyverse)21.2标签1、labs()
ggplot
(mpg,aes(displ,hwy))+geom_point(aes(color=class))+geom_smooth(se
陆慕熙
·
2023-03-30 10:48
2021-04-28corrmorrant包快速绘制相关图
发现了一个可以快速绘制相关图的
ggplot
2扩展包(https://www.business-science.io/code-tools/2021/04/27/corrmorrant.html)一行代码轻松绘制相关图安装包
iColors
·
2023-03-30 03:43
matlab调用R给散点图画95%置信椭圆(95% confidence ellipse in a scatterplot)
95%置信椭圆一开始画的不是置信椭圆,就是简单的椭圆,把一个类别的数据点都框起来的那种,就用了ggforce这个包,里面有一个geome_mark_ellipse的函数官方文档介绍参考示例1后面用的是
ggplot
2
Daily365
·
2023-03-30 01:29
Matlab使用小技巧
matlab
r语言
【R画图学习10.2】复杂箱图和显著性检验
library(
ggplot
2)library(ggp
jjjscuedu
·
2023-03-29 23:31
R包
ggplot
2画散点图+循环批量画+一些基本设置
library(
ggplot
2)#这个应该都知道,载入R包1)图例设置theme(legend.background=element_rect(fill="white",colour="black"))
五四四123456789
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2023-03-29 21:43
Fig4-a
ggplot
2绘制箱线图叠加散点图2020-12-14
ggplot
2包支持图形叠加,可以很好的实现我们想要的效果。由于使用ggpolt2包绘制的箱线图的末端没有短横线,可以采用误差条图来绘制箱线图胡须末端没有短横线。
RashidinAbdu
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2023-03-29 18:43
R语言数据处理学习记录--使用linkET包完成mental test
语言数据处理学习记录–使用linkET包完成mentaltest注:本文仅作为自己的学习记录以备复习查阅一简单介绍一下这个包依旧是来自于GitHub上,作者给出的介绍:linkET的目标是简单而直接地可视化基于’
ggplot
2
炮炮炮~~
·
2023-03-29 18:55
r语言
学习
开发语言
求助关于GO富集分析可视化代码问题
dplyr)#数据清洗library(stringr)library(org.Hs.eg.db)#物种注释(Homosapiens)library(clusterProfiler)#富集分析library(
ggplot
2
weixin_55021421
·
2023-03-29 05:53
r语言
ggpubr:快速绘制用于发表的图形
更好的阅读体验-->>
ggplot
2(HadleyWickham开发)是目前R语言数据可视化的主流。
Boer223
·
2023-03-28 19:15
关于双分组(时间点+分组)折线图绘制(带散点,带mean+sd,带显著性)
ggplot
(food,aes(x=Days,y=Food,fill=Groups,color=Groups,shape=Groups))+geom_linerange(aes(ymin=Food,ymax
leoxiaobei
·
2023-03-28 18:12
R中利用
ggplot
2做双轴图
以下代码实现利用
ggplot
2做双轴图的功能#构建数据Date<-seq(from=as.Date("2015-01-01"),to=as.Date("2015-12-01"),by="month")Consumers
LeoinUSA
·
2023-03-28 16:53
R语言主成分分析(PCA)加“置信椭圆”
使用R语言为PCA散点图加置信区间的方法,我知道的有三种,分别是使用
ggplot
2,ggord,ggfortify三个包去绘制。后面两个R包是基于
ggplot
2的快捷返方法。
Z_bioinfo
·
2023-03-28 11:46
R绘图|
ggplot
2火山图的绘制
上一期R绘图|
ggplot
2散点图的绘制简单介绍了散点图在高通量数据展示上的作用,以及如何绘制?散点图在数据展示上存在局限,只能体现基因的差异幅度,并不能体现统计学意义。
Clariom
·
2023-03-27 15:24
ggplot
2优雅的绘制华夫图
R包安装与加载package.list=c("tidyverse","wesanderson","lubridate","ggstream",ggwaffle"waffle","extrafont")for(packageinpackage.list){if(!require(package,character.only=T,quietly=T)){install.packages(package
R语言数据分析指南
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2023-03-27 00:42
Fig2-d 泡泡图的绘制2020-12-14
)首先需要的数据与格式:image.png读取数据bubble<-read.csv(file.choose())#选择对应的CSV文件bubble#展示读取的数据开始绘制:#导入画图包library(
ggplot
2
RashidinAbdu
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2023-03-27 00:24
R-
ggplot
2-瀑布图包安装使用太复杂,本文给出
ggplot
2版解决方案
目录0.问题导入1.
ggplot
2精仿版瀑布图预览2.示例数据生成3.绘制主图14.绘制主图25.主图1-2图例提取6.绘制瀑布图7.本文总结8.本篇所用软件包(没有的,还需要install.packages
TroyShen
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2023-03-26 10:22
2022-09-19一张图画多个KEGG富集结果
输入文件示例;Species用于指定不同的分组脚本library(
ggplot
2)pathway=read.csv("kegg1.csv",header=TRUE,check.names=FALSE)head
AsuraPrince
·
2023-03-26 02:25
R: stair
ggplot
library(plotly)library(
ggplot
2)d=data.frame(x=c(1,2,4,5,7,8,9),y=c(1,2,3,5,6,7,9))
ggplot
(data=d,mapping
小白菜学生信
·
2023-03-25 21:40
R-
ggplot
2
mianfunction:
ggplot
():初始化图形并指定数据来源aes():指定每个变量的角色geom_XXX():使用几何函数向图中添加几何对象(视觉输出)使用串联符号(+)创建函数图形保存:ggsave
JY_Liu
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2023-03-25 19:28
bioconvert计算测序覆盖度并使用R语言
ggplot
2画折线图进行可视化展示
参考基因组下载自NCBIhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/FN433596下载原始测序数据最近发现了两个新方法一个是bioconvert可以直接下载还有一个工具是kingfisher这个好强大git主页链接https://github.com/wwood/kingfisher-download我试了一下这个kingfisher这个工具kingfisherge
小明的数据分析笔记本
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2023-03-24 15:14
【
ggplot
2绘图二:散点图】
参考:《R数据可视化手册》、学术数据分析及可视化1.理解数据与图层library(
ggplot
2)set.seed(999)diamonds<-diamonds[sample(1:53940,5000,
lkj666
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2023-03-24 12:31
ggplot
学习笔记(四)
从本期开始学习折线图的内容。考虑gapminder数据集中每个国家的期望寿命随时间(年)的变化。用geom_line()可以画折线图。因为有许多国家,所以仅指定x、y变量无法得到所需图形,如:p%filter(lifeExp=1990)###Atibble:1x6##countrycontinentyearlifeExppopgdpPercap####1RwandaAfrica199223.672
财富经略
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2023-03-23 19:47
R语言三种方法绘制饼图
ggplot
2及其拓展包做出来的图美观。下面提供三种以
ggplot
2及其拓展包绘制饼图的方法。以mtcars数据集为例子,要查看32辆车中Cylinders数的分布情况。
Whuer_deng
·
2023-03-23 19:59
R中的柱形图(更新版)
有任何建议或疑问,请加QQ:1595218767,共同探讨学习如R/python代码编程作图等方面需要帮忙,欢迎来店咨询之恒科技,挥动热情的小爪爪期待你哦今天更新了一版
ggplot
制作barplot,前后还是有差异的
飘舞的鼻涕
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2023-03-23 05:31
10x数据热图绘制之指定图例上下限
看起来不统一”我改~也就是一个修改刻度~然后~然后我就后悔了~漫漫Debug路第一次尝试Seurat包里面热图,用的是
ggplot
2绘制的,一般处理这种问题,只要获取对象后
dasdadf
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2023-03-22 12:24
R语言与医学统计图形-【27】
ggplot
2图形组合、字体、保存
ggplot
2绘图系统——图形组合、字体选择、保存输出1.图形组合一页多图在基础包中利用par和layout函数来切分画布。
Bioinfarmer
·
2023-03-22 06:30
用R画boxplot+dotplot+violinplot+jitter及代码
首先violin的代码如下:library(
ggplot
2)theme_set(theme_bw())g<-
ggplot
(mpg,aes(class,cty
gtt儿_生物信息学习
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2023-03-22 05:10
Echart:入门可视化科研人必备
1.简介最近参加一个数据分析大赛,鉴于研一师妹对R不是很擅长,用
ggplot
绘制图形学习成本较大。于是小编让她使用了Echart来绘制。简单的使用教程可见:如何快速画出美观的图形?。
庄闪闪
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2023-03-21 14:23
python
开发语言
R语言:菌群Alpha多样性分析和Boxplot箱形图
过程分为以下几步:1)模拟原始数据;2)模拟分组;3)标准化;4)计算多样性;5)T检验;6)
ggplot
绘制Boxplot,保存结果。完成以上步骤将得到如下结果:1.png1模拟丰度矩阵set.
小白菜学生信
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2023-03-21 03:31
2021年你应该学会的20个R包
包功能tidyverse家族dplyr变量操控tidyr数据(结构)整理
ggplot
2画图purrr定义、应用函数,操作lists等stringr字符操作lubridate日期
多多爸
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2023-03-21 03:21
R语言
ggplot
2作图小技巧:柱形图如何让y轴的起始点不是0
答案是在coord_cartesian(ylim=c(5,10))函数里设置y坐标的范围library(
ggplot
2)dat<-data.frame(x=LETTERS[1:10],y=10)
ggplot
小明的数据分析笔记本
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2023-03-21 02:18
R语言——
ggplot
导入所需包install.packages("tidyverse")library(tidyverse)绘图模板:
ggplot
(data=)+(mapping=aes())【注】
ggplot
()的第一个参数是要在图中使用的数据集
小新122
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2023-03-21 00:16
R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记之
ggplot
2
4.3
ggplot
2简介4.3.1
ggplot
2和图形语法
ggplot
2可以用来创建优雅的图形,由于它的灵活,简洁和一致的接口,可以提供美丽、可直接用来发表的图形,吸引了许多用户,特别是科研领域的用户。
zd200572
·
2023-03-20 18:22
第四章第一节 R、RStudio和
ggplot
2简介
4.1RandRStudio简介①安装R、RStudio和R包:R可以从http://www.r-project.org下载。Rstudio可以从https://www.rstudio.com/products/rstudio/download3/下载,所有的统计分析和图形都可以通过RStudio来实现。下载并安装R和RStudio软件后,可以启动R或RStudio终端来安装所需的软件包。在使用其
ZMQ要加油呀
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2023-03-20 17:36
EMD(经验模态分解)算法 一
第一次尝试首先安装依赖包#install.packages("reshape2")#install.packages("plm")#install.packages("
ggplot
2")加载包library
cumtzzy
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2023-03-19 19:42
DoHeatmap 调整热图颜色
[参考链接](https://github.com/satijalab/seurat/issues/1048)library(Seurat)library(
ggplot
2)pbmc<-readRDS
Zee_李海海
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2023-03-19 09:38
R绘图基础指南 | 3. 散点图(一)
3.1绘制基本散点图library(gcookbook)library(
ggplot
2)#列出我们用到的列head(heightweight[,c("ageYear","heightIn")])>head
木舟笔记
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2023-03-19 07:49
[
ggplot
2]小提琴图经验总结
一、前期准备1.所用软件与版本:R4.0.52.所需R包:
ggplot
2,cowplot,ggpub,magrittr3.示例数据:iris数据集二、绘
YERA
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2023-03-19 07:50
使用R中
ggplot
2和Hmisc绘制带误差线的柱状图
>BiocManager::install("Biobase",version="3.8")>library("Hiiragi2013")>data("x")>dim(Biobase::exprs(x))>selectedProbes=c(Fgf4="1420085_at",Gata4="1418863_at",+Gata6="1425463_at",Sox2="1416967_at")>libr
热衷组培的二货潜
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2023-03-19 05:45
R语言
ggplot
2作图小技巧:如何给坐标轴添加minor breaks
需要用到ggh4x这个R包library(
ggplot
2)library(ggh4x)dat<-data.frame(x=1:10,y=1:10)
ggplot
(data=dat,aes(x=x,y=y)
小明的数据分析笔记本
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2023-03-18 16:00
ggplot
2 配色
ggplot
2的提供了海量的默认配色方案和DIY配色选项,根据色彩显示类型一般分为连续型(渐变色)和离散型(差异色)两种。
吴十三和小可爱的札记
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2023-03-17 20:36
R 数据可视化 —— ggforce(形状)
前言ggforce是
ggplot
2的一个扩展包,提供了许多自定义的工具函数,可以更方便地为图形添加不同的形状、线条等注释,更灵活的分面图形绘制使用安装使用#从CRAN安装install.packages
名本无名
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2023-03-17 03:46
ggplot
---展示带下标的log2FC和-log10(pvalue)
*"FC"))+ylab(expression("-log"["10"]*"PValue"))+注意expression里面要用*把文本隔开,另外,上标用^,下标用[]简单画一个火山图library(
ggplot
2
一只烟酒僧
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2023-03-17 00:26
不好好做图的NSC系列(十):一个可以替代
ggplot
做热图的R包---ggheatmap
LiverImmuneProfilingRevealsPathogenesisandTherapeuticsforBiliaryAtresia,其中的热图做的还是比较好的,有经验的小伙伴一眼就可以看出是用
ggplot
KS科研分享与服务
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2023-03-16 15:36
ggplot
2绘制环状条形图(进阶)
本节继续介绍通过
ggplot
2来绘制环状条形图,重点使用annotate函数对数据进行注释library(tidyverse)自定义颜色colors%head(6)%>%mutate_if(is.numeric
R语言数据分析指南
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2023-03-16 14:54
如何轻松绘制基因表达聚类趋势图
image.png#清除当前环境中的变量rm(list=ls())#设置工作路径setwd("C:/Users/Dell/Desktop/")#加载所需的R包library(
ggplot
2)library
Davey1220
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2023-03-16 00:02
ggplot
2 画个基因结构示意图
library(Homo.sapiens)library(
ggplot
2)xxC","T>A","C>G"))p1<-
ggplot
()+geom_point(data=xxx,aes(x=x,y=ymax
上校的猫
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2023-03-16 00:56
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