proteins

mouse mitochondria dna

mousemitochondiradnahttps://www.broadinstitute.org/mitocarta/mitocarta30-inventory-mammalian-mitochondrial-proteins-and-pathways

为了梦走一遭·2024-09-14 23:37

蛋白质组学基础知识12-20

它是一个合成词，可以拆分为两个单词，proteins和genome，分别取两个单词的前半部分和后半部分，proteins意思是蛋白质，gen

为什么都被用过了·2024-08-30 05:32

2020-02-11 eggnog-mapper的使用及结果

安装以及碰到的问题》一、使用1、数据库内容在下载好eggnog数据库之后，1）og2level.tsv.gz；；2）eggnog.db.gz；；3）OG_fasta.tar.gz；；4）eggnog_proteins.dmnd.gz

暮色下的烟波澜·2023-12-26 03:44

Graph Isomorphism Network(GIN)

文章目录前言一、WL检验原理二、GIN原理三、最大池化层四、GIN的应用1、Proteins数据集2、预处理数据集3、类函数定义4、模型训练总结前言神经网络在过去被用于逼近函数，具有一层隐藏层的神经网络前馈神经网络

Authony.·2023-12-06 18:51

Paper reading (二十五)：Prediction of Druggable proteins using machine learning and systems biology

论文题目：PredictionofDruggableproteinsusingmachinelearningandsystemsbiology:Amini-Reviewscholar引用：20页数：7发表时间：2015.12发表刊物：FrontiersinPhysiology(生理学)作者：GauravKandoi,MarcioL.AcencioandNeyLemke摘要：Keywords:dru

wxw060709·2023-10-04 03:40

CASP15比赛的新出的相关任务内容

题目：NewpredictioncategoriesinCASP15文献来源：Proteins.2023;1–8.代码：无内容：结构预测关键评估（CASP）实验中的预测类别随着结构建模中需要解决特定问题的需要而变化

DrugPython·2023-09-21 23:49

MutHTP数据库: Mutations in Human Transmembrane Proteins

MutHTP数据库是今年在『Bioinformatics』杂志上发表的一个数据库，我今天介绍一下这个数据库。惯例先给出文章、网址文章：MutHTP:MutationsinHumanTransmembraneProteins网址：https://www.iitm.ac.in/bioinfo/MutHTP/index.php一、数据库简介1.跨膜蛋白跨膜蛋白有多种功能，参与细胞信号传导、细胞粘附、分子

生信family·2023-02-03 06:08

Multimodal Graph-based Transformer Framework for BiomedicalRelation Extraction

Protein-ProteinInteractiontaskintroducedanovelframeworkthatenablesthemodeltolearnmulti-omnicsbiologicalinformationaboutentities(proteins

辉辉小学生·2022-12-31 08:52

生物信息学学习笔记（二）--蛋白质的结构分析与预测Structural analysis & prediction of proteins

生物信息学-蛋白质的结构分析与预测Structuralanalysis&predictionofproteins文章目录生物信息学-蛋白质的结构分析与预测1.蛋白质结构分类(Classification)2.蛋白质结构显示(Visualization)3.蛋白质结构预测(Prediction)蛋白质结构从头预测方法的探索4.蛋白质结构分析的应用(Application)1.基本理化性质分析2.蛋白

cling5899·2022-12-19 13:50

图神经网络---常用数据集

AnInformationFlowModelforConflictandFissioninSmallGroupsTUDataset：数据为无向图；包含58个基础的分类数据集几何，如“IMDB-BINARY”，“PROTEINS

Jankin_Tian·2021-04-15 17:28

图分类任务常用数据集

数据集#图#节点#特征#边#标签D&D117933492589168860922PROTEINS11134347131620882NCI14110122747372655062NCI1094127122494382652082FRANKENSTEIN4337732837801550682D

兰亭不写序·2020-08-02 14:21

Yoshua Bengio等图神经网络的新基准Benchmarking Graph Neural Networks(代码已开源)

我们一般会从节点分类数据集cora,citeseer,pubmed，图分类数据集PROTEINS，NCI1,NCI109等入手，这些数据集相对都比较小，数据集小不是什么问题，问题是当我们复现已提出的相关模型并进行训练和测试时

风度78·2020-07-01 23:08

blast

#Buildtheblastindex.makeblastdb-inindex/all-proteins.fa-dbtypeprot-o

琼脂糖·2020-03-18 02:37

Chapter3 - a.a. and primary structure of proteins

3.1a.a.aminoderivativesofcarboxylicacids20standardaminoacidsglycinehasnochiralcarbonallaainproteinsareoftheLconfigurationaliphaticaromaticsulfurcontainingalcoholbaseacidamideadditionalaminoacid:hormon

陆小寻同学·2020-02-29 21:10

基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析（一）

以下分析完全参照lxmic的内容（基于全基因组的基因家族分析），侵删~1.准备数据①下载番茄全基因组CDS序列、protein序列、gff注释文件、基因组fa文件ITAG3.2_CDS.faITAG3.2_proteins.faITAG3.2

pomela·2020-02-19 07:26

蛋白质相互作用数据库

DIP (database of interacting proteins) http://dip.doe-mbi.ucla.edu

·2015-11-02 19:04

Hackerrank--Mixing proteins(Math)

on protein recombination, and during their research, they have found a remarkable fact: there are 4 proteins

·2015-10-27 15:15

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