pydicom

python读取Dicom文件

GDCMLibrary(GrassrootsDICOM)下面提供几种用python方法读取Dicom文件1.pydicomLibraryimportpydicom#ReadDICOMfiledataset=pydicom.dcmread

北方骑马的萝卜·2024-01-18 01:45

DICOM文件即内部信息的读取

使用Python读取DICOM文件的tag，可以使用Python的pydicom库。

blazing-ambassador·2023-12-05 15:05

Python写入DICOM文件（AttributeError: ‘FileMetaDataset’ object has no attribute ‘TransferSyntaxUID’解决方式）

DICOM文件importnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltimportpydicomimportsysdefInitDicomFile():infometa=pydicom.dataset.Dataset

xtphysics·2023-11-27 15:13

使用Python对Dicom文件进行读取与写入

Dicom文件的读取Pydicom单张影像的读取一些简单处理读取并编辑DicomTags借助Numpy与PIL.Image可视化单张影像的写入SimpleITK单张影像的读取序列读取一些简单操作边缘检测可视化单张影像的写入

Mitty_Meng·2023-11-23 18:13

python dicom传输_使用Python对Dicom文件进行读取与写入的实现（pydicom 和 SimpleITK）_xjp_xujiping的博客-CSDN博客...

使用Python对Dicom文件进行读取与写入的实现(pydicom和SimpleITK)_xjp_xujiping的博客-CSDN博客2020-11-29使用Python对Dicom文件进行读取与写入的实现

weixin_39775577·2023-11-23 18:43

python dicom segment_使用Python对Dicom文件进行读取与写入的实现

Pydicom单张影像的读取使用pydicom.dcmread()函数进行单张影像的读取,返回一个pydicom.dataset.FileDataset对象.importosimportpydicom#

weixin_39620279·2023-11-23 18:12

Python计算DICOM图像两点真实距离

Codeimportnumpyasnpimportcv2importmathimportpydicomfrompydicom.pixel_data_handlers.utilimportconvert_color_spaceds=pydicom.dcmread

Alex-Leung·2023-11-23 17:04

matlab中ct值直方图,【CT值与灰度值的总结】

接下来，就要看你具体是要处理哪种格式的文件了，是DICOM还是NIFTI；文件格式不同，用来做解析的Python库也就不同，譬如，要处理DICOM类型的数据，一般会用simpleitk,pydicom库

weixin_39637589·2023-10-17 19:55

基于Python的DICOM文件转换教程，使用pydicom将图片存为DICOM文件。

基于Python的DICOM文件转换教程，使用pydicom将图片存为DICOM文件。DICOM是医学图像和信息的数字化标准，可用于将医学影像数据、诊断报告等信息在医疗领域进行传输、分享和分析。

NoABug·2023-10-14 08:18

使用pydicom将图片存为DICOM文件

在网上没有找到特别好的示例，pydicom的也不是非常全面。DICOM标准在网上找到一个较为详细的DICOM标准相关资料网页。包含DICOM标准、字段解释等很详细的信息。

森尼嫩豆腐·2023-10-14 08:16

[医学影像数据处理] dicom 转 nii

dicom_path)data_array=[]local_list=[]forfile_nameinfile_list:dicom_name=os.path.join(dicom_path,file_name)ds=pydicom.read_file

俭任G·2023-08-28 15:29

部署深度学习APP的经历（docker，streamlit cloud，nuitka）

部署深度学习APP的经历最近，接到一个部署深度学习APP的需求，这个APP使用torch、monai和pydicom等库构建了一个识别CT图像中皮下脂肪、内脏脂肪和骨骼肌，输入是CT图像，输出是识别的图像和相关数据

预测模型的开发与应用研究·2023-08-17 15:07

医学图像".dcm"查看处理操作 python

一，关于dcm文件的查看1，安装dicom包pipinstallpydicom2，导入importpydicom#进行绘图importpylab3,打开文件filePath='test.dcm'ds=pydicom.read_file

enen20132013·2023-08-15 15:19

Dicom修改图像内容重新生成dcm文件

用pydicom读取一张dicom医学文件，根据骨头的像素阈值分离出骨头（参考mimics软件中的阈值），然后更改像素值重新生成dcm文件保存。

Summer_HT·2023-08-15 15:48

将医学图像.dcm格式与.nii.gz格式进行一些处理

介绍.dcm文件是一种医学上用于存储CT、核磁共振等成像方式得到的患者器官图像的文件格式.nii.gz是通过标注软件导出的3D标签(可以看作一个np数组)我们通过pydicom和nibabel这两个包来辅助我们进行操作读取

Andy in boots·2023-08-15 15:48

使用PyDICOM包读取医学图像数据，并将其转成Numpy

我将使用pydicom包读取一系列DICOM图像，并将他们转成NumPy数组．这将涉及从DICOM文件和像素数据本身读取元数据。

一入DL深如海·2023-07-31 11:47

使用pydicom处理dcm文件提取信息并存储在csv

使用pydicom处理dcm文件提取信息并存储在csv使用pydicom使用pydicom#!

whojoe·2023-07-24 15:38

Python读取预处理DICOM文件方式详解

目录需要的库读取dicom需要的库●Simpleitk安装命令：condainstall-csimpleitksimpleitk使用：importSimpleITKassitk●pydicom（不推荐，

·2023-04-12 01:12

Python+pyqt+dicom+vtk 使用pyinstaller打包软件时正常，运行报错vtkmodules.all、pydicom.encoders.pylibjpeg等错误

**Python+pyqt+dicom+vtk使用pyinstaller打包软件时正常，运行时报vtkmodules.all、pydicom.encoders.pylibjpeg、Nomodulenamed

湿透丶·2023-04-06 08:01

python-读取dcm文件-2021.5.24

读取dcm文件#采用pydicom模块importpydicom#数据路径file_path=r"C:\Users\孔啊吱\Desktop\kaggle_covid19\data\3dcdfc352a06

孔胖·2023-01-12 16:10

Python处理DICOM（02）--DICOM转PNG

一、基础环境准备使用pipinstallXXX命令安装pydicom，SimpleITK，NumPy，opencv-python，tqdm几个模块。

baccolee·2023-01-12 16:33

SimpleITK、pydicom的安装使用——踏上python生物医学图像处理的初学之路

一、两个库的安装pip均可直接安装。这里说说conda怎么安装SimpleITK。首先这个库是不在默认的channel里面的所以不能够直接安装。因此需使用：来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/SimpleITK这个"channel/package"的项目。然后：来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/Sim

hdpai2018·2022-12-16 07:44

Python dcm转jpg与jpg转dcm

将DCM转JPG需用到pydicom库，若未安装，可使用控制台输入pipinstallpydicom进行安装DCM转J

渺邈·2022-11-19 03:41

Candidate Generation and LUNA16 preprocessing

本教程中用于读取，处理和可视化数据的库是matplotlib，numpy，skimage和pydicom.。图像大小（z，512,512），其中z是CT扫描中的切片数量，取决于扫描仪的分辨率。

weixin_33969116·2022-09-08 04:43

Pydicom读取dcm格式视频

Pydicom读取dcm格式视频，格式转换写本文的初衷是不想用dicom的付费软件格式转换，此处特指RadiAntdicomviewer，找到的免费软件又没有这功能。

旸枫·2022-05-28 03:50

python dicom图像分割_处理医疗影像的Python利器：PyDicom

Pydicom是一个用于处理DICOM格式文件的Python包，可以处理包括如医学图像（CT等）、报告等。

weixin_39844549·2022-05-09 07:41

清除dicom文件中的患者个人信息

利用pydicom清除某一子目录下所有dicom文件的中涉及患者隐私的数据：批量修改：importpydicomasdicomimportglobimportsys,getoptfrompathlibimportPathdefclear_dcm

北欧森林·2021-06-23 03:32

DICOM “.dcm”数据基本操作方法(python)

首先需要安装dicom包：#旧版pipinstalldicom#新版pipinstallpydicompydicom的官方documents参考https://pydicom.github.io/pydicom

StandWisdom·2020-09-14 15:15

DICOM 读取

病例数据结构1.通过读取DICOMDIR获取病人切片路径参考：https://pydicom.github.io/pydicom/stable/auto_examples/input_output/plot_read_dicom_directory.html

红薯塔就是爱太阳啊·2020-08-25 17:15

利用glob和pydicom清理某一子目录下所有dicom文件的隐私数据

结合pydicom对dicom的操作接口，可以实现对某一个目录以下所有子目录中的dicom文件进行隐私数据清

零壹之间·2020-08-22 11:39

Python对DICOM图像进行阈值分割

Python对Dicom图像进行处理，离不开pydicom，opencv-python，matplotlib，numpy四个代码库，安装完成这四个代码库后，可以读取Dicom图像，并对图像进行处理，显式处理后的结果

weixin_30763455·2020-08-21 22:59

DICOM学习(3)——python实现worklist获取

这里使用的仍然是pydicom和pynetdicom模块，在使用前需安装。思路：首先初始化AE作为SCP，并创建数据集dataset，dataset中可以设定具体tag的值，此处可根据需要自行设定。

LemonGEE·2020-08-20 00:31

python 用SimpleITK+pydicom 将4dnii图像转为单张dicom，并重新添加图像头信息

最近在处理一套心脏数据，需要将4dnii图像转换成单张的dicom图像进行试验，看了很多博客，发现SimpleITK是一个处理医学图像的很好用的包，里面支持很多医学图像的读取以及处理，以及对图像头信息的查看及修改。首先，可以用sitk.ReadImage读取4dnii图像，如下：itk_img=sitk.ReadImage('E:/cardic_data/training/patient009/p

hear~·2020-08-18 01:35

【CT值与灰度值的总结】

接下来，就要看你具体是要处理哪种格式的文件了，是DICOM还是NIFTI；文件格式不同，用来做解析的Python库也就不同，譬如，要处理DICOM类型的数据，一般会用simpleitk,pydicom库

Pierce_KK·2020-08-17 20:59

菜椒123·2020-08-17 10:02

医学图像分割——Unet

，而数据格式上有诸如dicom(.dcm，.IMA，常用的python处理库有：SimpleITK,pydicom库)，Nifit(

XX|XX·2020-08-14 19:38

python处理DICOM，并计算三维模型体积

每个体素为长方体，x，y为PixelSpacing，z为层间距使用pydicom.read_file读取DICOM文件，dcm_tag.PixelSpacing获取像素间距，dcm_tag.SliceLocation

qd_tudou·2020-08-11 01:04

Python 如何替换Dicom医学图像内容附代码

1.Python下对dicom图像进行解析操作需要安装Pydicom模块2.使用Pydicom模块读取dicom数据importp

xiaoxifei·2020-07-29 00:08

python pydicom读取dicom文件信息的几种方式

使用pydicom读取单张dicom信息看这篇文章之前，请各位对dicom文件有一定的了解。

黄河龙虾·2020-07-28 22:38

Pydicom+SimpleITK操作DICOM图像数据和TAG

操作过程中主要有几个问题：本来只用了pydicom库，发现它打不开有压缩的dcm文件，官网也说了只能借助其他工具打开（如gdcm），所以行不通（搞不懂这么好用的pydiocm怎么会有这种问题）后来改用SimpleITK

OShaoHui·2020-07-28 21:47

python 读取dcm tag值

python读取dicom图像的信息，是利用pydicom模块进行读取的。

蓦然回首时已逝·2020-07-27 12:00

初识DICOM以及pydicom的基础操作

初识DICOM以及pydicom的基础操作Author：LabyrinthineLeo Init_time：2020.06.30IndexWords：DICOM、pydicom库、dicom文件转jpg

*迷途不知返的野指针·2020-07-16 07:19

DICOM学习(2)——python实现DICOM文件归档PACS服务器

使用该插件可以轻松创建DICOM客户机和服务器，插件获取地址：http://www.github.com/pydicom/pynetdicom主要用户类是AE，它用于表示一个DICOM应用程序实体。

LemonGEE·2020-07-16 04:14

使用pydicom实现Dicom文件读取与CT图像窗宽窗位调整

在Dicom图像中CT的窗宽窗位是一个很重要的概念，但是找了半天在pydicom中没有相关设置函数，这里跟DCMTK还不一样。

m_buddy·2020-07-16 03:53

pydicom 安装与使用

安装condainstall-cconda-forgepydicom使用使用示例importpydicomfilename='path_to_dicom'ds=pydicom.dcmread(filename

linhai1028·2020-07-16 02:47

Python处理DICOM（01）--基础环境搭建

一、前言Python处理DICOM需要用到的第三方包有pydicom和NumPy。pydicom主要用于解析DICOM文件。

baccolee·2020-07-15 20:46

pydicom编辑、删除DICOM文件中病人相关信息

网上搜索了几款免费的软件，都不是好用，也知道一些C++的库，但不是免费的，后面发现可以用pydicom这个软件包。

乌鱼阳光·2020-07-15 17:28

pydicom----用法一

pydicom-易学教程DICOM“.dcm”数据基本操作方法(python)pydicom的官方documents参考https://pydicom.github.io/pydicom/stable/

Elvirangel·2020-07-15 17:45

pyDicom基本使用操作dicom文件

dicom文件前面已经介绍，那么我们需要读和写文件信息，我发现python中有pydicom这个好用的库，可以帮助我们方便的操作，据说比java的会方便很多。

chibin6332·2020-07-15 14:06

Python解析多帧dicom数据

目录概述DICOM多帧数据存储pydicom应用概述pydicom是一个常用pythonDICOMparser。但是，没有提供解析多帧图的示例。本文结合相关函数和DICOM知识做一个简单说明。

pkrobbie·2020-07-11 14:44

推荐频道