r语言主成分分析

R语言：TOPSIS综合评价法进行多属性最优方案选择

本文主要是介绍在R语言中如何用TOPSIS综合评价法进行多对象选择决策。TOPSIS综合评价法一般地，TOPSIS综合评价法主要包含两个步骤：计算权重和计算相对接近度。
数据老黄·2023-10-10 19:14

R语言ggplot2画热图的时候在色块上添加文本

今天的推文没有详细介绍代码，代码的介绍会以视频形式放到B站，欢迎大家关注我的B站小明的数据分析笔记本https://space.bilibili.com/355787260image.png首先是示例数据的格式画热图的数据image.png用来添加文本的数据image.png如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据image.png加载需要用到的R包library(ggplot2)librar
小明的数据分析笔记本·2023-10-10 14:29

R语言实现PSM（2）

library(MatchIt)help(package="MatchIt")data("lalonde")str(lalonde)table(lalonde$treat)#默认1:1匹配table(lalonde$treat)m.out1<-matchit(treat~age+educ+race+nodegree+married+re74+re75,data=lalonde)m.out1summ
weixin_49320263·2023-10-10 13:55

R语言实现计算预测模型的C指数（1）

#生成模拟数library(prodlim)set.seed(13)dat<-SimSurv(100)#3种Cox模型library(survival)cox12<-coxph(Surv(time,status)~X1+X2,data=dat,x=TRUE,y=TRUE)cox1<-coxph(Surv(time,status)~X1,data=dat,x=TRUE,y=TRUE)cox2<-co
weixin_49320263·2023-10-10 13:54

R语言实现竞争风险模型（2）-mstate

library(mstate)help(package="mstate")data(aidssi)aidssi.w%summary#Gray'slog-rank检验aidssi.wCCR<-crprep("time","cause",data=aidssi,trans=c("AIDS","SI"),cens="event-free",id="patnr",strata="ccr5")test.AI
weixin_49320263·2023-10-10 13:54

r library car_R语言 绘图组合布局grid/layout

“获取源代码请至公众号后台回复：一页多图”01—图形组合布局par(mfrow=c(2,2))par(mfrow=c(2,2))，可以理解将绘图区域分割为2x2的矩阵区域，另可参照《R语言实战》3.5图形的组合
weixin_39639600·2023-10-10 13:23

ggplot多图叠加_R作图 ggplot2图片的布局排版

ggplot2是R语言中用来可视化的利器，其图层逻辑非常人性化，简单的说就是一句话一张图，后一张图叠加在前一张图上，所想表达的几乎都可以用一句代码在图形上展示出来。
weixin_39568083·2023-10-10 13:52

gn算法java_R语言构建蛋白质网络并实现GN算法

R语言构建蛋白质网络并实现GN算法1.蛋白质网络的构建我们使用与人类HIV相关的蛋白质互作数据hunam-HIVPPI.csv来构建这个蛋白质互作网络。
活着改变世界·2023-10-10 13:22

R语言绘图：实用脑科学数据可视化包

文章来源于微信公众号（茗创科技），欢迎有兴趣的朋友搜索关注导读本文整理了R语言绘图中使用频率较高的程序包，每个程序包都附载相应的参考来源链接（链接里有实现绘图的脚本）和下载链接。
茗创科技·2023-10-10 13:50

R语言快速实现图片布局（1）

（1）简单的一排或者对称的多排，使用patchwork即可。/表示分行，|表示分列library(patchwork)pp1<-ggplot(mtcars)+geom_point(aes(mpg,disp))pp2<-ggplot(mtcars)+geom_boxplot(aes(gear,disp,group=gear))pp3<-ggplot(mtcars)+geom_bar(aes(gear
weixin_49320263·2023-10-10 13:44

Python机器学习实战-特征重要性分析方法（7）：主成分分析 PCA（附源码和实现效果）

实现功能对特征进行主成分分析，并查看每个主成分的解释方差比。在前几个组件上具有较高负载的特性更为重要。
数据杂坛·2023-10-10 12:52

学习小组Day4笔记-陶*

今天是学习小组第4天，内容主要是R语言基础。
陶子不淘气·2023-10-10 12:13

R语言矩阵相关性计算及其可视化？

1.矩阵相关性计算方法base::cor/cor.testR基础函数cor或cor.test都可计算相关性系数，但cor可直接计算矩阵的相关性，而cor.test不可。两者计算非矩阵时，cor仅得到相关系数，而cor.test还能得到pvalue。library(ggplot2)cor(mtcars)cor.test(mtcars)#errorcor.test(mtcars,mtcars)#err
生物信息与育种·2023-10-10 11:45

运用逻辑回归进行手写数字识别（基于R语言）

理论基础手写数字识别的本质是把手写数字灰度图片的256个特征作为预测变量，利用这256个特征判断这张图片写的是什么数字，即把该图片归入0、1、2…9这总共十个类中。根据《统计学习导论》4.3.5响应分类数超过2的逻辑回归里的表述，当响应变量的水平数量大于2时，依然可以把二分类的逻辑回归推广到多分类，例如当Y可取1、2、3时，可利用概率的性质P(Y=1|X)=1-P（Y=2|X）-P（Y=3|X）算
fanshunxing·2023-10-10 05:10

VBA-Excel工具函数

（2017-03-18银河统计）  Excel_VBA类模块框架是在Excel后台通过vba编程方式，实现类似R语言模块化数据操作的功能，对数据进行处理、挖掘、建模及可视化，提高数据分析和挖掘人员的数据处理效率
weixin_30376509·2023-10-10 02:52

R语言，正态分布检验，95%置信区间-2020-03-21

准备数据data，存成int型list，或float型list导入模块#!/usr/binenvpython3.6#-*-coding=utf-8-*-importnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltfromscipy.statsimportkstestfromscipy.statsimportshapirofromscipy.statsimportnormi
爬山小虎·2023-10-10 01:02

矩阵分解PCA,SVD

数据----去中心化-------协方差矩阵---------特征向量表示坐标轴方向，特征值表示坐标轴方向的方差缺点：受离群值的影响很大主成分分析（PrincipalComponentAnalysis，
小小白2333·2023-10-10 01:55

R语言绘图 | 使用pheatmap快速绘制热图

欢迎关注微信公众号“生信小王子”！热图是我们展示数据时常用的图形，今天小编教大家使用"pheatmap"快速绘制热图。首先，我们需要准备输入文件。比如，我想绘制热图来比较30个基因在6个组织里的表达情况。如图所示，第一列为基因名，第一行为不同组织的名称，整理好后保存为制表符分隔的txt格式，准备好输入文件后我们就可以开始绘制热图啦。##安装R包install.packages("pheatmap"
生信小王子·2023-10-10 01:48

跟着 Cell 学作图 | 5.UMAP降维分析

“复现是学习R语言的最好办法。”2021.4.12_1DOI:10.1016/j.cell.2020.05.032这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。
木舟笔记·2023-10-09 22:33

对一门不是非常熟悉的语言是怎么面试的

职位需求这个职位的需求就是使用Elixir语言来处理
HoneyMoose·2023-10-09 16:08

【R语言可视化】-- 环形柱状图

前言上一节师兄给大家介绍了在R语言中，常用的柱状图绘图技巧！如柱状图分组、调色、堆积柱状图、柱状图加误差棒等等！这一小节师兄准备带大家玩点有意思的！把柱状图画成环状的！别看成了饼图哦！
可视化艺术·2023-10-09 14:30

【R语言可视化】-- 柱状图要点一网打尽

先对这一系列做个简单说明：本系列旨在通过R语言编程，实现数据的各种可视化！其中主要用到的R包为ggplot2，不会再讲解R语言自带的基础函数，如plot、barp
可视化艺术·2023-10-09 14:59

R 语言学习心得——面向初学者

&emsp进行数据分析时，R语言有独特的优势，比如，很简单，无论是语法还是逻辑上，但是功能很强大。R是由统计学家发展起来的，因此在统计上有独特优势。无论是经典统计还是贝叶斯统计，都大量集成应用。
tiger007lw·2023-10-09 13:57

社交网络分析的 R 基础：（二）变量与字符串

本章会从R语言中最基本的数据类型开始介绍，在此之后就可以开始R语言实践了。对社交网络分析而言，我们在处理字符串上所花费的时间要远远大于处理数字的时间，因此本章还会介绍常用的字符串处理操作。
电脑玩家张高兴·2023-10-09 12:49

基于R语言的水文、水环境模型优化技术及快速率定方法

【阅读原文】：基于R语言的水文、水环境模型优化技术及快速率定方法与多模型案例实践【内容简介】：专题一、最速上升法、岭分析以及响应曲面模型1.最速上升路径2.信赖域3.响应面模型4.二阶响应面5.岭分析专题二
_遇见jia·2023-10-09 11:21

R语言学习--取整运算、有效小数、有效数字

取整运算：通俗点讲就是将一个小数（浮点数）转化成整数。比如，我们可以将3.42转化为3或者4。有效小数：将一个小数近似为小数位特定的小数。比如，将3.1415926转化为两位有效小数，即3.14。有效数字：将一个数近似为特定有效位数的数字。比如，将23456保留两位有效数字，即23000。1.ceiling()函数"ceiling"字面意思为“天花板”。ceiling()函数返回对应数字的“天花板
虾里巴人·2023-10-09 10:04

2020的六一儿童节

减肥，学摄影，记录文字，学习R语言，学英语，做兼职……
栀子花在梦游·2023-10-09 06:38

R语言 一种功能强大的数据分析、统计建模 可视化 免费、开源且跨平台 的编程语言

R语言是一种广泛应用于数据分析、统计建模和可视化的编程语言。它由新西兰奥克兰大学的罗斯·伊哈卡和罗伯特·杰特曼开发，并于1993年首次发布。
时雨h·2023-10-09 05:41

R语言 人工神经网络(nnet包）

数据威斯康乳腺癌数据集由699个样本和11个特征组成，第一列为Samplecodenumber(idnumber)，最后一列为Class:(2是良性,4是恶性)，是需要预测的变量。其余几个特征的大小均介于1-10之间。数据可以在UCI的网站上得到。datah1i1->h1i2->h1i3->h1i4->h1i5->h1293.2492.76-67.9231.3269.96-13.00i6->h1i
YangRiriri·2023-10-09 04:35

第十章 降维与度量学习

章节目录k近邻学习低纬嵌入主成分分析核化线性降维流形学习度量学习知识点1.懒惰学习（lazylearning）：此类学习技术在训练阶段仅仅是把样本保存起来，训练时间开销为零，待收到测试样本后再进行处理。
泽平阿·2023-10-09 02:13

跟着Nature学作图：R语言ggplot2画带有置信区间的折线图展示核心基因和非必需基因的数量

论文Achickpeageneticvariationmapbasedonthesequencingof3,366genomesimage.png本地存储s41586-021-04066-1.pdf鹰嘴豆基因组重测序论文，涉及到了泛基因组。最近朋友圈好多人转发这个论文。就找到原文来看了看。论文里的Figure1a基本上泛基因组的论文都会涉及到，正好论文提供了作图的原始数据，所以我们用原始数据尝试来
小明的数据分析笔记本·2023-10-08 19:33

特征工程—PCA与SVD降维基础

主成分分析=降维=PCA,SVD：降维后包含特征的主成分，无用特征可能是噪音。sklearn中有两种降维方式
单手法拉利·2023-10-08 19:27

手把手教你入门R语言--数据分析篇（1）——数据导入与基础绘图

R语言入门系列课程（6）前面已将R语言的基础全部交给大家了，这两节将教大家用R语言进行数据分析的基础。
zxxxlh123·2023-10-08 17:02

r语言调用python_R 调用 python

上一篇说了python使用rpy2调用R，这里介绍R如何调用python。R的强项在于统计方面，尤其是专业的统计分析，统计检验以及作图功能十分强大，但是在通用性方面，就远不如Python了，比如python可以做web，可以开发GUI，可以爬虫，甚至可以开发游戏，这些R其实也不是完全不行，但是在易用性方面实在是难以与Python相匹敌。所以如果要是能将R与Python相结合，充分发挥二者的优势，那
weixin_39787606·2023-10-08 17:51

用DESeq2对表达矩阵进行归一化的详细步骤

readscount进行ln()转换表达矩阵的行代表feature（如基因、外显子等），列代表sample；对于原始的每一个基因每一个样本对应的reads数进行以e为底的转换：ln(counts)ln()函数在R语言中是
泼皮混混·2023-10-08 09:08

菜鸟学R语言（回归分析1）

学会用R做回归分析在统计学中，回归分析（regressionanalysis)指的是确定两种或两种以上变量间相互依赖的定量关系的一种统计分析方法。回归分析按照涉及的变量的多少，分为一元回归和多元回归分析；按照因变量的多少，可分为简单回归分析和多重回归分析；按照自变量和因变量之间的关系类型，可分为线性回归分析和非线性回归分析。线性回归（LinearRegression）线性回归应该是最常用的回归了，
邱德勋·2023-10-08 06:26

Rstudio做多元统计分析R语言

练习题4研究货运总量y（万吨）与工业总产值x1（亿元）、农业总产值x2（亿元）、居民非商品支出x3（亿元）的关系。数据见表4-8.表4-8编号yX1X2X3116070351226075402.4321065402426574423524072381.2622068451.5727578424816066362927570443.21025065423计算出y，x1，x2，x3的相关系数矩阵并绘制
qq_61247494·2023-10-08 06:24

跟着Cell学作图|10.复杂热图

“复现是学习R语言的最好办法。”2021.4.12_1DOI:10.1016/j.cell.2020.05.032这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。
木舟笔记·2023-10-08 05:48

【R语言】四种风格展示DAVID GO富集分析结果

小编前面也用了好几期的内容来给大家分享如何零代码做GO和KEGG富集分析，主要用到的是DAVID这个网页工具，并且零代码展示GO和KEGG富集分析的结果，主要用到的是Excel。1.基因富集工具DAVID介绍（一）-基因ID转换2.基因富集工具DAVID介绍（二）-KEGG富集分析3.基因富集工具DAVID介绍（三）-零代码展示KEGG富集结果4.基因富集工具DAVID介绍（四）-GO富集分析及柱
生信交流平台·2023-10-08 04:31

【R语言数据分析三：回归分析】（5.30更新）

2021.4.30持续更新中。。。参考：《R数据可视化手册》、学术数据分析及可视化与回归拟合不同，回归分析主要侧重于数据的分析，模型的筛选以及数据的预测。同时回归分析会两个及两个以上的自变量，而回归拟合一般只有一个自变量。1.简单线性回归(单元)单元线性回归与线性拟合基本一致。library(MASS)data(whiteside)head(whiteside)#取子集df<-subset(whi
lkj666·2023-10-08 02:00

跟着Cell学作图|7.富集分析(Metascape数据库)

“复现是学习R语言的最好办法。”2021.4.12_1DOI:10.1016/j.cell.2020.05.032这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。
木舟笔记·2023-10-07 19:54

R语言提交后台任务Rstudio\nohup

R语言后台任务用法在进行大规模数据分析时，R语言提供了后台计算的功能，能将计算任务提交到后台执行，不影响当前窗口的活动，而且不会受到网络波动导致任务中断，提交后就不用盯着一直看，后台运行就可以下班。
生信分析笔记·2023-10-07 17:19

R语言学习笔记：模型选择（三）LASSO方法

红点代表均方误差和上下一倍标准差，均方误差越小模型越好；上方数量表明模型仍存在的自变量个数（不一定是单调递减）。第一条虚线处表明均方误差最小值；第二个虚线标出最低点的一倍标准差的位置，表示牺牲一倍标准差的情况下可以得到的最简单的模型查看第一条竖线（MSE最小）：lasso1.cv$lambda.min查看第二条竖线：一倍标准误：lasso1.cv$lambda.1secoef(lasso1.cv,
DANoob·2023-10-07 14:58

R语言中的颜色(二)

在上一期☞R语言中的颜色(一)中，我给大家介绍了R中的颜色以及自带的一些配色方案。这一期我给大家介绍一下gplots这个R包中的配色方案。
生信交流平台·2023-10-07 13:10

r语言结构方程模型可视化_R语言实现拟合神经网络预测和结果可视化

原文链接：http://tecdat.cn/?p=6691神经网络一直是迷人的机器学习模型之一，不仅因为花哨的反向传播算法，而且还因为它们的复杂性(考虑到许多隐藏层的深度学习)和受大脑启发的结构。神经网络并不总是流行，部分原因是它们在某些情况下仍然存在计算成本高昂，部分原因是与支持向量机(SVM)等简单方法相比，它们似乎没有产生更好的结果。然而，神经网络再一次引起了人们的注意并变得流行起来。在这篇
weixin_40006185·2023-10-07 10:45

人工智能入门需要学习哪些课程？AI基础知识

编程语言：人工智能需要用到编程语言进行算法实现和模型构建，建议掌握Python或R语言等编程语言。机器学习：机器学习是人工智能的核心技术
程序媛珂珂·2023-10-07 08:10

Meta分析的流程及方法

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。Meta分
Teacher.chenchong·2023-10-07 06:24

【无标题】

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。从文献计量
科研小白 新人上路·2023-10-07 06:24

Citespace、vosviewer、R语言文献计量学 、SCI

文献计量学是指用数学和统计学的方法，定量地分析一切知识载体的交叉科学。它是集数学、统计学、文献学为一体，注重量化的综合性知识体系。特别是，信息可视化技术手段和方法的运用，可直观的展示主题的研究发展历程、研究现状、研究热点和发展态势。Citespace和vosviewer是使用最广泛的文献信息可视化软件工具，在理工、经管、法学、教育、农学、文史、医学、艺术等学科中普遍应用，发文量逐年显著上升。文献计
Teacher.chenchong·2023-10-07 06:17

R语言通过接口获取网上数据平台的免费数据

大家好，我是带我去滑雪！作为一名统计学专业的学生，时常和数据打交道，我深知数据的重要性。数据是实证研究的重要基础，每当在完成一篇科研论文中的实证研究部分时，我都能深刻体会实证研究最复杂、最耗时的工作不是高深模型的构建，而是数据的收集、清洗等基础准备工作。今天和大家分享几个获取经济金融数据下载方法。目录（1）读取美国圣路易斯联储研究资源网站的数据（2）通过Quandl平台下载（3）下载美联储利率数据
带我去滑雪·2023-10-07 04:57
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