r语言degseq2

R包-VennDiagram韦恩图

R语言中有几个包能够较好的完成这份工作。如VennDiagram、Venn、UpSetR包等，也有一些在线画韦恩图网站。
新欣enjoy·2024-01-14 08:07

黄丽红日精进593/596

.…5.发励志giwin6.日精进7.研究生统计课本（+*r语言学习）
做自己小太阳·2024-01-14 04:51

spark入门教程（3）--Spark 核心API开发

Spark综合了前人分布式数据处理架构和语言的优缺点，使用简洁、一致的函数式语言Scala作为主要开发语言，同时为了方便更多语言背景的人使用，还支持Java、Python和R语言。
xwc35047·2024-01-14 04:45

学习小组Day6笔记-学习R包

生信必学R语言——含有丰富图表和Biocductor上的生信分析R包。每个包都解决生信的一个流程问题。
小路多虫·2024-01-14 03:37

R语言实践——U.Taxonstand标准化动植物科学名

U.Taxonstand标准化动植物科学名简介准备工作支持包的安装：openxlsx、plyr、magrittrU.Taxonstand安装方法1：GitHub方法2：devtools测试参照github文档测试1.加载U.Taxonstand2.加载示例数据库3.待查科学名以向量字符输入（charactervector)4.nameMatch函数使用5.结果解读nameMatch函数详解1介绍2
ALittleHigh·2024-01-14 01:26

R语言【文章复现】——集成式地绘制高分辨率的多样性分布图，对方法的检验和优化，以及处理思路的思考

参考文献本文对一篇2022年发表在NewPhytologist的绘图方法文章中的技术路线进行复现。Anintegratedhigh-resolutionmappingshowscongruentbiodiversitypatternsofFagalesandPinalesSummary文中，作者针对在全球尺度上绘制物种分布图提出了一种全新的方法。该方法整合了多边形绘图（polygonmapping
ALittleHigh·2024-01-14 01:25

R语言学习之选定目标行列

搜寻位置或逻辑值grep("color",irisSpecies)本行代码表示选择在iris数据集中，Species列包含”color“的所有行信息iris[1,]iris[grepl("color",iris$Species),]取字母，负号表示不要的资料letters[c(1,3,5)]letters[c(-1,-3,-5)]选择列使用，选择行iris$Speciessubset(iris,S
佐博伊森·2024-01-13 16:49

学习小组Day4笔记--邓陶

话不多说，先放上今天的主要学习内容：Day4学习内容.png1、安装R和Rstudio首先确认电脑用户名为英文接着下载R和Rstudio，具体操作参考果子学生信给自己一个全新的R语言环境2、初步了解R和
邓陶·2024-01-13 15:34

R语言【paleobioDB】——pbdb_intervals()：通过参数选择，返回多个地层年代段的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_interval(id,...)Arguments参数【...】：其余可通过API调用的参数。所有可用
ALittleHigh·2024-01-13 15:15

R语言【paleobioDB】——pbdb_occurrences()：从PBDB获取多个化石记录号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_occurrences(...)Arguments参数【...】：其余可通过API调用的参数。所有可用
ALittleHigh·2024-01-13 15:15

R语言【paleobioDB】——pbdb_interval()：通过ID选择，返回一个地层年代段的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_interval(id,...)Arguments参数【id】：地层年代段的标识符，即ID。此参数为必
ALittleHigh·2024-01-13 15:15

R语言【paleobioDB】——pbdb_collection()：从PBDB获取单个采集号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_collection(id,...)Arguments参数【id】：采集号的标识符，即ID。此参数为必
ALittleHigh·2024-01-13 15:12

R语言【paleobioDB】——pbdb_map()：根据化石记录绘制地图

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_map(data,col.int="white",pch=19,col.ocean="black",m
ALittleHigh·2024-01-13 15:12

在线作图丨做一张叠加mantel test的相关性热图

下边这张图摘自2015年的Science（暂且叫他Manteltest和相关性热图的组合图吧），这张图在各大论坛都有R语言的教程，今天小编教大家如何不使用R语言，分分钟在线做出这样的高水平图片。
维凡生物·2024-01-13 14:49

Day4-郭妞2020.04.27-R语言基础

1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面3.学会外观设置和基本操作准备工作1、查看电脑用户名是中文还是英文先在电脑桌面随便打开一个文件夹
郭妞儿·2024-01-13 09:28

R语言【paleobioDB】——pbdb_occurrence()：从PBDB获取单个化石记录号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_occurrence(id,...)Arguments参数【id】：化石记录号的标识符，即ID。此参数
ALittleHigh·2024-01-13 09:49

R语言【paleobioDB】——pbdb_collections()：通过参数选择，返回多个采集号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_collections(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有可用参数
ALittleHigh·2024-01-13 09:19

R语言【paleobioDB】——pbdb_collections_geo()：从PBDB获取根据地理位置信息筛选的采集号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_collections_geo(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有
ALittleHigh·2024-01-13 09:19

R语言【paleobioDB】——pbdb_map_occur()：通过化石分布记录，创建一个RasterLayer对象，和一个显示取样力度的图

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_map_occur(data,res=5,col.int="white",col.ocean="bla
ALittleHigh·2024-01-13 09:19

R语言【paleobioDB】——pbdb_map_richness()：通过化石分布记录，创建一个RasterLayer对象，和一个显示科、属、种等分类阶元丰富度的图

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_map_richness(data,rank="species",do.plot=TRUE,res=5
ALittleHigh·2024-01-13 09:19

R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图

详情点击链接：R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图前沿R语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。
夏日恋雨·2024-01-13 09:45

R语言【技巧】——判断自定义函数的传参内容是否符合要求

1.利用if条件判断，stop语句报错比如对一个应该传入数值型，数值为0或1的参数：if(add.strat1){stop("add.stratrepresentsthefractionofpseudoabsencesthataresampledenvironmentallystratifiedandshouldbebetween0and1!")}比如对一个应该传入字符型，字符串为某个向量元素之一
ALittleHigh·2024-01-13 09:41

医学统计学-为什么是个医学生就都要学R语言？

医学统计学中R语言对一个医学生意味着什么？众所周知，医学统计学在医学研究中占据了极其重要的位置，每一个医学人都不可能逃脱被统计支配的命运。
统计之光—Meta分析一对一指导·2024-01-13 08:45

统计学-R语言-4.1

文章目录前言编写R函数图形的控制和布局par函数layout函数练习前言安装完R软件之后就可以对其进行代码的编写了。编写R函数如果对数据分析有些特殊需要，已有的R包或函数不能满足，可以在R中编写自己的函数。函数的定义格式如下所示：functionname<-function(a1,a2,...)expression该式中，functionname是函数名称；function指明该对象为函数类型；a
柔雾·2024-01-13 08:35

统计学-R语言-3

文章目录前言给直方图增加正态曲线的不恰当之处直方图与条形图的区别核密度图时间序列图洛伦茨曲线计算绘制洛伦茨曲线所需的各百分比数值绘制洛伦茨曲线练习前言本篇文章是介绍对数据的部分图形可视化的图型展现。给直方图增加正态曲线的不恰当之处需要注意的是，给直方图拟合正态分布曲线并非总是适用，有时甚至是荒谬的，容易产生误导。合理的做法是为直方图拟合一条核密度估计曲线，它是数据实际分布的一种近似描述。下面通过一
柔雾·2024-01-13 08:32

代码+视频，手把手教你R语言使用forestploter包绘制单组及双组森林图

既往我们在文章《R语言快速绘制多因素回归分析森林图（1）》已经介绍了怎么绘制森林图，但是绘图比较简单，不够美观，不能绘制相对复杂的森林图。
天桥下的卖艺者·2024-01-13 03:56

代码+视频手把手教你基于R语言逆概率加权(IPTW)并行生存曲线分析

代码+视频手把手教你基于R语言逆概率加权(
天桥下的卖艺者·2024-01-13 03:56

代码+视频，超详细的R语言svykm函数绘制复杂抽样设计数据cox回归生存曲线(Kaplan-Meier)

我们在既往的文章《R语言绘制复杂抽样设计数据cox回归生存曲线(Kaplan-Meier)》中介绍了怎么使用jskm包的svykm函数绘制复杂抽样设计数据cox回归生存曲线(Kaplan-Meier)，
天桥下的卖艺者·2024-01-13 03:56

机器学习系列--R语言随机森林进行生存分析（2）

随机森林（Breiman2001a）（RF）是一种非参数统计方法，需要没有关于响应的协变关系的分布假设。RF是一种强大的、非线性的技术，通过拟合一组树来稳定预测精度模型估计。随机生存森林（RSF）（Ishwaran和Kogalur，2007；Ishwaraan，Kogalur、Blackstone和Lauer（2008）是Breimans射频技术的延伸从而降低了对时间到事件数据的有效非参数分析。接
天桥下的卖艺者·2024-01-13 03:55

如何利用R语言进行时间序列分析

R语言具有功能强大的程序包，在数据
吃一口小肉丸·2024-01-13 01:57

用R语言随便编一个模拟fasta序列

格式：第一行为一个大于号加序列名称；第二列为序列信息（核苷酸用ACGT四种字母表示；氨基酸用20个字母表示），接下来利用R语言一些函数循环编写多个fasta序列，并储存到本地。
小贝学生信·2024-01-12 22:31

Day4-路超杰

R语言基础1.R和Rstudio安装注意一定要确保用户名是英文的（深受其害，最后重装了系统解决）)R和RStudio安装教程和一些快捷键2.认识R和Rstudio生信星球公众号3.基本画图命令plot(
Imimp·2024-01-12 18:50

vscode配置R语言环境：“vscDebugger“的安装

vscode配置R语言环境：“vscDebugger“的安装_shaojie_45的博客-CSDN博客上文给出了3种解决方式，但我都不行。翻来翻去终于找到解决办法，应该是通用的。
朦朦墨色染·2024-01-12 09:56

R语言学习（2）——Windows系统下安装和配置R的IDE（VSCode）

上一期文章R语言学习（1）——Windows系统下安装R及Rtools文章目录安装VSCode（VisualStudioCode）配置相关设置和Rstudio相比，我更喜欢用VSCode，因为VSCode
闲鱼粗面·2024-01-12 09:24

R语言下载安装及VScode配置

文章目录1.R下载和安装1.1下载1.2安装2.VSCODE配置2.1安装R拓展2.2安装R语言辅助功能包2.3DEBUG1.R下载和安装1.1下载网址：https://www.r-project.org
X_Cosmic·2024-01-12 09:50

[原创][R语言]股票分析实战[10]:读取股票数据文件的细节: 数值精度丢失 和 排序

[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父·2024-01-12 08:58

100个GEO基因表达芯片或转录组数据处理之GSE126848（003）

，但是GEO、ArrayExpress等数据库储存并公开大量的基因表达芯片数据，还是会有大量的需求去处理芯片数据，并且建模或验证自己所研究基因的表达情况，芯片数据的处理也可能是大部分刚学生信的道友入门R语言数据处理的第一次实战
恩喜玛生物·2024-01-12 08:26

100个GEO基因表达芯片或转录组数据处理之GSE159676（002）

，但是GEO、ArrayExpress等数据库储存并公开大量的基因表达芯片数据，还是会有大量的需求去处理芯片数据，并且建模或验证自己所研究基因的表达情况，芯片数据的处理也可能是大部分刚学生信的道友入门R语言数据处理的第一次实战
恩喜玛生物·2024-01-12 08:26

R语言笔记

在一个函数中，如果一个包不存在，执行到library将会停止执行，require则会继续执行.2.R语言中$符号和@符号取值区别？$比较常用，@比较少用。
启动子学生信·2024-01-12 05:26

统计学-R语言-2.1

文章目录前言安装过程总结前言上篇文章介绍了统计学-R语言的介绍，本篇文章介绍如何安装R软件。安装过程可以登录官网，https://www.r-project.org/，点击此处跳转。
柔雾·2024-01-12 00:37

统计学-R语言-2.2

文章目录前言导入.RData文件方式1方式2方式3导入程序包总结前言本篇文章是将上篇得软件安装完，对其部分功能进行介绍。导入.RData文件在我们日常练习时会有.RData文件导入，并对其进行分析，下面是两种方导入.RData文件。方式1直接找到自己下载的.RData文件，双击进行打开即可。方式2上面得工具栏中找到文件。在里面找到打开程序脚本，找到你所保存的.RData文件存储位置。如果没有文件显
柔雾·2024-01-12 00:35

R语言可视化（十八）：UMAP图绘制

18.UMAP图绘制清除当前环境中的变量rm(list=ls())设置工作目录setwd("C:/Users/Dell/Desktop/R_Plots/18umap/")查看示例数据head(iris)##Sepal.LengthSepal.WidthPetal.LengthPetal.WidthSpecies##15.13.51.40.2setosa##24.93.01.40.2setosa##
Davey1220·2024-01-11 23:44

python数据分析与应用课后题答案第五章_《Geocomputation with R》第五章参考答案

作者：黄天元，复旦大学博士在读，热爱数据科学与开源工具（R），致力于利用数据科学迅速积累行业经验优势和科学知识发现，涉猎内容包括但不限于信息计量、机器学习、数据可视化、应用统计建模、知识图谱等，著有《R语言高效数据处理指南
weixin_39717121·2024-01-11 23:06

R语言中创建函数参数的问题

Sys.setlocale('LC_ALL','C')##[1]"C"R语言中创建函数参数的问题R可以很方便的指定任意长度的参数列表(…)可以表示将额外的参数传递给另外的一个函数-再有就是可以表示参数可变举例说明该计算会将
医科研·2024-01-11 20:48

raptor 速成

文章目录开始与结束Start：End：控制语句循环Set与变量Set语句：变量：开始与结束在Raptor语言中，Start和End是两个特殊的符号，它们用于表示程序的开始和结束。
JNU freshman·2024-01-11 20:38

R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图教程

详情点击链接：R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图教程前沿R语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。
夏日恋雨·2024-01-11 19:31

R语言【stats】——as.formula()：取已包含在其他对象中的公式的方法，额外保存属性

Packagestatsversion4.2.0Description泛型函数formula及其特定方法提供了一种提取包含在其他对象中的公式的方法。as.formula几乎相同，另外当对象已经继承了“formula”时，保留了属性。Usageformula(x,...)DF2formula(x,env=parent.frame())as.formula(object,env=parent.fram
ALittleHigh·2024-01-11 16:46

r语言degseq2_R语言seq()函数用法

1、seq()用来生成一组数字的函数。Usage：##DefaultS3method:seq(from=1,to=1,by=((to-from)/(length.out-1)),length.out=NULL,along.with=NULL,...)seq.int(from,to,by,length.out,along.with,...)seq_along(along.with)seq_len(l
weixin_39553352·2024-01-11 15:29

R语言【base】——sample()：随机取样和排列

Packagebaseversion4.2.0Descriptionsample()使用替换或不替换从参数【x】的元素中获取指定大小的样本。Usagesample(x,size,replace=FALSE,prob=NULL)sample.int(n,size=n,replace=FALSE,prob=NULL,useHash=(n>1e+07&&!replace&&is.null(prob)&&
ALittleHigh·2024-01-11 13:19

R语言【base】——ceiling()：对数字进行四舍五入

Packagebaseversion4.2.0Descriptionceiling接受单个数字参数【x】，并返回一个数字向量，其中包含不小于参数【x】对应元素的最小整数。Usageceiling(x)Arguments参数【x】：一个数值向量。Example>ceiling(c(1,2.2,3.1,5.9,9))[1]13469
ALittleHigh·2024-01-11 13:19
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