r语言glmnet

R＆RStudio的安装及配置

所以，Rstudio提供了一个人性化的可视界面来操作R语言。在软件里可以创建完整的项目，编写脚本，查看变量值，获取绘图的结果等等。1.R的安装（1）下载下载地址
涉川.·2023-09-29 19:07

rstudio安装后如何打开_R语言IDE之RStudio的安装及使用入门

RStudio功能特色RStudio支持语法高亮、代码完成和智能缩进直接从源代码编辑器执行R代码快速跳转到函数定义RStudio集成R帮助和文档使用项目轻松管理多个工作目录工作区浏览器和数据查看器交互式调试器快速诊断和修复错误RStudio广泛的软件包开发工具用Sweave和RMarkdown创作RStudio集成支持Git和Subversion支持创作HTML、PDF、Word文档和幻灯片RSt
weixin_39912566·2023-09-29 19:37

R | R及Rstudio安装、运行环境变量及RStudio配置

R|R及Rstudio安装、运行环境变量及RStudio配置一、介绍1.1R介绍1.2RStudio介绍二、R安装2.1演示电脑系统2.2R下载2.3R安装2.4R语言运行环境设置（环境变量）2.4.1
跳动的喵尾巴·2023-09-29 19:05

R语言报错Error:n() should onlybe called in a data context

提示可能是有两个函数互相冲突，通过制定包加函数的办法可以解决。解决办法见下图：或者关闭之前加载的plyr包detach(“package:plyr”）参考链接:https://www.jianshu.com/p/491b6eca2d9a
翻山越玲·2023-09-29 19:43

生信学习小组-Day5 - 三三

关键词R语言，数据类型，向量，数据框今日笔记向量来自生信星球1.赋值命令x数据框1.读取本地数据read.csv()read.csv()read.table()read.table()2.设置行名和列名
三三鹅_·2023-09-29 16:21

R语言用标准最小二乘OLS，广义相加模型GAM ，样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类...

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21379本文我们对逻辑回归和样条曲线进行介绍（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。logistic回归基于以下假设：给定协变量x，Y具有伯努利分布，目的是估计参数β。回想一下，针对该概率使用该函数是（对数）似然函数对数似然其中。数值方法基于（数值）下降梯度来计算似然函数的最大值。对数似然（负）是以下函数negLogLik=function(b
拓端研究室TRL·2023-09-29 12:44

跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画曼哈顿图展示XP-CLR score

今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文中的Figure3a,，曼哈顿图展示的是XP-CLRscore，这个分支具体是什么含义还得仔细学习，群体基因组类的论文通常都有这个数据
小明的数据分析笔记本·2023-09-29 10:27

R语言进行孟德尔随机化+meta分析（2）----基于R和stata

目前不少文章用到了孟德尔随机化+meta分析，在上一章咱们简单介绍了一下meta分析的基础知识。咱们今天来介绍一篇11分文章，由文章看看孟德尔随机化+meta分析如何进行，文章的题目是：Appraisingthecausalroleofsmokinginmultiplediseases:Asystematicreviewandmeta-analysisofMendelianrandomizatio
天桥下的卖艺者·2023-09-29 08:36

linux服务器安装R语言及Rstudio server

在linux服务器上使用R语言及Rstudioservercat/etc/redhat-release:查看服务器系统版本R程序包获取查看最新版本的下载链接，使用wget获取wgethttps://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn
Seurat_Satija·2023-09-29 07:04

R语言批量有规律改变量名

#把data数据集的18个变量名统一改为x1,x2....x18names(data)<-paste('x',1:18,sep='')
绿菡萏·2023-09-29 04:52

2020-05-30R语言 特殊函数

1、统计函数函数描述mean()平均数median()中位数sd()标准差var()方差mad()绝对中位差，即原数据减去中位数后得到的新数据的绝对值的中位数quantile(x,probs)求分位数，x为待求分位数的数值型向量，probs为一个由[0,1]之间的概率值组成的数值向量，eg:a均方根，均方差：均方根：2、数学函数函数描述abs()绝对值sqrt()平方根ceiling()向上取整f
Seurat_·2023-09-29 02:59

R语言 数据框：创建、操作和分析数据框

R语言数据框：创建、操作和分析数据框数据框（data.frame）是R语言中最常用的数据结构之一，它是一种二维的表格型数据对象，由行和列组成。
CyberwCoder·2023-09-29 01:19

R语言中将字符串转换为日期类型的方法

R语言中将字符串转换为日期类型的方法日期数据在数据处理和分析中非常重要。在R语言中，我们可以使用不同的函数和包来将字符串转换为日期类型。
CyberwCoder·2023-09-29 01:49

跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言ggplot2作图展示方差分解的结果

关于方差分解的内容之前已经分享过两篇推文之前的推文分享过一篇内容是重复了一篇NatureEcology&Evolution期刊论文的方差分解过程，虽然对运行过程还是不太理解，但是能得到结果。今天的推文我们利用得到的结果复现一下论文中的Figure4aimage.png前面的计算过程可以参考推文现在是假设我们已经拿到了计算结果，需要作图，组图用到的示例数据如下image.png（这里不再提供示例数据
小明的数据分析笔记本·2023-09-29 01:08

R语言中的数据重塑

文章目录介绍reshape2::melt()的用法实例reshape2::dcast()的用法实例tidyr::gather()的用法tidyr::spread()的用法介绍tidyverse系列包中的函数操作都是针对简洁数据框进行的，对于不是简洁的数据，实现需要进行数据重塑。数据重塑主要包括长宽表的转换、拆分/合并列、方形化。长宽表转化最初使用的是reshape2包的melt()和cast()函
zoujiahui_2018·2023-09-29 00:17

RNA 21. SCI 文章中单基因富集分析

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你88篇原创内容公众号今天就来剖析一下单基因到底怎么做
桓峰基因·2023-09-28 23:10

SCS【1】今天开启单细胞之旅，述说单细胞测序的前世今生

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你123篇原创内容-->公众号今天开启单细胞之旅，单细胞其实我也算接触较早的项目
90066456ace6·2023-09-28 20:33

R语言随机波动模型SV：马尔可夫蒙特卡罗法MCMC、正则化广义矩估计和准最大似然估计上证指数收益时间序列...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=31162最近我们被客户要求撰写关于SV模型的研究报告，包括一些图形和统计输出（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频本文做SV模型，选取马尔可夫蒙特卡罗法(MCMC)、正则化广义矩估计法和准最大似然估计法估计。模拟SV模型的估计方法：sim<-svsim(1000,mu=-9,phi=0.97,sigma=0.15)print(sim)
拓端研究室TRL·2023-09-28 13:25

如何开始着手一篇Meta分析 | Meta分析的流程及方法

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。Meta分
asyxchenchong888·2023-09-28 09:08

R语言分析：如何轻松地把数据分为三、四、五等份？

有网友问了，我如何对连续型资料进行分组，常见的有按照中位数分组、四分位数分组，甚至分为5组。这个问题其实很简单的了。用两个函数，一个是quantile函数，另外一个是cut函数1.quantile()函数的应用该函数目的是获得分组界值比如说，求某个百分位比data<-c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,5,6,7,43,9,4,12,46,22,0,14,15,3,5,7,9,4,22)
weixin_44693403·2023-09-28 03:02

限制性立方样条图还不会画？ RCS曲线，现在可以快速搞定了（附教程）

国内学者已经整出3个R语言包，简单暴力美现在我希望搞出一个网页版，快速绘制RCS曲线，本来我想把国内几种方法全部都呈现出来，不过实在精力有点限制，先画一种吧，希望下个
weixin_44693403·2023-09-28 03:31

R语言学习.6---绘图

R语言绘图是生信技能树生信爆款入门课程R语言部分Day6的讲到的一个重要知识点。为加深理解，现在做下练习巩固。
Seurat_·2023-09-28 00:49

GEO生信数据挖掘（一）数据集下载和初步观察

GSE1297为例目录GEOquery简介安装并加载GEOquery包getGEO函数获取数据（联网下载）更换下载数据源对数据集进行初步观察处理GEOquery简介GEOquery是一个在生物信息学中常用的R语言包
人工智能学术前沿（真)·2023-09-27 22:54

跟着Science学画图：R语言ggplot2作小提琴图展示NLRs基因的拷贝数（copy number）

论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本·2023-09-27 22:25

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画分组折线图和置信区间

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一
小明的数据分析笔记本·2023-09-27 22:17

R语言逻辑回归、决策树、随机森林、神经网络预测患者心脏病数据混淆矩阵可视化...

全文链接:https://tecdat.cn/?p=33760众所周知，心脏疾病是目前全球最主要的死因。开发一个能够预测患者心脏疾病存在的计算系统将显著降低死亡率并大幅降低医疗保健成本。机器学习在全球许多领域中被广泛应用，尤其在医疗行业中越来越受欢迎。机器学习可以在预测关键疾病（例如心脏病）的存在或不存在方面发挥重要作用（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频如果能提前准确预测这些信息，
拓端研究室TRL·2023-09-27 22:27

ggplot2绘制箱式图（并叠加小提琴图和点图）

本文使用基因表达数据绘制箱式图，并叠加小提琴图和点图(geom_boxplot绘制箱式图，geom_violin绘制小提琴图，geom_dotplot和geom_jitter绘制点图).了解一下R语言中箱式图的术语
钿璎纍纍佩珊珊·2023-09-27 20:17

介绍一位网络爬虫工程师

他系一名软件开发工程师，在工作之余，热爱Python编程，专注于网络爬虫与数据分析（R语言、水晶易表）。
IT农民工1·2023-09-27 18:32

介绍一位零基础学Python网络爬虫的工程师

他系一名软件开发工程师，在工作之余，热爱Python编程，专注于网络爬虫与数据分析（R语言、水晶易表）。
IT农民工1·2023-09-27 18:02

常用植被物候提取方法 (TIMESATE/R语言/Python)

文章内容仅用于自己知识学习和分享，如有侵权，还请联系并删除：）（一）Background这篇文章介绍的非常全面！！物候的提取通常包含两个步骤：（1）曲线的重构拟合（curvefitting）和（2）物候矩阵的提取（phenologicalmetricsextraction）（1）曲线拟合的方法通常有3种方法：(S-G)滤波法（Savitzky-Golay）,双逻辑斯蒂函数拟合法（DoubleLog
柚柚柚子爱吃葡萄柚·2023-09-27 12:17

r语言作业：基于线圈数据的交通流密速分析

目录1.数据读取：提取全部NHNX40(1)检测器的数据。2.冗余和缺失处理3.数据聚集4.可视化与分析5.选择第一天的数据分析6.总体代码1.数据读取：提取全部NHNX40(1)检测器的数据。通过Excel打开几个文件并查找后，确认仅有tmp02和tmp04中含有NHNX40（1）监测器结果，因此将两个文件合并为data文件，并针对data文件进一步通过函数过滤监测器NHNX40（1）的数据至新
苏瑾年sakuralen·2023-09-27 12:43

R语言逻辑回归Logistic选股因素模型交易策略及沪深300指数实证|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32071原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于交易策略的研究报告，包括一些图形和统计输出。随着中国的证券市场规模的不断壮大、市场创新不断深化、信息披露不断完善、市场监管不断强化，随着现代投资组合理论的发展和计算机技术的进步，投资者为了在股票交易中取得更多的收益，就需要有合理有效的投资策略，因素模型的基础上发展出众多量化研究模型。对
·2023-09-27 11:56

R语言用标准最小二乘OLS，广义相加模型GAM ，样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类...

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21379本文我们对逻辑回归和样条曲线进行介绍（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。logistic回归基于以下假设：给定协变量x，Y具有伯努利分布，目的是估计参数β。回想一下，针对该概率使用该函数是（对数）似然函数对数似然其中。数值方法基于（数值）下降梯度来计算似然函数的最大值。对数似然（负）是以下函数negLogLik=function(b
拓端研究室TRL·2023-09-27 08:40

数据分享|R语言分析上海空气质量指数数据：kmean聚类、层次聚类、时间序列分析：arima模型、指数平滑法...

本文向大家介绍R语言对上海PM2.5等空气质量数据（查看文末了解数据免费获取方式）间的相关分析和预测分析，主要内容包括其使用实例，具有一定的参考价值，需要的朋友可以参考一下（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据
拓端研究室TRL·2023-09-27 08:34

学习小组-day4笔记-htt1996

一、下载R和Rstudio下载R和Rstudio教程：https://mp.weixin.qq.com/s/NdHIFrfJVDsHIUDc5SItyA二、R语言基本操作plot(rnorm(50))#
Htt_1996·2023-09-27 01:11

R语言包lemon

具体都有什么作用暂时还不知道，可以操作ggplot2作图的坐标轴，比如下图dsamp<-diamonds[sample(nrow(diamonds),1000),]library(lemon)library(ggplot2)p<-ggplot(dsamp,aes(x=cut,y=price,colour=clarity))+geom_point(position=position_jitter(w
小明的数据分析笔记本·2023-09-27 01:40

如何用R语言读取Excel、PDF和JSON文件？

转自：微点阅读https://www.weidianyuedu.com导读：本文将讨论Excel、PDF等文件的读取，以及相应函数的参数设置。如需转载请联系大数据下图总结了主要程序包，希望读者在日常练习和工作中遇到不同格式的文件时，能够瞬间反应出读取该格式所需的包及对应的函数。（限于篇幅，本文未包含图中“平面文档格式”这部分的内容，如果你有兴趣，可以继续关注大数据后续文章。）▲不同格式的数据文件读
ysds20211402·2023-09-26 22:54

Python 用ARIMA、GARCH模型预测分析股票市场收益率时间序列

相关视频：时间序列分析：ARIMAGARCH模型分析股票价格数据时间序列分析模型ARIMA-ARCHGARCH模型分析股票价格数据相关视频：在Python和R语言中建立EWMA，ARIMA模型预测时间序列前言在量化金融中
拓端研究室·2023-09-26 15:12

R语言中更改R包安装路径

看到这些包下载到我的C盘，我蛮不爽的：所以决定毫不犹豫的改到D盘：首先，我们需要在RStudio中新建一个初始启动文件：file.edit('~/.Rprofile')然后去你喜欢的环境新建一个文件夹存放安装的包的位置，我喜欢这里：接着：（注意路径的反斜杠的方向！）.libPaths("D:/D_downloads1/R_libaray").libPaths(myPaths)保存完了之后，重启RS
每天都是被迫学习·2023-09-26 08:38

Neo4j - CQL使用

3.1Neo4j-CQL简介Neo4j的Cypher语言是为处理图形数据而构建的，CQL代表Cypher查询语言。像Oracle数据库具有查询语言SQL，Neo4j具有CQL作为查询语言。
Q z1997·2023-09-26 06:12

基于R语言分位数回归丨线性回归假设与分位数函数、线性分位数回归 、贝叶斯分位数回归、超越线性分位数回归等

目录专题一线性回归假设与分位数函数讲解专题二线性分位数回归【代码实践】专题三贝叶斯分位数回归【代码实践】专题四超越线性分位数回归（一）【代码实践】专题五超越线性分位数回归（二）【代码实践】更多应用回归是科研中最常见的统计学研究方法之一，在研究变量间关系方面有着极其广泛的应用。由于其基本假设的限制，包括线性回归及广义线性回归在内的各种常见的回归方法都有三个重大缺陷：(1)对于异常值非常敏感，极少量的
WangYan2022·2023-09-26 05:38

R语言_data.frame()函数用法

前言:微博参与话题#给你四年时间你也学不会生信#DataFrames|数据框data.frame()函数创建数据框，紧密耦合的变量集合，这些变量共享了矩阵和列表的许多属性，它们被大多数R的建模软件用作基本的数据结构。dataFrame一般被翻译为数据框，感觉就像是R中的表，由行和列组成，与Matrix不同的是，每个列可以是不同的数据类型，而Matrix是必须相同的。Usagedata.frame(
谢俊飞·2023-09-26 02:59

R语言多元（多变量）GARCH ：GO-GARCH、BEKK、DCC-GARCH和CCC-GARCH模型和可视化|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=30647最近我们被客户要求撰写关于GARCH的研究报告，包括一些图形和统计输出。从Engle在1982发表自回归条件异方差(ARCH)模型的论文以来，金融时间序列数据的波动性就倍受关注。同时，近几年又出现了研究股票市场的波动传递性多市场的多维广义自回归条件异方差模型及其在不同条件下的扩展与变形，它们不仅包含了单变量的波动特性，而且很好的描述了不同
·2023-09-26 00:17

R语言用普通最小二乘OLS，广义相加模型GAM ，样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21379原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文我们对[逻辑回归和样条曲线进行]()介绍。logistic回归基于以下假设：给定协变量x，Y具有伯努利分布，目的是估计参数β。回想一下，针对该概率使用该函数是（对数）似然函数对数似然其中。数值方法基于（数值）下降梯度来计算[似然函数]()的[
·2023-09-26 00:17

R语言文本挖掘：kmeans聚类分析上海玛雅水公园景区五一假期评论词云可视化|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32307原文出处：拓端数据部落公众号互联网时代，大量的新闻信息、网络交互、舆情信息以文本形式存储在数据库中，如何利用数据分析和文本挖掘的算法，将海量文本的价值挖掘出来，成为我们团队近期的一个研究方向，本案例就是我们的一个尝试。文本聚类其实也就是聚类分析在文本方向上的应用,首先我们要把一个个文档的自然语言转换成数学信息，这样形成高维空间点之后再去计
·2023-09-26 00:47

R语言用线性模型进行臭氧预测： 加权泊松回归，普通最小二乘，加权负二项式模型，多重插补缺失值|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=11386原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于线性模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。在这篇文章中，我将从一个基本的线性模型开始，然后从那里尝试找到一个更合适的线性模型。数据预处理由于空气质量数据集包含一些缺失值，因此我们将在开始拟合模型之前将其删除，并选择70％的样本进行训练并将其余样本用于测试：data(airqualit
·2023-09-26 00:46

在线平台如何做单细胞测序分析全套？有它so easy!

在线工具也能追上单细胞作者：白介素2单细胞测序技术是一个越来越Popular的技术，这不前两天还有小伙伴来找白介素同学，说是老板想分析单细胞测序的数据，喜欢追热点，让他们去学R语言，然后小伙伴自然是懵逼
医科研·2023-09-25 23:24

[R语言可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析（PCA）

本期内容为[R语言可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析（PCA）主成分分析：PCA（PrincipalComponentAnalysis）是一种常用的数据分析方法。
小杜的生信筆記·2023-09-25 22:46

R语言机器学习与临床预测模型26--综合判别改善指数

本内容为【科研私家菜】R语言机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01什么是综合判别改善指数？
科研私家菜·2023-09-25 22:07

python和r语言做大数据_R和python大数据

数据科学界华山论剑：R与Python巅峰对决如果你是数据分析领域的新兵，那么你一定很难抉择——在进行数据分析时，到底应该使用哪个语言，R还是Python？在网络上，也经常出现诸如“我想学习机器语言，我应该用哪个编程语言”或者“我想快速解决问题，我应该用R还是Python”等这类问题。尽管两个编程语言目前都是数据分析社区的佼佼者，但是它们仍在...文章小旋风柴进2017-05-02878浏览量Pyt
股民好多·2023-09-25 21:23
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